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Linux_生物信息学常见文件格式

Linux_生物信息学常见文件格式• fastafasta:一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。...:一种保存生物序列(通常为核酸序列)及其测序质量得分信息的文本格式。...FASTQ文件中,一个序列通常由四行组成: • 第一行:以 @ 开头,之后为序列的标识符以及描述信息 • 第二行:为序列信息,如 ATCG • 第三行:以 + 开头,之后可以再次加上序列的标识及描述信息...(保留行) • 第四行:为碱基质量值,与第二行的序列相对应,长度必须与第二行相同• gff/gtfgff:基因组注释文件 ,总共有 9 列。...gtf:基因注释文件 ,总共有 9 列。列 名称 含义 1 seqname 序列的名字。通常格式染色体ID或是contig ID 2 source 注释的来源。

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    LinuxLinux文件

    Linux文件操作 Linux中,一切皆文件(网络设备除外)。 硬件设备也“是”文件,通过文件来使用设备。 目录(文件夹)也是一种文件。...boot:这里存放的是启动Linux时使用的一些核心文件,包括一些连接文件和镜像文件。...deb:deb是Device(设备)的缩写,该目录下存放的是Linux的外部设备,在Linux中访问设备的方式和访问文件的方式是相同的。...tmp:用来存放一些临时文件 media:Linux系统会自动识别一些设备,例如U盘、光驱等,当识别后,Linux会把识别的设备挂载到这个目录下。...mnt:临时挂载其他文件。 proc:包含了进程的相关信息。 ---- Linux文件的操作方式 文件描述符fd fd是一个大于等于0的整数。

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    Linux进阶 02 生物信息学常见文件格式

    md5文件:确保下载的文件和公司的文件是否相同 md5验证解题思路:第一列代码和第二列文件分开处理less -NS Data/md5.txt |cut -f 1less -NS Data/md5.txt...|cut -f 1 |tr ';' '\n' # 把;分隔符替换为回车less -NS Data/md5.txt |cut -f 1 |tr ';' '\n' >tmp1 #暂时存为tmp1文件less...-NS Data/md5.txt |cut -f 2 |tr ';' '\n' >tmp2 #同理生成tmp2文件paste tmp1 tmp2 >tmp3cat tmp31 fasta格式fasta...缩写为fa特征:两部分,id行和序列行id行:以>开头,有时候会包含注释信息,如chr1、chr2…序列行:一个字母表示一个碱基/氨基酸 ,ATCGN或20种氨基酸2 fastq格式fastq:一种保存生物序列...(通常为核酸序列)及其测序质量得分信息的文本格式fastq文件中,一个序列通常由四行组成:第一行:以@开头,之后为序列的标识符以及描述信息第二行:为序列信息,如ATCG第三行:以+开头,之后可以再次加上序列的标识及描述信息

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    Linux 修改 XFS 文件系统信息管理 xfs_admin

    XFS 是一种 Linux 日志文件系统,本文记录修改 XFS 系统属性的方法。 XFS XfS文件系统是SGI开发的高级日志文件系统,XFS极具伸缩性,非常健壮。...不论目前文件系统上存储的文件与数据有多少,文件系统都可以根据所记录的日志在很短的时间内迅速恢复磁盘文件内容。 传输特性 XFS文件系统采用优化算法,日志记录对整体文件操作影响非常小。...xfs文件系统能连续提供快速的反应时间。笔者曾经对XFS、JFS、Ext3、ReiserFS文件系统进行过测试,XFS文件文件系统的性能表现相当出众。...test-label" 查看卷标 $ sudo xfs_admin -l /dev/sda2 label = "test-label" 图像界面查看卷标修改 Ubuntu 可以在磁盘管理界面查看卷标信息...管理界面中第一行信息为卷标,第二行为分区名称 也可以使用 blkid -p 命令查看分区详细信息,其中包含了LABEL值即为卷标 参考资料 https://baike.baidu.com

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    【Android 逆向】Android 系统文件分析 ( cpuinfo 处理器信息文件 | self 当前进程信息文件 | meminfo 当前内存信息文件 )

    文章目录 一、cpuinfo 处理器信息 二、self 当前进程信息文件 三、meminfo 当前内存信息文件 一、cpuinfo 处理器信息 ---- cpuinfo 文件中 , 会标明 CPU 型号...CPU revision : 1 Hardware : Qualcomm Technologies, Inc MSM8998 walleye:/proc # 二、self 当前进程信息文件...---- self -> 24374 是当前进程信息 , 任何程序读取 /proc/self 文件时 , 获取的都是自己当前进程的信息 , 不同的程序读取该文件获取的信息都是不同的 ; 这里的 24374...root 0 1970-01-01 08:00 thread-self -> 24374/task/24374 walleye:/proc # 三、meminfo 当前内存信息文件...---- meminfo 是当前内存信息文件 , 存储当前 Android 系统的内存使用情况 ; 这是总体的进程使用情况 ; 130|walleye:/proc # cat meminfo MemTotal

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    Linux本地信息收集

    我们在获取到webshell之后,经常会遇到Linux的操作系统,这是我们需要对Linux系统本地的敏感资源进行信息收集,下面就是一些有用的信息获取方式。...获取内核,操作系统和设备信息 命令 作用 uname -a 打印所有可用的系统信息 uname -r 内核版本信息 uname -n 系统主机名字 hostname 主机名 uname -m Linux...信息 df -a 文件系统信息 用户和组 命令 作用 cat /etc/passwd 列出系统所有用户 cat /etc/group 列出系统所有组 cat /etc/shadow 列出所有用户hash...find / -uid 0 -perm -4000 -type f 查找root权限的SUID文件 find / -perm -2 -type f 找出可写的文件 find / !...which %program_name% 查找有用的软件 cat /etc/apache2/envvars 查看运行apache的帐号 总结 这些内容基本上包含了在linux上需要去了解的所有信息

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