首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

使用fasterq-dump命令sra格式数据换为fastq格式遇到问题

从NCBI下载了一些转录组数据,这里用到下载工具是kingfisher ,github链接是 https://github.com/wwood/kingfisher-download 下载方法选是...aws-http (下载速度超级快) 默认会将sra格式换为fastq格式,使用到工具是fasterq-dump这个工具,试了几次一直遇到报错,所以就将下载格式默认选择为sra 需要制定参数-f sra...想是后续再单独转成fastq格式 下载完成后转化fastq格式还是有问题,使用fasterq-dump命令有时候可以成功,但是有时候就会卡住,卡住后按ctrl+c命令也不能退出,只能关掉窗口重新链接服务器...github.com/ncbi/sra-tools/issues/463 大家问题基本都是一样 计算机集群,slurm这个命令提交系统 BeeGFS 这个存储系统 和我硬件情况一样 没有找到解决办法...,如果没有下载就指定 SRR5187763 不带后缀名sra 文件下载好以后转换起来还是相当快 大家如果遇到这个问题也可以试试这个替代方案

4.5K20

python提取pdf文档表格数据、svg格式换为pdf

提取pdf文件表格数据原文链接 https://www.analyticsvidhya.com/blog/2020/08/how-to-extract-tabular-data-from-pdf-document-using-camelot-in-python.../ 另外还参考了这篇文章 https://camelot-py.readthedocs.io/en/master/ 实现提取pdf文档表格数据需要使用camelot模块 这个模块可以直接使用pip...表格数据转换成数据框 pandas 两个数据框按照行合并需要用到append()方法 aa = {"A":[1,2,3],"B":[4,5,6]} bb = {"A":[4],"B":[7]} import...pandas as pd a = pd.DataFrame(aa) b = pd.DataFrame(bb) a.append(b) SVG格式换为pdf格式原文链接 https://www.tutorialexample.com...pip安装 pip install svglib svg转换为pdf格式代码 from svglib.svglib import svg2rlg from reportlab.graphics import

1.1K40

Oracle使用

LOWER() 字符串转换为小写 UPPER() 字符串转换为大写 INITCAP() 把每个单词首字母变成大写 字符处理函数 CONCAT() 连接两个字符串...,返回日期所在期间第一天 转换函数 to_char() 把日期换为字符、把数字换为字符 to_number 字符格式和模板模式必须要一致 to_date() 日期按指定格式换成日期类型...通过正则表达式来替换 -- *a*b*d*d*e*r*f*g*g*g 把0-9数字换为* --SELECT REGEXP_REPLACE('1a2b3d4d5e6r7f8g9g0g','[0-9]...) MI:一小时分钟 SS:一分钟秒 SSSS:从午夜开始过去秒数 日期格式基础 年月日 格式 解释 YYYY,YYY,YY 分别代表4位,3位,2位数字年份 YEAR...年拼写 MM 数字月 MONTH 月份全拼名称 MON 月份缩写 DD 数字日 DAY 星期全拼 DY 星期缩写 时间格式 格式控制符

24330

javascript获取当前系统时间代码_获取当前系统时间

日期字符串 Date.prototype.toArray 日期分割为数组 Date.prototype.DatePart 取日期部分信息 Date.prototype.MaxDayOfDate 取日期所在月最大天数.../)DD或YYYY-(/)M-(/)D或YYYY-(/)MM-(/)D就替换为'' //数据,合法日期可以是:YYYY-MM/DD(2003-3/21),数据库会自动转换为YYYY-MM-DD...= t.getDate()) { //alert('错误日期格式格式为:YYYY-MM-DD或YYYY/MM/DD。注意闰年。')...'),date2.Format('yyyy-MM-dd')); return result; } //±————————————————– //| 取得当前日期所在周是一年第几周 //±—...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站立刻删除。

18.4K30

SQL函数 CAST

数字值被转换为日期或时间数据类型时,它在SQL显示为0 (0); 但是,当数字换为日期或时间时,从嵌入式SQL传递到ObjectScript,它显示为相应$HOROLOG值。...日期换为TIMESTAMP、DATETIME或SMALLDATETIME数据类型返回一个格式YYYY-MM-DD hh:mm:ss时间戳。...日期换为字符数据类型可以返回完整日期,也可以返回数据类型长度所允许全部日期。 但是,对所有字符数据类型来说,显示格式并不相同。...CHAR VARYING和CHARACTER VARYING数据类型以显示格式返回完整日期。 例如,如果日期显示为MM/DD/YYYY,这些数据类型日期返回为具有相同格式字符串。...其他字符数据类型以ODBC日期格式字符串形式返回日期(或其中一部分)。 例如,如果日期显示为mm/dd/yyyy,这些数据类型日期返回为yyyy - mm - dd格式字符串。

3.7K30

MySQL数据库应用总结(六)—MySQL数据数据类型和运算符(上)

可以使用各种格式指定YEAR值,如下所示: 以4位字符串或者4位数字格式表示YEAR,范围为1901~2155。输入格式YYYY’或者YYYY。 以2位字符串格式表示YEAR,范围为00到99。...00~69换为2000~2069;70~99换为1970~1999; 以2位数字表示YEAR值,范围为1~99。...1~69值是2001~2069;70~99范围值转换为1970~1999,而在这里0值被转换为0000; 案例 创建数据表tb_temp3,定义字段类型为YEAR字段y,向表插入数值2017,'2017...日期格式为:'YYYY-MM-DD' 。 以'YYYY-MM-DD'或者'YYYYMMDD'字符串格式表示日期,取值范围是'1000-01-01'~'9999-12-03' 。...格式为:'YYYY-MM-DD HH:MM:SS', 只要符合格式使用字符串和数字类型均可。

3.2K50

第十六天 常用API-Date&DateFormat&Calender&System&Math&基本类型包装类&正则【悟空教程】

1.2 DateFormat类 1.2.1 概念 DateFormat是用于日期格式化类,即将一个Date对象转换为一个符合指定格式字符串,也可以一个符合指定格式字符串转为一个Date对象。...(); //使用指定格式创建格式化对象 DateFormat df = new SimpleDateFormat("yyyy年MM月dd日 HH:mm:ss"); //调用format方法日期换为字符串...s1换为int值 s1赋值为”3.14”; s1换为double值 s1赋值为”你”; s1换为char值 s1赋值为:”true” s1换为boolean值 定义int变量v1,...初始值:200 v1换为String 定义double变量v2,初始值:3.14 v2换为String 2.1.6 System类 要求: 1) 掌握System类常用方法; 题目: 1)...("亲,请输入日期:(格式为:yyyy-MM-dd)");String s = new Scanner(System.in).next();//2、定义日期格式化对象,用于将用户输入字符串转换为日期对象

1.7K20

java整型转换成字符串_java整型转换成字符串

(s);//调用 Short 类 parseShort 方法把 s 转换成短 整型 c=Integer…… 本文由我司收集整编,推荐下载,如有疑问,请与我司联系 在 Java ,JSON 解析器自动字符串转换为数字...在 Java ,JSON 解析器自动字符串转换为数字…… (n); String s=String.valueOf(n); //把正整数n转换成字符串 number=s.length(); //得到整数位数...() 文章,用 API 是 SimpleDate…… format(Locale locale, String format, Object… args) 使用指定语言环境,制定字符串格式和参数生成格式字符串...java把当前时间转换成一个无符号字符串 用java 实现把当前时间转换成无符号…… HH:MM 格式(24 时制):10:43 定义日期格式转换符可以使日期通过指定转换符生成新字符串。.... * 10000010(原码)…… java字符串数字换为中文大写,在输出字符串_计算机软件及应用_IT/计算机_专业资料。

6.4K90
领券