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GENE ONTOLOGY-基因本体功能查询数据库

其中富集分析需要基因注释数据库作为背景数据。常用的背景数据库就包括KEGG以及GO。之前我们对[[KEGG-基因通路相关数据库]]进行了简单的介绍。...,对基因功能进行注释的数据库。...随着研究的深入,每一个基因的功能也在扩展。GO数据库的内的信息也在逐步的增多。2022-05最近的数据库中,包括了5183个物种的1473200个基因注释结果。...GO ONTOLOGY将物种中基因的功能分成了三个部分:分子功能 (Molecular Function, MF);细胞组分 (Cellular Component, CC);生物过程 (Biological...其中,BP表示生物反应的宏观过程,CC表示细胞内发挥功能的具体位置,MF则表示在细胞微观层面发挥的作用。比如TP53基因,其BP为「细胞周期调控」,CC是「染色质」,MF包括「转录顺式调节区结合」。

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Vc数据库编程基础MySql数据库的表查询功能

Vc数据库编程基础MySql数据库的表查询功能 一丶简介   不管是任何数据库.都会有查询功能.而且是很重要的功能.上一讲知识简单的讲解了表的查询所有....二丶.使用select 语句查询所有的字段跟指定的字段. 1.简单查询.以及需要了解的知识   查询所有命令: select * from 表名   条件查询: select * from 表名...以前我们用的通配符 *来查询所有.此时我们可以换成字段名. ? 3.条件查询.查询名字且sex = 1的时候 ? 此时我们使用了where关键字....过滤重复查询关键字 distinct select distinct name from user; 查询名字.过滤掉重复的. like关键字.模糊查询. 百分比号查询.   ...select * from stu where name like "张%"; 我们想查询带有张的人.都是不知道那个.所以就全部查询了. 下划线查询. 下划线代表占位查询.

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数据库-多表查询-连接查询

数据库-多表查询-连接查询 同时查询多张表获取到需要的数据 比如:我们想查询到开发部有多少人,需要将部门表和员工表同时进行查询 多表查询的分类: 准备数据 -- 创建部门表 create table...-- 只查询一张表不能查询出员工名字和部门名字,需要使用多表操作 select * from emp, dept; 完成多表操作的两种方式: 表连接 子查询 1....,显示员工id,姓名,性别,工资和所在的部门名称 确定查询哪些表 确定表连接条件,员工表.dept_id = 部门表.id 的数据才是有效的 确定查询条件,我们查询的是唐僧的信息,员工表.name='唐僧...联合查询 Union (Mysql 支持) Mysql 为了查询所有表的关联数据,可以将左右连接的查询 联合一起来执行。...语法格式: -- 使用union联合合并左右外连接的查询结果,就是相当于全外连接查询了。

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数据库,单表查询,多表查询,子查询

数据库查找方式进阶 一.单表查询 1.查看表单选择段落 1.disinct 所有内容去重:select disinct * from 表名称; 指定字段去重:select disinct 字段 from..........) as 新名字 2.in关键字查询 "查询平均年龄大于25的部门名称 子查询方式: 平均年龄大于25的部门id有哪些?...筛选出平均年龄大于25的部门id 拿着部门id 去查询部门表查询" select name from dept where id in (select dept_id from emp group...on emp.dept_id = dept.id group by dept.name having avg(age) >25; 3.exists关键字查询 xists 后跟子查询查询有结果是为...既然是表就能链接起来 #综合练习: "查询每个部门工资最高的员工信息 先查询每个部门的最高工资 将查询结果与员工表联合起来 在加条件判断部门id相同并且 最高工资相同 则显示" select *from

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【JavaWeb】107:分页查询功能

所以为了解决这个问题,就引入了分页的功能,基本上大家都应该见到过分页的应用: ? 现在网站一般涉及到查询功能时,都会使用到分页,关于分页其中牵扯到3个重要的参数: 当前页面的页码数pageNum。...而去数据库查询需要:数据的起始索引以及每页数据条数。 所以我们要找出其中的规律: ? 数据库中相关的数据有很多个,假设每页显示的数据为8个,那么 第1页:从索引位为0开始的8条数据。...所以功能更加地强大,也很实用。 ③封装数据 从dao层查询数据,返回值为一个route对象集合,将该集合封装到一个map中, 最后再转换成json数据并返回给web层。...3dao层 利用service传来的pageSize和startCount这两个参数从数据库查询数据。 ? 请求本来是pageNum和pageSize参数。...上述service层主要的作用其实也就是将它们转换成了数据库查询需要的参数。 注意sql语句中的Limt的使用,即从第startCount索引位数据开始,查询pageSize条数据。

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FreeSql 新查询功能介绍

新的查询功能 且先看看实体定义: public class Song { [Column(IsIdentity = true)] public int Id { get; set; }...`Tag_id`) limit 0, 1)) limit 0, 1)) 这个功能不受外建影响,更多前往wiki:《Select查询数据文档》 表达式函数 var t1 = select.Where.../异步数据库操作方法,丰富多彩的链式查询方法; 支持读写分离、分表分库,租户设计; 支持多种数据库,MySql/SqlServer/PostgreSQL/Oracle/Sqlite; | | | | -...除此以外,它还实用的全局、局部过滤器功能,分表分方库功能,以及工作单元的实现; 过滤器功能不仅可以查询时过滤,连删除/修改/插入时都会进行验证,避免开过过程担心数据安全问题; UnitOfWork 可将多个仓储放在一个单元管理执行...,最终通用 Commit 执行所有操作,内部采用了数据库事务; 结束语 本次更新主要涉及 一对一、多对一、一对多、多对多 的查询,当约定配置不正确的时候使用导航属性,会出现友好的错误提示。

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MySQL慢查询功能详解

有人的地方就有江湖,数据库也是,sql优化这个问题,任重道远,我们总是禁不住有烂sql。...怎么办呢,还好各大数据库都有相关烂sql的收集功能,而MySQL的慢查询收集也是异曲同工,配合分析sql的执行计划,这个优化就有了搞头了。...2.如何开启慢查询功能 方法一:在服务器上找到mysql的配置文件my.cnf , 然后再mysqld模块里追加一下内容,这样的好处是会一直生效,不好就是需要重启mysql进程。...#开启慢查询功能,1是开启,0是关闭 mysql> set global slow_query_log=1; #定义查过多少秒的查询算是慢查询,我这里定义的是1秒,5.6之后允许设置少于1秒,例如0.1...特别要注意的是long_query_time的设置,5.6之后支持设置低于0.1秒,所以记录的详细程度,就看你自己的需求,数据库容量比较大的,超过0.1秒还是比较多,所以就变得有点不合理了。

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MySQL数据库——多表查询之内连接查询、外连接查询、子查询

1 多表查询 1.1 多表查询概述 多表查询就是从多个表中进行数据的查询操作,语法:select  列名列表 from 表名的列表  where......】:SELECT *FROM dept,emp; 从查询结果中可以看到共计15条数据,这个查询结果叫做笛卡尔积,如查询2个表,每个表中的数据条数分别为A,B,则查询的结果条数就是A*B;但是看如下结果,...`id`; 3)内连接查询注意事项: 从哪些表中查询; 条件是什么; 查询哪些字段; 1.2.2 外连接查询 1)左外连接:查询的是左表所有的数据及其交集部分。...语法:select 字段列表 from 表1 right [outer] join 表2 on 条件 1.2.3 子查询 【概念】:子查询就是查询中嵌套查询,称嵌套查询为子查询。...【子查询的不同情况】 1)子查询的结果是单列的 子查询可以作为条件,使用运算符进行判断(> >= < <= =),如上述的举例,下例也是    -- 查询员工工资小于平均工资的人    SELECT

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数据库——查询操作

可以说查询数据库编程中最重要的一环,其用途是从一张表或多张表中检索出满足条件的数据信息 下面开始研究Select语句 Select 语句格式: Select [ALL DISTINCT] select_list..._1的表 Select * from 工龄_1 注: *表示查找表中的所有字段(列) 查询姓名列的所有数据(ALL) Select ALL 姓名 from 工龄_1 注意:当中有两个张三...查询结果没有重复的数据(DISTINCT) select distinct 姓名 from 工龄_1 WHERE子句 作用:指定条件过滤数据结果(行过滤) 举例: 查询新建的学生成绩表 select...select * from result_Info 查询“2000期中”(条件) 学科的平均分(按照语文,数学进行聚合) select course_Name,AVG (result) from...ASC 为升序 DESC 为降序 举例: 查询考试类型‘2000期中’,学科为语文的成绩 select * from result_Info where exam_No ='2000期中' and

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sql数据库嵌套查询_select嵌套查询

嵌套查询是将一个select 查询放到另一个查询的where 子句中去 如:查询”xx“同学的所修课程及分数 1.先选择姓名为”xx”的同学的学号 select 学号 from 学生 where 姓名...from 成绩 where 学号= 根据1,2 合并 select 课程名,分数 from 成绩 where 学号 = (select 学号 from 学生 where 姓名=”xx”); 带有in的子查询...查询与”xxx”在同一个系学习的学生的学生姓名及其院系名称 分步骤: 1.先查询 xxx 所在的系 select 院系编号 from 学生 where 姓名=”xxx”; 假如结果为:”yyy”; 2....查询 “yyy”的名称及该系学习的学生 select 姓名,院系名称 from 学生,院系 where 所属院系 = 院系编号 and 所属院系 = “yyy”; 3。...”xx”的学生学号和姓名 1,先从课程表中查询课程名为”xx”的课程编号 as: select 课程编号 from 课程表 where 课程名=”xx” 2.从成绩表中查询学生学号,通过1中的课程编号

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数据库查询优化

数据库服务器在解析时,如果碰到 *,则会先分析表的结构,然后把表的所有字段名再罗列出来。这就增加了分析的时间。...4 慎用SELECT DISTINCT: DISTINCT子句仅在特定功能的时候使用,即从记录集中排除重复记录的时候。...如果SQLServer在Master数据库里不能找到存储过程,那么接下来会将存储过程的拥有者作为DBO去解析。如果存储过程在目前的数据库里,那么它会执行。...14 完整性使用下的约束和触发器: 数据库里不要执行多余的完整性特点。例如,如果你正使用主键和外键约束来强迫引用完整性,则不要添加触发器来实现相同的功能而增加不必要的开销。...* 主键索引:在数据库关系图中为表定义一个主键将自动创建主键索引,主键索引是唯一索引的特殊类型。主键索引要求主键中的每个值是唯一的。当在查询中使用主键索引时,它还允许快速访问数据。

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