Aspera用法如下： Usage: ascp [参数] 目标文件 保存路径 一、 Aspera下载一个SRA文件 Step 1：建立Seqs文件夹保存下载序列 mkdir ~/Seqs...Step 2：下载SRA文件到Seqs文件夹 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR620/SRR6208854/SRR6208854.sra ~/Seqs/ 二、 Aspera...SRR6232299.sra 按Ctrl+O,Ctrl+X保存退出 Step 2：批量下载sra_list.txt列表中的文件 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera
Aspera在Ubuntu环境的安装过程如下： Step 1： 建立安装文件夹 mkdir ~/Biosofts cd ~/Biosofts Step 2： 下载Aspera软件...-64.tar.gz Step 3： 解压文件 是tar.gz格式，用tar命令和zvxf参数 tar zvxf aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64....tar.gz Step 4： 安装Aspera 解压后是一个shell脚本，运行即可 sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh Step...5：测试Aspera是否安装成功 ascp命令默认安装地址在：~/.aspera/connect/bin ~/.aspera/connect/bin/ascp -h Step 6：将...aspera安装路径加入环境变量 echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc Step 7：使环境变量生效<
Aspera下载和安装 Aspera下载： http://downloads.asperasoft.com/connect2/。...zxf aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.tar.gz sh aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.sh echo 'PATH=$...PATH:~/.aspera/connect/bin/' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ascp --help 软件一般安装在 ~/.aspera/connect/ 目录下...Aspera使用： 使用说明：https://www.internationalgenome.org/faq/how-download-files-using-aspera Aspera 高速下载 NCBI...-i 免密从SRA和ENA下载的私钥，为·安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下的asperaweb_id_dsa.openssh 文件。
虽然有aspera下载加速措施，但是每次下载至少失败一半！...fastq.gz fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR150/057/SRR15037157/SRR15037157_2.fastq.gz 继续使用脚本 step1-aspera.sh...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 & 然后前面失败的文件这次就成功下载了。
安装 $ tar -zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz $ ..../aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh $ sudo cp ~/.aspera/connect/etc/aspera-license /usr/local/bin...ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR507/SRR5077625/SRR5077625.sra EBI的aspera...命令 含义 ~/.aspera/connect/bin/ascp aspera的可执行文件 -k 1 断点续传 -QT 100M 提高下载速度 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...--user anonftp --file-list aspera_download.txt 4.
下载数据 由于是EBI数据库，用wget下载速度太慢，Jimmy大神强烈建议用aspera工具下载，于是参考生信技能树教程代码，首先需要熟悉GEO和SRA数据库： 解读GEO数据存放规律及下载，一文就够...使用conda安装aspera conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli...bioconda sra-tools which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 我用EBI...单个样本fq下载 找到单个样本的链接很容易： (base) vip31@tpm2-WD12:~/RNA_Seq/sra$ ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect...nohup cat filereport_read_run_PRJNA229893_tsv.txt | while read id; do ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera
xyz","http://api105.video88.xyz","http://api106.video88.xyz","http://api107.video88.xyz"}###以上就是json怎么用的详细内容
第一种用法：string Son_a=a.substr(5);从下标5开始形成新的子字符串
Hi 大家好，大家都知道kuka机器人的程序是顺序执行的，那么如何能实现某个信号的连续监控呢。或者说某个信号触发后，机器人就立即停止当前的任务去执行另外一个任务...
本文大部分都是代码案例, 如果您对 grpc 感兴趣, 可以作为基础参考的一部分.
官网资源： https://ftp.gnu.org/pub/gnu/libiconv/libiconv-1.16.tar.gz CSDN资源：https://...
我现在就在想我一开始用windows系统的时候怎么没有人教我这个，所以在一开始用电脑现在想想真的是混乱。...下面主要说说我的数据下载踩的坑，多亏了张老师的帮助让我从这两天的坑中跳了出来，我是用的aspera软件下载的。...在conda下安装aspera软件 conda install-y-chcc aspera-cli which ascp 找到要下载的数据的BioProject；一般知道它的GEO accession和...下载下来数据在windows下面用Excel打开了一下再上传的，由于点了每行行尾，然后在上传上去之后生成的sra.url文件每行行尾多了特殊字符，对数据下载流程即代码都不熟悉的我，开启了为时两天的踩坑。...在这里我是在后面生成sra.download.sh的时候才发现的，vim sra.download.sh，然后出现了下面这个图，我一直没有想明白怎么回事，后来在张老师的指点下，了解到时我上面写的那个问题
下面是100个lncRNA组装流程的软件的笔记教程 Aspera是IBM公司的一款高速传输软件，创造了新一代的传输技术(faspTM)，并能不受文件大小、形态、传输距离、网络条件限制，以最高效的速度来协助用户迁移各地的数据...一、软件安装 使用conda安装 conda install -y -c hcc aspera-cli conda install -y -c bioconda sra-tools which ascp...ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh # 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 二、aspera的用法 安装完成以后，可以使用ascp...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 &
相信很多像我一样的新手学习Android开发会遇到这个问题，通过这几天的归类和总结，将我的理解写在下面，欢迎大家一起前来讨论： 以按钮BUTTON的监听事件为例...
威胁情报在国内已经火了几年，威胁情报怎么用，具体的使用场景是什么，这方面的话题似乎较少。下面想根据个人所知，谈谈这方面，不完善准确的地方也请大家指正。 有些时候情报和威胁情报很容易被划等号，其实不然。
动态规划适用于子问题不是独立的情况，即各个子问题之间包含公共的子问题。动态规划对每个子问题只计算一次，保存其计算结果到"一张表",重复利用，从而优化执行。
本文为2020年MongoDB应用案例与解决方案征集活动优秀应用案例：MongoDB在京东的应用，作者王勇。
首先需要使用conda安装两个软件（kingfisher和aspera），大家现在可能会倾向于选择mamba来替代conda。...执行conda的安装两个软件（kingfisher和aspera），是如下所示的代码： mamba create -n kingfisher python=3.8 mamba init mamba list.../annotate_info.csv 但是，它默认调用aspera的高速下载失败： INFO: Running command: ascp -T -l 300m -P33001 -k 2 -i /home...所以还需要单独再安转一下aspera才能正常使用，kingfisher的官网也有说明，如果要 ena-ascp发挥作用，必须要再单独安装 ASpera： 必须要再单独安装 ASpera 所以其实kingfisher...里面挑选fastq_aspera和fastq_md5这两个关键信息哈，然后就可以输出 TSV文件下载： 挑选fastq_aspera和fastq_md5这两个关键信息 可以自己制作文件名字（fq.txt
早点的时间是直接在Mapper类上面添加注解@Mapper，这种方式要求每一个mapper类都需要添加此注解，比较麻烦。
一、揭开 Docker 的神秘面纱 Docker 是在Linux容器中运行的应用的开源工具，是一种轻量级的“虚拟机”诞生于2013年，短短几年时间，已经成为了开...
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