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把fasta序列读入到R里面

原贴来自于生信技能树论坛: http://www.biotrainee.com/thread-806-1-1.html把fasta序列读入到R里面~ fasta是什么,我就不多说了! ?...你一定会遇到这个需求,把fasta序列读入到R里面,至于读进去变成一个字符串还是一个list还是一个对象,是后话!...linked_transripts) all_recs <- entrez_fetch(db="nuccore", id=linked_transripts, rettype="fasta") 读入到R里面是一个什么东西...其实你看到这一个简单的帖子,是因为我懒,但是对初学者来说,这里面的内容非常之多,值得学习的地方更是数不胜数,希望大家勇敢的学习这些技巧,然后在下面回帖写出自己的感悟!...其它推荐:http://www.biotrainee.com/thread-805-1-1.html ,R语言的protr包计算多条蛋白序列相似度 里面说到了用这个包的readFASTA函数也可以直接读取

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mysql workbench如何导入数据库_sql数据库脚本导入

首先,打开MySQL workbench,先新建数据库(我们会把.sql文件导入之这个数据库),新建数据库过程如下: 先点击1处,新建数据库,给数据库起个名字,点击appy,就创建成功了。...之后点击2处,就可以看到现有的数据库了。 这里圈出来的是我新建的数据库,双击选中这个数据库(双击选中很重要,因为选中之后才能将.sql文件导入这个数据库中)。...然后点击左上方的第二个图标(图中圈出来的那个),选择自己要导入的.sql文件,点击打开即可。...点击“闪电”形状的按钮,运行.sql文件,就开始导入了,导入完成之后刷新数据库,就可以看到已经导入啦。 刷新newsrec数据库,就可以看到导入的表格了。

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数据库导入问题

不知道为啥,后台好多人都问数据库导入不进去的问题,本来以为这个没什么问题,结果还有不少呀,今天专门解决一下数据库导入的问题,首先,分享的项目基本都是mysql数据库的,其他数据库很少,开发时使用的数据库版本为...mysql5.7,下面先来介绍一下mysql数据库导入的问题,mysql导入数据库这里介绍两种方式导入 打开Navicat for MySQL连接上mysql 找到要连接的数据库,以要连接的数据库为名新建一个数据库...(具体可查看程程序内连接的数据库名,不过分享的项目数据库名基本为程序内连接的数据库) 以上步骤一致,接下来有两种方式导入,方式一 选中新建好的数据库,点击查询 新建查询 找到数据库文件,右键编辑,...以上为数据库导入的两种方式,如果还是不能解决,核对一下数据库版本,还是出错的话,可以给我说哟!...发送项目名称就行了,说数据库不能导入即可

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数据库重有几种方法_数据库

目录 概述 一、Oracle数据库重(推荐放在在第6点) 二、MySQL数据库重 三、sqlserver数据库重 四、pg数据库删除重复数据 ---- 概述 ---- 转发这个主要是有时会有重复数据的需求...,留一个查询方法,大家有空也可以测试一下.. ---- 一、Oracle数据库重(推荐放在在第6点) 1、环境准备 可以看到“ALLEN”和“SMITH”这两个人的数据重复了,现在要求表中name重复的数据只保留一行...DELETE FROM hwb a WHERE a.ROWID > (SELECT MIN(b.ROWID) FROM hwb b WHERE a.name = b.name); ---- 二、MySQL数据库重..._rowid))c ); ps:还可考虑表切换完成重步骤。 ---- 三、sqlserver数据库重 1、环境准备 CREATE TABLE [dbo]....%%lockres%%) FROM hwb b WHERE a.name = b.name); ---- 四、pg数据库删除重复数据 1、环境准备 set search_path to 'public

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linux 里面在docker 里面安装pg 数据库(亲测有效)

/home/softinstall/docker/pg 宿主机的这个地方,就是数据库存放东西的地方 因为我们要使用 Docker-compose 去管理容器,所以要使用Docker-compose...的东西; 我们需要找一个位置,专门放各个yml 文件 现在有一个关于pg的yml 编排文件,就是使用他去管理 找到pg 数据库的镜像名称 kartoza/postgis 里面内容是: version...f pg.yml up -d 查看日志 docker logs -f pgadmin 进入容器内部: docker exec -it 容器id /bin/bash 现在 就要进入这个数据库里面...-it 参数允许你与容器中的终端进行交互,psql -U your_username -d your_database 是要在容器中执行的命令,用于连接到指定的数据库。...执行上述命令后,你应该能够进入 PostgreSQL 容器中的数据库,并且可以执行相应的 SQL 查询和操作。

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sql文件怎么导入sql server数据库_sql怎么导入数据库

4、首先要在数据库中建立好数据库,然后导入脚本,所以先建立一个数据库哦,不要脚本是不知道要往哪个数据库导入脚本的。...5、然后就可以输入导入.sql文件命令: mysql> USE 数据库名; mysql> SOURCE d:/test.sql; 6、看到上面的画面,说明mysql数据库已经导入成功了。...方法二:使用Navicat for MySQL图形界面来导入数据库,使用图形界面导入数据库的步骤很简单 1、在图形界面中建立好数据库之后,使用导入脚本的功能来导入数据库 2、点击选择脚本,选择D盘的test.sql...脚本,然后设置数据库字符格式 3、接着点击开始运行脚本就行了,脚本开始导入了哦!...导入完成之后就会出现成功的提示 4、然后先关闭数据库,再打开数据库就可以看到建立好的数据库的表了。 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。

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卖AI服务器

在收到答复后,他联系了相识的弱电商。结果让所有人满意,他轻而易举地把AI服务器卖了进去。如果未来一如王峰所预见的那样,这次销售已经为渠道伙伴全新的业务空间拉开了一道门缝。...类似这样的小突破,在2019年浪潮AI服务器的销售中,总共为浪潮贡献了过亿元的业绩——在这个将AI服务器交给分销渠道销售的试点之年,浪潮原定的目标不过只有区区的4千万元。...无论4千万,还是1个亿,对于浪潮的AI服务器销售而言,它们显然仍微不足道。...这家2019年上半年AI服务器出货量全球第一,占据中国AI服务器市场50.2%市场份额的服务器巨头真正看重的,是它传统的分销体系能否用今天的小突破,抓住明天AI的大未来。...王峰表示,浪潮将借助元脑生态这一“命运共同体”中的三大平台,帮助AI算法公司技术孵化标准产品,同时帮助传统ISV孵化AI技术能力,最终加速推进AI与传统应用融合并尽快实现规模化的目标。

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在Linux服务器里面安装GISTIC软件

GISTIC这个软件在TCGA计划里面被频繁使用者,用这个软件的目的很简单,就是你研究了很多癌症样本,通过芯片或者肿瘤外显子测序+得到了每个样本的拷贝数变化信息,一般是segment结果,可以解释为CNV...但是考虑到大多研究者用不起matlab,或者不会用,所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题,我们仍然可以把人家写的matlab程序,在linux命令行下面,当做一个脚本来运行!...我们前面下载的GISTIC软件离线包里面是有一个 MCR_Installer 文件夹,里面就有 MCR_Installer压缩包可以解压然后安装。...如果想知道这个GISTIC软件结果图表文件的生物学含义,或者TCGA数据库的CNV文件的GISTIC软件运行方式,我们大约一个星期后继续在生信技能树写教程哈!

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