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小小配置一下,装github的R包畅通无阻

什么是 GitHub 个人访问令牌 GitHub 个人访问令牌(Personal Access Token, PAT)是 GitHub 提供的一种身份验证方式,用于代替传统的用户名和密码。...为 R 语言装包配置个人令牌 3.1 临时用用 Sys.setenv(GITHUB_PAT = "xxxxxxx") 将 xxxxxxx 替换为你刚刚生成的令牌,然后使用代码安装: devtools...注意:Sys.setenv 代码设置,在重启 Rstudio 窗口之后就会失效,也就是说你每次要安装之前,都需要先运行 Sys.setenv 来设置令牌。...➡️保存并关闭文件,重启 Rstudio。 这样,每次运行 R 时,令牌会自动加载,无需重复设置。...➡️检查是否配置成功 关闭在重新打开 Rstudio,运行: Sys.getenv("GITHUB_PAT") 能看到自己的令牌就是成功了。 4. 注意事项 令牌等同于密码,不可轻易示人。

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    Azure DevOps+Docker+Asp.NET Core 实现CICD(一 .简介与创建自己的代理池)

    它基本上提供了CI/CD所需要的全部功能。唯一的问题是在国内没有服务器,最近的服务器在香港。...3.创建代理服务器 点进去上一步创建的代理服务器池,找到agent 创建一个自己的代理服务器 可以看到微软给我们提供了多种平台版本的代理服务器客户端 这里我们选择linux然后下载复制tar包地址: ?.../bin/installdependencies.sh to install 创建自己的访问令牌 (PAT) 进行身份验证(这里一定要操作,后面需要使用) 点击右上角选择access Token ?...输入【Y】接受Team Explorer Everywhere许可协议; 输入服务器URL,即项目的Azure的地址; 输入身份验证类型,这里直接回车,选择默认的PAT; 输入个人访问令牌,即PAT;.../run.sh 这个时候我们应该就能在网页上看到我们的代理服务器上线了如图: ? 4.采用服务的形式运行代理服务器 上面我们的代理服务器虽然上线了,但是在linux中是主线程的形式,退出就关闭了..

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    使用账号密码来操作github? NO!

    并且从2021年8月13日开始,在 GitHub.com上对Git操作进行身份验证时将不再接受帐户密码。 这个改动只对使用用户名密码进行github交互的用户受影响。...创建令牌 令牌,英文名叫做token,个人访问令牌英文简写为PAT。它是一种使用密码对 GitHub 进行身份验证的替代方法。...下面讲解一下怎么在git中缓存令牌。事实上令牌跟密码是等价的,在git中缓存密码的方式同样适用于缓存令牌。 缓存令牌 通过设置credential.helper的缓存方式,可以对密码进行缓存。...成功通过身份验证后,你的凭据将存储在macOS钥匙串中,并且每次克隆HTTPS URL时都会使用钥匙串中的凭证。 Git不会要求你再次在命令行中键入凭据,除非你更改凭据。...GCM Core同样可以在windows和linux环境下使用。 总结 通过生成新的token,并更换现有的缓存密码,最终我的github又可以重新提交了,赞!

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    如何使用Shiny Server部署R应用程序

    准备 首先您需要一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器,并且已开启防火墙。...没有服务器的同学可以在这里购买,不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验,学会安装后在购买服务器。 您还需要在您的本地计算机安装RStudio,如何安装请参考RStudio官方文档。...将Shiny应用程序部署到远程服务器 应在您的CVM上完成本节中的步骤。...您可以通过将此选项设置为禁用此行为并隐藏目录的内容off。有关配置Shiny Server的详细信息,请参阅官方管理员指南。...生产部署还可能希望在反向代理后面运行Shiny Server以利用其他安全性和优化功能。怎么样,学会了吗?快尝试购买一台服务器进行测试吧!更多Linux教程请前往腾讯云+社区学习更多知识。

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    dyno使用教程--1个R包实现59种单细胞轨迹推断分析

    的安装过程会使用GitHub API,默认的API限制是60次请求,所以会遇到API rate limit exceeded的问题,解决方式如下: •在Rstudio命令行执行 usethis::browse_github_pat...()建议一个GitHub token•执行usethis::edit_r_environ() 添加以下环境变量GITHUB_PAT = 'your_github_token•重启R/Rstudio (重新载入...主要步骤 主要步骤如下[4] 准备数据 为数据集选择最佳方法 运行TI方法 轨迹可视化 从生物学角度解释轨迹 Rooting Milestone labelling 基因表达在轨迹上的展示 A global...如果我们是在linux集群上进行的操作,这一步弹出guidelines shiny的界面可能需要通过很复杂的设置才能获得,而且也不利于把命令行写成脚本执行。...我们设置了label_milestones = TRUE,所以里程碑被标注到了轨迹模型上,model一共有4个里程碑我们只标注了3个所以上图只显示3个。 ?

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    只有想不到,「99」种扩展Jupyter功能的好方法

    你可以通过 web 界面读写它们,就好像文件在本地一样。 我最喜欢的内容管理器是 Jupytext。在你读写.ipynb 的文件时,它会将其转换为.py 文件,并保持文件同步。...认证器 JupyterHub 是一个多用户应用,所以用户需要登录,认证器的工作是对登录用户进行身份验证。...你可能让他们从一个节点生成 Docker 容器、将它们连接到 Kubernetes 上、让它们使用你的 HPC 集群、或者使用你的 Hadoop 或者 Spark 集群、用 systemd 提供服务、或者直接将这些服务器视为不同的...Linux 用户。...很容易就能找到 nbconvert 导出器的方法 Bundler 扩展使你可以在菜单栏添加「下载为」按钮。

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    只有想不到,「99」种扩展Jupyter功能的好方法

    你可以通过 web 界面读写它们,就好像文件在本地一样。 我最喜欢的内容管理器是 Jupytext。在你读写.ipynb 的文件时,它会将其转换为.py 文件,并保持文件同步。...认证器 JupyterHub 是一个多用户应用,所以用户需要登录,认证器的工作是对登录用户进行身份验证。...你可能让他们从一个节点生成 Docker 容器、将它们连接到 Kubernetes 上、让它们使用你的 HPC 集群、或者使用你的 Hadoop 或者 Spark 集群、用 systemd 提供服务、或者直接将这些服务器视为不同的...Linux 用户。...很容易就能找到 nbconvert 导出器的方法 Bundler 扩展使你可以在菜单栏添加「下载为」按钮。

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    只有想不到,「99」种扩展Jupyter功能的好方法

    你可以通过 web 界面读写它们,就好像文件在本地一样。 我最喜欢的内容管理器是 Jupytext。在你读写.ipynb 的文件时,它会将其转换为.py 文件,并保持文件同步。...认证器 JupyterHub 是一个多用户应用,所以用户需要登录,认证器的工作是对登录用户进行身份验证。...你可能让他们从一个节点生成 Docker 容器、将它们连接到 Kubernetes 上、让它们使用你的 HPC 集群、或者使用你的 Hadoop 或者 Spark 集群、用 systemd 提供服务、或者直接将这些服务器视为不同的...Linux 用户。...很容易就能找到 nbconvert 导出器的方法 Bundler 扩展使你可以在菜单栏添加「下载为」按钮。

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    更现代的R代码编辑器----本地VSCode-R搭建

    此外,RStudio的性能问题可能会影响大型数据分析项目。当处理大型数据集时,RStudio可能会变得缓慢,特别是在使用RMarkdown等功能时。...此外,VSCode还具有出色的Git集成,可以使您更轻松地管理代码版本控制。您可以使用VSCode内置的Git功能轻松查看代码差异、提交更改和解决冲突。...图片 过程--以macOS为例 我们需要的东西 本地VS Code及插件 R(R LSP Client已被整合, 不需要单独安装) R tools 本地R包 languageserver httpd 服务器应用...配置 VS CODE配置 设置-插件-R, 将Bracketed Paste点上, 网上的教程一般还要点alwaysUseActiveTerminal, 但是我的实际体验是不好用.......因为设置了之后就无法自动从terminal打开r了.

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    ASP.NET Core + Jenkins实现自动化发布

    需要注意的是:如果使用git ssh 协议(也就是格式为git开头的仓储地址),则添加身份验证凭据的时候,凭据类型只支持:Username with password (用户名和密码验证)、SSH Username...创建身份验证凭据秘钥前,需要将服务器登录用户先切换到jenkins用户,不然以root用户创建的秘钥文件,将无法拉取代码(存在权限问题),切换到jenkins用户前,先执行以下命令,以便允许jenkins...sudo usermod -s /bin/bash jenkins 切换到jenkins用户 sudo su - jenkins 在服务器上输入以下命令创建身份验证凭据私钥,-C 后面的参数可以是任意内容..., cat ~/.ssh/id_ed25519.pub gitee上添加公钥后,在服务器上执行以下命令 ssh -T git@gitee.com 通过执行以下命令读取ssh身份验证私钥内容,并输入到...在jenkins 服务器上执行以下命令,创建ssh 身份认证秘钥,并将公钥复制到应用服务器上,以便在编译成功后,直接复制dll到应用服务器上,而无需输入应用服务的登录密码,需要注意的是,创建秘钥前,先切换到

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    2024年07月_生信入门班_微信群答疑笔记

    【软件安装】现在百度网盘的一些软件和b站视频里的不一样,少了一些,例如git,这种是不用装的吧? 可以不装哈,安装好R Rstudio 以及钉钉这些必备的即可,然后安装R包。...【R包安装】这条下载比较久是正常的嘛 正常的,但建议更新到 R4.4 版本 【软件安装】我的R是百度网盘里的R4.4.0,在Rstudio上安装R 包,上面显示程序包是 用R4.4.1版本建造的。...如果大家觉得服务器网络有问题,大概是中国大陆的问题,服务器本身没有特殊的网络设置哈,你有很多取巧的办法,比如合理的镜像地址,需要自己摸索自己尝试 options(BioC_mirror="https:/...【Linux报错】请问为什么无法激活rna环境呢? 你前面安装conda可能都没成功,重新安装一下conda看看。 【Linux基础】麻烦请问服务器CPU有56%占用,是哪个软件在运行呢?...本来所有账号的家目录是在 /home/Julxxxx的,但是为了方便管理,服务器管理员把大家的账号家目录设置为了 /trainee/Julxxxx 前面Linux基础有讲过 /trainee ,你应该是忘了

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    【愚公系列】2022年12月 使用Jenkins实现程序的自动化发布

    图片 需要注意的是:如果使用git ssh 协议(也就是格式为git开头的仓储地址),则添加身份验证凭据的时候,凭据类型只支持:Username with password (用户名和密码验证)、SSH...本人选择用户名和私钥验证 在服务器上输入以下命令创建身份验证凭据私钥,-C 后面的参数可以是任意内容,但通常用邮箱账号。...,在服务器上执行以下命令 ssh -T git@gitee.com 图片 通过执行以下命令读取ssh身份验证私钥内容,并输入到 jenkins 身份验证凭据的以下位置。...cat ~/.ssh/id_ed25519 图片 4、脚本配置 在项目的解决方案文件(.sln)同级目录下新建名称为jenkinsfile的文件,并输入以下脚本内容 git 初始化配置 git init...在jenkins 服务器上执行以下命令,创建ssh 身份认证秘钥,并将公钥复制到应用服务器上,以便在编译成功后,直接复制dll到应用服务器上,而无需输入应用服务的登录密码,需要注意的是,创建秘钥前,先切换到

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    这个40M的小工具助你在windows下处理数据如虎添翼!!

    或是想快速获取100个大小为1M的文件的行数呢?这两个问题以我对windows浅显的知识就很难解决,但是换个方向如果是在Linux系统中这两个问题是不是就迎刃而解了呢?...首先我们需要在Rstudio的Global Options中设置Terminal对应Git Bash。...然后我们就可以在Terminal里输入Linux命令了。...其他 Git for windows 使用技巧 wget功能拓展使用 我们可以通过查看上面提到的存放Git中的Linux命令的文件夹,来了解Git可以使用哪些Linux命令。...迅速打开进入某个文件夹的Git bash Git bash有一个好处是因为在某个文件夹中打开的Git bash here,所以打开的Git bash的所在位置都是文件夹的位置,然后可以通过cd来切换位置

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    2024年09月_生信入门班_微信群答疑笔记

    】我用给的账号密码无法登录服务器 试试换个网络环境,比如手机热点。...【服务器登录】请问一下我现在每次登录时,账号不会自动补齐,是什么原因呀 命令行ssh登陆本来就是无法补齐的,如果你之前登陆过,你可以在登陆之前按方向键上键,可能可以找到之前登陆命令。...【Linux实战】我在进行hisat2构建索引时,一直报错,是不是单纯是储存空间不足?该怎么办? 大概率是空间不够哈,学会构建索引这个操作就行,服务器有构建好的,不用重复运行。...【服务器登录】为啥登不上服务器了呢 换个网络环境试试,还有就是电脑不要开代理。...【R绘图】绘图这一步经常会遇到:因plot窗口太小无法显示图片 点“Zoom”,依然不显示图片 根据Kimi提示,用ggsave()限制图片大小后保存,可以解决,但麻烦 怎么设置Rstudio,可以直接在

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    【GitHub】:账号密码不好使了??

    原因 GitHub 为了安全性考虑,在2020年7月就准备对所有需要使用身份认证的git命令切换成基于令牌的身份验证。...并且从2021年8月13日开始,在 GitHub.com上对Git操作进行身份验证时将不再接受帐户密码。 这个改动只对使用用户名密码进行 GitHub 交互的用户受影响。...解决 令牌,英文名叫做token,个人访问令牌英文简写为PAT。它是一种使用密码对 GitHub 进行身份验证的替代方法。 你可以将token看做是密码,不过这个token具有权限和有效时间的限制。...首先登录 github.com, 在我的账号下方,选择settings: 然后在左侧边栏中,点击开发人员设置: 然后选择左边的个人访问令牌,点击生成令牌按钮,就可以生成令牌了。...在创建过程中,我们需要输入和选择一些数据: 这样一个令牌就创建好了。 注意,创建好的令牌需要及时保存,因为后续也不能再从网页上查看该令牌的内容。令牌的保存需要和密码的保存一样注意安全。

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    扩展 GitOps:在 Kubernetes 上轻松持续集成和部署

    身份验证可以通过不同的方式处理,但在本演示中,我们将使用 HTTPS。...:     在以声明方式创建用于身份验证的密钥之前,我们需要创建password密钥字段中使用的 GitHub 个人访问令牌 (PAT)。...我们现在应该能够开始在 Argo CD 应用程序中使用存储库定义。Argo CD 配置    现在我们可以通过 GitHub 进行身份验证,以从集群配置存储库中获取内容。...通过设置log.level为debug而不是默认值,info我们可以获得有关正在考虑哪些图像以及哪些图像不符合约束的更多信息。...对所展示的设置的一个可能的改进是切换到git写回方法,通过更具可重复性以及清晰的审计跟踪来改进设置。

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    如何在Linux运行RStudio Server并实现Web浏览器远程访问

    前言 RStudio Server 使你能够在 Linux 服务器上运行你所熟悉和喜爱的 RStudio IDE,并通过 Web 浏览器进行访问,从而将 RStudio IDE 的强大功能和工作效率带到基于服务器的集中式环境中...下面介绍在Linux docker中安装RStudio Server并结合cpolar内网穿透工具,实现远程访问,docker方式安装可以避免很多问题,一键安装,如设备没有安装docker,需提前安装docker...本地访问 上面安装完成后,访问Linux 8787端口,如局域网访问,需检查一下防火墙,这里使用Linux 内部浏览器访问,可以看到成功访问 输入用户名: rstudio 和自己设置的密码,即可登录成功...Linux 安装cpolar 上面我们成功安装了RStudio server,并局域网访问ok,下面我们在Linux安装cpolar内网穿透工具,通过cpolar 转发本地端口映射的http公网地址,我们可以很容易实现远程访问...,即可登录成功,这样一个远程地址就创建好了,在cpolar中,默认是随机地址,下面我们设置固定地址 6.

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