大数据文摘出品 编译：睡不着的iris、陈同学、YYY 不知道如何在地图上可视化网络图？下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。...nodes$weight = degree(g) 现在我们定义一个通用的ggplot2 的主题（在ggplot中设置及美化图形的一个工具）来展示地图 （无坐标轴和网格线）： maptheme <- theme...除了世界地图（country_shapes）中的国家多边形以外，我们还需创建三个几何对象：使用geom_point将节点绘制为点，使用geom_text为节点添加标签；使用geom_curve将节点之间的边绘制成曲线...据我所知在ggplot2中控制线宽只能通过“size“来实现。 使用ggplot2，我们只需决定要调整哪一个几何对象的大小。...在仅显示地图的某些细节，或者对边的定位点添加一些抖动时，这种方法可能会很有用。 完整的R脚本可参阅github上的gist。
一、简介 上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则，为了生成各种复杂的叠加图层，需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则，本文便就常见的基础几何图形进行说明； 二、各基础图形 2.1...abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...x轴，则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library(ggplot2) p <- ggplot...~variable) p 2.5 density()与density2d() 很多时候当我们获取的数据集样本数量足够时，通常我们可以绘制密度估计图来大致描述数据集数据的分布，ggplot2中当然提供了这类方法...() 小提琴图是一种功能和箱线图类似，但增加了核密度估计功能的图形，且更为美观，ggplot2可以绘制出与seaborn中的小提琴图同样优美的图形，因为涉及的内容比较复杂，我准备在之后单独开一篇来介绍
然而，用coord\_polar()或偶尔发现的ggplot2中的coord\_radar()构建它们可能很难。...映射您的数据和绘图需求，使其最终成为圆环。作为一个额外的好处，我还发现它的构建/加载速度更快。对我来说很重要，因为我让它们在 Shiny Apps 中交互。 我在示例中使用了 mtcars 数据。...该图显示了集合中的 12 辆汽车： 背景中的气缸。4、6 和 8 缸的浅色、中色和深色。 用蓝色标出每辆车每加仑的里数。 这篇文章是逐步展示如何将所需的元素添加到圆形图中。...# 数据点 rotate_data 我想展示绘图范围数据，所以我伪造了一系列 qsec 数据。基本上，您为每辆车（标签）上的 qsec 生成一个具有多个值（行）的数据框。...圆形网格线是通过多次调用 circle 并将所有点存储在数据框中来构建的。
这个是很长时间之前写的内容了，忘记了有没有在公众号发过，正好有人在公众号留言问这个环形的柱形图应该如何实现，就想到了这篇笔记，在公众号发一下 一下是笔记的内容 偶然间找到了一份教程利用ggplot2绘制环状柱形图...，个人感觉非常适合用来展示叶绿体基因组蛋白编码基因的dn/ds值，因为不仅能够通过柱状图的高低来比较dn/ds值的大小，还能够通过环状展示蛋白编码基因在叶绿体基因组上所处的位置 A circular barplot...Rplot05.png 环状图中间搞成空心，看起来好像美观一点 p+ylim(-100,120)+coord_polar() #添加标签 p+coord_polar()+ylim(-100,120)+...Rplot07.png 标签看起来有些乱，自己没有想到解决办法，模仿教程中的解决办法：为参数hjust和angle赋予数据来调控标签的位置 df$angle<-96-df$id*6 ggplot(df,...Rplot09.png 叶绿体基因组通常是典型的四部分结构，如何把上图改成四部分然后添加四种不同的颜色，原教程提供的解决办法是添加缺失值，画图时就会出现空白的部分从而达到分割的目的 df1<-data.frame
# 填充颜色和在头部添加标签 # 使用geom_text p1 <- p + geom_col(fill = "#0073C2FF") + geom_text(aes(label = len), vjust...= -0.3) # 在条图内部添加标签 p2 <- p + geom_col(fill = "#0073C2FF")+ geom_text(aes(label = len), vjust = 1.6...# 添加标签 p5 + geom_text( # lebel为len， aes(label = len, group = supp), # 位置需要与p5的位置0.8保持一致，这样才能一一对应...) 垂直区间 geom_pointrange()中间有一点的误差bar 代码 rm(list = ls()) #需要的包 library(tidyverse) library(ggplot2) library...# 水平误差线 # 这里的使用的x来计算最大值和最小值 # 同时x和y互换 dataset_summary %>% ggplot(aes( x = len, y = dose, xmin =
标签绘制 library(ggplot2) head(mtcars) p <- ggplot(mtcars,aes(wt,mpg,label=rownames(mtcars))) p+geom_text...() #使用geom_text绘制标签散点图 使用geom_label绘制标签散点图 p+geom_label() 绘制点，并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移 p+geom_point(...(x=4,y=40),label='y==1.2+x^2',parse = TRUE,size=7) #如果parse=FAKSE,图形上显示的就直接是y == 1.2 + x^2，而不是图上的公式。...图例绘制 2.1 guide_legend函数（主要参数：color, shape, size） 图例调整函数也属于标度函数的一类，但不可以直接使用加号来连接，必须放在函数中，作为一个参数。...在theme函数中，与图例有关的主要参数有： 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例的边缘范围
Geom_text（）将文本直接添加到绘图中。 geom_label（）在文本后面绘制一个矩形，使其更易于阅读。...image 添加映射 p + geom_text(aes(colour = factor(cyl))) ?...image 可以通过设置parse = TRUE来显示表达式。themama中描述了显示的详细信息，但请注意geom_text使用字符串，而不是表达式。...image 添加一个注释 p +geom_text() +annotate("text", label = "plot mpg vs. wt", x = 2, y = 15, size = 8, colour...", "b") ) ggplot2不知道你想给标签赋予相同的虚拟宽度 ggplot(data = df, aes(x, y, group = grp)) + geom_col(aes(fill =
Figure2B，论文里没有提供这个图的代码，可以尝试用ggplot2模仿一下 image.png 当然这个图用ppt很容易实现。...用ggplot2来做会稍微繁琐一点，但是后续多图组合会方便很多 流程图就是文本和箭头的组合，可以借助geom_text()函数和geom_segment()函数来做 首先是文本标签 library(ggplot2...fill="#547e34", size=5, label.size = 0) image.png 这里有个问题是背景颜色条和文本的宽度是一致的...，如何单独调整背景的颜色条的宽度暂时想不到办法了，我的办法是给文本前后加空格 https://stackoverflow.com/questions/48195587/how-to-set-a-standard-label-size-in-ggplots-geom-label...这个链接里重新自己定义了一个函数，关于自己写ggplot2的绘图函数我还看不明白 添加箭头 ggplot()+ geom_label(aes(x=0,y=0),label=" VE ",
ggtext的geom_richtext可以使用Markdown或者html语法来拓展ggplot2的文字图层geom_label用法。...最近在使用ggtext时，有一个需要geom_text的效果的需求，但是ggtext的图层效果都是类似于geom_label的，要想使用geom_text效果可以通过参数设置来实现。...fill、color还可以映射变量，和普通的ggplot2的geom_label类似，如果需要可以在aes函数中定义它。但是如果是映射的常量，则需要在aes函数外定义。...这里的上标使用的^字符，也可以html的sup标签。 至于上面的例子中特地提到换行和空格，是因为他们配合R中的无穷量Inf，可以实现一个相对优雅的固定排版布局。...PS：为了显示label的大小，注释文本添加了一个蓝色的边框。
饼图通过将一个圆饼按照分类的占比划分成多个切片，整个圆饼代表数据的总量，每个切片（圆弧）表示该分类占总体的比例，所有切片（圆弧）的加和等于100%。 下面会介绍两种在R中实现饼图的方法。...，labels可添加标签。...这里做了两种类型的标签，下面两图就是根据不同标签绘制的。labs包含了百分比和名字，中间用\n来分行；lab则只包含百分位数。...ggplot2 包绘制饼图 使用R中ggplot2包的geom_bar()函数绘制堆积柱形图，然后将直角坐标系转换成极坐标系，就可以显示为饼图，但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。...但是可以看到：由于缺乏饼图与数据标签之间的引导线，总感觉美观度不够，所以推荐使用graphics包的pie()函数绘制饼图。 代码以及资料存在我的github上，可见文末原文链接。
ggplot2是R语言最为强大的作图软件包，有着自成一派的可视化理念，数据可视化是数据分析的重要一步，让我们通过由浅入深的掌握数据可视化的精髓。...、geom_hline、geom_vline画直线 下面我们来在这张画布上画一条横线： > ggplot() + geom_hline(yintercept = 5) 我们也可以画一条竖线 > ggplot...ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point(aes(colour="red")) 接着上面划线一节，我们在已经画了点的画布上再画一条斜线：一条斜率为1，截距为1的直线，也就是...= 1, intercept = 1) 请尊重原创，转载请注明来源网站www.shareditor.com以及原始链接地址 使用geom_bar来画直方图 直观上看，直方图是表达一种累积量，因此默认的直方图的高度是...aes(x)) + geom_bar(aes(weight=y)) > ggplot(data, aes(x,y)) + geom_bar(stat = "identity") 如果我们想要把多种取值的统计数目累加显示在柱状图上
此外，图形中还可能包含数据的统计变换（statistical transformation，缩写stats），最后绘制在某个特定的坐标系（coordinate system，缩写coord）中，而分面（...除此之外，ggplot2提供了众多几何对象geom_xyz()供大家选择，完整的几何对象可以下载RStudio公司总结的ggplot2 cheetsheet。...#element_text()设置基于文本的组件 legend.title = element_blank())+ #不显示legend标题 geom_text...(aes(label = value), position = position_stack(vjust = 0.5),size=5) #vjust=0.5在堆叠柱子的中间位置添加文字...四、玫瑰图 然而，当我们的数据不是代表个体占总体的百分比，而是强调数据大小的对比时，可以用玫瑰图来展示，根据上面的代码做简单的修改即可。
我在网络上查了一下，比较少看到关于 coord_polar() 原理的介绍，只是在 ggplot2 的 Tidyverse 上发现了几个例子。...饼图中添加文字的位置控制 - 借助公式 绘制饼图的过程中，利用 ggplot2 的 geom_bar 结合 coord_polar 实现。...，不过从图片显示坐标中可以看到，"A" 在前，而 "A" 在原始数据 dat$Num 中对应的数据也在前 90，这样计算位置就会发生改变了，这时候 "A" 文字应该对应 90-90/2，文字 "B" 将对应...(aes(x=1.2,y=cumsum(dat$Num)-dat$Num/2 ,label=as.character(dat[,2])),size=3) p_pie 总结可知：ggplot2 在画饼图的过程中设定填充的因子方向总和图片坐标中的方向相反...饼图中添加文字的位置控制（借助公式）部分的内容主要参考了 Daitoue 在 OmicsClass 的一篇文章（详见参考资料），OmicsClass 上还给出了不借助公式在饼图中添加文字的位置控制，感兴趣的同学也已点击文章左下角
R语言绘制数据动图 随着互联网+和大数据科技的发展，VFX可视化和数据可视化越来越受到人们的喜爱，在R语言中，绘制GIF动图主要是在gganimate包中运行，制作视频主要是在av包,gganimate...是图形语法的扩展，由ggplot2包实现，它增加了对使用ggplot2用户熟悉的API声明动画的支持 01 加载包 library(av) library(ggplot2) library(gganimate...小结 得到这个动画主要是添加了一种类型的转换。转换是解释情节数据的函数，以便以某种方式将其分配到多个帧上。...gganimate通过为每个帧提供一组变量来解决这个问题，这些变量可以使用glue语法插入到plot标签中。 Enter and Exit：输入Enter和exit函数。...这些函数负责修改出现(进入)和消失(退出)数据的状态，以便动画可以在新状态和新状态之间进行转换。
： 缺失值是无法进行比较运算的，很多函数都有参数na.rm选项来移除缺失值，如下所示： 可以使用函数na.omit()来移除变量中缺失值或矩阵、数据框含有缺失值的行，如下所示： ②日期值 在R中，...例如：col=c("red","blue")需要绘制三条线，那么三条颜色分别为red、blue、red col.axis：坐标轴刻度文字的颜色，不是坐标轴的颜色 col.lab：坐标轴标签(名称)的颜色...，这里选择了回归的方法，则显示回归曲线，作图结果如下所示： 可以看出，ggplot通过mapping=aes()来映射图形属性，通过“+”来添加图层，使用数据框作为输入数据。...⑵直方图 在ggplot2中，geom_histogram()可以在图层上添加直方图，stat_density()可以在图层上添加密度曲线，我们使用ggplot内置的示例数据mpg做直方图，如下所示：...，geom_text()添加文本内容，作图结果如下：
最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签（还有图例）。 接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...在上述例子中，geom_point()函数在图形中画点，创建了一个散点图。labs()函数是可选的，可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数，并且大多数包含可选的参数。...分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意，ggplot2包在定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面，并进行绘图。...分组 在R中，组通常用分类变量的水平（因子）来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...遗憾的是，这些对ggplot2图形没有影响，该包提供了特定了函数来改变其图形的外观。 坐标轴 ggplot2包会自动生成基本所需要的图形参数。当我们需要更大程度定制时，需要了解相应函数的用法。
首先准备需要的R包，当需要一次性加载多个R包时，我们可以利用pacman，它整合了library包中的一些相关函数，利用pacman包中的p_load函数可以自动加载需要的R包，如果没有找到则会自动安装缺失的...，我们还需要三个几何对象： geom_point：绘制节点； geom_text：添加节点的标签名字； geom_curve：绘制节点间的连线（edge）。...element_rect(fill="transparent",color=NA), plot.background = element_rect(fill="transparent",color=NA) ) 在透明的背景上添加地图...这里介绍一个技巧，我们可以将绘图代码放置在()中，运行一句命令即可将图形显示在你的RStudio中，而不需要再次运行p_base。...最后需要用annotation_custom(ggplotGrob)把p_edges和p_nodes添加到p_base上，三个图形就叠加在一起了。
对于饼图，上一次学习《R语言数据可视化之美》的时候主要利用graphics包和ggplot包（可见R可视乎|饼图）。这几天的学习中发现还有一个更加简便的方法——ggpie包。...接下来介绍圆环图的各种方式绘制（圆环图和饼图的意义其实差不多，都是给出各数据的比重，只不过，圆环图中间少了一块，变成环状）。主要有两个包：ggpubr包（推荐使用）与ggplot2包。...利用该包中的ggdonutchart(）可非常方便的绘制环状图，数据还是使用前面的数据。...ggplot2包绘制圆环图 在[R可视乎|饼图]中ggplot2包绘制饼图的基础上，只要再加一条代码即可完成：xlim(c(0, 5))，即将x轴范围控制在0-5。...geom_text(aes(x = 3.5, y = ((ymin+ymax)/2),label = labs) ,size=3.6) ?
因为单独使用代码来调整单个图表元素，实在是太费劲了，更何况图表的细节元素有那么多，每一个都要单独写一句代码，即便简化后，也是一笔很大的工作量。...以上图表套用华尔街日报的主题模板和配色模板，看起来已经很完美了，但是图表中依然有很多不完美的地方，比如刻度线太短、单序列却添加了多余的图例、字体不太符合我们的审美。...以上过程在使用华尔街日报主题及配色包的同时，添加了我们需要的数据标签、删除了无效图例、同时加长了刻度线等图表元素。...如果你觉得柱形图的数据条间距太宽，也可以通过在在geom_bar()中利用width=0.65参数进行自定义修改。...其实无论怎么样，虽然套用行业顶级水平的主题可以节省我们很多作图时间，提升作图效率，但是毕竟与自己部门或者企业的风格相差甚远，如果是所在的企业比较重视企业形象或者强调品牌概念的话，最好还是在别人的主题基础上
然而，虽然R提供了一种通过cor函数创建这种矩阵的简单方法，但它没有为该函数创建的矩阵提供绘图方法。ggcorr函数提供了这样的绘图方法，使用ggplot2包中实现的“图形语法”来渲染绘图。...注意：尝试在颜色标度上使用ColorBrewer调色板时，调色板中的颜色比调色板中的颜色多，将向用户返回警告（实际上是两个相同的警告）。...控制变量标签 在上面的几个例子中，变量标签的渲染（在相关矩阵的对角线上示出）不一定是最佳的。 要修改这些标签的方面，用户所要做的就是将geom_text支持的任何参数直接传递给ggcorr。...相关矩阵中的变量标签可能出现的一个问题是它们太长而无法在图的左下方完整显示。...要解决这个问题，ggcorr可以通过layout.exp参数在绘图的水平轴上添加一些空格。
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