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R-ggplot2 空间绘图 - 房价气泡图的绘制

目前计划推出基础图表的绘制教程推文(会同时推出R和Python两个版本)，原因在于有时苦苦找不到数据，不仅导致想绘制的图表完成不了，而且也白白浪费了时间，再者也有小伙伴私信要求多些基础教程的推文，当然...geojson数据格式读取 ggplot2 可视化展示 openxlsx 实现R灵活读取excel文件 ggtext包实现文本定制化操作 geojsonio包对geojson数据格式读取 这里使用的数据和上期推文的数据一样...，读取geojson格式文件的代码如下： HK <- geojson_read("香港特别行政区.json",what='sp') 即可实现R语言对geojson格式地图文件的读取。...定制化设置 以上的代码将主要的绘图结果绘制出来，这部分要做的就是将图表进行美化处理：如配色、图例等绘图元素的定制化设置。...包 library(ggtext) #需要定制文本的地方 labs( title = "香港在售二手房分布图", subtitle="数据来源: <span style

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R语言ggplot2做玫瑰图（花瓣图）的简单小例子

这种图叫玫瑰图或者花瓣图，如果使用R语言的ggplot2来做的话， 比较常规的实现办法是先做柱形图，然后再用极坐标，比如 df<-data.frame(x=LETTERS[1:6],...印象里好像见过python实现推文开头提到的图。...，我们试着用R语言的ggplot2试一下 假设我们有10个数据 x<-1:180 x y<-sin(10*x*pi/180) df<-data.frame(x=x,y=abs(y)) df$yz<...下面是完整的代码 library(tidyverse) library(ggplot2) set.seed(123456) df<-data.frame(x=LETTERS[1:10],...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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R语言ggplot2做云雨图的简单小例子

云雨图的样子如下 ?...是一半的小提琴图加散点图的组合，看起来有些像云朵加雨滴的形式，所以得名云雨图，主要的作用还是用来展示数据的分布情况 之前看到过相关推文进行介绍，大部分的推文介绍的实现办法都是使用gghalves包，这个包中的函数可以将...ggplot2的常规图形只画其中的一般，比如 geom_half_boxplor() geom_half_violin() 最近在一个介绍ggplot2扩展包的链接里发现了一个包叫see，这个包里有一个函数是...geom_violindot()函数，画云雨图非常方便，下面简单介绍一下代码 首先是安装see这个R包 install.package("see") 使用鸢尾花的数据集作图 library(ggplot2...试了其中的几个，发现这个配色还挺好看的 ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length,

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R语言在树状图的末端标注物种值

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来分享一个进化树与棒棒糖图结合的案例来进行系统发育可视化展示，案例主要使用phytools包+基础绘图语法来进行展示，当然也可以使用ggplot语法来实现相同的功能。...h<-max(nodeHeights(eel.tree)) # 获取树的最大节点高度 plotTree(eel.tree,ftype="off",lwd=1,direction="upwards",ylim...0,2*h), # 绘制鳗鱼树 mar=c(0.1,3.1,0.1,0.1)) pp <-get("last_plot.phylo",envir=.PlotPhyloEnv) # 获取最后一次绘制的树的信息...cbind(anole_resid$resid,exp(anole.data[,"SVL",drop=FALSE])) # 组合数据 h<-max(nodeHeights(anole.tree)) # 获取树的最大节点高度...绘制变色龙树 mar=c(0.1,5.1,0.1,0.1),lwd=1) pp<-get("last_plot.phylo",envir=.PlotPhyloEnv) # 获取最后一次绘制的树的信息

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R语言ggplot2气泡图叠加图片的简单小例子

image.png 之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法，这个是气泡图，用ggplot2很方便能够实现，但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片，当然出图以后用其他软件来编辑是可以实现的，但是对齐之类的可能会比较麻烦...如果能用代码实现就能节省一些时间，正好最近看到一个ggplot2的扩展包 叫做 ggimg 对应的github的主页是 https://github.com/statsmaths/ggimg 下面我们就来试试能不能用这个包来实现推文开头的图...(ggimg) library(ggplot2) ggplot()+ geom_point_img(data=df, aes(x=x,y=y,img=img),...size=5)+ scale_x_continuous(limits = c(0.5,3.5))+ theme_minimal() image.png 接下来我们把职业生涯三分命中率的数据加进来用来做气泡图...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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R语言ggplot2绘制曼哈顿图展示GWAS分析的结果

之前分享过一篇推文介绍过这个内容 R语言ggplot2包画曼哈顿图的一个简单小例子，但是当时自己不太懂曼哈顿图，实现是直接借助ggplot2的geom_jitter()这个函数实现的。...这个函数并不会考虑每个变异位点的位置，而实际的曼哈顿图是需要根据变异位点的位置来画的。今天的推文重新介绍一下ggplot2绘制曼哈顿图的代码。...R语言中也有现成的包和函数可以直接画曼哈顿图，我这里选择用ggplot2来画是因为出图后可以非常方便的组合其他的图，比如可以叠加一个基因结构的图，然后再拼一个展示不同基因型表型差异的图。...这些如果是用ggplot2来做，都可以用代码实现，省去了手动拼图的过程。...，我这里的示例数据是每条染色体的长度多加了10M chr.len<-read_excel("D:/R_4_1_0_working_directory/env001/data/20230912/at_gwas.xlsx

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算法的权值-基于局部权值阈值调整的BP 算法的研究.docx

基于局部权值阈值调整的BP 算法的研究.docx基于局部权值阈值调整的BP算法的研究刘彩红'(西安工业大学北方信息工程学院,两安)摘要:(目的)本文针对BP算法收敛速度慢的问题,提出一种基于局部权值阈值调桀的...所以本论文提出的算法是对局部神经元权值阈值的调整,而不是传统的BP算法需要对所有神经元权值阈值进行调一整,(结果)通过实验表明这样有助于加快网络的学速度。...关键词:BP神经网络,学算法,距离,权值阈值调整-hong(Xi'ing,Xi'):e・,,'.^算法的权值,.,work....但以往大多改进算法,在误差的反向传播阶段也就是训练的第二阶段,是对所有神经元的权值阈值都进行修改的。针対不同的输入,神经网络激发不同的神经元,所以可以在训练的第二阶段修改部分神经元的权值阈值。...2基于局部权值阈值调整算法的改进思想本文提出的算法结合生物神经元学与记忆形成的特点⑸,针对特定的训练样本,只激发网络中的部分神经元以产生相应的输出,而未被激发的神经元产生的输出则与目标输出相差较大,那么我们就需要対未被激发的神经元的权值阈值进行调整

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R语言ggplot2画分组堆积柱形图展示密码子偏向性的RSCU值

之前录制视频介绍过如何绘制堆积柱形图展示密码子偏向性的内容，但是之前的内容只能画一组堆积柱形图，如果你有好几个物种想要画到一起，可能比较麻烦，我记录一些我自己的画图代码 ?...RSCU值文件的内容 V2是氨基酸 V3是密码子 V5是RSUC值 V6是密码子在下方的位置 V7是x轴的位置，取值是1到20 代码应该还有很多需要完善的地方，先在这里记录一下 #rm(list=ls(...)) library(readr) library(dplyr) library(ggplot2) library(ggstar) library(aplot) help(package="ggstar...，只是发现mdnice这个工具的一个新功能~可以插入动图，就试了试 ?...欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子

偶然间在github 上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材 链接是 https://github.com/blmoore/blogR ，主要内容有 image.png 光看这个可能有些枯燥...大家感兴趣的话可以自己研究研究 我们直接运行画图代码 加载ggplot2 library(ggplot2) 最基本的热图 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c...)) + geom_tile() image.png 调整热图方块的一些内容 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour...调整热图的颜色和图例 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour="white", #linewidth...欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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R语言可视化——用ggplot构造期待已久的雷达图

之前一直苦恼于ggplot函数无法制作雷达图，心想着既然饼图可以通过柱形图+极坐标模拟出来，为啥雷达图不行。...我尝试着用折线图+极坐标来模拟雷达图（之前在制作饼图和圆环图以及玫瑰图的时候就是这样做的）。...后来又是在浏览r语言论坛时，无意间看到一个围绕ggplot2包开发的插件——ggradar，果不其然，是专门用于辅助ggplot2制作雷达图而生的。...#以上构造了一个值区间为0~1,个数为40的5行8列随机数矩阵。 rownames(mydata) <- LETTERS[1:5] ?...可以看出，ggradar函数支持多序列雷达图，只是对它规定的数据结构很不能理解，为啥不是列代表分类，行代表轴变量呢，跟ggplot的语法还是有一些偏离，不过只要数据构造好之后，作图函数的语法是相当简练的

3.4K60

Excel图表学习56： 制作次要坐标轴显示百分比的图

图1 示例中，我们的销售额目标是500，目前各区贡献数额大小不同，在图表中使用堆积柱形图表示当前总销售额和各区所占销售额。 现在，我们需要在图表右侧再显示销售完成的百分比。 步骤1：绘制堆积柱形图。...如下图2所示，选择数据区域A1:B5，插入堆积柱形图。经过适当的调整后，结果如上图1所示。 ? 图2 步骤2：添加一个名为“空”值为0的新系列，如下图3所示。...在原有数据的下面，我们插入一行新数据，并将它们作为图表的新系列。 ? 图3 在图3的右侧，我们进行了计算，其中目标值500，图表中主垂直坐标轴最大值300，相对应的次垂直坐标轴应该显示60.0%。...步骤3：将新添加的值为0的系列移动到次坐标轴，结果如下图4所示。 ? 图4 步骤4：调整图表格式。...删除网格线，设置三个可见的坐标轴直线的颜色以及刻度格式，将次坐标轴的最小值设置为0，最大值设置为60%，并以百分比显示，结果如下图5所示。 ? 图5

2.5K10

R语言ggplot2画一幅漂亮的哑铃图

在找资料的时候偶然发现的这个图，这个图来源于论文 Russian periphery is dying in movement: a cohort assessment of internal youth.../ikashnitsky/2f3e2b2af6f50911bb775bbce6eb0fb8 https://ikashnitsky.github.io/2019/dotplot/ 感觉这个图很漂亮，数据代码还是公开的...，所以我们来重复一下 这个图横坐标是 变化率，纵坐标是地区，每一个纵坐标对应的是两个 1980-84 1988-92 变量，其中每一个对应的是实心点和空心点，census和stat record 这个图目前还想不到如何应用于我自己的数据...df_plot_1<-read.csv("20210822.csv") head(df_plot_1) image.png 画图代码 library(ggplot2) library(tidyverse...，次条推文是广告 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果

如果是研究比较多的物种，可以直接使用R语言包clusterProfiler做富集分析当然是最好，最后可以很少的代码拿到很漂亮的结果图。...但是如果是比较小众的物种，没办法借助clusterProfiler这个R包的话,如何得到和clusterProfiler一样的可视化结果呢？...今天的推文介绍一下相关的R语言ggplot2作图代码 clusterProfiler能出的图有柱形图、气泡图、网络图、热图等 今天的推文只介绍柱形图和气泡图，网络图和热图相对比较复杂。...(这里根据什么标准设置这个阈值我也不太清楚，欢迎大家留言讨论) library(tidyverse) dat %>% filter(Corrected.P.Value dat01...dim(dat01) dim(dat) 最基本的柱形图 library(ggplot2) ggplot(dat01,aes(x=Input.number/500,y=Term))+ geom_col

2.3K20

R语言ggplot2画漂亮的环形柱形图的一个实例

在twitter上看到一个图 image.png 配色很漂亮，代码和数据也是公开的，今天的推文来学习一下他的代码 代码来源的链接是 https://github.com/NearAndDistant/...data_science_with_r 这个链接还有很多其他的R语言ggplot2作图的例子，代码和数据都是公开的，大家自己有时间可以重复一下其中的代码 image.png 这个环形柱形图的代码是以shiny...app的形式提供的，这里我们忽略shiny app,只把作图代码拆解出来 首先是整理数据的代码 library(tidyverse) # import data for project breed_traits_raw...需要把添加狗的品种名的代码放到添加图片的代码的后面，要不然会有遮盖 image.png 同样的代码在话另外一个品种 top_dogs %>% filter(breed == "Yorkshire...Terriers") %>% ggplot() + geom_segment(data = data.frame(y=seq(0,5,1)), aes(x =

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