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1行代码计算肿瘤突变负荷TMB

肿瘤突变负荷(TMB, tumor mutation burden)在生信数据挖掘领域是很古老的东西了,没想到还有人在用它进行各种分析......本文目录: 准备数据 使用maftools计算TMB 生存分析 准备数据 肿瘤突变负荷(TMB, tumor mutation burden)的计算非常简单,你不用费心去找各种代码,找到了估计初学者也看不懂...加载临床数据,临床数据的下载可以参考推文: 新版TCGA数据库学习:批量下载数据 1行代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1行代码提取TCGA的6种表达矩阵是有视频教程的 我更推荐1行代码系列获取的临床信息...Alive ## TCGA-D5-6924-01A-11R-1928-07 TCGA-D5-6924 435 Alive 然后把临床数据和肿瘤突变负荷数据合并一下即可...可能是最适合初学者的TCGA官网下载和表达矩阵整理教程 新版TCGAbiolinks包学习:可视化 1行代码提取6种TCGA表达矩阵和临床信息 1行代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1行代码提取TCGA

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代码分享:用java备份MySQL数据库

),为了操作的灵活性,采用java来实现MySql的备份 核心代码 package org.tio.sitexxx.service.tool; import java.io.BufferedReader...; import java.io.File; import java.io.InputStream; import java.io.InputStreamReader; import org.slf4j.Logger...MysqlTool { private static Logger log = LoggerFactory.getLogger(MysqlTool.class); /** * @param host 数据库服务器主机地址...,可以是ip,也可以是域名 * @param port 数据库服务器端口 * @param dbName 数据库名字 * @param username 数据库用户名 * @param...} return null; } } 非核心代码 非核心代码主要是获取数据库信息这些,同时将生成的SQL做成zip,然后用个定时任务去执行这个程序,这些代码就不贴出来啦 看看效果 [1.png

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Java代码备份和还原MySQL数据库

import java.io.BufferedReader; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream...; import java.io.IOException; import java.io.InputStream; import java.io.InputStreamReader; import java.io.OutputStream...IOException{ Runtime runtime = Runtime.getRuntime(); //-u后面是用户名,-p是密码-p后面最好不要有空格,-family是数据库的名字...IOException{ Runtime runtime = Runtime.getRuntime(); //-u后面是用户名,-p是密码-p后面最好不要有空格,-family是数据库的名字...,--default-character-set=utf8,这句话一定的加 //我就是因为这句话没加导致程序运行成功,但是数据库里面的内容还是以前的内容,最好写上完成的sql放到cmd中一运行才知道报错了

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java数据库操作 (附带数据库连接池的代码)

java访问数据库的方法和有关API,java访问数据库主要用的方法是JDBC,它是java语言中用来规范客户端程序如何来访问数据库的应用程序接口,提供了诸如查询和更新数据库中数据的方法,下面我们就具体来总结一下...JDBC 一:Java访问数据库的具体步骤: 1 加载(注册)数据库   驱动加载就是把各个数据库提供的访问数据库的API加载到我们程序进来,加载JDBC驱动,并将其注册到DriverManager...中,每一种数据库提供的数据库驱动不一样,加载驱动时要把jar包添加到lib文件夹下,下面看一下一些主流数据库的JDBC驱动加裁注册的代码:  //Oracle8/8i/9iO数据库(thin模式) ...三:java操作数据库连接池 在总结java操作数据库连接池发现一篇很好的文章,所以就不做具体总结了,直接上地址: http://www.blogjava.net/chunkyo/archive/2007.../01/16/94266.html 最后附一段比较经典的代码吧: [java] view plain copy print?

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如何热更新线上的 Java 服务器代码

来源:未分配微服务 cnblogs.com/orange911/p/10583245.html 一、前言 二、Arthas的使用 三、热更新 ---- 一、前言 1、热更新代码的场景 (1)当线上服务器出现问题时...代码找到问题,修改好后打包部署的流程可能比较久,可以通过热部署代码及时解决问题 二、Arthas的使用 使用阿里巴巴开源的Java诊断工具---Arthas,他可以附着在我们的Java服务器进程上面,查看服务器状态...trace (4)监控某个函数的调用统计数据,包括总调用次数,平均运行时间,成功率等信息 monitor 4、输入exit可以退出当前的连接,但是附着在服务器进程上的...> 2、拿到java代码后,我们根据需求来修改代码,需要注意的是这里热更新代码的实际原理是调用Java基础类java.lang.instrument.Instrumentation...classLoaderHash 4、通过内存编译将Java文件编译成Class文件 mc -c 5、最后,我们通过命令将class文件进行热更新

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java通过jdbc连接sql server数据库_mysqljdbc连接数据库代码

文章目录 一、需求 二、环境准备 三、项目结构 四、步骤 1、创建数据库、数据表,插入数据 2、创建javaweb项目 3、下载驱动包 4、导入驱动包 5、创建包,创建类 6、程序 7、运行结果 一、...2、电脑安装tomcat(我这里是apache-tomcat-7.0.92) 3、电脑安装mysql,并启动mysql服务(我这里是mysql 5.5) 4、我这里用intellij idea写代码...三、项目结构 JDBC.java用来写主程序 mysql-connector-java-5.1.47.jar是java连接mysql需要导入的jar包 图片 四、步骤 1、创建数据库、数据表,插入数据...class 4、类名写JDBC,点击ok,类创建好了 6、程序 JDBC.java代码如下: package net.jdbc.test; import java.math.BigDecimal...; import java.sql.*; public class JDBC { //数据库url、用户名和密码 static final String DB_URL="jdbc:mysql

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走过微软20年,埋头并发编程15年,如何减少代码的认知负荷?| 码云周刊

技术干货 从Visual Studio看微软20年技术变迁 spring cloud netflix 微服务使用实例 2016 年崛起的 JS 项目 并发编程 15 年 编写良好的代码:如何减少代码的认知负荷...2、编写良好的代码:如何减少代码的认知负荷 Bug 少,性能好,容易修改。好的代码影响深远,而且它可能是产生 10 倍工作效率的开发者的主要原因。尽管好代码十分重要,但开发新手却不得要领。...,因为我们对文本内容分析起来非常吃力,通常第一步是先导入数据库,而手工导入到数据库又是一个费时费力的事情,IIS 6.0 日志导入工具专门针对导入这一步而开发。...是在 JFinal web 框架上搭建的一个 Java 项目。代码规范遵循淘宝分布式框架 dubbox 协议规范,方便分布式部署,数据库采用 mysql,管理端跟微信端前后端分离。...内置 Java 基础工具类、Dubbo 服务治理、单点登录权限系统(按钮级,权限修改实时生效)、支持分布式的定时任务服务及代码生成器、易用高兼容的 boostrap 前端 Html 模板。

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