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基于单细胞测序的转录因子调控网络预测数据库

基因转录的过程当中,基因由DNA转录成mRNA的过程受到很多因素的调控。其中就包括了转录因子的调控。转录因子调控的一个主要的过程是转录因子和基因启动子区进行结合进而来对其表达进行调控。由于每个转录因子都有自己的固定的识别序列,所以基于特定的识别序列,我们就可以了解每个转录因子都可能调控哪些基因。随着测序数据的发展,我们也可以通过cihp-seq来准确的了解转录因子的结合区域。同时可以通过RNA-seq来分析转录因子和结合基因之间是否存在共表达关系。之前的转录因子预测的数据库其实都是基于上面的原理来进行构建的。最近,随着单细胞测序数据的增多,我们也可以在单个细胞当中研究不同系统的调控情况。所以今天就给大家介绍一个纳入了单细胞测序数据的一个可以预测基因调控网络的数据库:GRNs[http://www.grndb.com/]

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