以上柱形图中，我们如果想要了解五个公司的销售额均值以及单个公司销售额与均值的对比情况，需要在图表中添加一条平均线。...当然这种均值线在分面状态下也是可以添加的。...辅助线在散点图中也是经常使用的一种图表元素，它可以帮助我们对分布形态进行分割和归纳，使得数据分布形态及趋势更加明显。 接下来使用diamond数据集来展示散点图中的辅助线。...像素画处理之后，再加上均值十字线，你可以清晰地看到，数据分布形态中，左下角最为密集。 辅助线的另外一种常见的用途就是在时间序列数据中。...start是一个代表日期的字段，也就是说我们可以赋值给geom_vline函数一个字段，从而在折线图中绘制出多个时间点的辅助线。
6.1 时间序列图：基于时间序列对象（ts） ggfortify 包中的 autoplot() 可以对时间序列直接绘图。...：时间跨度为 1 年 6.3 多个时间序列 在本例中，基于长数据格式进行可视化。...这样，只要调用一次 geom_line，就会绘制多条彩色线，每条线代表 variable 列中的每个唯一 value 。...应用场景有： 想要描述数量或体积（而不是价格之类的变量）随时间的变化； 有很多数据点。对于很少的数据点，可以考虑绘制柱状图。 希望展示各个类别的贡献。...这更适用于时间点很少的时间序列。下面给出使用 ggplot2 包绘制的案例，来源于：Top 50 ggplot2 Visualizations[5]。
ggplot2 R的作图工具包，可以使用非常简单的语句实现非常复杂漂亮的效果。...利用颜色深浅来代表年份，随着颜色从浅蓝变成深蓝，可以观察到失业率与失业时间的关系的变化趋势。...我们已经讨论了如何利用外观参数在同一图中比较不同分类的差异。...你可以将它想象成是一个三维的数组：分面构成了二维平面，然后图层给予其在新的维度上的扩展。在这个例子中，不同图层上的数据是一样的，但是从理论上来讲，不同的图层中可以有不同的数据。...scale和mapping是紧密相关的概念。 ? 几何对象(Geometric)：几何对象代表我们图中看到的图形元素，如点、线、多边形等。 ?
散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述，您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。 左边的图使用点geom，右边的图使用光滑的geom，一条适合数据的平滑线。...ggplot2中的每个geom函数都有一个mapping参数。 然而，并非每一种aesthetic都适用于每个几何。 您可以设置点的形状，但无法设置线的“形状”。 另一方面，您可以设置线的线型。...获得全面概述的最佳方法是ggplot2备忘单，您可以在http://rstudio.com/cheatsheets找到它。要了解有关任何单个geom的更多信息，请使用help：？...许多geom，如geom_smooth（），使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms，您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。...image.png 如果将映射放在geom函数中，ggplot2会将它们视为图层的本地映射。 它将使用这些映射来仅扩展或覆盖该层的全局映射。 这使得可以在不同层中显示不同的aesthetics。
），qplot还提供了参数data，控制传入的数据框名称，这样在qplot()中涉及数据框中变量的参数就可以直呼其名而不用加$； 在介绍qplot能够绘制的其他几何图像之前，我们先来理解一下其默认的模式...x*y*z, data=data) 同样的，我们也可以对图中的散点设置颜色、大小、形状等参数，与plot不同的是，qplot中可以使用更加丰富的内容和更自由的赋参方法，我们可以传入类别型数据，qplot...，在qplot中，当传入x为类别型变量，y为数值型变量时，通过传入geom='boxplot'，可以绘制出分组箱线图，例如下面绘制钻石颜色color与每颗钻石每克拉价格price/carat的分组箱线图...，可以自动绘制每个类别的频数统计条形图： qplot(color, data=data, geom='bar', fill=color) 2.2.7 时间序列图 通过设置...geom='line'可绘制线型图，当传入x为时间型数据时，即绘制出时间序列图： data("economics") data <- economics qplot(date, unemploy/pop
R语言绘制基因表达基因的“对称散点图 转录组分析中，计算了两组间差异表达的基因后，通常怎样表示？您可能第一时间想到可以使用火山图。...的确，火山图是使用频率最多的，在火山图中可以很轻松地根据基因在两组间的Fold Change值以及显著性p值，识别和判断差异表达基因概况。...图中的虚线代表了|log2FC|=1时的阈值线。 在该图中，我们可以很轻松地观察差异基因整体分布状态和数量比较的信息。 4 绘制差异基因散点图，颜色表示p值 上图中没有将p值信息展示出。...因此另一种思路是，颜色代表p值，这样就可以在图中获得一个渐变梯度。同样使用ggplot2的方法绘制，和上述过程相比仅在颜色指定上存在区别。...这样可以很方便地看出，在两组中的表达值差异越大的基因，p值越小，二者趋势是一致的，重在描述了差异倍数和p值的关系。
不过，我做不到，我只能做到的是可以绘制出几乎全部的图表的雏形，而且我个人觉得，把ggplot2学习到这个程度就足够了。...✦ 几何对象（Geometric objects, geoms）代表在图中实际看到的点、线、多边形等。...✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。 我在几年前《生信五周年》全国巡讲的活动重点推荐过《50个ggplot2现成图表》代码希望大家可以学习它！...ggplot2 Scatterplot 这个教程侧重于8个单元： 展现单个连续变量：散点图，折线图，气泡图 进阶条形图：区域图 展现排序：棒棒糖图 展现连续变量的统计分布：条形图，箱线图，小提琴图，峰峦图...://mp.weixin.qq.com/s/_Q16zDZgCr3XoO0r3wqRkw 如果我说，全部学完，需要一年的时间，不知道你还是否愿意入坑呢？
如果我们想比较某个数值在不同分组之间的变化差异。或者随着时间序列的变化趋势，往往会用到折线图。折线图是在我们的科研绘图当中最为常用的图形之一。 ?...如此高维的数据，如果我们想要观察他们的变化趋势，应该使用何种图形呢？ 在上面的这张图形中，仅仅有两条线。如果有几十条、几百条折线，或者多个分组呢？不知道大家有没有考虑过这样的问题。...顶点在每一个轴上的位置就对应了该对象在该维度上的中的变量数值，比如下面的这张图。 ? 从图中我们可以看出，平行坐标图和折线图相比是非常相似的。...对于时间序列的不同时间节点、不同梯度的反应浓度等等数值，都可以使用平行坐标图来进行具体数值的描述。下面我们就跳过对图形背景的描述，进入到实际的绘图时间过程当中。...现在，我们要做的，就是比较这150个基因在4个分组中的变化趋势。那么下面我们就来进行图形的绘制。在这里我们用了GGally包中的ggparcoord()函数进行绘图。
导语 GUIDE ╲ 用许多条目来表示和比较时间序列，将它们绘制为折线图可能具有挑战性。绘制此类数据集的一种更方便的方法是地平线图，它能够压缩数据但仍保留所有信息。...背景介绍 ggHoriPlot 允许我们在 ggplot2 中轻松构建地平线图。...在 ggHoriPlot 中，这可以通过在 geom_horizon() 中指定所需的原点参数来实现。...运动和休闲活动发生在一天中的不同时间。...包，ggHoriPlot绘制地平线图是非常有优势的，允许我们比较简单的生成基本图形，通过与ggplot2的联合使用，可以实现大数据的可视化，结果清晰美观，非常适合大家使用！
在本课中主要学习ggplot2绘图。 基础包绘图应用越来越少，因为ggplot2与基本R绘图函数相比功能更强大。ggplot2语法需要一些时间来适应，但一旦学会，会发现它非常强大、灵活。...例子包括： 点（geom_point，geom_jitter为散点图，散点图等） 线（geom_line，时间序列，趋势线等） 箱线图（geom_boxplot） 所有几何对象的详细列表及使用场景，请查看...但可以添加参数theme()手动改变它。由于我们将此图层添加到最上层（即代码的最后），因此更改的任何细节都会覆盖在theme_bw()中的设置的。...可以将它与ggplot2中可用的任何不同几何对象图层一起使用，轻松学习修改图形！...进行绘图所需的所有信息，可以尝试绘制一个箱线图。
在ACF可视化中，ACF或pACF被绘制为滞后的函数。指示的水平蓝色虚线表示自相关显着的水平。 分解时间序列数据 StSt TtTt ϵtϵt 执行分解的方式取决于时间序列数据是加法还是乘法。...正如我们所看到的，采用对数已经使季节性成分的幅度沿时间均衡。请注意，总体增长趋势没有改变。 在R中分解时间序列数据 要分解R中的时间序列数据，我们可以使用该decompose函数。...右图显示了一个非平稳过程，其中平均值随着时间的推移而增加。 介绍了与时间序列数据分析相关的最重要概念后，我们现在可以开始研究预测模型。 ARMA模型 ARMA代表自回归移动平均线。...移动平均线的影响 可以通过绘制自回归函数来研究移动平均线的影响： ? 请注意，对于自回归图，我们需要注意第一个x轴位置表示滞后为0（即标识向量）。...我们将模拟缺点，冰淇淋消费作为时间序列，并使用收入，价格和平均值作为外生变量。在开始建模之前，我们将从数据框中创建一个时间序列对象。 我们现在调查数据： ?
优点：大家都熟悉的形式；非常适合于类别之间的简单比较 缺点：许多条形图可能会造成趋势线的印象，而不是突出离散值；多组条形可能变得难以解析 04 气泡图 散布在两次测量上的点，为数据增加了第三个维度（...常用于通过把多条线画在一起来比较趋势，例如几家公司的收入。（也称为体温记录图或趋势线。）...优点：大家都熟悉的形式；非常适合于一目了然地表现趋势 缺点：如果我们重点关注趋势线，将更难看到和探讨离散的数据点；太多的趋势线使得人们很难看到任何单根的线 12 棒棒糖图 类似于点图，但在单个测量值上绘制两个点...，使得评估图中的单个项变得困难 13 隐喻图 箭头、金字塔、圆圈和其他公认的图形，用来表示非统计概念。...优点：和将所有的线都叠加在同一个图表中相比，更容易比较多个甚至几十个类别之间的差异 缺点：如果没有戏剧性的变化或差异，就很难在比较中发现其意义；你在单个图表中看到的一些“事件”就会丢失，例如变量之间的交点
分面 如果组在图中并排出现而不是重叠为单一的图形，关系就是清晰的。我们可以使用facet_wrap()函数和facet_grid()函数创建网格图形（在ggplot2中也称为刻面图）。...标尺可以连续也可以离散。 在ggplot2中标尺的概念很普遍，可以通过查看以scale_开头的函数来了解更多信息。 主题 主题可以让我们控制这些图的整体外观。...theme()函数中的选项可以让我们调整字体、背景、颜色和网格线等。主题可以使用一次，也可以保存起来应用到多个图中。...mytheme.png 多重图 基础绘图中，我们使用图形参数mfrow和基本函数layout()把两个或多个基本图放到单个图中，同样，这种方法在ggplot2中不适用。...将多个ggplot2包的图形放到单个图形中最简单的方式是使用gridExtra包中的grid.arrange()函数。我们需要事先安装这个包。 让我们创建3个ggplot2图并把它放在单个图形中。
优点：大家都熟悉的形式；非常适合于类别之间的简单比较。 缺点：许多条形图可能会造成趋势线的印象，而不是突出离散值；多组条形可能变得难以解析。...11 折线图 显示值如何变化的一些相互连接的点，通常随时间的推移而变化（连续数据）。常用于通过把多条线画在一起来比较趋势，例如几家公司的收入。（也称为体温记录图或趋势线。）...12 棒棒糖图 类似于点图，但在单个测量值上绘制两个点，用一根线连接，以显示两个值之间的关系。绘制几个棒棒糖图，可以产生类似于浮动条形图的效果，其中的值并不全都固定在同一个点上。...缺点：当变量“翻转”（高值是前一个棒棒糖图中的低值）时，多个棒棒糖图之间的比较可能令人困惑；值相似的多个棒棒糖图，使得评估图中的单个项变得困难。...优点：创造了一种简单的之前和之后的叙事，无论是单个值还是许多值的总体趋势，都让人很容易看出和掌握。 缺点：排除了两种状态之间值的所有细节；太多纵横交错的线条可能让人很难看到单个值中的变化。
ggplot2 中各种数据可视化的基本原则完全一致，它将数学空间映射到图形元素空间。...接下来我们将探索用 ggplot2 包绘制常用统计图形的方法。 2.分布的特征 在探索数据的过程中，最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量，可以绘制直方图或密度曲线图。...ggpubr 包提供了在平行箱线图上添加组间比较的统计学差异的功能。该包是一个 ggplot2 的衍生包，可以生成用于论文发表的统计图形，值得医学研究工作者探索。...另外，我们还可以用 ggplot2 绘制与上图相似的小提琴图，结果如下图所示。...包绘制的图形，该函数可以导出多种不同格式的图片。
例如，如果你想在x轴上绘制带有gdpPercap的散点图，在y轴上绘制lifeExp，那么你可以添加一个带有相关美学函数的geom_point（）几何图层： # describe the base ggplot...我们还可以使用geom_smooth（）在点上添加平滑的趋势线图层。...我们还可以将points geom图层与line geom图层或任何其他类型的geom图层组合在一起。 线图适用于绘制时间序列，因此下面我们使用点和线图层绘制平均预期寿命。.../地区年份分组数据框架上绘制一条线，则会得到一个奇怪的锯齿形图案。...对于上面的线图示例，我们绘制了每个大陆的平均预期寿命时间线，而不是指定“group”参数，您可以将colour参数指定为continent。 这将由continent自动分组和着色。
图层（Layer）：图层是ggplot2中最基本的组成单元。每个图层都由数据、图形属性和统计变换组成。通过将多个图层叠加在一起，可以创建复杂的图形。...几何对象（Geom）：几何对象是图层中的图形元素，用于表示数据的形状、大小、颜色等属性。ggplot2提供了多种几何对象，如点、线、条形、面积等。...ggplot2提供了多种主题，如theme_gray、theme_bw等。 通过组合和调整这些概念，ggplot2可以绘制出高度可定制的、美观且具有统计意义的图形。...组装较复杂：提供了许多零件，供用户跟需要进行组装，比较费时间。...集成统计方法：Seaborn提供了方便的函数来集成统计方法，如拟合回归线、绘制置信区间和展示数据的分布。 总的来说，各有各的优点，没有最好的，只有最适合的！
优势：根据想要观测的变量将数据分为每一分面，显示出每一分面中的趋势及不同分面之间的差别劣势：由于数据被分割为一个个的分面，数据整体的趋势就看不出来了如果有一个更大的数据集，就需要根据目标判断，如果看整体趋势的话就不用分面...，如果看单个变量的变化趋势就可以使用分面（5）阅读?...1.6.2 几何对象函数geom_point()geom_smooth()ggplot2中的每个几何对象函数都有一个mapping参数同一张图中可以放置多个几何对象ggplot(data = mpg)+...geom_line、geom_boxplot、geom_histogram、facet_grid（2）在脑海中运行以下代码，并预测会有何种输出。接着在R中运行代码，并检查你的预测是否正确。...哪些参数可以控制它的行为？（5）在比例条形图中，我们需要设定group = 1，这是为什么呢？换句话说，以下两张图会有什么问题？
与线性趋势的偏差 从系列中提取趋势的第一种方法是在常数和趋势项上回归目标变量并获得拟合值。在下图中绘制。...该方法的另一个缺点是，它仅排除趋势，而不排除噪声，即序列中很小的波动。...下图绘制了由HP过滤器获得的实际GDP周期性成分的值，并将其与线性趋势下的序列的值进行比较。 ? 尽管HP过滤器在经济学中得到了广泛的应用，但它们的某些功能也受到了广泛的批评。...小波滤波器 Yogo（2008）提出使用小波滤波器从时间序列数据中提取业务周期。该方法的优点是该函数不仅允许提取序列的趋势，周期和噪声，而且还可以更明确地了解周期发生的时间段。...emd 函数可以在EMD 包中找到， 并且需要一个不同的时间序列，一个边界条件和一个指定的规则，在该点上迭代算法可以停止。滤波方法的结果与HP，BK和小波滤波相对不同。 ? ?
Excel能实现大部分二维图表的绘制与基础的数据处理与分析，具体可以参考学习《Excel数据之美:科学图表与商业图表绘制》。...时间序列型 时间序列型图表强调数据随时间的变化规律或者趋势，X轴一般为时序数据，Y轴为数值型数据，包括折线图、面积图、雷达图、日历图、柱形图等。...其中，折线图是用来显示时间序列变化趋势的标准方式，非常适用于显示在相等时间间隔下数据的趋势。...饼图是用来呈现部分和整体关系的常见方式，在饼图中，每个扇区的弧长（以及圆心角和面积）大小为其所表示的数量的比例。但要注意的是，这类图很难去精确比较不同组成的大小。...R中ggplot2包的geom_path()和geom_polygon()等函数，结合地理空间坐标系可以使用DataFrame格式的数据，绘制不同投影下的世界与国家地图。
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