，事实上只要用 3.0.0 之后的版本都差距不是很大。我的电脑上的 R 的版本是 R version 3.6.2 (2019-12-12)。...安装常用的一些 R 包 可以运行下面的几句命令快速的安装一些 R 包： # 安装 devtools install.packages("devtools") # tidyverse 系列的 R 包 install.packages...R 包，例如我电脑上安装的 R 包有 1479个（截止 2019年12月14号）。...一个小的练习：爬取 CRAN 上的所有 R 包的名称、发布日期和标题 可以爬清华镜像源的列表：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/web/packages...://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/", x = "", y = "") 可以看到，今年截止到今天，CRAN 上一共有 15334 个 R 包，今天新发布的
中也会经常遇到R包安装错误的提示。.../CRAN/ （我的是windows） 2、点击contrib 3、点击contrib进入R包下载目录页（根据不同版本选择） 4、进入到Index of /CRAN/bin/windows/contrib.../3.6/ R包列表页 ctri+F 查找你需要下载的包 5、R-studio手动安装本地包 相信接下来你也知道怎么做啦 【拓展阅读】 1.通过Github仓库名和包名安装 不是所有的R包都提交上传到...CRAN，如Github存放一些R包，所以偶尔也会遇到安装github上的R包 install.packages("devtools")library(devtools)install_github("...Github上的R包路径") 2.更新R包列表（Rstudio） 这里仅说明Rstudio中的一键更新功能。
install_version()： require(devtools) install_version(“ggplot2”, version = “2.0.0”, repos = “https://cran.r-project.org.../src/contrib/Archive/ggplot2/”) 除此之外，还可以直接从源代码安装： packageurl cran.r-project.org/src/contrib...现在打算不定期更新记录一些笔记，公众号也会将简书的内容整理一下发布~
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可通过其Github进行安装，通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
因此，我创建了一个名为 ensembleR 的包，你可以在 CRAN 上找到它。这个包使人们能够在 R 中创建多个模型的集成。...这个包能够创建数百万个特殊集合（堆叠模型），借助一行代码就可使用所有这些集合给出预测。CRAN 上这个包的版本仍是其发布版本。...将包发布在 CRAN 上是最难的一步，因为为了维持 CRAN 上包的质量和稳定性，要对包进行大量的严格测试。...在本文中，我将向你介绍从零开始创建包和将包公开发布在 CRAN 和 GitHub 上的整个流程。 3. 创建 R 包的好处和挑战 创建 R 包的好处有： 实施新的、未被利用的构想。...在发布包的过程中会用到两大平台：CRAN 和 GitHub. 6.1 在 CRAN 上发布你的包 将包发布在 CRAN 上是较难的一步，因为在成功发布前要对包进行大量的严格测试。
在R包版本依赖有误、新版R包存在bug或者新版R包函数重大更新导致自己代码报错等情况下，一个可选的解决方案是安装特定的旧版本的R包来解决。...R包的两大分发位置是CRAN和bioconductor，CRAN的R包是本文讨论的重点，bioconductor包的版本依赖比较严格，因此本文暂不分析bioconductor包的旧版本安装。...有关于GitHub上面的R包，由于其本质上只是一个源码R包，因此其和CRAN的安装基本上并无不同，本文只会略有所提。...如何寻找旧版本的CRAN R包 CRAN是The Comprehensive R Archive Network，它是分发各版本R及R包的地方。...如果需要查找旧版本的R包，需要先找到此R包在CRAN上的主页地址，方法如下： 打开R packages列表页面 在CRAN主页https://cran.r-project.org/，找到左侧的Packages
ERROR: configuration failed for package ‘gsl’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/gsl’ 解决方案（全靠程序员之友
最近cran真是折腾，tinyarray有好多细枝末节的问题要处理。这次的问题如下 checking data for non-ASCII characters ......NOTE Note: found 2 marked UTF-8 string 只能继续改了，首先是豆豆的笔记（对啊就是豆豆花花的豆豆，由于读博加带娃事务繁忙，他失踪已久，让我们投个票，） 如何解决R...包检查中出现的non-ASCII characters问题 豆豆说检查哪个数据是非ascii码，结果我发现全部是true files = list.files('....Bioarray", "GE Healthcare/Amersham Biosciences CodeLink ADME Rat 16-Assay Bioarray" ) 顺便去掉了三个甲基化芯片的R...pkg_all$gpl=="GPL15380",] 最后把包里的数据文件覆盖掉即可 usethis::use_data(pkg_all,overwrite = T)
2、作用：实现特定的功能，你需要什么功能，安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机，需要使用微信与人聊天，你就按照微信APP，需要上腾讯视频看电视剧，你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R包： （1）官方网站CRAN网站下载，使用“install.packages（）”函数来安装 （2）Bioconductor网站下载，主要是生物生信相关的...R包，使用 “BiocManager::install()来安装 （3）github网站，是R包作者写的，没有经过审核，使用”devtools::install_github...几乎不使用，使用时需要写明R包的作者，就是指明选择谁写的R包。...5、如何实现快速下载 如果官网速度慢，请使用镜像网站 图片 图片 官方网站CRAN网站的镜像使用方法1，Bioconductor网站的镜像使用方法2，方法2也适用CRAN 三、安装R包会遇到问题
本文的绝大部分都为解决问题的思路，如果只想知道如何安装特定版本号（每次提交的唯一标识），可以直接翻到文末。...结合该读者是最近才装的RNAseqStat，这就很有可能是永和在对包进行调整的时候出了问题，我们前往永和RNAseqStat[1]的界面，进入R，找到代码更新历史，发现在一个多月前，该部分代码（enhance_volcano.R...因为RNAseqStat没有发布不同的release，我以为只能等永和更新了，但永和提到了一种安装以前版本R包的方法。...由于github上每一次包的更新都会有所记录，我们便可以通过每次提交的唯一标识下载以前更新的包。 我们可以通过以下命令查看我安装的是哪一版的RNAseqStat。...win-library/4.1 [2] D:/Program Files/R/R-4.1.2/library 可以发现是c374ed0；接下来安装该版本。
交流群有人询问一个包（oncoPredict）的安装问题，说是R版本问题，需要 大于4.1.0。 我下意识的认为他应该是有其它错误，但是看大家在群里讨论的热火朝天， 我就去试了试。...首先看了看最原始的安装方式： > install.packages("oncoPredict") Warning in install.packages : package ‘oncoPredict...’ is not available (for R version 4.0.2) 确实是失败了，然后去 官网查看：https://cran.r-project.org/web/packages/oncoPredict...Version: 0.2 Depends: R (≥ 4.1.0) 哪怕是下载源代码进行安装，也是绕不过去这个版本依赖 ： > install.packages('oncoPredict_0.2.tar.gz...，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定
第2步 - 安装devtools包 通过devtools，我们将能够直接从GitHub，BitBucket，本地文件安装和构建软件包，并从CRAN安装特定版本。...R Archive Network（CRAN）进行安装。...第3步 - 从GitHub安装R包 在这一步中，我们将直接从GitHub安装Shiny的最新开发版本，这是一个R的Web应用程序框架。...重新安装Shiny版本的Shiny 对于生产情况，我们将从CRAN安装，除非我们有令人信服的理由从存储库安装。 让我们花一点时间回到稳定的包裹。...cat /usr/local/lib/R/site-library/shiny/DESCRIPTION 结论 在本教程中，我们直接从GitHub安装了最新的Shiny软件包，并学习了如何从CRAN重新安装其稳定版本
通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...2）如果所要下载的R包不在R语言官网上，那它极有可能在Bioconductor或者Github上，可以先登录Bioconductor官网（http://www.bioconductor.org/）搜索相关...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github...，github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名，否则无法进行下载安装。
安装ggstatsplot时,没有针对当前版本的R包....于是用下面方式手动安装 package_url="https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggstatsplot/ggstatsplot_0.9.2....tar.gz" install.packages(package_url, repos=NULL, ask = F, update = F) 但这种方式不能自动安装依赖: #ERROR: dependencies...parameters’, ‘performance’, ‘statsExpressions’ are not available for package ‘ggstatsplot’ 用devtools下载特定版本...R包, 并自动安装依赖. require(devtools) install_version('ggstatsplot', version = '0.9.2')
引言有些时候会存在需要安装特定版本 R 软件的需求，比如为了满足特定软件包的安装使用要求或减少不同平台迁移成本。...因此，本文以 Ubuntu 为例分享一下 R 在 Linux 等操作系统上的特定版本安装和 rstudio-server 中 R 版本的切换。...过程LinuxUbuntu官网提供的安装方法实际只能安装最新版，无法指定安装版本1。...引用The Comprehensive R Archive NetworkUbuntu Packages For R - Older Releases安装低版本的 R 语言、和自行下载安装各个版本的 R...语言包、以及多环境运行 R_r 官网怎么找旧版本的 r-CSDN 博客20.04 - How to install specific R version in ubuntu - Ask UbuntuPosit
安装R语言的包的方法： 1....自动安装（在线安装） 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl...手动安装（离线安装） Windows: 下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” 选择package.zip...文件 Linux上安装R包（离线安装）: 下载package.tar.gz文件 在Shell终端（注意不是R）输入: sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 注意：需要sudo...查看全部安装的R包： .packages(all.available=T) 查看某个安装的R包： library("XML") help(package="XML")
r语言的包中，集成了众多函数，大大扩展了r的功能且降低了使用难度。本篇文章就来介绍r语言中包的两种安装方式：install.packages和从github安装包。...install.packages() install.packages()是从镜像安装包，在括号中输入包的名称字符串就可以完成包的安装。...install.packages("dplyr", repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/") 更多镜像地址可登录r官网查询。...通过github安装 一些开发者没有将包上传至镜像，而是在github上开发并分发，此时就需要从github安装相应包。这里提供两种方法。...但实际操作中，经常会遇到要安装一个包要先安装很多包的情形，因此本地安装方法有时可操作性较差，因此不在这里详细介绍。
使用默认方法安装相关R中文文本挖掘包（tmcn、Rwordseg、Rweibo）时，会出现安装失败。合适的方法是：通过源代码安装相关包的程序：手工下载源代码及其依赖，然后编译安装。...首先是基础性的tm包。tm包是R文本挖掘的通用包。直接使用install.package即可安装。...install.packages("tm") tmcn、Rwordseg、Rweibo是李舰等人开发的中文文本挖掘包。三个网页（官网）中提供了包说明与安装方法。但经测试，其中的安装方法不可用。...该包需要预先安装Java环境。如果未曾安装Java，请先安装Java，安装Java（及PATH的配置）过程不再赘述。...这四个依赖包同样不能直接安装，需要先从科大源下载源码：（按包名搜索RCurl、XML、rjson、digest），然后再安装。
使用默认方法安装相关R中文文本挖掘包（tmcn、Rwordseg、Rweibo）时，会出现安装失败。合适的方法是：通过源代码安装相关包的程序：手工下载源代码及其依赖，然后编译安装。...首先是基础性的tm包。tm包是R文本挖掘的通用包。直接使用install.package即可安装。...本帖隐藏的内容 1 install.packages("tm")tmcn、Rwordseg、Rweibo是李舰等人开发的中文文本挖掘包。三个网页（官网）中提供了包说明与安装方法。...但经测试，其中的安装方法不可用。正确的安装方法为：先下载tmcn、[Rwordseg]、Rweibo的源码。tmcn无依赖关系，直接使用。...该包需要预先安装Java环境。如果未曾安装Java，请先安装Java，安装Java（及PATH的配置）过程不再赘述。
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