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阿榜生信笔记2

+函数名查看帮助文档,这相当于我们会查R语言字典了 四、对两向量进行操作 ①、比较运算: #####2.3.对两向量进行操作##### x = c(1,3,5,1) y = c(3,2,5,6)...两者联系:当我们需要把几个字符串(或者变量)拼接成一字符串,可以使用R语言中paste和paste0函数来完成,两者区别在于是否使用分隔符。...⑤、循环补齐 #向量长度不一致 x = c(1,3,5,6,2) y = c(3,2,5) x == y  提个小问题:x有五元素,y有三元素,两者长度不相等,为什么最后输出了5值?...五、向量筛选(取子集) #####2.4.向量筛选(取子集)##### x <- 8:12 #根据逻辑值取子集 x[x == 10] x[x < 12] x[x %in% c(9,13)] #根据位置子集...x[4] x[2:4] x[c(1,5)] x[-4] x[-(2:4)] ①、根据逻辑值取子集 ②、根据位置子集 金句来了哦,大家多看看理解它: 六、向量修改 ####2.5.修改向量某个/

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理解谱聚类

在要处理经验数据几乎所有科学领域,我们需要通过鉴别数据中相似的样本所构成分组来建立对数据直观映像。...图论中基本概念 图是离散数学和数据结构中概念。一图由顶点和边构成,任意两节点之间可能都有边进行连接。边可以带有值信息,称为权重,例如两点之间距离。下图是一简单图 ?...切图权重可以看作两个子图之间关联程度,如果两个子图之间没有边连接,则该值为0。从另一角度看,这是对图进行切割去掉权重之和。 下图为图切割示意图 ?...无论是哪种方式,建立两连接之后,边权重设置为两点之间相似度。 全连接图。简单为所有的节点对之间建立起边,边权重为Sij。...RatioCut与NCut 前面说过,需要对图切割代价函数进行归一化。第一种方法是用图顶点数进行归一化,由此得到优化目标为: ? 其中|Vi|为子集元素数,称为RatioCut。

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机器学习模型特征选择第一部分:启发式搜索

特征选择能够改善你机器学习模型。在这个系列中,我简单介绍你需要了解特征选择全部内容。本文为第一部分,我将讨论为什么特征选择很重要,以及为什么它实际上是一非常难以解决问题。...我们应该总是努力使我们模型更容易工作。聚焦于那些噪声信号特征,我们将有一更具鲁棒性模型。 为什么这是一难题? 我们从一例子开始。...第一向量看起来像这样: ? 正如我们所看到,当我们使用第一属性我们提出了68%精度。这比我们使用所有属性精度62%要高得多。现在我们试着只使用第二属性: ?...我们需要为每一组合进行模型验证。如果我们使用10折交叉验证,我们需要训练10,230模型。对好计算机来说这仍然是可行。...因此,这些算法根本不去寻找更高山丘。他们只拿走他们可以轻易得到东西。这正是我们称之为“贪心”算法原因。而他们停止改进,他们停留在最高山顶上只有很小可能性。

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R2向量

快捷键ctrl+enter(mac:command+enter) #向量生成,对单个/两向量进行操作,取子集,元素修改。...传入参数无法转换为所需类型,as.complex函数会返回NA(缺失值),而as.numeric函数则会报错。...因此,需要将字符串表示复数转换为复数类型,应使用as.complex函数;而对于其他类型数据,应使用as.numeric函数。 #3 #####2.1.向量生成?...总之,paste()和paste0()函数主要区别在于是否添加分隔符。 #向量长度不一致,循环补齐(向量长度不相等+等位运算),简化代码。...1和5,而1,5啥也不是 ## [1] 8 12 x[-4]#去掉第四位置 ## [1] 8 9 10 12 x[-(2:4)]#去掉234位置 ## [1] 8 12 ####2.5.修改向量某个

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Day02 生信马拉松-vector

总结来说,paste和paste0主要区别在于,paste在连接字符串默认使用空格作为分隔符,而paste0则直接将字符串连接在一起,不使用任何分隔符。...)) 3.向量运算 3.1 单个向量简单数学计算 e.p:x+1,log(x),sqrt(x) 3.2 单个向量初级统计 max(x)最大值 min(x)最小值 mean(x)均值 median(x...数学计算 x + y 3.5.3 连接 paste(x,y,sep=",") 分隔符为"," 以上均为等位运算,向量长度不一致时会自动发生循环补齐 3.5.4 交集 intersect(x,...y中存在吗—谁在前对谁负责 y %in% x #y每个元素在x中存在吗 3.6 向量筛选(取子集) 3.6.1 根据逻辑值取子集 x[x == 10] #[]将TRUE对应值挑选出来,FALSE丢弃...,[]里是与x等长且一一对应逻辑值向量 x[x < 12] x[x %in% c(9,13)] 3.6.2 根据位置值取子集 x[4] #[]中为数字表示从向量位置子集,[]中是由x下标组成向量

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这就是深度学习如此强大原因

来源:数学中国本文约2200字,建议阅读9分钟有适当神经网络架构以及足够大数据,深度学习网络可以学习从一向量空间到另一向量空间任何映射。...一简单 sin(x) 函数是从角空间(-180° 到 180° 或 0° 到 360°)映射到实数空间(-1 到 1)。 让我们看看为什么神经网络被认为是通用函数逼近器。...)之间误差函数; 梯度下降是用于收敛到最优函数算法;决定学习率变得具有挑战性,因为当我们远离最优我们想要更快地走向最优,而当我们接近最优我们想要慢一些,以确保我们收敛到最优和全局最小值; 大量隐藏层需要处理梯度消失问题...使用 CPU 进行并行处理不足以计算数百万或数十亿权重(也称为 DL 参数)。神经网络需要学习需要向量(或张量)乘法权重。这就是 GPU 派上用场地方,因为它们可以非常快速地进行并行向量乘法。...通过使用适当神经网络架构(层数、神经元数量、非线性函数等)以及足够大数据,深度学习网络可以学习从一向量空间到另一向量空间任何映射。这就是让深度学习成为任何机器学习任务强大工具原因。

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2023.4生信马拉松day2-数据类型

;x (x <- c(1,3,5,1)) -(2)简单数学计算 #(2)简单数学计算 x+1 log(x) sqrt(x) -(3)根据某条件进行判断,生成逻辑型向量 #(3)根据某条件进行判断,生成逻辑型向量...decreasing = T) 8.对两向量进行操作 x = c(1,3,5,1) y = c(3,2,5,6) #(1)比较运算,生成等长逻辑向量 x == y y == x #以上两行返回结果完全一致...y,sep = "") paste(x,y,sep = ",") #区别在于paste0默认连接方式为无缝连接,没有sep这个参数;paste默认连接方式为空格,有sep这个参数; #向量长度不一致...y里所有的元素比一遍; 9.向量筛选(取子集) x <- 8:12 #根据逻辑值取子集 x[x == 10] x[x < 12] x[x %in% c(9,13)] #根据位置子集 x[4] x[2:...简单向量作图 k1 = rnorm(12);k1 k2 = rep(c("a","b","c","d"),each = 3);k2 plot(k1) # plot()默认以下标作为横坐标,以输入向量为纵坐标进行画图

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R语言-基础+向量

"b","c"),1:3)#默认元素连接为sep=""## [1] "a1" "b2" "c3"https://www.jianshu.com/p/44e3de9b7a812.对单个向量进行操作#(1...x = c(1,3,5,1)y = c(3,2,5,6)#(1)比较运算,生成等长逻辑向量x == y y == x#(2)数学计算x + y#(3)连接paste(x,y,sep=",")#向量长度不一致...x %in% c(9,13)]#根据位置子集x[4]x[2:4]x[c(1,5)]x[-4]x[-(2:4)] #-表示删掉元素- 表示删掉元素,与python区分总结:按照逻辑值:中括号里是与x等长且一一对应逻辑值向量按照位置...:中括号里是由x下标组成向量按条件挑选某个向量中两种类型子集x为向量 y为条件x[x%in%y]5.修改向量某个/某些元素:取子集+赋值#改一元素x[4] <- 40x#改多个元素x[c(1,5...)] <- c(80,20)x变量修改需要赋值操作6.简单向量作图k1 = rnorm(12);k1k2 = rep(c("a","b","c","d"),each = 3);k2 #each和times

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 01 数据结构之向量

") #sep表示分隔符号 paste(x,y,sep = ",") #向量长度不一致 x = c(1,3,5,6,2) y = c(3,2,5) x == y # 啊!...#循环补齐 #利用循环补齐简化代码 paste0(rep("x",3),1:3) paste0("x",1:3) #paste0中连接是两向量,'X'可以看做是只有一元素X向量 #(4)交集...中存在吗 图片 图片 向量筛选(取子集) [ ] :将TRUE对应值挑选出来,FALSE丢弃或者是一有x下标组成向量 x <- 8:12 #根据逻辑值取子集 x[x==10] #被取子集向量在外面...,[]内部为选取条件 x[x<12] x[x %in% c(9,13)] #根据位置子集 #向量元素存在下标,从左到右表示元素位置 x[4] x[2:4] x[c(1,5)] x[-4] #去掉第四元素...是给逻辑值运用 图片 图片 修改向量某个/某些元素:取子集+赋值 #改一元素 x[4] <- 40 x #改多个元素 x[c(1,5)] <- c(80,20) x 简单向量作图 k1 = rnorm

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R语言笔记-1

,to=4,by=2) #向量中数字随机生成 rnorm(n=3) #向量之间组合 paste0(rep("a",3),1:3) 输出结果: 图片 #向量简单计算 x = c(1,2,3,4) x...#从大到小排序 输出结果: 图片 #向量子集 x <- 8:12 #根据逻辑值取子集 x[x==10] x[x<12] x[x %in% c(9,13)] #根据位置子集 x[4] x[2:4]...x[c(1,5)] x[-4] x[-(2:4)] #改一元素 x[4] <- 40 x #改多个元素 x[c(1,5)] <- c(80,20) x 输出结果: 图片 向量位置从1开始,而不是从0...开始 x[-4]表示向量除了第4位置其他元素 任何操作需要赋值才能修改变量 向量之间操作 #向量之间运算 x = c(1,2,3,4) y = c(1,3,2,1) x + y #直接进行数学计算...x == y #比较运算可以生成逻辑值 paste(x,y,sep=",") #连接向量,以","作为连接符 paste0(x,y) #paste0()不需要连接符,直接连接向量 输出结果:

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【生信技能树培训笔记】R语言基础(20230112更新)

可以是1或多个向量其为1向量,其作用相当于函数as.character()sep 多个向量连接,指定各元素之间连接符号,paste默认为空格,paste0固定为空(即元素之间没有连接符号,...紧密连接)collapse 非单元素向量连接,将生成多个元素合并成1元素,并指定多元素间合并连接符号举例:> paste0(rep('x',times=3),1:3)[1] "x1" "x2...(1,15,2)+1)c(1:7) #先将8奇数变成偶数,再取出其中7> 1 2 4 6 8 10 12 14Tips:向量只允许一种数据类型存在,出现不同类型数据,会自动根据下图优先顺序进行转换...连接> paste(x,y,sep=",")[1] "1,3" "3,2" "5,5" "1,6"paste与paste0区别见前文“本节函数”循环补齐 向量长度不一致,会通过循环补齐方式对照较长那个向量补齐运算...==与%in%区别图片向量长度不等,==会发生循环补齐;而%in%不适用。==是元素对应位置比较,有顺序影响,%in%前后两向量中所有元素都会互相比较,没有顺序影响。

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R语言学习day2

(x,decreasing = F) #按照递增方式排列 [1] 1 1 3 5 > sort(x,decreasing = T) #按照递减方式排列 [1] 5 3 1 1 对两向量进行操作...按照逻辑值取子集,[]里代表逻辑,会生成一系列逻辑值,根据逻辑值对应元素取子集向量 > x <- 8:12 > x[x == 10] ##在x向量里取 x == 10子集 [1] 10 >...x[x < 12] ##在x向量里取 x < 12子集 [1] 8 9 10 11 > x %in% c(9,13) # 在x向量里,每一元素是否和c向量里有对应逻辑值 [1] FALSE...根据位置子集, []里代表位置,根据位置判断逻辑值,再根据逻辑值,取子集向量 > x <- 8:12 > x[4] #单独位置可以直接写 [1] 11 > x[2:4] #连续位置可以直接用冒号连接...[1] 9 10 11 > x[c(1,5)] #取两不连续位置时候,要写成向量集合,他是两个位置组成向量 [1] 8 12 > x[-4] #- 是反选 [1] 8 9 10

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用Python实现神经网络(附完整代码)!

因此,在一以四维向量为输入、有5神经元连接神经网络中,一共有20权重(5神经元各连接4权重)。...函数 表示实际结果向量, 表示该向量第 个位置值, , 是倒数第二层第 节点和输出第 节点输出,连接这两节点权重为 ,误差代价函数对 求导结果相当于用 (学习率)乘以前一层输出再乘以后一层代价函数导数...在小批量学习中,会传入训练集子集,并按照批量学习中误差聚合方法对这个子集对应误差进行聚合。然后对每个子集按批将其误差进行反向传播并更新权重。...我们可以快速计算一下:10神经元,每个神经元有3权重,其中有两是输入向量权重(输入向量每个值对应一权重),还有一是偏置对应权重,所以一共有30权重需要学习。...网络一遍又一遍地学习这个小数据集,它终于弄明白了这是怎么回事。它从样本中“学会”了什么是异或!这就是神经网络神奇之处。

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三、数据结构:向量

四、对两向量进行操作 > x = c(1,3,5,1) > y = c(3,2,5,6) 4.1 比较运算,生成等长逻辑向量 > x == y [1] FALSE FALSE TRUE...#循环补齐 #利用循环补齐简化代码 就是x和y不一样长,发生循环补齐。...10 12 > x[-(2:4)] [1] 8 12 按照逻辑值取向量:中括号里是与x等长且一一对应逻辑值向量; 按照位置向量:中括号里是由x下标组成向量。...13颜色赋值给x,“蓝色”和“绿色”赋值给y 图片 六、修改向量某个/某些元素:取子集+赋值 > x [1] 8 9 10 11 12 R语言里所有修改都要经过赋值,没有赋值就相当于没有发生过...80,把第二元素改成20 > x [1] 80 9 10 40 20 七、简单向量作图 k1 = rnorm(12);k1 k2 = rep(c("a","b","c","d"),each =

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学界 | 港中文AAAI录用论文详解:ST-GCN时空图卷积网络模型

如图 3 所示,在每个扫描中心位置像素附近,抽取一与权重矩阵大小相同像素矩阵,将这些像素上特征向量按空间顺序拼接并与卷积核参数向量做内积以得到该位置卷积输出值。...这就使得我们我们很难确定: 1)需要使用卷积核参数维度;2)如果排列权重矩阵与邻域内节点以进行内积运算。...这使得: 1)卷积核参数可以确定为一固定长度向量;2)不需要考虑邻域内节点顺序。这个设计使得 GCN 可以在任意连接关系图上使用,并在一些任务,如网络分析和半监督学习中取得了较好性能。...这种划分规则将节点 1 邻域划分为 3 个子集,第一子集为节点本身,第二为空间位置上比本节点更靠近整个骨架重心邻节点集合,第三则为更远离重心邻节点集合。...我们将所有时序卷积操作转为时空图卷积操作,每一卷积层输出是一时空图,图上每一节点保有一特征向量。最终,我们合并所有节点上特征并使用线性分类层进行动作分类。

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R基础(二)

数据结构:向量,数据框,矩阵,列表 数据框中一列只能是一种数据类型,一列是一向量向量只能有一种数据类型,可以有重复值。...y中每个元素一对一比较,%in%是将x中每一元素分别和y中所有元素全部比较 命令提示符 " > " 中括号取子集, 按照逻辑值:元素 和 括号中逻辑值向量需要一一对应 按照位置:中括号里是由下标位置组成向量...#排序,默认从小到大 1 1 1 3 5 sort(x,decreasing = F) 1 1 1 3 5 sort(x,decreasing = T) 1 5 3 1 1 #####2.3.对两向量进行操作...#循环补齐:等位运算,两向量长度不一样,会循环短向量 a = c(3,2,5) b = c(2,2,2,2,2,2,2,2,9) a==b 1 FALSE TRUE FALSE FALSE..."55" "16" paste(x,y,sep = "") 1 "13" "32" "55" "16" paste(x,y,sep = ",") 1 "1,3" "3,2" "5,5" "1,6" #向量长度不一致

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R语言入门-02:向量

(n=3)[1] "x" "x" "x"[1] 3 6 9 12 15 18 21[1] -0.8970375 1.3205699 0.22382112.2 对单个向量进行操作(1) 赋值给一变量名...TRUE TRUE TRUE FALSE> table(x) #重复值统计x1 3 5 2 1 1 [1] 1 1 3 5[1] 1 1 3 5[1] 5 3 1 1#打开帮助文档2.3 对两向量进行操作...% y 和 x==y 区别# %in% 是x每一元素和y每一元素逐一比较;x、y元素长短不一,根据x元素输出相应逻辑值# x==y 是x中每一元素与y中对应位置元素相比较;...x、y元素长短不一,短元素发生循环补齐,根据长元素个数输出逻辑值----# !!!...12----#按照逻辑值:中括号里是与x相等且一一对应逻辑值向量#按照位置:中括号里是由x下标组成向量----2.5.修改向量某个/某些元素:取子集+赋值修改一元素xx[4] <- 40x[

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变分自编码器如何淘汰经典推荐系统

我们场景中,一项目的交互次数并不影响它最终被推荐可能性,这意味着涉及到新项目我们不存在冷启动问题。 「实现简单」:如上图所示,使用几行伪代码,算法相当简单。...在不进行预处理情况下,每次要求系统向用户推荐新内容,它都必须找到与用户交互每个项目最接近k项目。...「仅项目具有足够特征才有效」:如结果所示,如果项目没有足够特征,则此操作不起作用。例如如果有电影情节描述,我们会有更好结果。...「查询时间是O(#items)」:此方法问题之一是,对于给定用户,我们需要解析所有项目。项目数量增加,这可能会成为一可伸缩性问题。...它将有一采样层,而不是简单连接层。这一层将使用从编码器最后一层均值和方差得到一高斯样本,并使用它作为输入解码器。跟AE一样,我们在第一层使用dropout。 ?

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