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EEG频谱模式相似性分析:实用教程及其应用(附代码)

人脑通过神经激活模式编码信息。虽然分析神经数据的常规方法侧重对大脑(去)激活状态的分析,但是多元神经模式相似性有助于分析神经活动所代表的信息内容。在成年人中,已经确定了许多与表征认知相关的特征,尤其是神经模式的稳定性、独特性和特异性。然而,尽管随着儿童时期认知能力的增长,表征质量也逐步提高,但是发育研究领域特别是在脑电图(EEG)研究中仍然很少使用基于信息的模式相似性方法。在这里,我们提供了一个全面的方法介绍和逐步教程——频谱脑电图数据的模式相似性分析,包括一个公开可用的资源和样本数据集的儿童和成人的数据。

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这也太简单了吧!一个函数完成数据相关性热图计算和展示

NGS系列文章包括Linux基础 (PATH和path,傻傻分不清)、R基础 (ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色))、Python基础 (Python学习极简教程)、NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集)、图形解读 (可视化之为什么要使用箱线图?)、GSEA (一文掌握GSEA,超详细教程)、WGCNA (WGCNA分析,简单全面的最新教程)等内容。

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Nature子刊:临床前家族性阿尔兹海默症患者的功能性大脑老化加速

即将发展为阿尔兹海默病(AD)痴呆人群的静息态功能连接(rs-fMRI)在早期就已经出现异常。这种异常可能有助于AD的临床前研究。本文运用静息态(rs)fMRI数据得到了一个预测大脑年龄的模型,并评估了AD的遗传决定因素和淀粉样蛋白(A)病理学是否会加速大脑老化。使用从多地得到的1340名(年龄在18-94岁)认知未受损的参与者数据,结果表明根据rs-fMRI构建的图的拓扑属性可以预测整个生命周期上的年龄。将预测模型应用于临床前AD,结果表明常染色体显性AD的症状前阶段存在功能性大脑老化加速。这种联系在有明显A病变的个体中更强。

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