之前我写了文章简单的讲了一下最近非常热闹的由Databricks发起的和Snowflake的撕逼文章们:
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f. Kaplan-Meier survival curves of overall survival in 180 bladder cancer patients based on METTL3 expression analyzed by IHC staining. The log-rank test was used to compare differences between two groups (P = 0.0128)
本来呢,还在奇怪,TCGA数据库里面的乳腺癌患者的放化疗信息应该是没有那么全吧。等我看完摘要才明白,原来是研究者自己招募的病人队列,来自于Iceland between 1976 and 2007. 而且Chemotherapy信息很丰富,包括 cyclophosphamide, methotrexate, and fluorouracil 。
最近一段时间,有拿了Databricks或者Snowflake的offer,或者两者皆有的人,加我微信,然后问我问题的人数已经很多很多了。 我被重复的问同样的问题两位数次,也答的不厌其烦。所以我就写篇文章在这里。以后有拿了这两家公司的offer,然后想加我微信问问题的,先看这里。 第一个问题:Databricks/Snowflake的估值是不是偏高/偏低? 这个问题我没办法回答。估值是一个很个人的问题。有人觉得高,有人觉得低。 客观说几句,Snowflake是上市公司,有好几个季度的财报,所以判断起来,信息
不过,哪怕是对人类来说,kegg注释的也仅仅是蛋白编码基因,但是如果你了解人类gtf文件,就应该是知道,里面有6万左右的基因,如果我们的差异分析,定位到了 lncRNA,假基因,miRNA的基因,其实就不能直接进行功能数据库注释。
但是不少粉丝表示不明白这些东西是做什么的,现在就给一个示例,文章是发表于2017的纯粹生物信息学数据挖掘的:Identification of miRNA‐mRNA crosstalk in laryngeal squamous cell carcinoma,其实你把癌症替换成为TCGA的另外33种癌症,都是类似的分析策略,类似的写作思路。
该研究使用的是 CapitalBio 平台 (CapitalBio 公司) 芯片,非常清晰的研究思路;
近日,天阳信用卡新一代核心产品CreditX完成了与腾讯云分布式数据库TDSQL的适配性测试,并基于双深度融合,推出“金融零售核心CreditX+分布式数据库TDSQL”的新一代分布式信用卡核心产品联合解决方案。 这标志着信用卡核心系统应用将迎来安全可控的分布式、数字化转型升级加速期。 技术上,CreditX采用“分布式+微服务+云部署”技术架构。在关系型数据库部分,使用标准SQL语法与标准数据建模方法,经过本次与腾讯云分布式数据库TDSQL全面适配性测试,证实在数据库功能性、连通性,应用适配性等各方面完
而且使用TCGA数据库来看感兴趣基因的生存情况非常简单,一个网页工具即可,都无需R语言了。即使是这样,仍然是有文章并不使用TCGA数据库来看感兴趣基因的生存情况,比如 Cancer Res. 2016 April 1; 文章:
所以我这里安排一个学徒作业,大家需要去下载TCGA数据库的BRCA这个癌症的芯片和RNA-seq的表达矩阵,分别进行差异分析,拿到统计学显著的上下调基因列表。
TDSQL获奖啦! 众所周知,TDSQL是一款非常优秀的数据库产品 因此,TDSQL获奖应该也是不值得惊讶的事情了。但这次,TDSQL拿了两个(→这话我是不是之前说过了 ) 2021年4月7日至8日,2021 GDCC 全球分布式云大会在北京举行。 在所有企业乘“云”而上的生态背景下,诞生了众多行业的领航者和开拓者,产生了引领分布式云技术的优秀产品。借这一趋势,全球分布式云联盟经过数月的策划、在报名的众多企业中进行仔细的遴选和评审,最终设立了“分布式云奖项”,并通过“全球分布式云大会·颁奖典礼”进
转文: 首先解释面上意思,service是业务层,dao是数据访问层。 呵呵,这个问题我曾经也有过,记得以前刚学编程的时候,都是在service里直接调用dao,service里面就new一个dao类对象,调用,其他有意义的事没做,也不明白有这个有什么用,参加工作久了以后就会知道,业务才是工作中的重中之重。 我们都知道,**标准主流现在的编程方式都是采用MVC综合设计模式,MVC本身不属于设计模式的一种,它描述的是一种结构,最终目的达到解耦,解耦说的意思是你更改某一层代码,不会影响我其他层代码,如果你会像spring这样的框架,你会了解面向接口编程,**表示层调用控制层,控制层调用业务层,业务层调用数据访问层。 初期也许都是new对象去调用下一层,比如你在业务层new一个DAO类的对象,调用DAO类方法访问数据库,这样写是不对的,因为在业务层中是不应该含有具体对象,最多只能有引用,如果有具体对象存在,就耦合了。 当那个对象不存在,我还要修改业务的代码,这不符合逻辑。好比主板上内存坏了,我换内存,没必要连主板一起换。我不用知道内存是哪家生产,不用知道多大容量,只要是内存都可以插上这个接口使用。这就是MVC的意义。 接下来说你感觉service的意义,其实因为你现在做东西分层次不是那么严格,在一个你们做东西业务本身也少,举个最简单的例子,你做一个分页的功能,数据1000条,你20条在一个页,你可以把这个功能写成工具类封装起来,然后在业务层里调用这个封装的方法,这才是业务里真正干得事,只要没访问数据库的,都要在业务里写。 再有不明白的追问,这是经验问题,呵呵,其实以后你就会懂。只是刚开始写的代码都是有个请求,我就去数据库取,业务几乎没有。
文章数据分析流程图如下: 任务 如果你有R代码基础,那么你可能需要阅读我在生信技能树的甲基化教程列表: 01-甲基化的一些基础知识.pdf 02-甲基化芯片的一般分析流程.pdf 03-甲基化芯片
摘自:微头条,阿尔法工场欧阳长征推荐 导读:如果银行是一家海鲜酒楼,把IBM换掉相当于大搞一次装修,把Oracle换掉相当于把厨子和菜谱全部换掉,把EMC换掉相当于把放食材工具的储物间换个地方。难度在
本文源自于知乎的提问与回答,相信大家也有自己去思考或者实践“造”几个轮子。毕竟不管是学习人家造好的轮子还是自己造轮子,都是对自身开发设计能力的一种提升。本文的回答者从公司的实际项目出发,大致列举了我们可以研究的“轮子”,并给出设计建议。
比如,一个课题是为了说明 BACE2 基因在癌症研究领域很重要,就可以使用两个数据库(TCGA and GTEx),做出差异和生存的图表来辅助自己的研究。
从大家 iPhone 手机中 Siri 到淘宝京东咨询客服的时候出现的智能客服,从小朋友喜欢玩的儿童机器人,到智能家居中的各种语音控制,背后都是聊天机器人。
记者发现,前程无忧51Job.com(Nasdaq:JOBS)用户信息在暗网上被公开销售,黑客甚至展示了部分样本数据,包括邮箱、密码、真实姓名、身份证号码、电话等。 前程无忧方面向记者证实,部分用户账户密码被撞库,但否认该公司数据被拖库。 撞库是黑客通过收集互联网已泄露的用户和密码信息,生成对应的字典表,尝试批量登陆其他网站,得到一系列可以登录账号信息的行为。拖库原本是指从数据库中导出数据,在黑客圈,拖库也被用来指网站遭到入侵后,黑客窃取其数据库。 目前,有关人员通过泄露的前程无忧用户信息对网站进行登录测试,部分成功。 据贩卖用户信息的人声称,其手中共有195万条数据可被销售,打包价为12个比特币。(目前1个比特币价格超过4万元人民币,12个比特币总价约50万元人民币。) 黑客圈人士对记者分析,暂时无法确认是因为数据库泄露造成,还是撞库导致的,“怀疑有人从其他地方挑选了一些数据,伪装成51job被拖库,拿其数据售卖。” 6月15日,前程无忧方面回复记者称,该公司从当天早间就已经对暗网上放出的数据做进一步验证,对这些用户登录情况做了进一步的分析汇总,从公布出82条数据中发现,“有65条在我们的碰撞库中,其余17条数据无法正常登录。” 前程无忧方面表示,经过安全团队校验,释放出来的样本数据,绝大部分来自于一些邮箱泄露的账户密码,且都是在2013年之前注册,所以很可能是这些邮箱的用户名和秘密被非法获得,“恶意用户通过这些已泄露的邮箱账户及密码,对我们站点进行登录匹配。然后蓄意倒卖,并非51job被拖库。2013年不少互联网邮箱的密码还是明码,且数年前确实发生过一些邮箱的信息泄露。” 前程无忧不愿意公开具体涉及的是哪家邮箱服务商。 资料显示,2015年,网易163/126电子邮箱过亿数据泄漏,网易方面称,“这是由于部分用户在其他网站使用了和网易邮箱相同的账号密码,其他网站的账号信息泄露,被不法分子利用,侥幸尝试登陆网易邮箱造成。” 前程无忧方面表示,“这次很可能是对这批泄露信息再利用。换言之,如果这些用户名和密码和其他网站一致,也很可能会侵入这些用户在其他平台上的信息安全。” 前程无忧同时介绍了该公司对用户信息安全的管理方式。据称,前程无忧的用户密码是加密串,非本人无法从前程无忧获取登录密码、进入他人账户,即使数据库的管理人员也无法获取。 此外,前程无忧已经在几年前建立起密码碰撞库,用户必须重设密码(暗码)才能进入在51job的账户。前程无忧表示,此次涉及的用户是多年未登陆51job,没有重设密码的。
“大数据”、“组学”、“数据挖掘”是近几年来我们经常听到的词汇,科研工作中也经常用到二代测序,不管送哪家测序公司进行测序或数据分析,结题报告中都会看到一个标准的分析套路:功能富集分析。
DUNS编号是由Dun & Bradstreet公司于1962年推出的。Dun & Bradstreet公司的总部位于美国新泽西州,是目前世界上最大的企业商业信息提供商。
今天我们比较一下另外的一个miRNAtap包,与multiMiR的结果的一致性,以及两个数据库的差异!首先安装miRNAtap包,代码如下:
最近安全事故濒发啊,前几天发生了《顺丰高级运维工程师的删库事件》,今天又看到了 PHP 工程师在线执行了 Redis 危险命令导致某公司损失 400 万。。
卖羊肉串首先就得有羊肉,于是我就联系了很多养殖场,我又是一个比较负责任的人,为了保证羊肉的质量,我就去考察了一家又一家养殖场,同时我也是个“小气”的人,所以我考察过程中,和对方谈判、比价,最终选了一个养殖场作为我的羊肉供应商,为我提供羊肉。
推荐阅读: 《外包,狗都不去。。》 《这次,我得夸夸西安。。。》 大家好,我是微笑。 最近,俄罗斯受到了以美国为首的西方国家的疯狂制裁,在科技领域,以谷歌、苹果、微软、英特尔、Facebook、亚马逊、戴尔、Oracle 为首的 20 多家科技巨头相继对俄罗斯出手。 作为IT从业人员,我们肯定会想到,如果制裁落到中国头上会怎么样? 笼统地分析可能意义不大,今天转载屠飞飞的一篇文章,具体分析银行对美国科技的依赖。 来源: https://www.zhihu.com/question/23932487/ans
本篇文章来源:知乎 作者:屠飞飞 最近,俄罗斯受到了以美国为首的西方国家的疯狂制裁,在科技领域,以谷歌、苹果、微软、英特尔、Facebook、亚马逊、戴尔、Oracle为首的20多家科技巨头相继对俄罗斯出手。作为IT从业人员,我们肯定会想到,如果制裁落到中国头上会怎么样? 作为IT从业人员,我们肯定会想到,如果制裁落到中国头上会怎么样?笼统地分析可能意义不大,今天转载这篇文章,具体分析银行对美国科技的依赖。 一、科普下什么是IOE 这是三家IT巨头的名字,I=IBM,O=Oracle,E=EMC。 他们都
中国信息化已经搞了近20年,按理说对于SAP和Oracle不应该陌生,可是还是会有一些企业对于SAP和Oracle的咨询,今天我就把几年前整理的一些内容跟大家分享一下。 SAP和Oracle各中优劣 SAP始于德国,偏重与严谨性和对流程上更重视,实施起来SAP比较倾向于改变企业的业务流程来匹配SAP,实现标准化管理。 Oracle来自美系,相对灵活调整起来更加方便,侧重于通过开发来实现企业业务流程,匹配企业管理。所以我们会发现重资产的企业用SAP的偏多,轻资产的企业用Oracle偏多。稳定期的企业更倾向
最近在做一个0元,10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》,直播活动,收集整理文献看到了一个很有意思的研究,节选文章里面的部分图表作为学徒作业哈!
https://ossinsight.io 发布了一份有趣的关于开源数据库的分析报告。从4,572,765,143个GitHub事件中统计分析了开源数据库的许多深刻见解,例如数据库流行度、数据库贡献者、编码活力、社区反馈等。
差异分析相信大家都不陌生了,基本上看我六年前的表达芯片的公共数据库挖掘系列推文即可;
Spark 是 Apache 的顶级项目,一举一动都在整个社区的瞩目之下。凡是由 Apache 推动的项目,自然大概率是比较成功的。回想 Google 当年没将 Big Table, Map Reduce, GFS 及时的推广到 Apache 落地,反而被后来者 Hadoop 夺得了头魁,甚为惋惜。想知道Google 错过这段好时机,可以看我的这篇文章《继蚂蚁金服OceanBase之后,腾讯也祭出了大杀技》
MYSQL 版本的一直在更新迭代,这是一个好事情,新的功能对老的问题进行修改补丁,但这需要一个过程,一个产品的核心是用户, 众多MYSQL 的用户到目前为止有几个进入到了MYSQL 8(我是进了踩了无数的坑,包括各种与开发的PK), 这里的说说MYSQL 8 的N 宗罪.
做数据库的用数据库的,都知道Oracle。作为去IOE的典范,Oracle在中国的形象一方面是被消灭的对象,另外一方面则是根深蒂固的代表。
虽然生存分析如此重要而且如此常见,但是仍然有一些未解之谜,不同数据库来源,病人的不同时期的记录信息,以及不同的阈值分组,拿到的结果居然是可以不一样的!虽然大家都倾向于做各种花式分析,然后挑选具有统计学显著意义的生存分析结果。
数据库发展至今,已经有许多人为的分类和产品,开发者使用最多的关系型数据库,包括MySQL、PG和SQL Server;为适应新的业务逻辑和场景而生的缓存数据库Redis、Memcached;顺应数据爆炸时代的分析型数据库ClickHouse;以及一些其他的图数据库和时序数据库等。 而在开发者眼中,这些分类并不是这么重要,大多数开发者使用数据库的日常是这样的:申请资源——设计表结构——写SQL语句——找DBA审核语句——复现诡异问题——申请扩缩容。而在一遍遍的日常中,总有些痛点让人糟心。接下来就给大家盘点开
曾经作为一名想黑盒出CNVD的小白,我几乎看遍了所有公开的关于挖CNVD的文章与视频,什么CNVD收录条件啊,利用搜索引擎啊,刷弱口令啊,复现三例凑足十个案例啊......
我找到的是jsdelivr提供的GitHub加速服务,这样就可以不用另找地方存储我的图片了。下面我来讲一下这个的具体实现方法。
MrDoc 是州的先生基于 Python 的 Django 框架开发并开源的在线文档系统。
刚进公司,人生地不熟,偷偷藏着本《mybatis入土为安》,以为可以靠mybatis混的轻松点,谁知天有不测风云,大家用的是JPA。
TCGA数据挖掘真的是绵绵不绝,这里就不再赘述了,从基因集到ceRNA,到可变剪切,肿瘤免疫, 再到现在的m6A和自噬基因, 马上缺氧,代谢应该是也要出来了,每次一个策略就是33篇数据挖掘文章。真的是很不走心,比如最近有学徒一直咨询我的m6A,我发现仅仅是ccRCC的就有4篇,有一个很简陋的文章,完全是6个网页工具图表拼凑的,再加上一点点多组学。
十月一前T哥参加了一场浪潮“K迁工程”全国巡展行”,浪潮对外正式推出面向关键应用整合的主机新品-天梭K1 910,天梭K1 910的问世使得浪潮主机业务完成了从高端到中低端市场的延伸,形成了对关键应用主机市场高中低领域的全线覆盖。至此,浪潮主机业务完成了从技术突破到产业化的整体布局。 在本次发布会上让T哥感到惊讶的是,IBM从主机业务的主角沦为了为浪潮站台的配角,这在以往历史中是不现实的,IBM和浪潮一直处于水火不相容的敌对状态,国外主机厂商一直在软硬端设置技术壁垒,防止国产主机厂商接入,而此次与浪潮达成
JAVA中Action层, Service层 ,modle层 和 Dao层的功能区分
本文作者——美国顶级投资机构Andreessen Horowitz的合伙人Frank Chen,在看了大量的AI创业公司后,有感而发! 作者 | Frank Chen 编译 | AI科技大本营(rgznai100) 参与 | reason_W,鸽子 这不是标题党。 过不了几年,AI驱动的创业公司将不再受投资者青睐。(小编注:作者指的是纯技术公司。) 最近一段时间,我们见的大部分创业公司几乎都一个套路——机器学习驱动+使用最新的RNNs和GANs+后端深度学习架构。 但我有一种强烈的感觉,几年后,如果这
过去一段时间来,众多的网站遭遇用户密码数据库泄露事件,这甚至包括顶级的互联网企业–NASDQ上市的商务社交网络Linkedin,国内诸如CSDN一类的就更多了。 层出不穷的类似事件对用户会造成巨大
提到云数据库第一个想当然的问题不是云数据库本身,而是云数据库来了,DBA 都没饭吃了。期初我也是这个想法,因为见过不少云数据库的DBA的不专业和对数据库底层以及高可用,接近白痴的知识水平,对于他们,只有两个字,呵呵。
本文主要大概介绍一下响应式/反应式编程方式访问 redis,不能解决很多生产问题,只是帮助大家对响应式编程有一个认识。
比如RNA-seq的技术基本上取代了affymetrix的表达量芯片,但是甲基化测序技术,无论是WGBS还是RRBS都无法取代illumina公司的甲基化芯片,反而是其自己从27K进化到了450K,以及目前的850K甲基化芯片。每个技术在火爆之前都是一个红利期,那个时候只需要一个简单的实验设计,使用了最新技术,进行了基础分析就可以发表在很好的杂志。
进入正题!最近面试了不少家公司,从一家非外包跳到了外包(委屈脸Ծ‸Ծ),下面总结一下最近的一些心得体会 1.如果在做技术只是为了过日子,而没多大兴趣,那你必须需要考虑一下行业发展方向了。选定一个行业,深入某个行业发展,熟悉业务+技术,你会得到更多。懂业务的技术人,往往比技术大牛,牛逼(所以我选了这家银行外包)
前两天看到字节一个老哥写的帖子,提到高阶开发者必须掌握的技能,其中他明确提出了“精通 MySQL”。 为啥 MySQL 对开发人员如此重要? 第一,不管你去面试哪家公司,数据库是必问项,而 MySQL 使用范围广,无论如何是避不开的; 第二,你对 MySQL 掌握的越深入,意味着你能做的事情越多。 实现业务功能,要懂基本的 SQL 语句; 性能优化,那么索引、引擎就要摸透; 想分库分表,主从同步机制、读写分离你就得了解; 安全方面,你得知道权限、备份、日志等等; 涉及到云数据库,就得懂源码及瓶颈。 我在面
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