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ChAMP R安装事故

ChAMP 包提供了完整分析illumina甲基化芯片pipeline, 和普通Bioconductor 包安装一样,代码只有简单两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用电脑是windows 操作系统,64位R-3.4.3,安装过程除了网速较慢,花费一点时间安装之外,并没有出现任何问题。...(now), ...): 无法载入共享目标对象‘D:/work/R-3.4.3/library/mvtnorm/libs/x64/mvtnorm.dll’:: `已达到了DLL数目的上限......dll 文件就是windows操作系统下动态链接库,加载R过程,如果这个R包有对应动态链接库,那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统,R语言对应环境变量都可以.Renviron文件中进行设置。

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安装Apache之后,浏览器无法访问问题

前面说到服务器上安装Web服务器Apache:https://www.jianshu.com/p/81eb2e086267,今天继续启动,继续学习,操作如下,此时此刻办公室就剩下我一个人了,好孤独~...1:登陆服务器时候 启动一下apache,执行下面的命令启动apache apachectl start 一般安装完Apache环境之后,正常的话直接输入ip就可以看到apache测试页面,差不多是这样...但是,浏览器输入我们ip或者域名时候是这样,没有办法访问 ?...在网上看到了一个解决办法: 1:修改系统防火墙配置文件,第五行配置增加允许80端口监听外来ip iptables -I INPUT 5 -i eth0 -p tcp --dport 80 -j ACCEPT...如果依旧无法访问,可能是阿里云服务器没有配置安全组 可以参考解决方案: https://help.aliyun.com/document_detail/25471.html?

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python安装pycharm不显示_pycharm上无法安装各种库

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。...使用pycharm安装库总是出现安装不成功提示 ‘Non-zero exit code (2)’ 错误提示: 最后找了很多方法都不能安装成功,最后发现可以降级pip就可以 步骤...: 1、点击Terminal 2、在里面输入“python -m pip install pip==20.2.4”对pip进行降级 3、重新安装你需要库或者模块 最后还有一个小点...: 如果降级pip后,设置里面能成功安装模块,但是导入引用时候提示没有安装,那就在‘Terminal’里面用‘pip install +名称’再次安装一下,再导入就行了 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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R语言】因子临床分组应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R因子(factor) 今天我们来结合具体例子给大家讲解一下因子临床分组应用。 我们还是以TCGA数据CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...参考资料: ☞【R语言】R因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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R安装安装程序包****时退出状态不是0,或者版本不适一种解决方法。

oconductor包几乎都是安装下面代码安装。比如:miRBaseVersions.db包 if (!...但安装时候会发生出错。提示需要3.5版本R。你说要4.0。安装时提示要3.5。 ? 我也换成3.5版本R安装,结果显示:安装程序包****时退出状态不是0。...我想很多人安装包都遇到这样状况。如果你安装miRBaseVersions.db包时也出现这样状况,你可以尝试我下面的解决方式,我这里解决方法是下载安装包本地安装。 ?...下载后,RStudio。 ? 然后选择下载包,安装就可以啦。 ?...我这里是3.6版本R安装,不是3.5,我这里安装成功了,可能你不一定能成功,那是因为有一些依赖包可能你没有安装,我这里是因为很多有关生信分析R包我都安装过,所以不报错。 ?

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ubuntu 愉快安装 Jenkins

这篇文章详细记录了 ubuntu 安装 Jenkins 一步又一步,因为找了很多 Linux 下安装 Jenkins 教程,不是很满意 所以决定自己写一篇以备后用(终于让我找到了Java...su root 切换用户 现在可以使用 root 但是无法远程连接,还需要设置/etc/ssh/sshd_config PermitRootLogin 值为 yes 设置后记得重启 ssh 服务.../bin/bash -ilex,此为我安装 nvm 后终端可以访问, Jenkins 构建 shell 脚本时无法访问解决方案 通过-i 参数和-l 参数让 bash 为 login shell...总结 使用过程,还有很多需要记录,后续再逐步总结。...最近十分不容易用Jenkins+Docker把项目部署到服务器了,找资料过程,发现很难一下就找到自己想要,果然,还是得自己动手总结了。

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如何在Redhat安装R包及搭建R私有源

1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat配置R环境后,我们知道对于多数企业来说是没有外网环境离线环境下如何安装R包,能否搭建R私有源对R包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat安装R包及搭建R私有源。...1.Linux已安装Apache2服务并正常运行 2.R安装完成并正常使用 2.Package安装 ---- RPackage安装主要分为在线安装和离线安装两种方式,如下: 1.在线安装 R控制台输入...(如果是自己制作R包,同理PACKAGES末尾添加包描述信息也是可行,未做验证有兴趣朋友可以验证下告诉Fayson)。...4.配置R使用私有源 ---- 1.$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site Rprofile.site文件增加如下内容: [root@ip-172-31

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