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Nat. Methods | MARS: 跨异构单细胞实验发现新型细胞类型

今天给大家介绍由美国斯坦福大学计算机科学系Jure Leskoveck课题组在《Nature methods》上发表了一篇名为“MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments”的文章。文中提出了用于识别和注释已知的以及新的细胞类型的元学习方法MARS,MARS通过跨多个数据集传输潜在细胞表示,克服了细胞类型的异质性。使用深度学习来学习细胞嵌入功能以及细胞嵌入空间中的一组地标。该方法具有发现以前从未见过的细胞类型并注释尚未注释的实验的独特能力。将MARS应用于大型小鼠细胞图集,并展示了其准确识别以前从未见过的细胞类型的能力。此外,MARS通过概率性地在嵌入空间中定义细胞类型,自动为新的细胞类型生成可解释的名称。

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codeReview常见代码问题

路线图   常见代码问题   空值   未捕获潜在的异常   低性能   影响范围过大   单测问题   与原有业务逻辑不兼容   缺乏必要日志   错误码不符合规范   参数检测缺乏或不足   引用错误   名字冲突   细节错误   多重条件   文不符实   跨语言或跨系统交互   可维护性问题   硬编码   重复代码   通用逻辑与定制业务逻辑耦合   直接在原方法里加逻辑   多业务耦合   代码层次不合理   不用多余的代码   使用全局变量   缺乏必要的注释   更难发现的错误   并发   资源泄露   事务   SQL问题   安全问题   设计问题   较轻微的问题   命名不贴切   声明时未初始化   风格与整体有不一致   类型转换错误   否定式风格   容器遍历的结构变更   API参数传递错误   单行调用括号过多   修改方法签名   打印日志太多   多级数据结构   作用域过大   分支与循环   残留的无用代码   代码与文档不一致   使用冷僻用法或奇淫巧技

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一种触摸式的多模态加密生物人机接口

本研究开发了一种专门用于酶测乙醇的电流型TH传感器和一种无干扰伏安型TH传感器,用于针对对乙酰氨基酚(APAP,一种广泛使用的镇痛药物)进行靶向检测。所设计的伏安TH传感方法可以广泛检测电活性的生物标志物,尤其是在存在非靶向干扰电活性物质的情况下,可以用于检测多种药物。发达的生物分析能力和生理学研究的发现为设计基于触摸的加密生物HMI (CB-HMI;图1A)能够将用户基于触摸的输入转换为加密的生化、生物物理和生物特征指数。为了设计CB-HMI,将每个已开发的TH传感器与光体积脉搏波(PPG)传感器和指纹扫描仪集成在一个统一的平台内,允许获得额外的生物输。为了实现无缝和多模态传感器信号采集和数据处理,利用专用的信号调理电路和推理/加密算法增强了传感器读数,形成了完整的HMI解决方案。利用其生物感知/解释功能,CB-HMI可以集成到周围的物体中,以智能和交互的方式确定并为每个用户提供适当的行动方案(图1B)。为此,本研究将设计的CB-HMI应用于两个具有代表性的场景:驾驶安全和用药,其中使用开发的乙醇和APAP TH传感器分别获取相关的生化指标。因此,本研究展示了一个车辆激活系统和一个药物分配系统,其中集成的CB-HMI在提供预期服务之前独特地启用了用户生物认证(基于用户的生物状态和身份)。这些演示的应用说明了CB-HMI在升级周围物体以达到前所未有的生物感知水平方面的能力。最终,CB-HMI和其他HMI的无处不在的集成/部署将创造智能环境——配备对个人心理生理状态和需求的深刻和全面的认识——可以积极地帮助用户有效地达到最佳结果(图1C)。

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[Kubernetes](二)Kubernetes核心组件解读(上)

Kubernetes由两种节点组成:master节点和工作节点,前者是管理节点,后者是容器运行的节点。其中master节点中主要有3个重要的组件,分别是APIServer,scheduler和controller manager。APIServer组件负责响应用户的管理请求、进行指挥协调等工作;scheduler的作用是将待调度的pod绑定到合适的工作节点上;controller manage提一组控制器的合集,负责控制管理对应的资源,如副本(replication)和工作节点(node)等。工作节点上运行了两个重要组件,分别为kubelet和kube-proxy。前者可以被看作一个管理维护pod运行的agent,后者则负责将service的流量转发到对应的endpoint。在实际生产环境中,不少用户都弃用了kube-proxy,而选择了其他的流量转发组件。

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