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脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,时光飞逝,不知不觉来南京工作已经一年了,从2018年参加工作至今,今年是我工作最快乐的一年,遇到一群志同道合的小伙伴,使我感觉太美好了。...今天是2022年的最后一天,小编在这里给大家分享一个好用的脚本,也希望各位小伙伴明年工作顺利,多发pepper。‍...install biopython pip install pandas 查看脚本参数 python Fasta_sort_renames.py -h 实战演练 # 只对fasta文件中的序列进行命令...python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna # 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序...,并对排序后的文件进行重命名 python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna

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2021年大数据Hadoop(二十):MapReduce的排序和序列化

MapReduce的排序和序列化 概述 序列化(Serialization)是指把结构化对象转化为字节流。 反序列化(Deserialization)是序列化的逆过程。把字节流转为结构化对象。...当要在进程间传递对象或持久化对象的时候,就需要序列化对象成字节流,反之当要将接收到或从磁盘读取的字节流转换为对象,就要进行反序列化。..., 也可以对key进行比较, 我们这里可以通过自定义 Key 实现 WritableComparable 来实现我们的排序功能. // WritableComparable分别继承Writable和Comparable...方法用来定义排序规则,用于将当前对象与方法的参数进行比较。...​​​​​​​分析 实现自定义的bean来封装数据,并将bean作为map输出的key来传输 MR程序在处理数据的过程中会对数据排序(map输出的kv对传输到reduce之前,会排序),排序的依据是map

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    数据处理思想和程序架构: 对使用的数据进行优先等级排序的缓存

    简单的处理就是设备去把每一个APP的标识符记录下来 然后设备发送数据的时候根据标识符一个一个的去发送数据. 但是设备不可能无限制的记录APP的标识符....往里存储的时候判读下有没有这条数据 如果有这个数据,就把这个数据提到buff的第一个位置,然后其它数据往后移 如果没有这个数据就把这个数据插到buff的第一个位置,其它数据也往后移 使用 1.我封装好了这个功能...2.使用的一个二维数组进行的缓存 ? 测试刚存储的优先放到缓存的第一个位置(新数据) 1.先存储 6个0字符 再存储6个1字符 ? 2.执行完记录6个0字符,数据存储在缓存的第一个位置 ?...测试刚存储的优先放到缓存的第一个位置(已经存在的数据) 1.测试一下如果再次记录相同的数据,缓存把数据提到第一个位置,其它位置往后移 ?...使用里面的数据 直接调用这个数组就可以,数组的每一行代表存储的每一条数据 ? ? ? 提示: 如果程序存储满了,自动丢弃最后一个位置的数据.

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    对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归

    p=4146 通过对用电负荷的消费者进行聚类,我们可以提取典型的负荷曲线,提高后续用电量预测的准确性,检测异常或监控整个智能电网(Laurinec等人(2016),Laurinec和Lucká( 2016...最好的方法之一是使用时间序列表示,以减少维数,减少噪声并提取时间序列的主要特征。 对于用电的两个季节性时间序列(每日和每周季节性),基于模型的表示方法是提取典型用电量的最佳方法。...让我们使用一种基于模型的基本表示方法- 平均季节性。在此还有一个非常重要的注意事项,对时间序列进行归一化是对时间序列进行每次聚类或分类之前的必要步骤。...让我们对数据进行聚类并可视化其结果。 让我们绘制 评估的结果。 聚类的最佳数目为7。让我们绘制结果。 提取的消费数据比平均季节性数据更平滑。现在,K 中心提取了4个典型的轮廓,并确定了3个簇。...---- 本文摘选《对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归》

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    Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析

    p=17748 在数据科学学习之旅中,我经常处理日常工作中的时间序列数据集,并据此做出预测。...我将通过以下步骤: 探索性数据分析(EDA) 问题定义(我们要解决什么) 变量识别(我们拥有什么数据) 单变量分析(了解数据集中的每个字段) 多元分析(了解不同领域和目标之间的相互作用) 缺失值处理 离群值处理...[月/年]:提供最近的竞争对手开放的大致年份和月份 促销:当天促销与否 Promo2:Promo2是某些商店的连续和连续促销:0 =商店不参与,1 =商店正在参与 PromoInterval:描述促销启动的连续区间...如果未进行促销,则应将“促销”中的NaN替换为零 我们合并商店数据和训练集数据,然后继续进行分析。 第一,让我们按销售量、客户等比较商店。...商店类别 B的每位客户平均销售额最低。因此,我认为客户只为小商品而来。 商店类别 D的购物车数量最多。 促销仅在工作日进行。 客户倾向于在星期一(促销)和星期日(没有促销)购买更多商品。

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    R语言Copula对债券时间序列数据的流动性风险进行度量

    本文将帮助客户运用Copula模型,对债券的流动性风险进行度量,旨在提供一种新的方法来评估债券的流动性风险。...主要是写二元Copula,关于对债券的流动性风险来进行度量,先估计两个的边际分布,然后选择出最优的Copula函数进行联接,之后进行蒙特卡洛模拟。...数据为流动性风险,liq1,liq2,liq3,h这四个指标,h代表换手率,对选择债券的流动性风险进行度量。...读取数据 data=read.xlsx("11华微债.xlsx") 估计liq3和h这两个指标的边际分布 x <- data[,c("liq3","h")]## 观测值 ##删除缺失值 x=...##对随机数进行可视化 plot( 计算模拟数据的相关数据 估计边缘函数分布 绘制拟合值和实际值 模拟多元分布的样本进行拟合 (使用不同的df) ----

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    未来两年将有75%的企业对大数据进行投资

    今年是大数据落到实处的一年,也是大数据迈向标准化的开始 美国信息咨询公司Gartner表示2015年度大数据方面的投资依然在增长,但与2014年相比增长速度有所放缓。...Gartner今年六月对全球所有行业进行了采样分析,结果显示未来两年有计划进行大数据相关投资的企业占到了75%,比2014年小涨3%。...随着大数据解决方案逐渐成为主流,海量数据、不同数据源和新的处理分析技术已经为企业所接受。 已经采用了大数据的企业中正在或有计划进行位置数据和文本分析的比例已经达到了70%和64%。...将优化办事流程和制定市场目标作为使用大数据原因的企业则占到了47%。值得注意的是关注数据安全的企业比例从15%增加到了23%。今年数据泄漏事件频频登上媒体头条,所以企业对安全更加关注也不难理解。...但进行大数据分析对企业来说也并不是一项简单的任务,尤其是各个企业所面临的情况有所差别,所以技术、管理以及大数据的投资回报成为了管理层关注的重点。

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    Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析|附代码数据

    p=17748 最近我们被客户要求撰写关于销售量时间序列的研究报告,包括一些图形和统计输出 在本文中,在数据科学学习之旅中,我经常处理日常工作中的时间序列数据集,并据此做出预测 我将通过以下步骤: 探索性数据分析...---- 点击文末 “阅读原文” 获取全文完整代码数据资料。 本文选自《Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析》。...:ARIMA,KNN和神经网络时间序列分析 深度学习:Keras使用神经网络进行简单文本分类分析新闻组数据 用PyTorch机器学习神经网络分类预测银行客户流失模型 PYTHON用LSTM长短期记忆神经网络的参数优化方法预测时间序列洗发水销售数据...Python用Keras神经网络序列模型回归拟合预测、准确度检查和结果可视化 Python用LSTM长短期记忆神经网络对不稳定降雨量时间序列进行预测分析 R语言中的神经网络预测时间序列:多层感知器(MLP...(LSTM)神经网络对序列数据进行分类 R语言实现拟合神经网络预测和结果可视化 用R语言实现神经网络预测股票实例 使用PYTHON中KERAS的LSTM递归神经网络进行时间序列预测 python用于NLP

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    Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析|附代码数据

    p=17748 最近我们被客户要求撰写关于销售量时间序列建模预测的研究报告,包括一些图形和统计输出。 在本文中,在数据科学学习之旅中,我经常处理日常工作中的时间序列数据集,并据此做出预测 。...:到最近的竞争对手商店的距离(以米为单位) CompetitionOpenSince [月/年]:提供最近的竞争对手开放的大致年份和月份 促销:当天促销与否 Promo2:Promo2是某些商店的连续和连续促销...Python中利用长短期记忆模型LSTM进行时间序列预测分析 - 预测电力负荷数据 左右滑动查看更多 01 02 03 04 缺少数据,因为商店没有竞争。 ...store_df.groupby(by = "Promo2", axis = 0).count() 如果未进行促销,则应将“促销”中的NaN替换为零  我们合并商店数据和训练集数据,然后继续进行分析。...本文选自《Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析》。

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    Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析|附代码数据

    p=17748 最近我们被客户要求撰写关于销售量时间序列的研究报告,包括一些图形和统计输出。...在本文中,在数据科学学习之旅中,我经常处理日常工作中的时间序列数据集,并据此做出预测 我将通过以下步骤: 探索性数据分析(EDA) 问题定义(我们要解决什么) 变量识别(我们拥有什么数据) 单变量分析(...d CompetitionDistance:到最近的竞争对手商店的距离(以米为单位) CompetitionOpenSince [月/年]:提供最近的竞争对手开放的大致年份和月份 促销:当天促销与否 Promo2...store_df.groupby(by = "Promo2", axis = 0).count() 如果未进行促销,则应将“促销”中的NaN替换为零  我们合并商店数据和训练集数据,然后继续进行分析。...商店类别 B的每位客户平均销售额最低。因此,我认为客户只为小商品而来。 商店类别 D的购物车数量最多。 促销仅在工作日进行。 客户倾向于在星期一(促销)和星期日(没有促销)购买更多商品。

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    python对100G以上的数据进行排序,都有什么好的方法呢

    在多列上对 DataFrame 进行排序 在数据分析中,通常希望根据多列的值对数据进行排序。想象一下,您有一个包含人们名字和姓氏的数据集。...使用熊猫,您可以通过单个方法调用来完成此操作。如果要按升序对某些列进行排序,并按降序对某些列进行排序,则可以将布尔值列表传递给ascending....在这个例子中,您排列数据帧由make,model和city08列,与前两列按照升序排序和city08按降序排列。...这在其他数据集中可能更有用,例如列标签对应于一年中的几个月的数据集。在这种情况下,按月按升序或降序排列数据是有意义的。 在 Pandas 中排序时处理丢失的数据 通常,现实世界的数据有很多缺陷。...使用排序方法修改你的 DataFrame 在所有的例子你迄今所看到的,都.sort_values()和.sort_index()已经返回数据帧对象时,你叫那些方法。这是因为在熊猫排序不工作到位默认。

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    Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析|附代码数据

    p=17748 最近我们被客户要求撰写关于销售量时间序列建模的研究报告,包括一些图形和统计输出。...d CompetitionDistance:到最近的竞争对手商店的距离(以米为单位) CompetitionOpenSince [月/年]:提供最近的竞争对手开放的大致年份和月份 促销:当天促销与否 Promo2...--- 点击标题查阅往期内容 Python中利用长短期记忆模型LSTM进行时间序列预测分析 - 预测电力负荷数据 01 02 03 04 缺少数据,因为商店没有竞争。 ...store_df.groupby(by = "Promo2", axis = 0).count() 如果未进行促销,则应将“促销”中的NaN替换为零  我们合并商店数据和训练集数据,然后继续进行分析。...---- 点击文末 “阅读原文” 获取全文完整代码数据资料。 本文选自《Python对商店数据进行lstm和xgboost销售量时间序列建模预测分析》。

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    疑车无据:大熊猫何时交配才能怀上宝宝?四川学者用音频AI给出预测

    他们在自己的研究中以人工方式定义了 5 种不同的大熊猫叫声,并基于人工设计的声学特征使用聚类方法对叫声数据进行了分组。...研究者对学习到的发声特征进行了可视化分析,结果表明新提出的方法是有效的。作者也对预测准确度进行了定量分析,结果表明基于音频自动预测大熊猫的交配成功率是可行的。这项研究有望更加智能地帮助繁殖大熊猫。...给定一段原始音频序列,作者首先对其进行了预处理:裁剪出大熊猫的叫声,然后根据一个预先设定的最大值对其进行了归一化处理,并将每一段序列的长度设定为 2 秒,并且每秒提取出 43 个声学特征。...对于输入的音频序列,最终的预测结果是通过求和所有帧上的概率而得到的,如果整体的成功概率更大,那么就将这个交配结果分类为成功。 预处理 首先,基于人工标注的起止点从输入音频序列中提取出大熊猫的叫声。...然后,基于一个预先设定的最大值,对音频幅度进行归一化,并将每一段音频的长度规范为 2 秒——裁切长音频序列或通过复制部分短音频来填充短音频序列。

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    怎样在 SQL 中对一个包含销售数据的表按照销售额进行降序排序?

    在当今数字化商业的浪潮中,数据就是企业的宝贵资产。对于销售数据的有效管理和分析,能够为企业的决策提供关键的支持。而在 SQL 中,对销售数据按照销售额进行降序排序,是一项基础但极其重要的操作。...如果能够快速、准确地按照销售额从高到低进行排序,那么您就能一眼看出哪些产品是销售的热门,哪些可能需要进一步的营销策略调整。 首先,让我们来了解一下基本的 SQL 语法。...DESC LIMIT 10; 或者,您可能需要根据多个条件进行排序,比如先按照销售额降序排序,如果销售额相同,再按照销售量升序排序: sql 复制 SELECT * FROM sales_data...无论是为了制定销售策略、评估市场表现,还是优化库存管理,都能从有序的数据中获取有价值的信息。 总之,SQL 中的排序操作虽然看似简单,但却蕴含着巨大的能量。...通过巧妙地运用排序功能,您可以让数据为您讲述更精彩的商业故事,为企业的发展指引方向。

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    全面对标Sora!中国首个Sora级视频大模型Vidu亮相

    在插帧的步骤中,模型不知道两帧之间的内容如何连接,只是采用了类似于PPT中“平滑”的效果将线条和内容进行移动。...其他国产视频大模型生成的画面“动画感”较强,以动物类模型,用“一个培养皿,里面长着一片竹林,里面有小熊猫在跑来跑去”作为关键词生成视频[4],可以看到字节和腾讯的大模型生成的视频中,小熊猫和环境的动画风格强烈...图11 字节艺映AI和腾讯VideoCrafter2生成的动物类视频内容而Vidu生成的动物类视频,从环境到主体的大熊猫都具备更强的真实感,熊猫弹吉他的行为除外。...但是其生成视频类内容的连续性、稳定性较弱,不具备连续内容关联能力。Transformer是一种基于自注意力机制的神经网络架构,广泛用于处理序列数据,如文本、语音和图像。...它能够捕获序列数据中的长距离依赖关系,适用于各种任务,包括自然语言处理、计算机视觉等。其优势在于内容的关联性,但是需要更多的数据和训练。

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    关于使用Navicat工具对MySQL中数据进行复制和导出的一点尝试

    最近开始使用MySQL数据库进行项目的开发,虽然以前在大学期间有段使用MySQL数据库的经历,但再次使用Navicat for MySQL时,除了熟悉感其它基本操作好像都忘了,现在把使用中的问题作为博客记录下来...需求 数据库中的表复制 因为创建的表有很多相同的标准字段,所以最快捷的方法是复制一个表,然后进行部分的修改添加....但尝试通过界面操作,好像不能实现 通过SQL语句,在命令行对SQL语句进行修改,然后执行SQL语句,可以实现表的复制 视图中SQL语句的导出 在使用PowerDesign制作数据库模型时,需要将MySQL...数据库中的数据库表的SQL语句和视图的SQL语句导出 数据库表的SQL语句到处右击即可即有SQL语句的导出 数据库视图的SQL语句无法通过这种方法到导出 解决办法 数据库表的复制 点击数据库右击即可在下拉菜单框中看到命令列界面选项...,点击命令行界面选项即可进入命令列界面 在命令列界面复制表的SQL语句,对SQL语句字段修改执行后就可以实现数据库表的复制 视图中SQL语句的导出 首先对数据库的视图进行备份 在备份好的数据库视图中提取

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    【业界】对人工智能、大数据和分析领域在2018年的九大预测

    因此,70%的企业预计在未来12个月内实现人工智能,高于2016年的40%和2017年的51%。...以下是我对弗雷斯特预计的在2018年会发生的事情的九大总结: 1.25%的企业将通过用对话接口来补充point-and-click分析。...弗雷斯特预计,在2018年,50%的企业将采用一种公共云的策略,以获取数据、大数据和分析,因为企业希望获得更多的成本控制,而非本地软件能够提供的灵活性。...面向业务的CDO将探索并利用数据进行创新的机会,要么通过内部业务流程的分析,要么通过新的外部数据支持的产品和服务。...预计在2018年,超过50%的CDO将向CEO汇报他们的想法,高于2016年的34%和2017年的40%。 8.数据工程师将成为热门的新职位。

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