尽管对我的数据使用了scale_x_discrete，X轴标签仍不存在 - 腾讯云开发者社区

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝在使用ggplot2包绘制图形时，若轴文本标签过长则非常难受需要经过处理才能完美的嵌合图形。...本次来介绍了两种处理长标签的方法，希望对各位观众老爷有所帮助，可根据自己的数据需求选择合适的解决方案。...❝这种方法直接在坐标轴设置中处理长标签，优点是代码更简洁，无需修改原始数据。...❞ p1 x, y)) + geom_col() + scale_x_discrete(labels = scales :: label_wrap(15)) 案例2...❝使用mutate和str_wrap，这种方法在数据预处理阶段处理长标签。

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ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

分面 5.1 使用分面将数据分割绘制到子图中 5.2 在不同坐标轴下使用分面 5.3 修改分面的文本标签 5.4 修改分面标签和标题的外观 6....scale_x_discrete(limits=c("trt1","ctrl","trt2")) 如忽略因子中某些类别，则输入：limits=c("trt1","ctrl") 反转因子顺序 scale_x_discrete...轴标签，但是会留出空间，表示存在空白文本 # 以上y轴同 4.7.2 修改坐标轴标签文本 xlab() # 修改x轴标签文本 ylab() # 修改y轴标签文本 labs(x = "x轴标签", y...= "y轴标签") scale_x_continuous(name="x轴标签") # scale_y_continuous()、scale_x_discrete()也适用 4.7.3 修改坐标轴标签外观...5.2 在不同坐标轴下使用分面使每个分面的坐标轴不一样，将标度设置为"free_x"、"free_y"或"free"。

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ggplot2绘制热图标准化从0-1

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友询问绘制热图时如何使刻度条展示为从「0-1」，这就涉及对数据进行标准的特殊处理，通常对数据进行处理无外乎「取log」或者直接使用「scale()函数进行标准化」...使用Min-Max标准化方法对df进行归一化处理 df_normalized x) (x - min(x)) / (max...(aes(name,id,fill=value))+ # 设置绘图的数据映射 geom_tile()+ # 绘制瓷砖图 labs(x=NULL,y=NULL)+ # 设置x和y轴标签为空...left')+ # 设置y轴为离散型，并将标签显示在左侧 scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ # 设置x轴为离散型 theme(plot.background...=element_text(color="black",size=8), # 设置坐标轴文本的颜色为黑色，大小为8 axis.ticks = element_blank(), # 设置坐标轴刻度为空白

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86-R可视化18-自定义分类或连续数据坐标轴文本

)[1] 前言最近遇到一个问题，如何将ggplot 连续性数据的坐标轴文本，自定义成想要的分类数据，比如1:10 的数值替换成 id1, id2...id10，实现以假乱真的效果。...当然首先从基础说起，也就是从分类与连续数据的不同标签设置开始。...这里主要谈的还是标签，关于坐标的范围限定，可以参考：[[57-R可视化6-ggplot2三部曲最终之进阶为菜鸟]] 连续与分类数据的处理无论是y 还是x 轴，都对应scale_**_discrete/...continuous，比如x轴如果是分类数据，则使用函数scale_x_discrete。...", "trt2" 改动为 "Control", "Treat 1", "Treat 2" bp + scale_x_discrete(breaks=c("ctrl", "trt1", "trt2"),

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跟着Science学画图：R语言ggplot2作小提琴图展示NLRs基因的拷贝数（copy number）

Figure S16 image.png 没有找到论文中提供代码中用到的数据集NLR-violin-col.csv，论文中提供的数据集是NLR-violin4.csv 部分数据集如下 image.png...，接下来增加一些代码使之更像附件中的图更改x轴刻度的文本,并将其设置为斜体 plot3 + stat_summary(fun=mean, geom="point", shape=23, size..."NLR prediction", y="Copy Number of NLRs") + theme_minimal() + scale_x_discrete(labels=c("A. thaliana...= element_text(face="italic")) image.png 通过代码我只能做到这种程度了，如果需要完全模仿原图的图例目前只能借助其他工具编辑图片了欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本...小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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ggalluvial绘制桑基图

to_lodes_form在数据框中指定几个变量作为坐标轴，并对该数据框进行重塑，使坐标轴变量名构成一个新的因子变量，其值构成另一个因子变量。其他变量的值将被重复，并且可以引入行分组变量。...to_alluvia_form取一个包含要用于冲积图的轴和轴值变量的数据框，对数据框进行重塑，使轴组成单独的变量，其值由值变量给出。...绘图 geom_alluvium接收到冲积图的lodes位置数据，包括水平(x)和垂直(y, ymin, ymax)位置，以及冲积流与strata的交叉点。...geom_stratum接收到冲积图的strata位置数据，包括水平(x)和垂直(y, ymin, ymax)位置，它为这些地层画出一定宽度的矩形。...,color冲积层边框颜色 geom_label(stat = "stratum", aes(label = after_stat(stratum))) + #冲积层添加标签 scale_x_discrete

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ggbrick绘制砖块风柱状图

数据可视化 df %>% ggplot(aes(state,state_lab)) + # 设置x轴和y轴的变量为"state"和"state_lab" geom_brick(aes(state...\nMarkers") + # 设置x轴和y轴的标签为空，设置填充颜色的标签为"Number of\nHistorical\nMarkers" scale_y_continuous(expand...= c(0,100)) + # 设置y轴的范围扩展为0到100 scale_x_discrete(labels = function(y) str_wrap(y, width=6)) +...# 设置x轴的离散变量标签格式，使其每行最多显示6个字符 theme_classic() + # 使用经典主题 theme( axis.line.y.left = element_blank..., # 隐藏y轴的刻度线 axis.text.x = element_text(color="black", size=8, face="bold"), # 设置x轴刻度标签的颜色为黑色

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ggplot2修改坐标轴详细介绍

交换x轴和y轴设置坐标轴范围使图形从0开始反转连续型坐标轴修改类别型坐标轴的顺序设置x轴和y轴的比例设置刻度线位置移除刻度线和标签修改刻度标签修改坐标轴标签沿坐标轴显示直线使用对数坐标轴...环状图形日期坐标轴交换x轴和y轴在很久以前的版本中，还只能通过coord_flip()函数实现，现在支持直接换一下x轴和y轴的映射即可。...unnamed-chunk-5 修改类别型坐标轴的顺序使用scale_x_discrete()中的limits参数即可。...或者在原始数据中，先设置好分类变量的因子顺序。...= element_text(angle = 45,vjust = 0.5)) p1/p plot of chunk unnamed-chunk-20 以上就是今天的内容，希望对你有帮助哦！

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R中优雅的绘制物种冲积图

df % column_to_rownames(var="ID") 数据清洗 # 按列求和单独计算每列的相对丰度 df_new %...) + # 根据group变量进行网格分面，设置自由的x轴和y轴刻度，自由的x轴间距 labs(x = NULL, y = NULL) + # 设置x轴标签和y轴标签为空 scale_fill_simpsons...() + # 设置填充颜色的比例尺为Simpsons风格 scale_y_continuous(expand = c(0, 0)) + # 设置y轴刻度范围的扩展为0 scale_x_discrete...(expand = c(0, 0)) + # 设置x轴刻度范围的扩展为0 theme( axis.line.x = element_line(color = "black"), # 设置...(), # 设置分面标签背景为空白 strip.text = element_text(color = "black", face = "bold"), # 设置分面标签文本的颜色为黑色，样式为粗体

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ggpol包优雅的绘制蝴蝶图

欢迎关注R语言数据分析指南加载R包 library(tidyverse) # devtools::install_github('erocoar/ggpol') library(ggpol) 导入数据...summarise(count = sum(count)) %>% # 计算每组的数量 ungroup() %>% # 解除分组 unite(col = "status_gender"...(data = results, # 添加点图层，使用处理后的选举数据 mapping = aes(x = constituency,y = y,color = dominant_gender...coord_flip() + # 翻转坐标轴，使选区显示在y轴 scale_x_discrete(name = NULL,expand = c(0,1), # 调整x轴比例和标签...legend.background = element_blank(), legend.key = element_blank(), legend.spacing.x

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R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起...首先是读入数据 df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T) 以上数据是宽格式，借助reshape2这个包中的melt函数将宽格式转变为长格式...接下来是美化调整一下y轴的的顺序 df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A)) ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile...上面的图还忘记添加文字标签了，下面补上 ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+ scale_fill_manual...如果需要本文的示例数据，直接在文末留言就好了

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R中优雅的绘制物种冲积图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...) + # 根据group变量进行网格分面，设置自由的x轴和y轴刻度，自由的x轴间距 labs(x = NULL, y = NULL) + # 设置x轴标签和y轴标签为空 scale_fill_simpsons...() + # 设置填充颜色的比例尺为Simpsons风格 scale_y_continuous(expand = c(0, 0)) + # 设置y轴刻度范围的扩展为0 scale_x_discrete...(expand = c(0, 0)) + # 设置x轴刻度范围的扩展为0 theme( axis.line.x = element_line(color = "black"), # 设置...(), # 设置分面标签背景为空白 strip.text = element_text(color = "black", face = "bold"), # 设置分面标签文本的颜色为黑色，样式为粗体

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R语言ggplot2科研数据数据可视化实用手册~第八章热图（heatmap）

，然后用display_numbers参数添加文本,这里我就直接使用热图的数据 dat01数据和宽格式数据，ggplot2作图的输入数据都是长格式数据，长格式数据如下，一列x，一列y，还有一个数据宽格式数据截图如下这个长宽格式转化是ggplot2作图必须理解的一个概念...R语言里提供了长宽格式数据互相转化的函数，这里我以tidyverse这个R包里的函数作为介绍，tidyverse主要是用来在数据处理的，也不是R语言自带的R包，需要运行安装命令install.packages...6 这个是最基本的长宽格式数据转换，如果数据集有很多列，有时候转换会相对比较复杂，这里就不做介绍，因为我也搞不懂有时候 8.2 ggplot2热图以下介绍ggplot2做热图的代码都是假设已经拿到了长格式数据...scale_fill_paletteer_c("ggthemes::Classic Orange-White-Blue", direction = -1) 调整坐标轴文本标签的位置

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Nature图表复现 | 组合绘制个性化热图

论文论文原图 ❝此图主要通过多个几何对象的叠加来进行绘制，图形的绘制并非难点，难点在于如何对源数据进行统计分析得到绘图所需数据，在此小编随意构建了数据仅供绘图展示。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(readxl) library(magrittr) 导入数据 df x=NULL,y=NULL)+ # 移除x和y轴标签 scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ # 设置x轴 scale_fill_manual(values...element_text(color="black",size=8,face="bold",angle = 90,vjust=0.5), # 自定义x轴文本 axis.text.y=element_text...= unit(0.05,"in"), # 设置图例内部的水平间距 plot.margin = ggplot2::margin(10,30,10,10), legend.direction

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ggplot2的活学活用

这种图又称 cross-talk ，当数据集做完富集分析后，查看两个通路里有哪些基因是重叠的。...，方便大家查阅输出高清图 CairoJPEG("crosstalk.jpeg",width=7200,height=4800,res=1200) 排列X轴顺序 scale_x_discrete(limits...()) 去掉X轴刻度尺 theme(axis.ticks.x = element_blank()) 去掉X轴标题 theme(axis.title.x = element_blank()) 在图上加基因名字...（我只想给重叠的基因加，不然太乱了） geom_text_repel(aes(x=test$Symbol,y=test$log2FoldChange.C2.C1....还是整理好这样的矩阵df,第三列就是富集分析得到的结果此次我们关注以下这5个通路，看他们中的基因是否存在交集，于是把df中其他无关的通路都删掉。

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ggplot2优雅绘制热图添加双箭头注释

(var="...1") 数据清洗 # 对数据进行预处理，只选取前60行和前13列，并进行数据透视 df2 % rownames_to_column(var="ID") %>% head...(clip = "off") + # 关闭坐标轴裁剪 labs(x=NULL,y=NULL)+ # 移除x和y轴标签 scale_y_discrete(expand=c(0,0),position...="right")+ # 设置y轴 scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ # 设置x轴 scale_fill_gradient2(mid="#FBFEF9",low...="#0C6291",high="#A63446") + # 设置填充颜色 coord_cartesian(clip = "off") + # 再次关闭坐标轴裁剪（可能是重复的步骤） theme_test..., y = 0.55, angle = 90,color="black",fontface = "bold",hjust = 0.5) # 添加文本标签

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R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

() image.png 增加y轴的上下空白 ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+...(expand=expansion(mult=c(1,0))) image.png 如果是要更改x轴左右的间距把scale_y_discrete()换成scale_x_discrete()就可以了...coord_polar()+ scale_fill_social_c()+ theme_void()+ scale_y_discrete(expand=expansion(mult=c(1,0)))+ scale_x_discrete...(expand=expansion(mult=c(0,0.2))) image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python...做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！

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ggplot2绘制半透明云雨图

spam %>% filter(value > 0, value % # 过滤数据，只保留value在0到3000之间的数据 ggplot(aes(x = as_factor...(yesno), y = value, color = yesno, fill = yesno)) + # 创建ggplot图，设置x轴为yesno的因子，y轴为value，颜色和填充都基于yesno...geom_half_point(side = "l",alpha = 0.1, size = 0.6) + # 添加半点图，设置显示的一侧、透明度和大小 scale_x_discrete...(log10 scale)") + # 设置x轴和y轴的标签 facet_wrap(~ category, scales = "free") + # 按category分面显示，并允许每个面的刻度自由变化...), # 隐藏y轴次要网格线 panel.grid.major.x= element_blank(), # 隐藏x轴主要网格线 panel.grid.minor.x= element_blank

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表观调控13张图之一证明基因干扰有效性

我把表观调控数据分析，拆分成为了13张图，分别录制为13个视频，即将免费发布在B站，这个期间我们的视频编辑师还在兢兢业业的奋斗，希望这13张图能带领大家学会表观调控数据分析的一般流程，然后应用到自己的课题哈...# 因为 x 轴标签要旋转 90°，所以这里用来旋转 axis.text.y = element_text(size = 16),...轴标签顺序 labels = c(paste0("WT", "_",1:3), paste0("PhoKO", "_", 1:3), paste0("SppsKO", "_", 1:4)) # 然后使用...轴标签的顺序，这里是按照原图的顺序来的 labels = c(paste0("WT", "_",1:3), paste0("PhoKO", "_", 1:3), paste0("SppsKO", "...关于ATAC-seq数据处理系列连载目录：第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同第2篇：原始数据的质控、比对和过滤第3篇：用MACS2软件call peaks 第4篇：对ATAC-Seq

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ReliableStudent | 减轻噪声伪标签的半监督3D目标检测方法，超越 KITTI 3D目标检测在点云水平！

半监督3D目标检测在标签数据有限的情况下可以从富有前景的伪标签技术中受益。然而，尽管近期方法通过基于置信度的过滤来提高伪标签质量，但它们忽略了训练过程中噪声伪标签的影响。...x轴上的 \mathrm{IoU_{FG}} 显示了 Proposal 相对于与 GT 值相关的伪标签的前景的IoU。（a）PV-RCNN Baseline 中的默认类别无关阈值。...总结来说，作者的主要贡献如下：作者深入研究了噪声伪标签对基于IoU的目标分配的影响。作者提出了一种类别感知的目标分配方法，以解决最近伪标签方法中存在的目标误分类问题。...考虑到存在噪声IoU，尽管实施了类特定的局部阈值，按照方程（1）进行的分配仍不可避免地会导致假阴性（FN）和假阳性（FP）错误的发生。...在背景区域，（a）部分沿y轴附近存在FN Proposal 。

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