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Parsl-Python中的高效并行编程模块

之前qiime2的更新介绍中了解到了这个模块,这里再详细了解一下!哪天用起来呀!...Parsl是一个基于Python的开源(https://github.com/Parsl/parsl)并行编程库,使用户能够并行化 Python 程序并在各类计算资源(例如个人电脑、集群和超算集群)上扩展高效地运行它们...满足任务的依赖关系时,才会执行任务。 可扩展的 Jupyter notebook。轻松管理跨分布式资源的执行。...笔记本电脑到超级计算机Parsl 脚本独立于执行环境。可以在一个或多个执行资源上执行单个脚本,而无需修改脚本。...使用 Pip 安装 虽然pip可用于安装 Parsl,但我们建议使用以下方法许多 Python 环境可用时进行可靠安装。

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Linux 中高效编写 Bash 脚本的 10 个技巧

-- Aaron Kili 本文导航 -1、 脚本中多写注释08% -2、 运行失败时使脚本退出15% -3、 Bash 用未声明变量时使脚本退出21% -4、 使用双引号来引用变量26% -5、...# TecMint 是浏览各类 Linux 文章的最佳站点 2、 运行失败时使脚本退出 有时即使某些命令运行失败,bash 可能继续去执行脚本,这样就影响到脚本的其余部分(会最终导致逻辑错误)。...用下面的行的方式在遇到命令失败时来退出脚本执行: # 如果命令运行失败让脚本退出执行 set -o errexit # 或 set -e 3、 Bash 用未声明变量时使脚本退出 Bash 也可能会使用能导致起逻辑错误的未声明的变量...因此用下面行的方式去通知 bash 它尝试去用一个未声明变量时就退出脚本执行: # 若有用未设置的变量即让脚本退出执行 set -o nounset # 或 set -u 4、 使用双引号来引用变量...用时(使用一个变量的值)用双引号有助于防止由于空格导致单词分割开和由于识别和扩展了通配符而导致的不必要匹配。

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Linux中高效编写Bash脚本的10个技巧

# TecMint 是浏览各类 Linux 文章的最佳站点 2、 运行失败时使脚本退出 有时即使某些命令运行失败,bash 可能继续去执行脚本,这样就影响到脚本的其余部分(会最终导致逻辑错误)。...用下面的行的方式在遇到命令失败时来退出脚本执行: # 如果命令运行失败让脚本退出执行 set -o errexit # 或 set -e 3、 Bash 用未声明变量时使脚本退出 Bash 也可能会使用能导致起逻辑错误的未声明的变量...因此用下面行的方式去通知 bash 它尝试去用一个未声明变量时就退出脚本执行: # 若有用未设置的变量即让脚本退出执行 set -o nounset # 或 set -u 4、 使用双引号来引用变量...用时(使用一个变量的值)用双引号有助于防止由于空格导致单词分割开和由于识别和扩展了通配符而导致的不必要匹配。...在脚本中用双引号 5、 在脚本中使用函数 除了非常小的脚本(只有几行代码),总是记得用函数来使代码模块化使得脚本更可读和可重用。

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五分钟搞定Bash功能与使用技巧 转

BASH使用技巧 1重定向技巧 1.如果你编写了一个脚本实现自动修改系统帐号的密码,那么默认密码修改成功后系统会提示successfully这样的提示信息,如果需要修改20个账户密码则显示20条这样的信息...2.标准输出与错误输出分离重定向 很多时候自动运行的脚本编写完成后,是要在深夜服务器负载最低时以无人职守方式运行的,那么管理员去检查脚本运行情况时会希望看到哪些命令执行成功了,哪些命令出现了问题,并且为了方便管理需要将正确输出与错误输出分写保存在两个不同的记录文件中...其中[&]控制符使得命令开启一个子Shelll并在后台执行;使用[;]控制字符可以把多个命令组合,但多个命令之间没有任何逻辑上的关系,按循序执行;使用[&&]控制字符也可以将多个命令组合,但当前一个命令执行成功后才会执行...[&&]控制符后面的命令;[||]控制字符的作用与[&&]刚好相反,当前一个命令执行失败才会执行[||]控制符后面的命令。...所有命令按顺序执行(不管前面的命令是否成功,后面的命令一定正常执行): [root@centos6 ~]# ls /tmp ; ls /root ; ls /home 4.如果某个文件存在则显示该文件内容,否则报错(

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五分钟搞定Bash功能与使用技巧

BASH使用技巧 1、重定向技巧 1.如果你编写了一个脚本实现自动修改系统帐号的密码,那么默认密码修改成功后系统会提示successfully这样的提示信息,如果需要修改20个账户密码则显示20条这样的信息...2.标准输出与错误输出分离重定向 很多时候自动运行的脚本编写完成后,是要在深夜服务器负载最低时以无人职守方式运行的,那么管理员去检查脚本运行情况时会希望看到哪些命令执行成功了,哪些命令出现了问题,并且为了方便管理需要将正确输出与错误输出分写保存在两个不同的记录文件中...其中[&]控制符使得命令开启一个子Shelll并在后台执行;使用[;]控制字符可以把多个命令组合,但多个命令之间没有任何逻辑上的关系,按循序执行;使用[&&]控制字符也可以将多个命令组合,但当前一个命令执行成功后才会执行...[&&]控制符后面的命令;[||]控制字符的作用与[&&]刚好相反,当前一个命令执行失败才会执行[||]控制符后面的命令。...所有命令按顺序执行(不管前面的命令是否成功,后面的命令一定正常执行): [root@centos6 ~]# ls /tmp ; ls /root ; ls /home 4.如果某个文件存在则显示该文件内容,否则报错(

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五分钟搞定Bash功能与使用技巧

640.webp (2).jpg BASH使用技巧 1重定向技巧 1.如果你编写了一个脚本实现自动修改系统帐号的密码,那么默认密码修改成功后系统会提示successfully这样的提示信息,如果需要修改...640.webp (3).jpg 2.标准输出与错误输出分离重定向 很多时候自动运行的脚本编写完成后,是要在深夜服务器负载最低时以无人职守方式运行的,那么管理员去检查脚本运行情况时会希望看到哪些命令执行成功了...其中[&]控制符使得命令开启一个子Shelll并在后台执行;使用[;]控制字符可以把多个命令组合,但多个命令之间没有任何逻辑上的关系,按循序执行;使用[&&]控制字符也可以将多个命令组合,但当前一个命令执行成功后才会执行...[&&]控制符后面的命令;[||]控制字符的作用与[&&]刚好相反,当前一个命令执行失败才会执行[||]控制符后面的命令。...所有命令按顺序执行(不管前面的命令是否成功,后面的命令一定正常执行): [root@centos6 ~]# ls /tmp ; ls /root ; ls /home 4.如果某个文件存在则显示该文件内容,否则报错(

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五分钟搞定Bash功能与使用技巧

BASH使用技巧 1重定向技巧 1.如果你编写了一个脚本实现自动修改系统帐号的密码,那么默认密码修改成功后系统会提示successfully这样的提示信息,如果需要修改20个账户密码则显示20条这样的信息...2.标准输出与错误输出分离重定向 很多时候自动运行的脚本编写完成后,是要在深夜服务器负载最低时以无人职守方式运行的,那么管理员去检查脚本运行情况时会希望看到哪些命令执行成功了,哪些命令出现了问题,并且为了方便管理需要将正确输出与错误输出分写保存在两个不同的记录文件中...其中[&]控制符使得命令开启一个子Shelll并在后台执行;使用[;]控制字符可以把多个命令组合,但多个命令之间没有任何逻辑上的关系,按循序执行;使用[&&]控制字符也可以将多个命令组合,但当前一个命令执行成功后才会执行...[&&]控制符后面的命令;[||]控制字符的作用与[&&]刚好相反,当前一个命令执行失败才会执行[||]控制符后面的命令。...所有命令按顺序执行(不管前面的命令是否成功,后面的命令一定正常执行): [root@centos6 ~]# ls /tmp ; ls /root ; ls /home 4.如果某个文件存在则显示该文件内容,否则报错(

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一、事件函数的执行顺序(脚本的生命周期)

Editor Reset:调用Reset可以在脚本首次附加到对象时以及使用Reset命令时初始化脚本的属性。 在第一帧执行之前 Start:启动脚本实例后,才会在第一帧更新之前调用Start。  ...动画图中存在控制器组件(例如,AnimatorController、AnimatorOverrideController 或 AnimatorControllerPlayable)时才会发生此回。...动画图中存在控制器组件(例如,AnimatorController、AnimatorOverrideController 或 AnimatorControllerPlayable)时才会发生此回。...使用人形骨架时才会执行此事件。...动画图中存在控制器组件(例如,AnimatorController、AnimatorOverrideController 或 AnimatorControllerPlayable)时才会发生此回

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Linux-编写Shell的几个技巧

1 脚本中添加注释 2 运行失败时使脚本退出 3 Bash 用未声明变量时使脚本退出 4 使用双引号来引用变量 5 在脚本中使用函数 6 字符串比较时用 而不是 7 用 command 而不是老旧的...注释用 # 号来定义 ---- 2、 运行失败时使脚本退出 有时即使某些命令运行失败,bash 可能继续去执行脚本,这样就影响到脚本的其余部分(会最终导致逻辑错误)。.../test.sh: line 12: pwde: command not found ---- 3、 Bash 用未声明变量时使脚本退出 Bash 也可能会使用能导致起逻辑错误的未声明的变量。.../test.sh: line 12: VAR_NO_DEFINE: unbound variable ---- 4、 使用双引号来引用变量 用时(使用一个变量的值)用双引号有助于防止由于空格导致单词分割开和由于识别和扩展了通配符而导致的不必要匹配...除了非常小的脚本(只有几行代码),总是记得用函数来使代码模块化使得脚本更可读和可重用。

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

程序配套使用的一个网页插件 http://crysplot.crystalsolutions.eu/web_pages_yves3/vibration.html 这个网页插件是CRYSPLOT套件的一部分,使用时需要将...使用前准备 2.1 PyMOL程序的安装 由于PyVibMS需要依赖PyMOL程序才能使用,在还没有安装PyMOL的情况下,我们需要先安装PyMOL。...将PyMOL安装包下载到Linux之后,需要先解压。然后打开一个终端窗口,进入解压后得到的pymol文件夹,输入 chmod +x pymol ./pymol 就可以开启PyMOL程序了。...勾选了Displacement Vectors后,PyMOL的显示界面则会显示振动模式的矢量箭头,对应的拉杆可以调节矢量箭头的长短。...mode文件可以通过自写脚本的方式量子化学、第一性原理计算程序的振动分析结果里面提取相应的信息 来制作。下面以这个二氧化碳分子为例,介绍其文件格式。 #之后的文字为注释,在实际情况下不存在。

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让类进程脚本「单身」的方法

正文 flock 命令为脚本加锁 可以用flock命令为 Shell 脚本加锁。多个进程可能会执行同一个脚本,这些进程需要保证其它进程没有在操作,以免重复执行。...flock命令来为脚本加锁,如下命令: flock -xn -c -x : 获取一个排它锁,或者称为写入锁,为默认项 -n : 非阻塞模式,获取锁失败时,返回 1 而不是等待...编写一个测试脚本 test.sh #! /bin/bash echo "Hello World" sleep 1000 2. flock 命令给脚本加锁 flock -xn ....开启另外一个 bash 窗口运行同个的脚本 ? 另外一个 bash 窗口运行了同个脚本后,未获取到锁直接返回了,直到上一个脚本运行完毕,这个才可以开始正常运行。...局部静态对象单例模式实现 Single 使用的静态变量是一个「局部静态变量」,因此只有在 Single 的GetInstance()函数被调用时才会被创建,从而拥有了延迟初始化(Lazy)的效果,提高了程序的启动性能

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Node中的事件循环和异步API

主线程发起I/O调用时,I/O操作会被放在I/O线程来执行,主线程继续执行下面的任务,在I/O线程完成操作后会带着数据通知主线程发起回。...而每个阶段有自己的特殊之处,简单说,就是event loop进入某个阶段后,会执行该阶段特定的(任意)操作,然后才会执行这个阶段的队列里的回。...idle, prepare: 内部使用。 poll: 获取新的I/O事件;node会在适当条件下阻塞在这里。 check: 执行setImmediate()设定的回。...在进行系统调用时JS层传入的方法和参数都被封装在一个请求对象中,请求对象被放在线程池中等待执行。JS立即返回继续后续操作。...JS这种机制的一个典型的坏处,就是某个事件处理耗时过长时,后面的事件处理都会被延后,直到这个事件处理结束,在浏览器环境中运行时,可能会出现某个脚本运行时间过长,页面无响应的提示。

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Node 事件循环知多少

界面需要重绘或者由于某种操作引发回流时,将执行该线程。 该线程与 JS 引擎线程互斥,执行 JS 引擎线程时,GUI 渲染会被挂起,任务队列空闲时,主线程才会去执行 GUI 渲染。...当然,该线程与 GUI 渲染线程互斥, JS 引擎线程执行 JavaScript 脚本时间过长,将导致页面渲染的阻塞。...微任务队列空,宏任务队列里有只有一个 script 脚本(整体代码)。 全局上下文( script 标签)被推入执行栈,同步代码执行。...每当进入某一个阶段的时候,都会对应的回队列中取出函数去执行。队列为空或者执行的回函数数量到达系统设定的阈值,就会进入下一阶段。...但二者在异步 I/O callback 内部调用时,总是先执行 setImmediate,再执行 setTimeout,例如: const fs = require('fs') fs.readFile

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NSIS 打包脚本基础

在nsi脚本中函数分为两种:用户自定义函数和回函数。...用户自定义函数 用户自定义函数当是Call指令调用时才被执行,如果函数体中没有abort语句,则安装程序执行完了用户自定义函数,继续运行Call语句和指令。...如果指定了 /ifempty,则该注册表键它无子键时才会被删除(否则,整个注册表键将被删除)。有效的根键值在后面的 WriteRegStr 列出。... “INI文件” 的 “区段” 区段读取 “项” 的值并把该值输出到用户变量。如果该项未找到时会放置一个错误标记该用户变量被赋为空值。...nsi脚本常常使用相对跳转表示条件分枝,其语法是[+-][1-9],加号表示当前位置往前跳转,减号则表示当前位置往后跳转。数字表示跳转的语句条数。

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【科研利器】slurm作业调度系统(二)

其中我们需要关注的主要是 state 和 partition ,若 state 中显示 idle 表示节点处于空闲状态,可接收新的作业;显示 allocated 表示节点已经分配了一个或者多个作业所有核心用满...一个 slurm脚本可设置很多内容,比如作业要提交到的分区、运行的最大时长等。以下给出一个常用的模板: #!...来执行脚本。...以上的所有 #SBATCH 属性均可以不设置,缺少某属性时,系统将使用默认值。在这里说一句题外话,请大家在使用时估计自己任务的开销,适量申请计算资源,避免造成资源的浪费,毕竟这都是花钱买来的!...3 提交任务 将slurm脚本编写完毕并上传超算后(或直接在超算编辑),进入 slurm脚本的目录,使用如下命令完成脚本(test.slurm)的提交。

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渗透测试-编程-1

Bash脚本 Bash脚本(程序)可以单批次地执行数条计算机命令。Bash脚本又称作shell脚本,是一种由多条终端命令构成的脚本程序。所有可以直接在终端界面里运行的命令,都可以通过脚本来执行。...2.脚本编程 现在写一个对整个网段进行ping扫描的Bash脚本程序。大多数的计算机程序都能通过帮助信息来完成一个程序的使用方法。因此首先完成程序的提示功能。 #!...通过if语句,脚本程序就能够在特定条件下显示帮助信息。 脚本程序首先判断命令行的第一个参数(1)是否为空(null)。符号$1代表命令行传给Bash脚本程序的第一个参数。双等号(==)是逻辑符号。...if条件判断表达式的值为真(true)时----就程序而言,命令行传入的第一个参数为空时---程序将执行介于then语句和fi语句(if的反写)语句(3)之间的全部命令. 5.for循环...在这种情况下,for循环语句(2)就符合需要,程序中的“for x in seq 1 254; do” 可以让脚本程序把x变量1逐次迭代到254,与此同时它还会执行254次循环体。

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