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为什么癌症病人据肿瘤单细胞水平异质性但是细胞没有

在回顾2014science关于GBM细胞转录组文章,DOI: 10.1126/science.1254257 标题是;Single-cell RNA-seq highlights intratumoral...我发现肿瘤细胞具有病人异质性但是细胞没有: 如下所示: ?...可以清楚看到,不同病人肿瘤细胞之间差异还是蛮大,病人内部细胞之间相关性是高于病人之间,所以可以看到这个聚类是病人内部细胞在一起。...但是最右边两个细胞系就不是这样啦,两个细胞系虽然也是具有肿瘤细胞异质性,但是相关性要普遍高于病人肿瘤细胞。...(如果你确实没有学过R语言,处于对单细胞数据分析感兴趣阶段,那就做一点文献搜索,看看有没有其它文章也提出过这个问题哈)

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什么情况下我会把科研思路给你

我们多次分享过:那些自带全套图表复现代码细胞文章,也在各种单细胞群聊号召大家共享了自己看到自带图表复现代码及数据集细胞及多组学文章,也确实成功收集了一些: https://doi.org/...然而,即使在这样环境中,研究者们也需要谨慎地选择他们分享内容,以确保他们研究成果得到适当保护。...同时,他们也需要尊重他人研究成果和知识产权,避免在没有得到适当许可情况下使用或公开他人研究成果。...为什么通常不交流科研思路 首先,必须是得承认确实有私心,虽然说不清楚自己科研想法是否非常超前和有意义,但是非亲非故,没有足够利益交换,绝大部分人都是不可能交流。...但是交流技术是完全没有问题 前面分享过:那些自带全套图表复现代码细胞文章,那些文章自己就把全部数据和代码公开,给大家学习和复现,我们也针对具体组学数据分析技术,已经组建了各种各样交流群,包括下面这些

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【NSR】中国人工智能迎来黄金时代,跟风发展快但缺乏重大突破

但是,这种情况也说明了在这一领域有一种些事需要澄清:那就是目前机器并没有那么有效,并且需要巨大计算能力支撑(很少有人能承担AlphaGo所需要运算能力)。...事实上,人类大脑也是从大数据训练中获得结果,这种对“大数据”训练,在人脑网络结构中是不断演变。 新生婴儿拥有神经细胞,但是还没有发育出完整神经网络。...查红彬:大学和研究所战略计划并没有太大区别,它们经常合作一起完成重大国家项目,不同研究团队会分别关注模式识别、机器人硬件等领域。中国研究者关注西方国家发展。...我们已经证明当某些神经规律引入时候——例如神经细胞动态分配,突触形成和消除,兴奋神经细胞和压抑神经细胞适当比例——这个强化神经网络精确度得到显著提高。 蒲慕明:这很有意思。...我对发达国家研究看得越多,我越感受到我们缺乏差异化思维。我们特别习惯于跟风,很少有人想做一些需要数十年去验证想法。我们似乎总是忙于不断发一些以推广为目的论文。

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重新信仰PoW,今天我们有了EPoW

复制证明是区块链存储关键技术! 回顾一下工作量证明 中本聪提出工作量证明,提出了以计算能力作为选票,形成共识。因为在计算机世界,身份是容易伪造。...一旦在区块链中移除虚拟币设计,就没有矿工会投入资源。 作为回报,区块链得到了自己需要啊安全保护,巨大算力保护着区块链本身,不被恶意分叉,双花。 工作量证明最大问题是什么?...以往,我们为了获得虚拟币而工作,努力消费更多电力换取虚拟币,从区块链角度看,得到了工作量证明以保护链安全。...现在,矿工为了挣钱(法币)而按需工作(有新文件需要复制证明时候工作,没有则不工作),顺带产生免费工作量证明,来保护区块链安全。 既然还是用到PoW算法,为什么EPoW是经济?...然而这些早期投资依然能产生可观算力来保护区块链网络,如果他们可以找到适当理由来使用这些算力,如果有人可以支付开机成本。

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UI 设计中视觉无障碍设计

读者可以试试自己选择一张照片,比如我选择了我拍摄家门口照片: ? 看完就一个感觉—— ? ? 然而为什么模拟器会模拟成这种图片?因为不可能找到真正能模拟色盲模拟方法。...我们没有办法证明每个人对颜色感知完全一致,不过这里列举这四种颜色,在全世界所有文化中理解是一致。这说明遗传带给我们三种视锥细胞在颜色感知和理解上占了主导地位。...于是,红绿色盲者和大部分祖先——哺乳类观察绿色和棕色(橙色调暗一点就是棕色)是接近两种颜色。这种接近很像我们观察绿色和波长稍微长一点绿色一样。于是——哺乳类毛发颜色其实是保护色: ? ?...那是多么刺眼颜色!以至于散落薰衣草颜色与周围杂草颜色对比开始显得暗淡。甚至如果不经过上面的保护色而是直接看到下图你都不一定注意得到薰衣草存在。 ?...色盲 - 维基百科,自由百科全书 为什么没有绿色毛发哺乳动物?

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得了也白得?Science:奥密克戎不是「疫苗」,很难真正免疫

此外,之前得过原始新冠病毒的人,再得奥密克戎时候,他们免疫力同样没有任何增强。 简单来说,得了奥密克戎就想获得对奥密克戎免疫,是不太可能。 这也就解释了为什么复染比例很大。...不过,他们强调说,以上结论不意味着疫苗没有作用。在防重病和死亡方面,疫苗还是管用。 有人认为,哪怕抗体识别奥密克戎能力很差,T细胞免疫说不定能填上这部分空缺,实现有效地预防。...在最新研究中,研究人员细致考察了为什么一直以来惯例到奥密克戎这儿就行不通了:为什么很多感染过奥密克戎的人并没有产生相应抗体,甚至有的人该打的疫苗也打全了。...研究小组想借此来研究抗体、T细胞、B细胞针对奥密克戎免疫情况。 研究发现,之前没有感染过新冠病毒的人群,假如在之后感染了奥密克戎,那么就会产生加强交叉反应性免疫——针对奥密克戎之前毒株。...在这种情况下,B和T细胞得到了增强,能更好地对抗过去毒株。 然而对奥密克戎而言,反倒还弱了。

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在重构业务系统时应用领域驱动设计

顾名思义,就是把得到app内所有的虚拟商品在交付时用标准订单号关联起来?你也许会好奇,一个电商平台居然没有订单?...开始时,可以用“身陷重围,十面埋伏”来形容,因为几乎每天都会被“拷问”,为什么这么多问题数据?谁是对应产品经理呢?得到端谁对权益数据准确性负责呢?让你们老大招个懂财务产品经理吧!...信任关键,一个团队或者跨团队协作时,信任本身就是生产力。...3 用限界上下文保护领域 确定了领域后,就要保护领域不能随意被“侵犯”,而保护依据,就是“限界上下文”。...这里,细胞代表上下文,而细胞膜代表了包裹上下文边界。 ? 对业务上下文和限界理解不足,容易切换到以用户为中心去建立领域模型心流模式。

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在重构业务系统时,应用领域驱动设计

顾名思义,就是把 得到App 内所有的虚拟商品在交付时用标准订单号关联起来?你也许会好奇,一个电商平台居然没有订单?...开始时,可以用“身陷重围,十面埋伏”来形容,因为几乎每天都会被“拷问”,为什么这么多问题数据?谁是对应产品经理呢?得到端谁对权益数据准确性负责呢?让你们老大招个懂财务产品经理吧!...信任关键,一个团队或者跨团队协作时,信任本身就是生产力。...05 用限界上下文保护领域 确定了领域后,就要保护领域不能随意被“侵犯”,而保护依据,就是“限界上下文”。...这里,细胞代表上下文,而细胞膜代表了包裹上下文边界。 ? 对业务上下文和限界理解不足,容易切换到以用户为中心去建立领域模型心流模式。

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在重构业务系统时应用领域驱动设计

顾名思义,就是把得到app内所有的虚拟商品在交付时用标准订单号关联起来?你也许会好奇,一个电商平台居然没有订单?...开始时,可以用“身陷重围,十面埋伏”来形容,因为几乎每天都会被“拷问”,为什么这么多问题数据?谁是对应产品经理呢?得到端谁对权益数据准确性负责呢?让你们老大招个懂财务产品经理吧!...信任关键,一个团队或者跨团队协作时,信任本身就是生产力。...3 用限界上下文保护领域 确定了领域后,就要保护领域不能随意被“侵犯”,而保护依据,就是“限界上下文”。...这里,细胞代表上下文,而细胞膜代表了包裹上下文边界。 ? 对业务上下文和限界理解不足,容易切换到以用户为中心去建立领域模型心流模式。

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【Jetson开发项目展示】利用开放显微镜和深度学习进行疟疾检测

现在尽管我们几乎可以利用技术来解决所有问题,但是人们在没有得到适当医疗照顾情况下死亡,并且大多数人无法使用医疗设备来确定疾病,因此他们不了解这种疾病严重性,最终,带来大问题。 ?...然而,印刷零件通常是塑料,与传统机械加工相比,其性能往往很差。开放显微镜便宜,容易制作,主要目标是给穷人和社会提供高质量健康检查,在需要时候得到医疗照顾。...【建议解决方案】 提出解决方案将使居住在农村地区的人们受益,他们需要长途旅行以应对任何医疗情况,无论是否紧急。人们携带疟原虫只需要去看医生就可以得到治疗,并且可以随时在开放范围内进行检测。...软件和数据集 我们使用带有Python和TensorflowJetpack SDK来推断数据模型, 美国国立卫生研究院有一个27558张细胞图像疟疾数据集,其中有同等数量寄生细胞和未感染细胞。...【结论】 该项目是完全开放源代码,我们相信该项目可以通过帮助穷人提供健康和适当治疗来改变社会。借助更多数据模型和培训,我们可以提高准确性,更好地对抗疟疾等疾病。

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剑桥科学家重新编码细菌基因,可完全抵抗病毒感染 | Science

首先,携带众多基因片段DNA会转录生成mRNA ,然后mRNA将指导tRNA(tRNA可以携带氨基酸)合成蛋白质。 当病毒入侵细胞后,由于密码子是通用,所以它们也容易指挥tRNA合成蛋白质。...所以,研究人员也盯上了tRNA,他们重新编码了大肠杆菌中tRNA。 那为什么要选大肠杆菌? 简单来说,因为它是种理想受体细胞。...后来,剑桥大学研究员Jason Chin和团队在此基础上,向前迈了一步:他们在大肠杆菌中换掉了同样终止密码子, 并且增加了一层保护。...但实验发现,这些细胞对12种病毒敏感,依然较容易感染。 而在本研究中,Chin博士他们再次升级了编码策略,没有直接删掉识别原始丝氨酸密码子tRNA,而是重新设计了tRNA。...这些tRNA还可以对病毒搞破坏,可以说是“基因防火墙”又得到了新升级。 至于下一步要做什么,剑桥研究团队表示,他们将致力于通过重构基因编码来加速细胞定向进化。

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CancerQuest(埃默里大学一个癌症教育和外展项目)

这一部分也包括关于微小核糖核酸(miRNAs) 和它们在癌症中功能介绍。 癌症表现遗传学 - DNA变化可能微小,但对细胞表现有巨大影响。表观遗传学是研究这些微小但重要变化。...肿瘤细胞转移-大部分癌症引发死亡都由于疾病从原始位置扩散而导致。这一部分介绍了癌症是“怎样”和“为什么”会扩散。并介绍干预癌细胞扩散办法。...免疫系统-免疫系统保护我们身体受到内部和外部威胁,包括癌症。这节详细地介绍了免疫细胞。因为免疫细胞在癌症预防、癌症产生,和使用免疫细胞和抗癌药物中起到了重要作用。...教育游戏 - 通过各种挑战和娱乐互动游戏来检测您对癌症知识了解。 小测试 - 小测试分布在网站许多页面,它们允许用户测试自己知识并得到及示反馈。...没有成绩,没有分数,这一个检测知识掌握情况简单方法。 我们- 11分钟动画纪录片展示了癌症如何生成,发展和传播。 癌症历史时间表 - 展示了两条时间线:癌症历史和癌症检测历史。

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“智齿”干细胞采集获四倍提升,帮助解决提取效率问题 | 黑科技

但是,目前该领域相关业务主要集中在存储环节,对于采集方面则没有太多政策和业务,因此在干细胞提取方面的研究项目相对来说也较少,故而提取效率低成为该行业链发展上一块短板。 ?...干细胞提取 | 为什么选择“智齿” 对于干细胞提取难度,内华达大学拉斯维加斯分校(UNLV)James Mah博士解释道:“我们几乎可以从任何活组织中提取干细胞,事实上,甚至在死者组织中也存在干细胞...伴随着现在矫正牙齿的人越来越多,拔牙是常见现象,且仅仅在美国,拥有智齿成年人就达到500万,这一现状为干细胞提取提供了大量来源。...智齿内干细胞提取 | 难点 牙齿根髓富含丰富细胞,主要是两大类:一是具有吸引其它细胞能力多能干细胞;另一种是可以转换为特定功能细胞细胞。...对于坚果,想要得到完整核仁,我们通常采取敲击方法,但从断裂学角度来看,牙齿和坚果之间有很大不同,它外形极其不规则,一敲即碎,很难实现对牙髓保护

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Self-Expanding ⾃扩展神经⽹络

抽象 https://arxiv.org/pdf/2307.04526.pdf 训练神经⽹络结果在⼤程度上取决于所选架构;即使仅修改⽹络⼤⼩,⽆论多么⼩, 通常都需要重新启动训练过程。...我们说明了这种⾃扩展神经 ⽹络在分类和回归问题中好处,包括那些适当架构⼤⼩先验基本上不确定问题。...⼒以适应任意任务是极具挑战性,特别是当后者尚未得到充分研究时。...这些 问题,如果在⽂献中得到解决的话,通常是零碎或以临时⽅式解决。例如,很少有⽅法解决“什么”问题 [6] [26]。...在突触学习和计算目标之间建立精确关系框架 人、鼠神经细胞差异对比 及神经元计算建模 大脑中复杂适应动力学神经调节控制 生物躯体稳态控制第一原理 脑网络结构高清大图

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脑科学研究丨你永远想不到运动能让大脑变得多么强大

运动能改变大脑,只要单纯地去动你身体,就能对你大脑产生立即、持久,且有保护作用益处,且持续一生。 人类大脑中有两个关键区域。...我花了太多时间,独自待在黑暗房间中,完全没有动身体,体重增加了二十五磅!此后,我参加一趟泛舟之旅,自己一个人,因为我没有社交生活。接着我回来了。我心想:「我天,我是那趟旅行中最弱的人。」...这就是我上健身房动力来源。 我把我A型人格专注在去参加健身房中所有的运动课程。我什么都尝试了,我去试了自由搏击、跳舞、瑜伽、阶梯课程,一开始真的辛苦。...但我注意到,在我每回尝试会让我满身大汗运动之后,我情绪和能量都会大大提升。这就是为什么我会一直持续回到健身房。我开始感觉比较强壮了,我开始感觉更好了。...海马回─运动确实能制造出全新细胞,海马回中新细胞能增加容积,还能改善你长期记忆。对你我皆是如此。 第二:长期运动可以改善注意力,而这项功能取决于你前额叶皮质。

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我保研啦!

基本信息 最重要几点:姓名、邮箱、学校、专业、照片,其他按排版需要来控制。 学习情况 列出GPA,年级排名,学术加权平均分等数据,同时可以适当放一些与未来研究方向一致专业学科分数。...校园经历 研究生导师少有看重学生校园经历,我想法是该部分虽然次于科研经历,但从某种方面又能体现出学生性格和能力。...另外,在来之前我断断续续了解了一下单细胞技术,也知道一些在植物上发展前景和瓶颈,结合植物保护专业知识,和陈老师聊了一些单细胞在植保领域可能应用,很有意思,陈老师也非常感兴趣。...为什么考虑南京大学? 01 机会 作为一个植物保护专业学生,能够有机会前往生物信息学实验室学习,本就是一个不可多得机会。...5月底给王老师发了邮件 得到王老师回复相当开心,也在这个时候得知分子植物科学卓越创新中心将在六月中旬来华农进行推免面试。

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3秒完成超大规模单细胞转录组差异表达量分析

下面是七月优秀学员翻译投稿 为什么 bulk RNA-seq 差异表达在单细胞世界中不是最有用?...当然,也有许多尝试使用不同统计分布和假设来更好地适应单细胞数据属性。快速浏览一下谷歌就会发现,有足够多相互竞争方法可以保证至少有一篇基准论文。...对于单细胞“差异表达”,大多数时候我真正想知道是哪些基因在一组细胞中表达,而在其他任何地方都没有。 假设我正在将肿瘤细胞与周围正常组织进行比较。...edgeR 发现顶级基因列表确实非常好,如果您感兴趣的话,可以容易地找到并过滤出上述无效基因。...这有一些限制;如果要得到这样结果,我们必须将 scRNA-seq 设为二进制。但是,它捕捉了我们在单细胞数据上进行“差异表达”时最经常感兴趣本质。

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Neuron综述|昼夜节律和情绪障碍:是时候看清真相了

摘要:时间重要性在我们世界中一直普遍,正常光/暗和睡眠/觉醒周期中断现在已经成为常态。...如果没有这种发展,生物体就无法预测每天日出,无法形成可靠作息时间,也无法有效地控制代谢需求。人类共享着这种古老计时机制进化保护,几乎身体每一个细胞、都适应着这种每日循环。...失眠或睡过头、疲劳和精力下降以及食欲变化在重度抑郁症患者中常见。...用西酞普兰(另一种SSRI类药物)治疗增加了重度抑郁症患者昼夜节律系统对光线敏感性,这可能解释了为什么BLT与SSRI类药物联合使用时更有效。...IP3信号遗传变异可能是对锂有反应和无反应一些差异基础有趣是,VPA对细胞培养中分子节律节律幅度有类似的影响,但它对周期影响可能与锂相反,产生更短昼夜节律周期,并且容易推测测量BD昼夜节律可能有助于预测锂或

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多云安全要以架构和治理为重点

Mulder:应用程序是云计算基础设施基础。但目前很少有书籍描述如何在AWS、Azure或谷歌云平台进行设置,对于如何使用不同云平台也很少描述。所以我决定自己编写一本。...这些云平台所做唯一一件事就是提供一个工具箱,用户可以用它保护运营环境。这与组织在传统基础设施中确保工作负载安全没有什么不同。 组织不要认为能够阻止网络攻击者进入其系统。...但是,当考虑应对不可避免攻击时,组织可以计划如何响应以及如何保护运营范围内资产。例如可以采取适当措施,一旦数据落入攻击者手中,就会使其无法使用。...构建防火墙是一条安全捷径,但安全性并非始于防火墙,而是始于治理。需要回答一系列问题,例如,谁有资格进入什么系统?需要在哪里保护系统,在什么级别进行保护?为什么?...这费时,但为了撰写这本书,我不得不从控制台执行所有操作。在起初,我觉得自己回到了10年前,当时采用Unix重新编程。但令我惊讶是它强大功能。

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