有没有办法将HSD.test的结果从agricolae直接导入到ggplot2中的geom_text()中？ - 腾讯云开发者社区

本来直接就想用他给的代码，水一篇。但是！！！ ❝分享的是有道云笔记的小程序，没有办法在电脑端打开，只能在手机端查看，我太难了。...另外，我觉得上面的示例不够美观，好的例子至关重要，坏的例子南辕北辙。我想到了数据分析师的格言：没有数据，创造数据也要上！没有理想结果，多试几次就能达到，所以，关于图片误用，一切皆有可能，哈哈。...10.701356 3.861863 14.69404 4.779965 10 0.5543380 9.527209 6.253815 14.61953 3.916631 这个数据，需要变为长数据 ^[就是ggplot2...方差分析因为模拟的数据，我们直接用aov进行方差分析，直接用agricolae进行多重比较吧，就不整那些正态性检验，齐性检验了。注意，这里要讲Day转化为因子！...❞ 整体思路：将水平列出来计算标准差将数据合并 xx = aggregate(y ~ Day, dd,sd) names(xx) = c("Day","sd") xx re2 = re1 %>%

6962 0

ggplot2饼图和图注顺序不一致如何解决

不知道大家用ggplot2绘制饼图的时候有没有遇到过饼图上展示的顺序和图注上展示的顺序不一致的情况。今天小编就来跟大家一起来探讨一下这个问题。...问题其实出在name的levels上，饼图默认会根据name的levels来按逆时针绘制。我们从堆积柱形图上可以发现，程序会默认按字母顺序来对name进行排序，这也是因子levels的默认排序方法。...修改name的levels，使其跟图注中的顺序一致 library(dplyr) data=data.frame(name=c("apple","pear","orange","banana","grape...修改图注中的顺序，使其跟原来name的levels的顺序一致 library(dplyr) data=data.frame(name=c("apple","pear","orange","banana...的顺序 index=order(data$name) library(ggplot2) pie=ggplot(data, aes(x="", y=prop, fill=name)) + geom_bar

2.7K2 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

R语言ggplot2画环状柱形图(circular barplot)的简单小例子

这个是很长时间之前写的内容了，忘记了有没有在公众号发过，正好有人在公众号留言问这个环形的柱形图应该如何实现，就想到了这篇笔记，在公众号发一下一下是笔记的内容偶然间找到了一份教程利用ggplot2绘制环状柱形图...paste("Mister",seq(1,60),sep=""),value=sample(seq(10,100),60,replace=T)) df$id<-seq(1,nrow(df)) library(ggplot2...Rplot07.png 标签看起来有些乱，自己没有想到解决办法，模仿教程中的解决办法：为参数hjust和angle赋予数据来调控标签的位置 df$angle<-96-df$id*6 ggplot(df,...Rplot09.png 叶绿体基因组通常是典型的四部分结构，如何把上图改成四部分然后添加四种不同的颜色，原教程提供的解决办法是添加缺失值，画图时就会出现空白的部分从而达到分割的目的 df1<-data.frame...Rplot10.png ######小知识点：ggplot2更改绘图区空白大小 https://ggplot2.tidyverse.org/reference/element.html theme(plot.margin

4.3K2 0

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图

image.png 今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b，很多个饼状图放到一起 ?...image.png 最基本的想法就是单独画好多个饼状图，然后通过拼图实现，但是因为之前重复地图的时候新遇到了一个包是 scattermore可以直接指定输入数据，然后一次性将所有饼状图画好，这样就省去了拼图的步骤...theme_void()+ theme(legend.position = "none")+ scale_fill_manual(values = c("#5b9bd5","#e64b35")) 结果如下...fill="#5b9bd5")+ geom_label(data=df2,aes(x=x+0.1,y=y,label=label), fill="#e64b35")+ geom_text...image.png 模仿的还差不多这里遇到一个问题是：ggplot2添加文本的时候默认是以坐标轴的位置居中分布的，有没有办法让文本以坐标的位置居左或者居右来呢？

2.1K2 0

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画图展示SNP位点的碱基类型

image.png 之前的推文已经介绍过上半部分的基因结果的画法，今天的推文介绍下半部分SNP位点的碱基类型的实现办法，背景颜色这里借助的是ggplot2包中的geom_tile()函数；表示碱基的文本借助的是...geom_text()函数这里最开始的思路是借助aplot这个包的拼图功能实现的，但是上下两个部分拼接的时候遇到了报错，使用patchwork拼接的时候也遇到了报错，报错的内容忘记保存了，暂时不知道如何解决...，使用ggbio这个包做的图可以继续使用ggplot2的函数叠加，但是如果使用ggplot2的拼图方式却不行。...image.png 这个原图中有7个品种，我这边就不全部准备了，我这边只准备3个第一列是品种的名字第二列是snp的位置第三列是snp在图上的y轴位置，从-1开始，每多一个品种就减一第四列是碱基类型...第五列是碱基的分类 A代表变异的碱基，R是参考序列的碱基第一步是加载需要用到的R包 library(ggh4x) library(ggplot2) library(ggbio) library(GenomicRanges

1.7K5 0

经典方差分析：手把手教你读懂、会用1

如果不同小组为非均衡设计（也即不同小组样本数目不同），则表达式中因子顺序会对结果有影响（也即A*B与B*A结果不同）。...S-N-K检验：StudentNewman Keuls，q检验法（与秩和检验法类似，将两个样本数据一起排序，通过两端非重叠数据个数计算Q值进行检验），在R中使用agricolae包中的SNK.test(...TukeyHSD()函数或者agricolae包中的HSD.test()可以进行分析； Duncan检验：是基于NewmanKeuls检验法更新的方法，生物统计领域最常用，检验尺度适中，在R中可以使用agricolae...具体分析方法如下： #对方差分析结果进行图基（Tukey）检验 TukeyHSD(fit) 函数直接返回了校正后的p值。...()函数计算去除协变量影响后的每组均值： library(effects) effect("dose", fit) 可以看出其结果与直接计算的均值是有差异的。

2.9K2 0

R语言学习 - 图形设置中英字体

绘制生信宝典调查总结文中的柱状图时，出现了中文乱码，就搜索了下解决方案，记录如下。修改图形的字体 ggplot2中修改图形字体。...geom_text的字体 geom_text(family="Arial") ggplot2支持中文字体输出PDF showtext包可给定字体文件，加载到R环境中，生成新的字体家族名字，后期调用这个名字设定字体...合并字体支持中英文通常情况下，作图的字体都是英文，ggplot2默认的或按需求加载一种字体就可以了。...但如果中英文混合出现时，单个字体只能支持一种文字，最好的方式是合并两种字体，类似于Word中设置中英文分别使用不同的字体。...一个示例字体文件自己从Windows获取，School bell从Google fonts获取。

2.8K8 0

火山图|给你geneList，帮我标到火山图上

得名原因也许是因为结果图像火山吧! ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来火山图只标示指定基因？这需求都遇到过吧。...一载入R包，数据 library(ggplot2) library(openxlsx) library(dplyr) #绘制火山图数据 data <- read.xlsx("火山图.xlsx", sheet...scale_color_manual(name = "", values = c("red", "green", "black"), limits = c("UP", "DOWN", "NOT")) + geom_text...了解一下ggplot2绘图的方式，标示的基因就是各个基因的text，然后想办法将其赋予到一个 aes 中即可。三标示指定基因和上面类似，将指定基因添加到绘制数据中即可。...3.3 标示文件中的指定基因 ggplot(data = data2, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val), color = change)) + geom_point

3.7K2 3

（数据科学学习手札38）ggplot2基本图形简述

一、简介　　上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则，为了生成各种复杂的叠加图层，需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则，本文便就常见的基础几何图形进行说明；二、各基础图形 2.1...abline()、hline()与vline() 　　在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()：　　...(ggplot2) library(reshape2) #将原数据转置以处理成行对应一个年份的形式 data <- data.frame(t(USPersonalExpenditure)) #添加年份变量...data$year <- as.numeric(row.names(data)) #利用reshape2中的melt函数按照year列将原数据集伸展为“年份、变量名、对应数值”的形式 data <-...，箱线图是非常有代表性的，它通过图形表现五数概括的情况，在数据基本的描述性统计中具有重要意义，而ggplot2中必然可以绘制箱线图，而且可以绘制得非常精美，下面先看一个最朴素的分组箱线图形式： p <-

5.1K2 0

你确定！？这些基础绘图技能你全都掌握了！？

函数中shape属性进行更改，这里有0~25数字分别代表不同形状，且21~26号的点形状有fill属性，其他数字所表示的形状则只有颜色(colour)属性。...()函数中的starshape参数修改形状。...Example Of ggplot2 fontface 「Justification」:对齐(左、右、居中) 字体对齐在添加文本图层中经常遇到，ggplot2中有水平(horizontal) 和垂直(vertical...使用0和1之间的数字表示：top = 1, middle = 0.5, bottom = 0 left = 0, center = 0.5, right = 1 展示结果如下： just <- expand.grid...[2] 总结今天这边推文详细介绍了R-ggplot2绘图体系中基础的点、线、字型的内容，希望对刚学习ggplot2绘图的小伙伴有所帮助。

7272 0

R语言之可视化（20）之geom_label（）和geom_text（）

Geom_text（）将文本直接添加到绘图中。 geom_label（）在文本后面绘制一个矩形，使其更易于阅读。...themama中描述了显示的详细信息，但请注意geom_text使用字符串，而不是表达式。...对齐标签和条形 df <- data.frame( x = factor(c(1, 1, 2, 2)), y = c(1, 3, 2, 1), grp = c("a", "b", "a", "b") ) ggplot2...不知道你想给标签赋予相同的虚拟宽度 ggplot(data = df, aes(x, y, group = grp)) + geom_col(aes(fill = grp), position = "...image 如果将文本放在堆积的条形图中每个条形图的中间，需要设置position_stack（）的vjust参数 ggplot(data = df, aes(x, y, group = grp)

36.7K4 3

温故而知新，ggplot2 饼图的几点笔记

对于为什么 ggplot2 中没有专门用于饼图绘制的函，有人说：“柱状图的高度，对应于饼图的弧度，饼图并不推荐，因为人类的眼睛比较弧度的能力比不上比较高度（柱状图）。”...coord_polar coord_polar() 是 ggplot2 中的极坐标函数，它可以弯曲横纵坐标，使用这个函数做出蜘蛛图或饼图的效果。...饼图中添加文字的位置控制 - 借助公式绘制饼图的过程中，利用 ggplot2 的 geom_bar 结合 coord_polar 实现。...(aes(x=1.2,y=cumsum(dat$Num)-dat$Num/2 ,label=as.character(dat[,2])),size=3) p_pie 总结可知：ggplot2 在画饼图的过程中设定填充的因子方向总和图片坐标中的方向相反...文章的最后，提个问题：有没有通用的 R 包或者函数，可以得到下面效果的饼图？

1.3K1 0

「R」数据可视化15：倾斜图

“今年注定是个与众不同的春节，因为武汉肺炎病毒，整个中国都有些不太平。但是，过去几十年中国曾克服过很多困难，相信这一次，也一定会平安渡过。...不仅因为我们比过去更加强大了，也因为在强大的过程中我们依然心连心甚至因为信息网络变得更加紧密。...以下是两个倾斜图的例子： ? 左边的图统计了农场动物从2005年到2015年数量的变化，右边的图是2000年到2013年的移民居住情况。...Top10的省份由于湖北省的人数过高，可以看到下面的省份都挤在了一起，这时候可以考虑使用ggrepel将文字区分开，或者是有AI等工具调试会比较方便。...当然，针对图可以再做一些美化，不过个人觉得可以直接在AI软件中调试，这样会更方便一些，所以本次就偷懒了～最后希望疫情赶快控制住！加油！

1.2K1 0

RunTSNE二维及三维结果可视化

前情提要在单细胞PCA降维结果理解以及细胞聚类分群及其可视化中，除了有PCA以及聚类分群结果的可视化以外，都展示了一下UMAP图 UMAP图是运行完RunUMAP()的线性降维可视化结果，和RunUMAP...()同样起非线性降维作用的还有RunTSNE() 在单细胞PCA降维结果理解中，我们运行完RunPCA之后，一共会保留下来50个维度，根据不同维度的相关性基因可以区分不同的细胞类群。...单细胞周更中，有一期就是对TSNE和UMAP图进行美化——tsne及umap图美化使用ggplot2美化：提取tSNE二维坐标数据，以及细胞分群情况celltype 计算二维坐标的中位数，作为细胞分群情况的标签坐标...使用ggplot2绘制散点图使用stat_ellipse加置信区间使用geom_text加上标签信息 #提取坐标数据 tSNE=pbmc@reductions$tsne@cell.embeddings...，tsne和PCA的结果差异不算很大，但PCA结果中因为有feature.loding的基因信息，所以不同维度根据其相关性基因可以对细胞亚群进行区分 DimPlot(pbmc,label = T,reduction

1561 0

商务图表案例——仿经济学人分组漏斗图~

今天看到一个看着挺养眼的经济学人图表案例，于是职业病爆发了，用ggplot2按照自己的思路写了一遍。现在把代码思路分享给大家！...可以看到，ggplot2图形对象禁止同时在一个图形中使用两个或者两个以上的标度，否则最后的标度将会覆盖前面的同名标度。...这个问题已经困惑了我将近一年了，最初的疑惑是在这篇文章里： R语言可视化——多图层叠加（离散颜色填充与气泡图综合运用）好在如果是多边形和气泡图同时使用颜色填充的时候，我们可以通过将气泡图使用1~5号仅有...数据地图多图层对象的颜色标度重叠问题解决方案但是针对本例而言，这个问题没法直接解决，因为我要填充的两个图层都是fill属性，但是并不是一点儿也没有解决办法，我将其中一个图层（polygon）的颜色类别变量因子拆开成了三个图层分别映射...，虽然费事了，暂时没有办法，这是唯一的办法。

1.5K4 0

R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程的简单小例子

本篇推文来自于公众号读者的投稿最近在画散点图的时候使用lm函数进行线性回归拟合之后，想将拟合的方程与R2加入到绘制的图片中。在百度中翻了半天，终于在一个外国网站上找到了方法。...基本的散点图并添加拟合曲线 library(ggplot2) p <- ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_smooth(method = "lm...95%置信区间，可以<em>将</em>se参数<em>的</em>FALSE改为TRUE p <- ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_smooth(method = "lm",...添加拟合方程和R2 这里他的办法是自定义了一个函数，这个函数看起来还挺复杂的，先不用管这个函数的意思了，直接复制过来用就可以了 lm_eqn <- function(df){ m <- lm(y...第二种方法现成的R包 ggpmisc 加载R包，模拟数据集 library(ggplot2) library(ggpmisc) df <- data.frame(x = c(1:100)) df$y

23.4K4 1

跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2以原点为中心画坐标轴

前天的推文里跟着Nature microbiology学画图~ggplot2散点图添加分组边界模仿论文中的散点图以原点为中心花了一个坐标轴，R语言的ggplot2画图通常坐标轴是在左下角，如果想把坐标轴改成以原点...经过搜索找到了一些办法，记录在这篇推文里。...最大值是6.9，那我们将坐标轴的范围设置为-7~7. axis_begin<- -7 axis_end<-7 刻度设置为15个 total_ticks<-15 最终是通过geom_segment()...在前天的推文下跟着Nature microbiology学画图~ggplot2散点图添加分组边界有人留言直接把以上代码打包成了函数 draw_axis_line <- function(length_x...,y=lab,label=lab),hjust=1.5) + theme_void() return(p)} 画图的时候直接用如下代码 draw_axis_line

1.5K1 0

R可视乎|饼图

饼图通过将一个圆饼按照分类的占比划分成多个切片，整个圆饼代表数据的总量，每个切片（圆弧）表示该分类占总体的比例，所有切片（圆弧）的加和等于100%。下面会介绍两种在R中实现饼图的方法。...graphics包绘制饼图 library(RColorBrewer) library(dplyr) library(graphics) library(ggplot2) init.angle可设定饼图的初始角度...首先我们构造一个模拟数据，如下所示，并用dplyr包中的arrange()进行排序(默认从小到大)，faction表示数值所占比例，ymax进行累积占比，总值为1。...以下为两种不同标签的结果，为了区分，使用rewer.pal()函数将颜色进行变换。...ggplot2 包绘制饼图使用R中ggplot2包的geom_bar()函数绘制堆积柱形图，然后将直角坐标系转换成极坐标系，就可以显示为饼图，但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。

1.4K2 0

手把手教你掰弯柱状图

整理数据：将数据按照州分类，并求没一个州的STEM的均值，这里就需要用到dplyr工具包中的两个函数group_by()和summarise()函数。 ? 结果就会变成下面的样子： ? ?...至此前期的简单数据整理就到这了。 ? 3 ? 提起大刀开始画图了，当然这个掰歪的柱状图采用ggplot2来画，不得不再一次佩服ggplot2的强大。...绘图妙用ggplot2 ?...geom_text参数则可以实现给每个柱状图加上label的操作，同样需要在geom_text中定义好x轴参数和y轴参数，以及对应的角度。...结果图如下，我们就可以看到每一个柱状图仿佛地球村一样排列，是不是觉得眼前一亮？ ? ? 6 ?

9772 0

R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起...那我们就按照这个思路来构造数据将数据集按照以上格式整理好，存储在csv文件中。...首先是读入数据 df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T) 以上数据是宽格式，借助reshape2这个包中的melt函数将宽格式转变为长格式...，直接出图后手动编辑吧。...如果需要本文的示例数据，直接在文末留言就好了

3.2K1 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

多重比较的可视化 | 增加趋势线及调整顺序

ggplot2饼图和图注顺序不一致如何解决

R语言ggplot2画环状柱形图(circular barplot)的简单小例子

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画图展示SNP位点的碱基类型

经典方差分析：手把手教你读懂、会用1

R语言学习 - 图形设置中英字体

火山图|给你geneList，帮我标到火山图上

（数据科学学习手札38）ggplot2基本图形简述

你确定！？这些基础绘图技能你全都掌握了！？

R语言之可视化（20）之geom_label（）和geom_text（）

温故而知新，ggplot2 饼图的几点笔记

「R」数据可视化15：倾斜图

RunTSNE二维及三维结果可视化

商务图表案例——仿经济学人分组漏斗图~

R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程的简单小例子

跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2以原点为中心画坐标轴

R可视乎|饼图

手把手教你掰弯柱状图

R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

扫码

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

资源

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐