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(转载)Annovar注释人类以外的基因

本文介绍如何用Annovar注释人类以外的基因。 分析过NGS数据的朋友应该都听说过乃至使用过Annovar这个工具。 Annovar是一款对基因数据进行注释的软件。...而注释就是将基因的序列变异数据转化为我们更关心的生物学功能变化的信息。 Annovar常被用在人类基因的注释上,其实,它也可以对人类以外的基因数据进行注释。比如,老鼠基因的注释上。...annovar一般只包含人类基因注释数据库,其他的物种如小鼠需要自己进行建立注释信息。...第二步:安装Annovar linux系统下该命令解压 tar zxvf annovar.latest.tar.gz 解压后生成annovar文件夹,里面有6个perl脚本程序和两个文件夹,其中一个是...这个例子输出test.exonic_variant_function文件输出为空文件,因为这些位点没有在exonic区域的,所以没有结果。

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    LINUX架设FTP服务器

    第二章 LINUX架设FTP服务器 2.1 什么是FTP 2.2 安装Wu-FTP 2.3 让FTP服务器跑起来 2.4 配置文件的设置 2.5 开设只能FTP的帐户 2.6 设置虚拟FTP主机...类别 [ …] 若一个匿名用户属于任何一个参数类别的类,则FTP服务器将实施setegid()调用使其属于这个名定义的,这样做是为了实现某些特定类别的匿名用户可以访问一些只允许本组及拥有者可以访问的文件...名必须是/etc/group内定义的有效。 指示: class 类名 类别(real、guest、anonumous) IP地址 这个指示是设定FTP服务器用户的类别。...这里的%M是一个变量,代表同时允许连接的人数的上限,FTP服务器可以前面设置的值自动替代该变量,其他允许的变量包括: %T 本地当前时间; %F CWD所在分区剩余空间,以KB为单位。...若输入的名和密码有效的话,该用户将变为该的成员,具有该的访问权限。

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    Python的Numpy求解线性方程

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    Ubuntu 终端设置 Web 服务器

    由于其强大性和社区支持,许多专业人士更喜欢将其作为服务器操作系统。在本指南中,我们将深入探讨如何使用终端在 Ubuntu 上设置基本的Web服务器。...准备工作在设置服务器之前,请确保你具有:一个 Ubuntu 服务器或桌面版本。超级用户(root)访问权限或具有sudo权限的帐户。更新和升级 Ubuntu保持系统更新是最佳实践。...首先刷新软件包列表并升级系统:sudo apt updatesudo apt upgrade -y安装 ApacheApache HTTP 服务器,通常称为 Apache,是最广泛使用的 Web 服务器解决方案之一...>" | sudo tee /var/www/html/phpinfo.php如果设置正确,这将显示有关服务器上的 PHP 的详细信息。...保护你的 Web 服务器安装防火墙UFW(Uncomplicated Firewall)是一个面向 iptables 的界面,旨在简化配置防火墙的过程。

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    Python 实现简易 Web 服务器

    HTTP 首部(Headers)是一键值对,如同下面这三行: Accept: text/html Accept-Language: en, fr If-Modified-Since: 16-May-2005...实现的方法通常使用 cookie, 这是服务器发送到客户端的短字符串,之后由客户端返回给服务器。...这个版本循环遍历一存储在列表中的情况,而不是一内嵌的测试。每种情况都是一个有着两个方法的对象,test 告诉我们是否能够处理请求,act,实际上进行处理。...为了将他们从编辑源码拯救出来,服务器一般都支持一种叫做公共网关接口(CGI)的机制,它为 web 服务器提供了一个标准的方式来运行外部程序,以响应请求。...我们的代码也使用了 popen2 库函数,为了更好的支持子流程模块它被弃。不过,popen2 用在这个例子中,的确是更少分散注意力的工具。

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    Serverless架构:服务代替服务器

    Serverless是最新兴起的架构模式,中文意思是“无服务器”架构。...BaaS是在PaaS和SaaS之间,为了满足移动互联网快速发展的需要,将后端的能力以服务形式提供,是在PaaS平台开发能力的基础上,SaaS的思路,将后端能力服务化,让开发者在此基础上开发自己的Software...该平台为移动应用提供了一个完整的后端解决方案,让开发者以最小的配置和最简单的方式使用Bmob平台提供的服务,进而完全消除开发者编写服务器代码以及维护服务器的操作。...Serverless不代表完全去除服务器,而是代表去除有关对服务器运行状态的关心和担心,以及透明化基础设施。...首先“Ops”意味着比服务器维护更多的内容,Serverless不要关注基础设施以及服务器,但是针对应用还是存在监控、网络、安全,以及产品排错等问题,这些问题对于Serverless应用来说仍然还在,需要一种策略来处理

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    Linux Sendmail架设Mail服务器

    今天我就给大家介绍一种在Red Hat Linux 9.0环境下运行的邮件服务器软件Sendmail.Sendmail作为一种免费的邮件服务器软件,已被广泛的应用于各种服务器中,它在稳定性、可移植性、及确保没有...配置步骤为:   第一步:模板文件sendmail.mc生成sendmail.cf配置文件,并导出到/etc/mail/目录下,使用命令行:m4 /etc/mail/sendmail.mc > /etc...五、限制单个用户邮箱容量   如果对用户的邮件容量不加限制,服务器的硬盘是不堪重负的。...经过以上步骤后,应该就可以Outlook Express正常发送邮件了,但这时还不能用Outlook Express从服务器端收取邮件的,因为sendmail默认状态并不具备POP3功能,我们还得自己安装并启用它...参考推荐: Linux 环境Sendmail架设Mail服务器 Sendmail 邮件服务器应用配置

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    PHP实现高并发服务器

    /configure make make install php -m | grep event #看看装上了没 复制代码 我们要实现的服务器,传输层是TCP协议,应用层协议太多太复杂,限于篇幅,会简单地以...HTTP服务器举个例子,HTTP协议本身就很复杂,要实现起来细节上有很多考究,我们也不会完全实现HTTP协议。...可读事件发生,说明有新连接来了, stream_socket_accept 接收新连接Conn,把Conn放到Reactor中监听可读事件,可读事件发生,说明客户端有数据发送过来了,循环读直到没数据,...撸完收工, ab 测一下并发,加 -k 参数复用连接,i5+8G,3W的并发没啥问题,当然我们这儿没有磁盘I/O,实际情况要从磁盘读取文件,读文件要通过linux的系统调用,而且有几次的文件拷贝操作,...这就是PHP实现高并发服务器的思路了,只要是EPOLL解决的,思路都一样,都是三步曲,放到Reactor下监听FD事件。

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    安卓手机管理服务器

    首先是管理vps上的文件,类似于winscp那样,其实在安卓也有这样实用的软件,那就是ES文件浏览器,他支持远程连接ftp和sftp,你只需要点开菜单,点开'网络'点FTP,然后在下方点新建,然后填好服务器...FTP地址,账号密码(可以ssh私钥),保存之后就可以连接了~可以正常地上传下载删除文件,不过貌似修改不了文件的权限。。...在电脑上我们通常都是putty来连接vps远程运行shell命令,当然在Android上依然可以,大家都知道安卓是Linux内核嘛,所以它很多东西都是和Linux是相通的,而在Linux系统下连接vps...通常是在终端下ssh客户端来连接,因此只要我们在安卓之下有这么样的程序的话理论上连接vps是没问题的。...我是不会告诉你这个博客搬过来的时候我就是用它在2G网络成功地在vps上编译lnmp的、、、、、、、、、 妈妈再也不用担心我的服务器管不了了~ ssh客户端下载 : ssh.zip

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    服务器为什么 Linux?

    前段时间开发游戏服务器模拟玩家行为的压力测试工具,网络框架netty, 运行的机器是4核8G的云服务器,win server 2012 和 centos7都有。...每台服务器开5000个玩家,每个玩家每秒发送1条消息。linux服务器下一切正常,运行良好。win server就有一定数量的消息发不出去。...却也敢对服务器大放厥词。 操作系统领域是有马太效应的,而操作系统又分为桌面端(用户端)和服务器端。...事实上,从处理器执行一个应用程序中的一指令到Linux调度微处理器再次运行这个程序之间只有很短的时间延迟,用户是感觉不出来的。...Linux潜在的商业价值不可限量,性能相当地好,稳定性也很好,其替换商业操作系统真是明智的选择。

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