靶基因预测
1、miRanda
miranda file1 file2 [options..]
miranda的使用需要准备两个文件,file1是miRNA序列的fasta文件,file2是mRNA序列的...>>’的行并输出至指定文件夹)。...文件中,但是这个文件并不是我们真正想要的,PITA这个软件真的太不友好了,还需要我们自己提取△△G小于或等于-10kcal/mol的行....,我的有400多兆,这条命令执行起来也是超慢的,于是我用了一个很古老的方法,也就是复制粘贴,因为我观察过了,文件中每一条结果是按照△△G由小到大排序的,所以直以将前面小于等于-10的结果(事实上只有很少的一部分...结果整理
miranda结果
targetscan结果
RNA22结果
PITA结果
以上是4种软件靶基因预测结果, miRNA和靶mRNA名称在前两列中, 并且以制表符tab分隔, 我希望从文件中提取前两列的信息