在文本处理和数据清洗阶段，对字符串或者字符型变量进行分割、提取或者合并虽然谈不上什么高频需求，但是往往也对很重要的。...接下来跟大家大致盘点一下在R语言与Pyhton中，常用的字符串分割与合并的函数。...： unite #合并数据框中的某几列 separate #将数据框中某一列按照某种模式拆分成几列 R语言： library(dplyr) library(stringr) library...(data,col, into,sep="-", remove = TRUE) unite和separate函数是配对函数，内部的参数严格白痴对称，第一个参数数要操作的数据框名称，第二个参数是合并后的新列名...： R语言： 拆分： strsplit str_split 合并： paste tidyr::unite tidyr::separate Python： 拆分： .split 合并： “+” join
如果你想了解更多的基本理论，你可能会喜欢发表在《统计软件杂志》上的tidy data论文[1]。 本文框架 ?...该例子来自《R for data science》[2],案例数据来自tidyr::who，其包含按年份，国家，年龄，性别和诊断方法细分的结核病（TB）病例。...变量名中给出的结构（例如new_sp_m014，new_ep_m014，new_ep_f014）可能是值，而不是变量。...字符分割 接下来就是将key中的字符进行分割,我们使用separate()对字符进行两次分割。 1.将在每个下划线处拆分代码。...separate() 该函数可将字符进行分割,具体案例如上. 默认情况下，当separate()看到非字母数字字符(即不是数字或字母的字符)时，它将分割值。可以用里面的参数sep。
介绍tidyr包中五个基本函数的简单用法:长转宽，宽转长，合并，分割，NA简单填充。 长数据就是一个观测对象可由多行组成，而宽数据则是一个观测仅由一行组成。...#载入所需的R包 library(dplyr) library(tidyr) #测试数据集 widedata <- data.frame(person=c('A','B','C'),grade=c(5,6,4...(data, col, into, sep = " ") data：为数据框 col：需要被拆分的列 into：要拆分为的(多个)列, 通常用c()的形式进行命名 sep : = " " 用于指定分隔符...remove：是否删除被分割的列 用separate函数将上面的wideunite数据框还原: widesep separate(wideunite, information,c("person...()函数和unite()函数的功能是相反的.
——将左侧的值应用到右侧数据data位置 管道函数在tidyverse中，管道符号是数据整理的主力，可以把许多功能连在一起，而且简洁好看，比起R的基本代码更加容易阅读！...这些函数允许在长数据格式（long data）和宽数据格式（wide data）之间进行转换（功能类似于reshape包，但是比reshape更好用，并且可以用于管道%>%连接）。...tidyr包的下述四个函数用法 5.1 宽数据转为长数据：gather （excel透视表反向操作） 5.2 长数据转为宽数据：spread （excel透视表功能） 5.3 多列合并为一列：unit...() #separate()函数可将一列拆分为多列，一般可用于日志数据或日期时间型数据的拆分，语法如下： #separate(data, col, into, sep = “[^[:alnum:]]+”...，为字符串向量 #sep：被拆分列的分隔符 #remove：是否删除被分割的列 widesep separate(wideunite, information,c("person","grade
R基础字符串处理函数 nchar paste strsplit tolower toupper casefold chartr gsub sub substr substring grep grepl...针对向量 strsplit #针对字符串向量（拆分） str_split #针对字符串向量（拆分）stringr包内函数 paste #针对向量合并 针对数据框 unite...#合并数据框中的某几列 separate #将数据框中某一列按照某种模式拆分成几列 a <- c("2016-2-7","2016-3-8","2016-4-9","2017-5-...casefold(b,upper=T) chartr("ab","mn",b) # 对应替换,不支持正则表达式 gsub(pattern="-\\d-",replacement="B",a) # 搜索匹配的内容替换全部...根据位置 根据pattern（正则表达式）} 提取->{根据位置 根据pattern（正则表达式）}}") library(dplyr) library(stringr) library(tidyr
这些变量应该是真正的属性，而不是同一属性在不同年、月等时间的值分别放到单独的列。...extract 除了seperate 外，函数 extract() 可以按照某种正则表达式表示的模式从指定列拆分出对应于正则表达式中捕获组的一列或多列内容。...2.11 处理关系数据 参见：中的join 函数介绍部分 2.12 数据框的列拆分与合并 参见：34....( list(avg = ~mean(.), std = ~sd(.)), na.rm=TRUE) %>% knitr::kable() 结合的好用函数 image.png n() 进行计数： >...实际上，tibble 允许存在数据类型是列表 (list) 的列，子数据框就是以列表数据类型保存在 tibble 的一列中的。
plyr包是Hadley Wickham为解决split – apply – combine问题而写的一个包。...使用plyr包可以针对不同的数据类型，在一个函数内同时完成split – apply – combine三个步骤。...参数注释： data：函数处理的数据框； variables：要进行拆分的变量名称，传递变量的格式是：....tidyr包主要涉及：gather（宽数据转为长数据），spread（长数据转为宽数据），separate（多列合并为一列）和unite（将一列分离为多列） （1）gather 使用gather()函数实现宽表转长表...separate函数可将一列拆分为多列，一般可用于日志数据或日期时间型数据的拆分，语法如下： separate(data, col, into, sep = “[^[:alnum:]]+”, remove
而tidyr正是一个这样的包，它的唯一目的是简化创建[tidy data]的过程。...本教程使您基本了解tidyr提供的数据整理的四个基本功能： [gather()]宽数据转化成长数据 [spread()]长数据转变成宽数据 [separate()]将一列数据拆分为多列 [unite()...]将多列数据合并为一列 install.packages("tidyr") library(tidyr) 管道函数%>%运算符将值或表达式的结果转发到下一个函数表达式中。...很多时候，一个列变量将包含多个变量，我们可以在每种情况下，我们的目标可能是在变量字符串中分隔字符。这可以使用separate（）函数来实现，该函数将单个字符列分割为多个列。...函数spread（）将某一列数据值分布在多个列上。
tidyr包 tidyr包旨在整理您的数据。它的工作原理是识别数据集中的变量，并使用提供的工具将它们移动到具有三个主要功能的列或gather（），separate（）和spread（）。...它与plyr包非常相似，虽然年龄较大，但有些用户只是觉得它的使用更容易，功能也更标准化。 sqldf包 很多R用户更习惯用SQL语言而不是R编码。...这个函数允许你在R studio中编写SQL代码来选择你的数据元素 Janitor包 该软件包能够通过多个列查找重复项，并轻松地从您的数据框中创建友好列。...随着新的库一直涌现，在开始任何新项目之前进行研究并获得正确的库是非常重要的。...其他福利：来自于名企的数据科学工作者，北大清华以及海外等名校学生他们都将成为你在翻译小组的伙伴。
5.6 分组: group_by 6 tidyr包的下述四个函数用法 6.1 宽数据转为长数据：gather （excel透视表反向操作） 6.2 长数据转为宽数据：spread （excel透视表功能...接下来就以鸢尾花测试数据集进行进一步的数据管理和筛选操作。...，把相应的数据直接引用为右侧源数据集 countcars % summarise(count = n()) 6 tidyr包的下述四个函数用法...() #separate()函数可将一列拆分为多列，一般可用于日志数据或日期时间型数据的拆分，语法如下： #separate(data, col, into, sep = “[^[:alnum:]]+”...，为字符串向量 #sep：被拆分列的分隔符 #remove：是否删除被分割的列 widesep separate(wideunite, information,c("person","grade
conda进行安装 如果是0/1矩阵作为输入数据，iqtree需要用到的格式是phy这个格式 http://www.iqtree.org/doc/Tutorial image.png 我们那到的基因存在缺失变异矩阵通常的格式是...%>% write_tsv("2024.data/20240123/fig1_pangenome/pra.phy",col_names = FALSE) 输出文件pra.phy需要手动修改，在第一行添加两个数字...这里有一个小知识点，R语言里把数据框所有列合并成一列，可以用tidyr包中的unite函数。...把一列拆分成很多列可以用separate函数，参考这个链接 https://tidyr.tidyverse.org/reference/unite.html 这里的示例数据集来源于论文 Aspergillus...ggtree(tree,layout = "circular") 这个进化树怎么美化再单独出推文进行介绍吧
str_length(x) # 1.检测字符串长度str_split(x," ") # 2.字符串拆分（以空格隔开的字符串拆分）拆分后以列表格式呈现str_sub(x,5,9)...T成立，{}中的函数被运行，如果F不成立，则不执行if条件语句：如果...就...否则...if(一个逻辑值){ CODE1} else{CODE2}重点：ifelse函数ifelse(x,yes,no...模式）二、for循环for(i in x){CODE} # 对x里的每个元素i进行同一操作for( i in 1:4){print(i)} #对1:4中的每个元素进行循环输出批量画图...X, MARGIN, FUN, …) #其中X是数据框/矩阵名；#MARGIN为1表示行，为2表示列，FUN是函数#对X的每一行/列进行FUN函数test的每个元素进行rnorm操作5.数据框的连接inner_join #取交集连接full_join #全连接left_join(test1,test2,by="name") #左连接
") 拆分字符串 图片 -（1）拆分之后成为了了列表，列表的每个元素对应原来的每个元素拆分的结果 -（2）列表使用不方便——simplify = T简化结果，简化成矩阵 -（3）注意：之前提到过，矩阵的某一列不能单独转换数据类型...#按空格拆分x，注意没有赋值就没有发生过！...y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152") str_split(y," ") str_split(y," ",simplify = T) #简化拆分结果，简化成返回矩阵而不是列表...，也支持多个逻辑值组成的向量 -（6）相当于对向量的每个元素逐个进行判断，然后对判断结果F/T进行逐个替换； i = 1 ifelse(i>0,"+","-") x = rnorm(3) x ifelse...(x>0,"+","-") 4. ifelse()+str_detect()【王炸】 str_detect()可以检测样本中是不是含有某个字符，然后返回逻辑值，ifelse()对逻辑值T/F进行替换 samples
引号里有空格class(str_split(x," ")) ## 拆分后数据类型是一个列表x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 y = c("jimmy 150","nicker...) ## 只取空格前面的部分（第一部分）str_split_i(y," ",i = 2) ## 只取空格后面的部分（第二部分）### 3.按位置提取字符串str_sub(x,5,9)### 4.字符检测...***注意这个函数列名不能加引号！！！...就if(一个逻辑值){一段代码} ，只有这个逻辑值为true才执行后面的代码长脚本的管理下载数据的代码，保留但不反复运行长脚本的管理方式：用Rdata来衔接为什么用Rdata而不是表格文件来衔接if条件语句...(iris[,i],col = iris[,5])}#批量装包pks = c("tidyr","dplyr","stringr")for(g in pks){ if(!
背景 Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合，里面包括了readr，tidyr， dplyr，purrr，tibble，stringr...但是并不是所有的 R 包都兼容这套语法。...tidyr 之前的版本主要包含以下几个重要函数： gather：宽数据变成长数据； spread：长数据变成宽数据； unite：将多列按指定分隔符合并为一列...1.1 整洁数据 tidyr 名字来自于 tidy(整洁)一词。所谓“整洁数据”，根据 Hadley Wickham 对整洁数据的专门研究，其定义如下： 1....稀疏矩阵与稠密矩阵 在矩阵中，若数值为 0的元素数目远远多于非0元素的数目，并且非 0元素分布没有规律时，则称该矩阵为稀疏矩阵；与之相反，若非 0 元素数目占大多数时，则称该矩阵为稠密矩阵
# 空格和标点也会被计入字符数1.2 字符串的拆分x 空格）进行拆分class(str_split(x," "))1 "list"#获得向量：[1]#str_split()可对多个字符串进行拆分，每个字符串成为一个数据框...(x," |,") #按" "或","进行拆分1.3 按位置提取字符str_sub(x,5,9)1 "birch"#提取第5到第9个字符1.4 字符检测str_detect(x2,"h")对每个字符串内的字符进行检测...，每个脚本最后保存.Rdata，下一个脚本开头清空再加载为什么保存为.Rdata而不是表格文件*1 变量，自带变量名称，无需赋值，没有参数*2 表格文件需要赋值，参数影响读取结果，不能在后续文件同等处理...k2,"tumor","normal")3.4 for循环for(i in x){CODE}#对x中的每个元素i执行相同的代码CODE#有几个元素则执行几次，函数本身不存在判断条件，可自行添加其它函数进行判断
这好像不是我想的答案 rm(list = ls()) if(!...，那说明你有些概念没有弄清楚： 看完上幅图的概念后，你是不是明白了？...对的，str_length(x)得到的是字符串的长度，它包括了“”内的所有东西，包括空格哦。 2、字符串拼写 那有人会问我不想包括空格，想要单词的长度，怎么办？...str_split(y," ",simplify = T)这段代码是用于将字符串 y 按空格进行分割，参数 simplify 设置为 T 表示结果直接返回成为一个数组。...其中的参数“.keep_all = T”表示保留所有列，而不仅仅是Species列。
如果确实如此，那么将对这些变量进行mutate指令。 *mutate_at（）要求你在vars（）参数中指定要进行变异的列。...：在许多情况下，您可以传递函数名称而不使用括号，但在某些情况下，您需要参数或者您想要组合元素。...两个选项之间的主要区别是：funs（）版本是一行代码少，但是将添加而不是替换列。 根据您的情况，两者都可能有用。...的separate（）函数拆分列。...tidyr的unite（）函数。
玩转字符串1.检测字符串长度str_length(x)length(x)# 字符的个数2.字符串拆分str_split(x," ") # 把42个字符 按照“空格”拆分成八个字符串class(str_split...y需要赋值，不然还是原来的y3.按位置提取字符串str_sub(x,5,9) #空格也要算上 x字符串里5-9位置4.字符检测str_detect(x2,"h") # h类似于地雷，扫雷探测，含有h的就会变成...：右连接，以右边的为准right_join(test1,test2,by="name")表达矩阵画箱线图当x和y没有名字可以简写表达清楚的时候，不是ggplot2可以接受的类型1....1exp数据框如下library(tidyr)library(tibble)library(dplyr)dat = t(exp) %>% # 赋值dat，然后进行转置as.data.frame() %>...(1)分步解法a = colnames(y)b = x$file_namek = match(a,b);k#match(a,b)的意思是a里的每个元素在b的第几个位置上。
## [1] 1 ### str_split字符串拆分,一个元素拆成一个列表 str_split(x," ")#按空格拆分，返回1个元素的列表，此时class是 "list" ## [[1]] ## [...，进行更加复杂的筛选操作。...语言中，str_to_lower()函数是由stringr包提供的函数，而tolower()函数是R的基础函数之一。...默认情况下，head()函数显示数据框的前6行，而tail()函数显示数据框的后6行。可以使用可选参数n来指定要显示的行数。...b的第几个位置上。
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