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FunDA(14)- 示范:并行运算并行数据库读取 - parallel data loading

FunDA的并行数据库读取功能是指在多个线程中同时对多个独立的数据源进行读取。这些独立的数据源可以是在不同服务器上的数据库表,又或者把一个数据库表分成几个独立部分形成的独立数据源。...当然,并行读取的最终目的是提高程序的运算效率。在FunDA中具体的实现方式是对多个独立的数据流进行并行读取形成一个统一综合的数据流。我们还是用上次示范所产生的表AQMRPT作为样板数据。...val countiesP_ZStream = countyLoader.fda_typedStream(qryCountiesP_Z.result)(db_b)(64,64)() 然后对这四个数据源进行并行读取...同样,我们可以用两个自定义函数来运算这两种动作行: //user-task to catch States insert action rows and run them def runStateAction...processCounties) .appendTask(runStateAction) .appendTask(runCountyAction) .startRun 然后用startRun来正式运算这个程序

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Oracle 之 控制Oracle RAC 进行并行运算

RAC的一大优点就是可以跨节点进行并行计算,那么如何控制并行运算?这就是这篇文章要讨论的内容。...节点2多一个进程是因为它是并行查询的发起者,额外的会话是发起会话,也就是并行查询协调器(parallel query coordinator),其余的是并行从属进程。...RAC可以通过instance_groups和parallel_instance_group来灵活控制如何跨节点进行并行运算。 2. parallel_instance_group区分大小写。...1/3/4上执行 dwrac1.instance_groups='other' --不会启用并行 11 g 中: 11g 数据库中,并行会话默认使用的是 shared pool 用于并行执行时的消息缓冲区...slave 进程限制在发起并行 SQL 的会话所在的 节点,即避免跨节点并行产生大量的节点间数据交换和引起性能问题。

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生信小课堂(2) 并行运算那些事

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何在命令行终端执行并行运算,使用并行可以极大的提高效率充分利用机器的性能。并行运算的方式有很多,在此主要介绍「parallel」。...parallel是一个命令行工具,用于并行执行作业。它可以在单台机器上的多个核心或多台机器上并行执行命令。 ❞ 基本特性 1.并行执行:parallel可以并行执行命令,从而充分利用多核心CPU。...它允许用户为命令提供多个输入参数,并使命令并行地对每个输入参数执行一次。...❞ 生信中的并行应用 并行下载原始数据 cat sra_explorer_fastq_aspera_download.sh| parallel -j 6 --will-cite 并行解压缩 parallel.../rawdata/*.fastq ❝本节内容介绍到此结束过程仅供参考,关于并行运算还有很多的案例等着大家去探索;

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R语言多任务处理与并行运算包——foreach

但是实际上除了内的apply组函数之外,你还有另外一个更好地选择,就是利用一些支持并行运算的扩展包,来发挥本地计算机的多和计算优势。...包执行任务的核心理念与传统的apply组函数基本一致,都是与split – apply – combine一致的流程,不过foreach比传统apply组函数的优越之处在于,它可以通过调用操作系统的多核运行性能来执行并行任务...>% content(as="text",encoding="UTF-8") %>% fromJSON() %>% `[[`(9) } 2、执行多进程函数 方案1——使用%do%函数执行普通的向量运算...多个进程共享的系统环境 ) %dopar% GETPDF(i) stopCluster(cl) }) 用户 系统 流逝 0.08 0.01 2.18 方案2——使用%dopar%函数执行多进程的运算

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FunDA(15)- 示范:任务并行运算 - user task parallel execution

FunDA的并行运算施用就是对用户自定义函数的并行运算。原理上就是把一个输入流截分成多个输入流并行地输入到一个自定义函数的多个运行实例。...这些函数运行实例同时在各自不同的线程里同步运算直至耗尽所有输入。并行运算的具体函数实例数是用fs2-nondeterminism的算法根据CPU内核数、线程池配置和用户指定的最大运算实例数来决定的。...我们在这次示范里可以对比一下同样工作内容的并行运算和串形运算效率。在前面示范里我们获取了一个AQMRPT表。...我们想知道并行运算结果。...那么我们首先要把这个getIdsThenInsertAction转成一个并行运算函数FDAParTask: AQMRPTStream.toPar(getIdsThenInsertAction) FunDA

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FunDA(16)- 示范:整合并行运算 - total parallelism solution

在对上两篇讨论中我们介绍了并行运算的两种体现方式:并行构建数据源及并行运算用户自定义函数。我们分别对这两部分进行了示范。本篇我准备示范把这两种情况集成一体的并行运算模式。...这次介绍的数据源并行构建方式也与前面描述的有所不同:在前面讨论里我们预知需要从三个独立流来并行构建数据源。但如果我们有一个不知长度的数据流,它的每个元素代表不同的数据流,应该如何处理。...我们知道在AQMRPT表里有从1999年到2xxx年的空气质量测量数据,我们可以试着并行把按年份生成的数据流构建成一个数据源。...a stream from parallel sources val source = fda_par_source(parSource)(3) source是个FDAPipeLine,可以直接运算...下面我们把其它两个用户自定义函数转成并行运算函数后接到source后面: //the following is a process of composition of stream combinators

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提升R代码运算效率的11个实用方法——并行、效率

有许多种方法可以提升你的代码运算效率,但或许你更想了解运算效率能得到多大的提升。...本文将介绍几种适用于大数据领域的方法,包括简单的逻辑调整设计、并行处理和Rcpp的运用,利用这些方法你可以轻松地处理1亿行以上的数据集。...此时,运算速度的提升程度取决于条件状态中真值的比例。 本部分的测试将和case(2)部分进行比较,和预想的结果一致,该方法确实提升了运算效率。 ?...9.利用并行运算 并行运算的代码: ? 10.尽早地移除变量并恢复内存容量 在进行冗长的循环计算前,尽早地将不需要的变量移除掉。...在每次循环迭代运算结束时利用gc()函数恢复内存也可以提升运算速率。 11.利用内存较小的数据结构 data.table()是一个很好的例子,因为它可以减少数据的内存,这有助于加快运算速率。

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泛函编程(18)-泛函库设计-并行运算组件库

我们在这节讨论中从一个并行运算组件库的设计过程来介绍泛函组件库设计模式。     我们设计这个并行运算组件库的目的:可以把一个普通运算放到另外一个独立的线程(thread)中去运行。...这样我们可以同时把多个运算分别放到多个线程中同时运行从而达到并行运算的目的。...这样有两个优越:1、可以有更灵活的并行运算策略(有些已经确定很快完成的运算可能没有必要用新的线程,独立线程运算可能消耗更多的资源);2、独立线程机制和并行运算是松散耦合的:Par的实现中不需要了解线程管理机制...知道fork会为这个运算设定新的运行空间。注意还是返回Par[A] 因为我们追求的是线程机制和并行运算的松散耦合,那么我们就不会在Par里实际进行并行运算的运行,那么Par就只是对一个并行运算的描述。...我们下一节将会讨论如何通过一些算法函数来实现并行运算

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聊聊并行并行编程

并行编程主要聚焦于性能,生产率和通用性上。 所谓性能,更像是可扩展性以及效率。不再聚焦于单个CPU的性能,而是在于平均下来CPU的性能。...并行和并发有着小小的区别:并行意味着问题的每个分区有着完全独立的处理,而不会与其他分区进行通信。并发可能是指所有的一切事务, 这可能需要紧密的,以锁的形式或其他的互相通信的方式形成的相互依赖。...因为并行编程的相对较难,导致工程师的生产率不会太高,会聚焦于更精密的细节,花费大量的时间。...并行任务变得复杂不仅仅在于之上的原因,更因为: 1.对代码,对任务的分割,这会导致错误处理以及事件处理更为复杂。如果并行程序之间会牵扯到交互,通信的时间成本,共享资源的分配和更新更为复杂。...2.并行访问控制,单线程的应用程序可以对本实例中的所有资源具有访问权,例如内存中的数据结构,文件之类的。

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FunDA(11)- 数据库操作的并行运算:Parallel data processing

FunDA最重要的设计目标之一就是能够实现数据库操作的并行运算。我们先重温一下fs2是如何实现并行运算的。...品名:Believe 演唱:Justin Bieber 年份:2016 发行:Columbia Records Process finished with exit code 0 FunDA的另一个并行运算需求是并行对一长串数据元素进行一个函数的施用...我们同样可以把产生的ActionRow用并行的方法来运算: val runner = FDAActionRunner(slick.driver.H2Driver) //并行运算函数 def...others@ _ => fda_next(others) } } val runner = FDAActionRunner(slick.driver.H2Driver) //并行运算函数...(s1.toPar(updateYear))(3) //并行运算Action val s3 = fda_runPar(s2.toPar(runActions))(3) //开始运算 s3.appendTask

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数据并行和任务并行

OpenCL并行加减乘除示例——数据并行与任务并行 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载。...https://blog.csdn.net/zhouxuanyuye/article/details/79949409 OpenCL并行加减乘除示例——数据并行与任务并行 关键词:OpenCL; data...parallel; task parallel 数据并行化计算与任务并行化分解可以加快程序的运行速度。...这种办法对不同的数据使用相同的核函数,称为数据并行。 ? 图3....(task parallel) 另外还有一种就是任务并行化,可以使所有功能函数内部的语句并行执行,即任务并行化,如本文中的功能函数可以分解为“加减乘除”这四个任务,可以产生“加减乘除”四个核函数,让四个函数同时执行

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一、简单使用二、 并行循环的中断和跳出三、并行循环中为数组集合添加项四、返回集合运算结果含有局部变量的并行循环五、PLinq(Linq的并行计算)

Console.WriteLine(data[i]); }); DateTime dt2 = DateTime.Now; Console.WriteLine("并行运算...ShowProcessExecution) Console.WriteLine(i); }); DateTime dt2 = DateTime.Now; Console.WriteLine("并行运算...四、返回集合运算结果/含有局部变量的并行循环 使用循环的时候经常也会用到迭代,那么在并行循环中叫做 含有局部变量的循环 。下面的代码中详细的解释,这里就不啰嗦了。...五、PLinq(Linq的并行计算) 上面介绍完了For和ForEach的并行计算盛宴,微软也没忘记在Linq中加入并行计算。下面介绍Linq中的并行计算。...在ParallelEnumerable中提供的并行化的方法 ParallelEnumerable 运算符 说明 AsParallel() PLINQ 的入口点。指定如果可能,应并行化查询的其余部分。

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TPU中的指令并行和数据并行

高性能的多来自于并行,因此本文分别讨论了指令并行和数据并行的设计方法。...为了获得更高的性能,可以采用一系列的常规方法进行设计,包括 指令并行,即一次性处理更多指令,让所有执行单元高效运行 数据并行,即一次性处理多组数据,提高性能 后文会针对这两点做进一步描述,并简单讨论...根据指令流和数据流之间的对应关系,可以将处理器分为以下几个类别 SISD,单指令流单数据流,顺序执行指令,处理数据,可以应用指令并行方法 SIMD,单指令流多数据流,同一指令启动多组数据运算,可以用于开发数据级并行...MISD,多指令流单数据流,暂无商业实现 MIMD,多指令流多数据流,每个处理器用各种的指令对各自的数据进行操作,可以用在任务级并行上,也可用于数据级并行,比SIMD更灵活 由于TPU应用在规则的矩阵.../卷积计算中,在单个处理器内部的设计上,SIMD是数据并行的最优选择。

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C#并行与多线程——Parallel并行

并行Parallel 在Parallel下面有三个常用的方法invoke,For和ForEach。 先说下StopWatch,这个类主要用于测速,记录时间。...很直观的看出,使用Parallel.Invoke()之后,Run1和Run2是并行执行的,一共用时3s(3000ms左右),而直接运行Run1和Run2则耗时5s。...Parallel.For实际上是并行执行了循环,因为内部只是一个单纯的累加,因此效率差异明显,但是并非所有的场景都适合使用并行循环。 修改一下上面的方法。...."); } 改为操作一个全局变量的累加,这个时候由于并行请求,需要等待调用内存中的全局变量num,效率反而降低。...同样的,由于并行处理的原因,For的结果并不是按照原有顺序进行的: public void ParallelForCW() { Parallel.For(0, 100, i => { Console.Write

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