比如基因列为ID的需要转为常见的symbol,基因列为symbol|ID的就需要拆开了!
在处理数据过程中,会需要将一条数据拆分为多条,比如:a|b|c拆分为a、b、c,并结合其他数据显示为三条数据。
介绍tidyr包中五个基本函数的简单用法:长转宽,宽转长,合并,分割,NA简单填充。
大海:如果只要干一次,那很简单,直接在Excel里先将左括号“(”替换为逗号“,”,将右括号替换为空,然后直接按逗号拆分即可。操作如下动画所示:
> 经常听别人说 Python 在数据领域有多厉害,结果学了很长时间,连数据处理都麻烦得要死。后来才发现,原来不是 Python 数据处理厉害,而是他有数据分析神器—— pandas
分析师面临的普遍问题是,无论从哪里获得数据,大部分情况都是一种不能立即使用的状态。因此,不仅需要时间把数据加载到文件中,还得花更多的时间来清洗它,改变它的结构,以便后续做分析的时候能更好的使用这个数据。
注意默认nThread=getDTthreads(),即使用所有能用的核心,但并不是核心用的越多越好,本人亲自测试的情况下,其实单核具有较强的性能,只有在数据大于3Gb的情况下,开启10核(我的机器全部核心30多核)效率才比一个核心更高,而默认使用全部的核心效率一直非常低。因此对于不是非常巨大的文件,建议设置为1,不要使用全部核心
有朋友在微信公众号的后台发消息提问:怎么同时对两列合并的文本进行逆透视?
sort命令在Linux里非常有用,它将文本文件内容进行排序,并将排序结果标准输出或重定向输出到指定文件。
对于列的拆分一般使用的比较多,也相对容易,通过菜单栏上的拆分列就能搞定,那如果是多列拆分又希望能一一对应的话需要如何操作呢?如图1所示,这是一份中国香港和中国台湾的电影分级制度,需要把对应的分级制度和说明给对应,那如何进行处理呢?目标效果如图2所示。
cut 译为“剪切, 切割”,是一个强大文本处理工具,它可以将文本按列进行划分的文本处理。cut命令逐行读入文本,然后按列划分字段并进行提取、输出等操作。
tidyverse就是Hadley Wickham将自己所写的包整理成了一整套数据处理的方法,包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、purrr、tibble、stringr、forcats。出版有《R for Data Science》(中文版《R数据科学》),这本书详细介绍了tidyverse的使用方法。
在Excel中,拆分是一项常见的任务,而Excel中的“分列”功能只能将单列文本拆分成多列。如果想拆分并提取文本中的数字,或者将文本拆分成多行,那么使用Power Query是一个好的选择。
一般在做数据分析时最常接触的就是逗号分隔值(Comma-Separated Values,CSV,有时也称为字符分隔值,因为分隔字符也可以不是逗号),其文件以纯文本形式存储表格数据(数字和文本)。纯文本意味着该文件是一个字符序列,不含必须像二进制数字那样被解读的数据。CSV文件由任意数目的记录组成,记录间以某种换行符分隔;每条记录由字段组成,字段间的分隔符是其它字符或字符串,最常见的是逗号或制表符。通常,所有记录都有完全相同的字段序列。
对于一个已知分隔符的简单分割(例如,用破折号分割或用空格分割).str.split() 方法就足够了 。 它在字符串的列(系列)上运行,并返回列表(系列)。
(2)、delims参数 按指定的字符串切分,默认情况下,只显示第一个分隔符前的内容.如下代码
列操作cut 面对较大CSV文件的时候,可以用列工具做简单操作。 以如下的一个student.csv为例子: name gender score grade David male 85 B Michael female 90 A Cammy male 88 A Tom female 59 C 甄选列cut CSV有很多列,可以用cut挑选出指定列。这里有几个有用的参数: -d:field delimiter,字段分隔符; -f:fields,指定字段; 常用操作: cut -d',' -f1 fi
在Excel中,我们经常会遇到要将文本拆分。Excel中的文本拆分为列,可以使用公式、“分列”功能或Power Query来实现。
需求描述 实现的sql 案例演示 字符串拆分: SUBSTRING_INDEX(str, delim, count) 替换函数:replace( str, from_str, to_str) 获取字符串长度:LENGTH( str ) 实现的原理解析 实现sql 正式的原理解析 Step1:首先获取最后需被拆分成多少个字符串,利用 help_topic_id 来模拟遍历 第n个字符串。 Step2:根据“,”逗号来拆分字符串,此处利用 SUBSTRING_INDEX(str, delim, count) 函数,最后把结果赋值给 num 字段。 扩展:判断外部值是否在 num列值中 find_in_set instr 字符串转多列
我们知道 Linux 三剑客,它们是 grep、sed、awk。在前边已经讲过 grep 和 sed,没看过的同学可以直接点击阅读,今天要分享的是更为强大的 awk。
前两天,全国疫情得到基本控制,而美国确诊病例破100万之时,全国人民在家中躺着沙发吃着瓜看着这位全真道士为美国“捐”了100万亿美元,而且是三界通用的天地中央银行发行的,假不了。
1、转换是转换里面的第四个分类。转换属于ETL的T,T就是Transform清洗、转换。ETL三个部分中,T花费时间最长,是一般情况下这部分工作量是整个ETL的2/3。
awk是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时显得尤为强大。简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理,切开的部分使用awk可以定义变量、运算符,使用流程控制语句进行深度加工与分析。
先前已经讲过R语言生成测试数据、数据预处理和外部数据输入等内容,但这仅仅是第一步,我们还需要对数据集进行筛选、缺失值处理等操作,以便获得可以应用于建模或者可视化的数据集(变量)。接下来就以鸢尾花测试数据集进行进一步的数据管理和筛选操作。
假设数据以 tibble 格式保存。数据集如果用于统计与绘图,需要满足一定的格式要求,(Wickham, 2014) 称之为 整洁数据 (tidy data),基本要求是每行一个观测,每列一个变量,每个单元格恰好有一个数据值。这些变量应该是真正的属性,而不是同一属性在不同年、月等时间的值分别放到单独的列。
import工具从RDBMS向HDFS导入单独的表。表格中的每一行都表示为HDFS中的单独记录。记录可以存储为文本文件(每行一个记录),或以Avro或SequenceFiles的二进制表示形式存储。
我们可以在执行shell脚本时实时传递参数从而指定某些具体的参数(在本例中包括表格的样式、颜色等),脚本中获取参数的格式为$n。其中除n为0表示执行的文件名外,1表示第一个参数,2表示第二个参数,以此类推。
read.csv,用于读取“comma separated value”文件。它以 DataFrame 的形式导入数据。相关参数:
Pandas可能是广大Python数据分析师最为常用的库了,其提供了从数据读取、数据预处理到数据分析以及数据可视化的全流程操作。其中,在数据读取阶段,应用pd.read_csv读取csv文件是常用的文件存储格式之一。今天,本文就来分享关于pandas读取csv文件时2个非常有趣且有用的参数。
awk的工作过程是这样的:按行读取输入(标准输入或文件),对于符合模式pattern的行,执行action。当pattern省略时表示匹配任何字符串;当action省略时表示执行'{print}';它们不可以同时省略。 每一行输入,对awk来说都是一条记录(record),awk使用$0来引用当前记录:
pandas.read_csv参数整理 读取CSV(逗号分割)文件到DataFrame 也支持文件的部分导入和选择迭代 更多帮助参见:http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html 参数: filepath_or_buffer : str,pathlib。str, pathlib.Path, py._path.local.LocalPath or any object with a read() method (such as a file handl
pandas.read_csv参数详解 pandas.read_csv参数整理 读取CSV(逗号分割)文件到DataFrame 也支持文件的部分导入和选择迭代 更多帮助参见:http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html 参数: filepath_or_buffer : str,pathlib。str, pathlib.Path, py._path.local.LocalPath or any object with a read() method (
在Linux下,有时候需要对文本内容进行排序,例如按照字典顺序排序,按照数字排序或者按照特定列排序等等。今天我们就借助一个命令-sort来满足我们对文本排序的需求。
更多帮助参见:http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html
作为一名数据专家,日常工作很可能都是在使用数据之前对其进行导入、操作和转换。可悲的是,许多人都没有机会接触到拥有精心策划过的数据的大数据库。相反,被不断地喂食 “TXT” 或 “CSV” 文件,并且在开始分析之前,必须经历将它们导入到 Excel 或 Power BI 解决方案的过程。对用户来说,重要的商业信息往往是以以下格式存储或发送给用户的。
Awk是Unix和类似Unix系统下功能强大的文本分析工具,但是因为它具有可用于执行常见解析任务的编程函数,因此也被视为一种编程语言。 您可能不会使用awk开发下一个GUI应用程序,也不会改变您的默认脚本语言,但是在特定任务下它可以成为十分强大且实用的程序。这些任务可能是多种多样的。想要知道哪些问题可以使用awk的最好方法就是学习awk。之后您会惊讶地发现使用awk后将会令工作事半功倍。
数据表是由表名、表中的字段和表的记录三个部分组成的。设计数据表结构就是定义数据表文件名,确定数据表包含哪些字段,各字段的字段名、字段类型、及宽度,并将这些数据输入到计算机当中。
Python数据分析——数据加载与整理 总第47篇 ▼ (本文框架) 数据加载 导入文本数据 1、导入文本格式数据(CSV)的方法: 方法一:使用pd.read_csv(),默认打开csv文件。 9、
在文件的操作过程中,因为文件过多,往往需要进行一下排序,排序方法也就是从小到大排序或者从大到小排序。比如我们从nginx日志中需要找到访问量最长的url,那就需要对请求时间进行一个排序,根据请求时间长短排序后在打印后面的url就能清楚的知道那个url有问题了,废话先不说,看方法:
在使用 R 语言的过程中,需要给函数正确的数据结构。因此,R 语言的数据结构非常重要。通常读入的数据并不能满足函数的需求,往往需要对数据进行各种转化,以达到分析函数的数据类型要求,也就是对数据进行“塑形”,因此,数据转换是 R 语言学习中最难的内容,也是最重要的内容。
我们先来用专业的术语描述一下awk是什么,如果你看不懂,没关系,我们会再用”大白话”解释一遍。
对于许多数据科学家来说,数据操作起始于Pandas或Tidyverse。从理论上看,这个概念没有错。毕竟,这是为什么这些工具首先存在的原因。然而,对于分隔符转换等简单任务来说,这些选项通常可能是过于重量级了。 有意掌握命令行应该在每个开发人员的技能链上,特别是数据科学家。学习shell中的来龙去脉无可否认地会让你更高效。除此之外,命令行还在计算方面有一次伟大的历史记录。例如,awk - 一种数据驱动的脚本语言。Awk首次出现于1977年,它是在传奇的K&R一书中的K,Brian Kernighan的帮助下出现的。在今天,大约50年之后,awk仍然与每年出现的新书保持相关联! 因此,可以肯定的是,对命令行技术的投入不会很快贬值的。
导读:在已经准备好工具箱的情况下,我们来学习怎样使用pandas对数据进行加载、操作、预处理与打磨。
sep='\s+': 指代\f\n\t\r\v这些,分别为换页符,换行符,制表符,回车符,垂直制表符。
When you click the Knit button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
文档操作属于pandas里面的Input/Output也就是IO操作,基本的API都在上述网址,接下来本文核心带你理解部分常用的命令
今天我们来学习一个简单的功能,就是一行转多行,本文将介绍如何通过Excel实现,下一篇将介绍Hive中的实现方法。
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