对于诸如此类的一系列复杂操作，在文本文件中进行操作会更容易，因此请创建一个名为 sort.awk 的新文件并输入以下文本： #!...awk 中的数组 你已经知道如何通过使用 $ 符号和字段编号来收集特定字段的值，但是在这种情况下，你需要将其存储在数组中而不是将其打印到终端。这是通过 awk 数组完成的。...要将键和值添加到数组，请创建一个包含数组的变量（在本示例脚本中，我将其称为 ARRAY，虽然不是很原汁原味，但很清楚），然后在方括号中分配给它键，用等号（=）连接值。...{ # dump each field into an array ARRAY[$2] = $R; } 在此语句中，第二个字段的内容（$2）用作关键字，而当前记录（$R）用作值。...最好可以在运行时灵活选择要用作排序键的字段，以便可以在任何数据集上使用此脚本并获得有意义的结果。 添加命令选项 你可以通过在脚本中使用字面值 var 将命令变量添加到 awk 脚本中。
grep "^root" /etc/passwd $:锚定行尾，此字符前面的任意内容必须出现在行尾。...awk -F: 输入分隔符 OFS="#" 输出分隔符 awk变量 awk内置变量 FS: filed separator,读取文本时，所用字段分隔符 RS:recordsepartor，输入文本信息所使用的换行符...\n,$1,$2}' file awk的操作符 算术操作符 字符串操作符 布尔表达式 x < y x <= y x > y x !...循环每一字段 length([string]) awk -F: '{i=1; while (14) {print $i}; i++}}' df -hP...break和continue contine是遍历字段的 next 提前结束对本行文本的处理，并接着处理下一行， 数组 数组下表是从1开始的 awk[mon]=1 awk[tus]=2
根据您的知识您可以将其视为一个2D 数组或表，或者仅仅是一个以行分隔的数据集合。...对于诸如此类的一系列复杂操作，在文本文件中进行操作会更容易，因此请创建一个名为sorter.awk的新文件并输入以下文本： #!...在 awk 中的数组 您已经知道如何通过使用 $符号和字段号收集特定字段的值，但是在这种情况下，您需要将其存储在数组中，而不是将其打印到终端。 这是通过 awk 数组完成的。...把这个添加到你的脚本中： END { asorti(ARRAY,SARRAY); # get length j = length(SARRAY); for (i = 1; i <= j; i+...最好能够在运行时灵活地选择要使用哪个字段作为排序键，这样就可以在任何数据集上使用此脚本，并获得有意义的结果。 添加命令选项 您可以通过在脚本中使用var将命令变量添加到awk脚本中。
文件内容查看 cat 从上往下阅读文件内容 cat [-AbEnTv] ${FILE_NAME) cat -n /etc/issue 将该文件的内容输出到标准输出中，并显示行号 cat file1 file2...> file3 将file1 file2的内容依次添加到file3当中 tac 从下往上阅读文件内容，用法同cat nl 添加行号打印，默认情况下空白行不显示行号 nl [-bnw] ${FILE_NAME...，都会询问用户 -n: 后面接次数，要使用几个参数的意思 文件格式化处理 awk 主要是处理每一行的字段内的数据，而默认的字段的分隔符为空格键或tab键 awk '条件类型{动作1}条件类型2{动作2}......' filename NF：$0每一行拥有的字段总数 NR：目前awk所处理的是第几行数据 FS: 目前的分隔符 last -n 5 | awk '{print $1 "\t" $3}' #打印一行的第一段文字和第三段文字...} $3 < 10 {print $1 "\t " $3}' diff 以行尾单位比较两个文件之间的区别，也可比较不同目录之间相同文件的内容 diff [-bBi] from-file to-file
awk是怎样处理文本流的？ awk从输入文件或流中每次读取一行文本，并使用字段分隔符将其解析为多个字段。awk术语中，当前缓冲区（buffer）是一条记录。...，字段数量): 当awk解析一行记录时，NF代表已解析的字段数量 $0: 当前记录（行） 1, 2, NR (记录行数): 截至当前awk脚本已解析的记录行数 除此之外，还有很多其他影响awk行为的变量...例如，下面的单行脚本打印了 /etc/passwd中的用户名列表： awk -F":" '{print $1 }' /etc/passwd 如我们上面提到的，$1是当前记录的第一个字段。...-F选项设置了字段分割变量为冒号 :。...\"'\t]+"; } 然后，在主循环函数中，遍历每个字段，忽略空字段（当行尾有标点符号时会出现这种情况），并对本行中的每个单词增加单词计数。
（一）awk简单用法 用法示 选项 -F 指定输入记录字段的分隔符，默认使用环境变量IFS的值 -f 从指定文件读取awk_script -v 为awk设定变量 The IFS is a special...：/rexp/，如/^A/、/A[0-9]*/ ^ 只匹配行首 ( 可以看成是行首的标志 ) $ 只匹配行尾 ( 可以看成是行尾的标志 ) * 一个单字符后紧跟 *，匹配 0个或多个此字符 [ ] 匹配...匹配任意单个字符 str1|str2 匹配 str1 或 str2 + 匹配一个或多个前一字符 ? 匹配零个或一个前一字符 ( ) 字符组 ? ?...（六）更多awk awk不仅是一个命令，它更是一个编程语言 变量 内部变量 awk ' {print NR,$0} ' #给文件加上行号 自定变量 函数 内置函数 自定义函数 awk...'{ print sum($1,$2) } function sum(x,y) { s=x+y ; return s }' grade.txt 数组 awk 'BEGIN { print split
$0 #当前记录 1~n #当前记录的第N个字段 FS #输入字段分隔符（-F相同作用）默认空格 RS #输入记录分割符，默认换行符 NF #字段个数就是列 NR #记录数，就是行号...，默认从1开始 OFS #输出字段分隔符，默认空格 ORS #输出记录分割符，默认换行符 外部变量 [mingongge@ ~]#a=100 [mingongge@ ~]#b=100 [mingongge...@ ~]#echo |awk '{print v1*v2 }' v1=a v2=b 10000 Awk运算与判断 算术运算符 + - 加减 * / & 乘 除 求余 ^ * 求幂 ++ -- 增加或减少...，所有用作算术运算符进行操作，操作数自动转为数值，所有非数值都变为0 赋值运算符 = += -= *= /= %= ^= **= 正则运算符 ~ !...= = 其它运算符 $ 字段引用 空格 字符串链接符 ?: 三目运算符 ln 数组中是否存在某键值 Awk正则 ^ 行首定位符 $ 行尾定位符 .
即输出没有没有匹配的行 -n：显示匹配成功的行所在的行号 -r：从目录中查找pattern -e：指定多个匹配模式 -f：从指定文件中读取要匹配的 pattern -i：忽略大小写 正则表达式 是对字符串操作的一种逻辑公式...^ 行首 cat readme.txt | grep '^T' $ 行尾 cat readme.txt | grep ')$' .换行符之外的任意单个字符 cat readme.txt | grep...：也称 gawk，编程语言，可对文本和数据进行处理 -Ffields，设置字段分隔符 awk 在读取一行文本时，会用预定义的字段分隔符划分每个数据字段，并分配给一个变量。...$0 代表整个文本行； $1 代表文本行中的第1个数据字段； …… $NF 代表文本行中的最后一个数据字段 awk 默认的字段分隔符是任意空白字符（如：空格 or 制表符），也可以用 -F 参数自定义分隔符...基础结构：' {script} ' 匹配结构：' /pattern/{script} ' 扩展结构：'BEGIN{script} {script} END{script}' awk 内置变量： FS
' file1 # 将匹配的行写入file2中 awk Awk 是一个强大的文本分析工具，它每次读入一条记录，并把每条记录切分成字段后进行分析。...，也可以是正则表达式 常用参数 -F value 设置域分隔符，相当于给 FS 内置变量赋值 -v var=value 将变量 value 的值赋给程序变量 var，-v 可以多次使用 记录与字段 记录是一次读入的内容...，通常是文件的一行，保存在字段变量 0中，记录可以被分割成字段，保存在变量 1， 2，...， NF 中。...表达式与操作符 Awk 表达式的符号与 C 语言的类似，基本的表达式有数字，字符串，变量，字段，数组以及函数调用。变量无需声明，它们在首次使用时被初始化为null。...# number的值被传给了程序变量n awk '$2 > 100' file # 打印第2列大于100的行 awk 'NR>1 && NR<4' file # 打印第2~3行 awk '/EGFR
awk内置变量（预定义变量） 说明：[A][N][P][G]表示第一个支持变量的工具，[A]=awk、[N]=nawk、[P]=POSIXawk、[G]=gawk $n 当前记录的第n个字段，比如n为1...，使用 (NF-1)则是打印倒数第二个字段，其他以此类推： echo -e "line1 f2 f3\n line2 f4 f5" | awk '{print $NF}' 输出结果： f3 f5 echo...-e "line1 f2 f3\n line2 f4 f5" | awk '{print $(NF-1)}' 输出结果： f2 f4 打印每一行的第二和第三个字段： awk '{ print $2,$3...它负责从输入获得下一行的内容，并给NF,NR和FNR等内建变量赋值。如果得到一条记录，getline函数返回1，如果到达文件的末尾就返回0，如果出现错误，例如打开文件失败，就返回-1。...示例： 执行linux的date命令，并通过管道输出给getline，然后再把输出赋值给自定义变量out，并打印它： awk 'BEGIN{ "date" | getline out; print out
' file1 # 将匹配的行写入file2中 awk Awk 是一个强大的文本分析工具，它每次读入一条记录，并把每条记录切分成字段后进行分析。...，也可以是正则表达式 常用参数 -F value 设置域分隔符，相当于给 FS 内置变量赋值 -v var=value 将变量 value 的值赋给程序变量 var，-v 可以多次使用 记录与字段 记录是一次读入的内容...，通常是文件的一行，保存在字段变量 中，记录可以被分割成字段，保存在变量 1， ，， NF 中。...表达式与操作符 Awk 表达式的符号与 C 语言的类似，基本的表达式有数字，字符串，变量，字段，数组以及函数调用。变量无需声明，它们在首次使用时被初始化为null。...# number的值被传给了程序变量n awk '$2 > 100' file # 打印第2列大于100的行 awk 'NR>1 && NR<4' file # 打印第2~3行 awk '/EGFR
语句中双引号其实就是个拼接作用 Awk的变量 内置变量 $0 #当前记录 $1~$n #当前记录的第N个字段 FS #输入字段分隔符（-F相同作用）默认空格 RS #输入记录分割符，默认换行符...NF #字段个数就是列 NR #记录数，就是行号，默认从1开始 OFS #输出字段分隔符，默认空格 ORS #输出记录分割符，默认换行符 外部变量 [mingongge@ ~]#a=...100 [mingongge@ ~]#b=100 [mingongge@ ~]#echo |awk '{print v1*v2 }' v1=$a v2=$b 10000 Awk运算与判断 算术运算符...{a="0";print a,a++,--a,++a;}' 0 0 0 1 #和其它编程语言一样，所有用作算术运算符进行操作，操作数自动转为数值，所有非数值都变为0 赋值运算符 = += -= *=...= = 其它运算符 $ 字段引用 空格 字符串链接符 ?: 三目运算符 ln 数组中是否存在某键值 Awk正则 ^ 行首定位符 $ 行尾定位符 .
2）如果没有BEGIN条件，则读入第一行，把第一行的数据依次赋予0、1、2等变量。其中0代表此行的整体数据，1代表第一字段，2代表第二字段。 3）依据条件类型判断动作是否执行。...-h | awk '/sda[O-9]/ { printf $1 "\t" $5 "\n"}’ #查询包含有sda数字的行，并打印第一字段和第五字段 1.2.5 awk 内置变量 awk内置变量...比如，$1表示第1个字段(列)，$2表示第2个字段(列)，如此类推 NF 当前行拥有的字段（列）总数。 NR 当前awk所处理的行，是总数据的第几行。 FS 用户定义分隔符。...获取最后一列 ps -aux | grep watchdog | awk '{print $NF}' 7. 对文件进行操作 awk '{print $1}' fileName 8....“NR==2 {iphp1=$3}” (条件是NR==2，动作是php1=$3）这句话是指如果输入数据是第二行（第一行是标题行），就把第二行的第三字段的值赋予变量“php1”。
，就是用事先定义好的一些特定字符及这些特定字符的组合，组成一个“规则字符串”，这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑^ 行首$ 行尾....2.如何替换每一行的前4个字符？3.如何对奇数行进行操作？...，并分配给一个变量$0：代表整个文本行$1：代表文本行中的第1个数据字段（第1列）$NF：代表文本行中的最后一个数据字段awk默认的字段分隔符是任意空白字符（如：空格or制表符），也可以用-F参数自定义分隔符图片用...| awk '/UTR/{print $0}' | less -S #打印feature为UTR的整个文本行 3.3 awk内置变量FS：定义输入字段分隔符，同 -FRS：定义输入记录分隔符，Record...S Data/example.gtf | awk '{if($3=="gene") {print $1,$2,$3}}' |less -S以行为单位进行循环，每一行里面取出$1 $2 $33.5 awk
\r\n，在进行NGS分析前最好将其转换为Unix风格的行尾\n。）...合并两个fastq文件 cat fastq1 fastq2 >merged_fastq 获取fastq文件名前缀 （假设fastq文件名是test.r1.fq.gz，我们想得到其前缀test） your_string...–f1 ? 或者： your_string |sed ‘s/\..*//’ ? 或者： your_string |awk –F. ‘{print $1}’ ?...或者（如果是在脚本中实现这一功能的话）： 利用shell中的字符串变量删除功能${var%%}来实现。 ?...或者 awk ‘{a[$1]++}END {print length(a)}’ your_file ?
下面是相应的Awk命令： awk -F "," '{print $1}' file.txt -F ","：指定字段分隔符为逗号。 '{print $1}'：匹配所有行，并打印第一个字段。...运行以上命令，输出结果为： apple orange banana 在这个案例中，可以看到，Awk命令通过模式{print 1}匹配所有行，并通过动作print 1打印第一个字段数据。...body 块紧接着执行，在每行的第 2 个字段上将其值添加到 sum 变量中。最后，END 块在程序执行完毕后被执行，打印一条结束执行的消息和 sum 的总和。...3 大于 3 代码解释 在该案例中，body 块用于判断第 2 个字段的值是否大于 10，并打印相应的结果。...在主模块中，我们使用print命令来打印每个学生的姓名和分数， 1表示第一个字段（姓名）， 2表示第二个字段（分数）。 最后，我们指定了要处理的文件file.txt。
AWK 内置变量，它代表_字段数_。...我们通过管道将其传递给，uniq因为默认行为将打印每行的列数，并且由于每行具有相同的列数，因此uniq会将其减少为一个数字。 打印字段和搜索 我们还可以使用 awk来选择和打印文件的一部分。...有关在 awk 中查找模式的更多信息，请查看awk 指南的模式、操作和变量部分。 根据字段值过滤行 现在我们知道如何访问字段（列）并在我们的文档中查找模式，但是我们如何控制要搜索的内容和位置？...这里的表示我们正在处理一个变量，在这种情况下，awk 知道这7意味着我们数据集中的第 7 个字段。同样， 现在我们要在Pos列上测试条件的另一部分。...> awk '{ if($8 >= 11000000) { print }}' rumenz.txt | head MarkerName Allele1 Allele2 Freq1 FreqSE
awk 语法结构 awk [options] 'commands' file(s) option： -F 定义字段分割符号 -v 定义变量并赋值 command: 1、范围说明或者正则表达式或者...{awk命令语句1;awk命令语句2;} 2、范围说明部分可以是BEGIN、END、逻辑表达式或者为空 3、awk命令语句间用分号间隔 4、引用shell变量时需要用双引号引起，...命令模式都在单引号''里面 BEGIN{} {} END{} 行处理前 行处理 行处理后 字段分割及相关变量 $1,$2,$3......，并包括行号 awk -F: '{print FNR,$0}' /etc/passwd /etc/hosts awk -F: '{print $0,NF}' /etc/passwd #保留记录的字段数...$1,$2,$3}' /etc/passwd 参数解释: %s 字符类型 strings %-20s %d 数值类型 占15字符 - 表示左对齐，默认是右对齐 printf默认不会在行尾自动换行
---- 【常用文本处理命令】 awk 1. awk脚本结构awk ' BEGIN{statements } statements2 END{ statements } '2....工作方式1) 执行begin中语句块；2) 从文件或stdin中读入一行，然后执行statements2，重复这个过程，直到文件全部被读取完毕；3) 执行end语句块；特殊变量：NR NF $0 $1...$2NR:表示记录数量，在执行过程中对应当前行号；NF:表示字段数量，在执行过程中对应当前行的字段数；$0:这个变量包含执行过程中当前行的文本内容；$1:第一个字段的文本内容；$2:第二个字段的文本内容...；例：打印每一行的第二和第三个字段awk '{print $2,$3}' file统计文件的行数awk ' END {printNR}' file grep 主要用于文本搜索，它能使用正则表达式搜索文本...dumpsys meminfo demo2|grep "TOTAL"|awk '{print $2}'|sed -n '2p' >> log2.txtsleep 1donedate>>log.txt
awk是按行处理文件，内部有一个隐藏的循环，即默认下逐行读取文件并运行程序 使用单引号原因：双引号中的$会被 shell 解析成 shell 变量引用，于是会进行 shell 变量替换。...pattern : pattern # 三目运算符 # 范围 pattern pattern1, pattern2 # 范围匹配，匹配从 pattern1 到 pattern2 之间的内容...：RS变量作为输入记录分割符，所读取的每条记录不包含RS变量值 RS 为单个字符， 则直接用该字符来分割记录 RS 为多个字符，则将其作为正则表达式，只要匹配上正则表达式都用来分割记录 设置预定义变量IGNORECASE...当RS为正则表达式时，RT`为正则匹配的记录分隔符 行号 awk读取每条记录后，将其赋值给$0和设置RT外，还会设置NR和FNR这两个预定义变量 NR: 所有文件的行号计数器 FNR: 各个文件的行号计数器...，针对于多个文件输入的情况 字段分割 awk读取每条记录后，将其赋值给0，同时还会对该条记录按照预定义变量FS划分字段，将划分后的各个字段依次存入1，2，3 …，同时将划分好的字段数量赋值给预定义变量NF
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