选择参考基因组物种及版本,如果没有本地版本,需要联网下载
b. 选择染色体编号
c....chr6:64,664,854-64,666,044
按基因名搜索:如 pou5f1,但是不支持别名等其他名称搜索
按突变搜索,支持两种格式:
如KRAS:G12C,搜索 KRAS 第 12 个氨基酸上,从G...* 表示终止密码子
如 123A>T,搜索 KRAS 第 123 个氨基酸,从 A 到 T 的突变
4
放大缩小
放大:
双击轨迹窗口
按住 Shift 健,单击轨迹窗口
点击缩放工具 +
在基因组标尺窗口按住左键滑动...0,0,0.2,效果如下
设置Min,Mid,Max 依次为 -0.2,0,0.2,效果如下
设置Min,Mid,Max 依次为 -1,0,1,效果如下
最终效果如下:
2
散点图
切换到散点图选项...设置同折线图,效果如下
3
条形图
切换到条形图
设置同折线图,最终效果
4
热图
选择热图选项
配置参数
设置
效果
总结一下,一共可以绘制四种图,包括:
热图
折线图
条形图