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小鼠大脑之空间转录组分析

INTRODUCTION 为了展示空间转录组学技术潜力,下面介绍一些由空间解析RNA测序数据基本分析。为了产生这个数据,我们在小鼠大脑冠状切面上进行了空间转录组分析。...该图像显示了组织切片与突出主要形态学区域示意。...,并在原始组织切片上显示其空间解析表达情况。...在这个例子中,我们比较了海马体(红色)和丘脑(黑色),这两个区域在解剖学和功能上是不同。 下面我们列出了表达差异最大基因。 在火山图中,您可以看到数据集中所有基因log2 FC和p调整变化。...将鼠标置于表中一个基因名称上方,组织图像中斑点将根据该基因表达而着色。或者,通过将鼠标放在表中之上,您可以观察特定基因表达,并突出显示单个集群中斑点。

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小鼠大脑之空间转录组分析

INTRODUCTION 为了展示空间转录组学技术潜力,下面介绍一些由空间解析RNA测序数据基本分析。为了产生这个数据,我们在小鼠大脑冠状切面上进行了空间转录组分析。...该图像显示了组织切片与突出主要形态学区域示意。 ?...,并在原始组织切片上显示其空间解析表达情况。...在这个例子中,我们比较了海马体(红色)和丘脑(黑色),这两个区域在解剖学和功能上是不同。 ? 下面我们列出了表达差异最大基因。...将鼠标置于表中一个基因名称上方,组织图像中斑点将根据该基因表达而着色。或者,通过将鼠标放在表中之上,您可以观察特定基因表达,并突出显示单个集群中斑点。

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Nature:人类一生中脑图形态变化

显示了人类大脑在生命早期迅速扩张,并随着年龄增长而缓慢萎缩变化过程。 正常大脑生长发育参考标准 研究人员使用基于位置、尺度和形状广义加法模型(GAMLSS)创建了人类寿命大脑图表。...灰质,皮质下灰质,白质增长速度都在婴儿期和儿童早期达到峰值。大脑总体积增长速度在灰质和白质最大速度之间,大脑总体积增长速度大约在7个月时达到峰值。...图3:神经发育里程碑 个体化百分位数 利用与年龄相关标准化脑图进行了基准测试,计算了个体化百分位分数。汇总数据临床多样性,使研究能够全面分析百分位数得分病例-对照差异。...样本外百分位数在多个测试-重测数据集中被证明是高度可靠,并且对图像处理管道变化具有鲁棒性。 图5:脑图示意图,突出样本外百分位评分方法。...总结 研究汇总了迄今为止最大神经成像数据,用于构建典型和非典型的人类大脑发育和衰老标准人脑图表。研究结果表明,利用构建的人脑标准图表,可以通过MRI按年龄和性别记录脑图像正常变化速率和方向。

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用Excel也能实现和Python数据分析一样功能!

需求说明 分析某电商企业销售趋势,找到影响销售增长因素。同时分析不同市场产品销售状况,找到不同市场销售差异。挖掘不同产品销售状况,找到不同产品销售差异。...条件格式 选中将要处理数据区域,点击菜单栏里【开始】——【条件格式】里选择【突出显示单元格规则】——【重复】。如下操作: ? ? 数据透视表 数据透视表一样能计算数据重复频次。...实现方式 VLOOKUP,语法如下: VLOOKUP(要查找,查找范围,属于查找范围第几列(序列号),模糊/精确查找) 通过上面的语法,我们能够成功获取到性别这一列数据,但是还有几个字段,如果通过复制粘贴形式...点击【数据透视表和数据透视图向导】——选择【多重合并计算数据区域】——【创建单字段】——下一步——选定将要操作区域——下一步——选择【新工作表】——完成——双击【总计】——即实现二维表转为一维表...注:因为上面的数据里用户量有限,做同期群后不明显。所以这里是一个新用户数据

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eLife:EEG和MEG中相位数据贝叶斯分析

相比ITPC,它可以保留更多信息。为了证明这一点,本研究通过将这两种方法应用于两个不同频率标记实验数据,并使用模拟数据进行比较。...(C) 每个条件对ITPC差异在短语组频率上计算,并在整个颅骨上进行插。 因此,本研究提出了一种贝叶斯方法来处理相位数据。...材料和方法 数据 本文考虑了两个实验数据和模拟数据。第一个实验数据是上文描述短语数据;为了展示方法普适性,我们还考虑了模拟数据。另一个数据用于测量人工语言统计学习。这些数据在此简要描述。...在图8中,展示了对统计学习数据进行贝叶斯分析。图8A显示了对EXP - BL条件差异后验分布,涵盖了所有感兴趣频率。...贝叶斯模型在两种情况下特别值得努力:(1)数据有限且嘈杂,因此统计不确定性很高,因此值得明确表示;(2)数据具有强烈结构,可以设计贝叶斯模型以匹配并在参数之间共享信息。

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5个Tips让你Power BI报告更吸引人

例如,出于一个非常简单原因,我尝试避免使用饼图和树图–您看不到具有相似饼图字段之间差异。...将可视化方法从饼图更改为柱状图后,该报告显示每个区域销量。请注意,我们如何轻松地看到欧洲(红色)销售额与北美(橙色)销售额之间差异,并立即注意到谁更高。...一个空洞排名,用排序数据,它更易于阅读 条形图(横着) –实际上最适合数据排名 曲线图–通常用于需要比较多个数据系列时间序列,对于单个条形图,效果也很好 柱状/线形混合 -表示两个不同类型(...单击顶部栏不会影响底部显示数据 2)突出强调 过滤后显示在总计上下文中。当您要显示所选元素总数中有多少时使用它。在示例中–单击顶部图表中条会淡出底部图表。...栏上仅适用于单击元素部分保持突出显示: 高亮显示–一种过滤形式,单击顶部一个条之后,将更改底部显示相关数据颜色 3)筛选器 显示实际筛选

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「有效上下文」提升20倍!DeepMind发布ReadAgent框架

每一步都会为LLM提供部分文本,从上一个暂停点开始,并在达到最大单词数限制时结束;提示LLM选择段落之间哪个点将是自然暂停点,然后将前一个和当前暂停点之间内容视为一个episode,也可以叫做(...并行和顺序交互查找 由于要点记忆与相关,所以只需提示LLM来找出哪一更像是答案,并在给定特定任务情况下再次阅读,主要有两种查找策略:同时并行查找所有页面(ReadAgent-P)和每次查找一个页面...虽然ReadAgent不需要训练,但研究人员仍然选择在训练上开发了一个模型并在验证、测试和/或开发上进行了测试,以避免过拟合系统超参数风险。 选用模型为指令微调后PaLM 2-L模型。...除此之外,研究人员使用自动LLM评分器来评估这些数据,作为人工评估替代方法。...实验结果显示,ReadAgent(查找1-5)实现了最好结果,压缩率为66.97%(即提要后上下文窗口中可以容纳3倍token)。

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IntelliJ IDEA 2022.2.2汉化版免登陆账号「winmac」

IntelliJ IDEA是Mac端最好用Java开发工具!IntelliJ IDEA分析您代码,在所有项目文件和语言中查找符号之间连接。...IDE现在支持根据JEP 323 lambda参数本地变量语法,因此您可以在lambda表达式中使用var关键字。- 在编辑器中预览数据流信息IDE可以在编辑器中显示已知数据流信息。...- for和while关键字突出显示将插入符号放在break或continue关键字时,IntelliJ IDEA会突出显示相应循环for或while关键字。...7、差异查看器比较任何文本来源在IntelliJ IDEA 中,您可以打开一个空差异查看器,并在其左侧和右侧面板中粘贴您要比较任何文本。...可以在“ 查找操作”对话框中找到新“ 打开空白差异查看器”操作。

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从黑盒到玻璃盒:fMRI中深度可解释动态有向连接

我们模型捕获动态模式是自然可解释,因为它们突出了信号中对预测最重要信号间隔。该方法表明,感觉运动网络和默认模式网络之间连接差异是痴呆症和性别的一个重要指标。...图6a显示了我们HC和SZ被试模型对FBIRN数据估计DNC,而图6b显示了OASIS数据男性和女性组DNC。这两个结果都是使用ICA预处理数据进行计算。...同样地,我们也对底部5%进行了实验。表10显示了三种脑疾病数据比较。结果表明,LR模型仅使用5%重要时间点即可提供较高AUC分数。...这种方法通过查找模型对输入哪一部分最敏感来解释输入数据。显著性映射在二维图像计算机视觉任务中显示了一些良好结果。...尽管我们DICE模型通过显示出较高分类性能,并在相对较小数据上分配一致自我注意和时间注意,从而工作得很好,但正如我们所显示,在我们实验中,有更多训练对象会导致更一致时间权重分配。

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【GEE】2、探索数据

这些数据通常用于帮助了解基于适当栖息地衍生范围物种或群落生态位。重要是要了解其中一些是通过插方法创建,该方法估计监测站点之间地理空间中,而不是仅提供直接测量值许多其他栅格。...在搜索栏中输入数据名称结果。 如果我们点击数据名称,我们会看到一个弹出窗口,其中包含一个“导入”按钮(以红色突出显示)。单击此按钮将自动将数据加载到脚本工作区中。...单击“导入”按钮(以红色突出显示)将加载 MODIS 积雪集合。 虽然使用导入按钮很方便,但加载数据命令实际上并未写入我们脚本中。...要查找我们数据空间分辨率,请再次键入数据名称并单击搜索栏中结果(即“MYD10A1.006 Aqua Snow Cover Daily Global 500m”)。...从上面添加我们脚本和下面的代码,我们将打印出这些信息。要查找您自己坐标,请单击“检查器”选项卡,然后单击地图。然后检查员将获取该点坐标(下面以红色突出显示)。

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看看这些《经济学人》图表设计师也会犯设计错误,超有用~~

让我们看看我们档案中三个例子。 错误:截断比例 该图表显示了按政治左翼页面划分 Facebook 帖子平均点赞数。这张图表目的是显示科尔宾先生帖子与其他人帖子之间差异。...原始图表将数据散布得比应有的更宽。在重新设计版本中,我在比例开始和最小数据之间留出了更多空间。...上图显示了美国商品贸易逆差和制造业就业人数。 该图表非常难以阅读。它有两个主要问题。首先,一个数据系列(贸易逆差)值完全为负,而其他数据系列(制造业就业)都为正。...将这些差异并在一张图表中而不使任一数据系列变平是具有挑战性。对此明显“解决方案”导致了第二个问题:两个数据系列不共享公共基线。贸易逆差基线位于图表顶部(由横跨图表主体一半红线突出显示)。...右侧刻度基线位于底部。 重新设计图表显示无需合并两个数据系列。贸易逆差与制造业就业之间关系依然清晰,只需要极少额外空间。

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. | scGNN,一种新型用于单细胞RNA测序分析图神经网络框架

scGNN还可以放大差异表达基因 (DEGs) 信号倍数变化 (FC) (图2c)。本实验还利用其他插补工具比较了插前后DEG信号变化。...使用Klein数据和Zeisel数据中第1天细胞原始表达和scGNN插补表达对DEGlogFC评分进行比较。其差异性信号在插补后被增强。...图2 插补性能比较 3.2 scGNN可以准确地预测细胞簇 除了人工模拟“dropout”基准数据,本文继续评估scGNN和9个插补工具在相同两个数据聚类性能。...其中GA-表示去除图自编码器结果,CA-表示去除聚类自编码器结果,AG表示使用框架中所有基因后结果。结果显示,除去这两个自编码器中任何一个都会显著降低scGNN在细胞聚类精度方面的性能。 ?...图4 基于scGNN阿尔茨海默氏病数据 (GSE138852) 分析 四、总结 与以前在scRNA-seq数据分析中应用自编码器不同,scGNN可以使用自底向上方法有效地聚合相似细胞之间关系。

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PowerBI 2020.11 月更新 - 各类图标更新及查找异常

最终用户打开报表时,缩放滑块端点将默认为您保存端点,从而使您可以突出显示特定数据窗口,同时保持其上下文可立即访问。 将为条形图/列,折线图,折线和条形图/列组合以及散点图启用缩放滑块。...现在,您可以使用模糊文本搜索来更好地过滤所要查找,因此不必滚动很长列表即可获得所选项目。要了解更多信息,请查看Power BI服务中有关分页报告参数文档 。...集群节点工具提示 多工具提示解决了为群集中每个数据显示其他信息问题。您可以使用导航箭头在一个工具提示中浏览所有相关节点信息。...xViz散点图/气泡图 所述xViz分散/气泡图表提供9快速启动模板,包括散点图,气泡和两个IBCS变化。甲散点图图表显示两个数值(X和Y坐标)和理想相关性分析和异常检测之间关系。...以下是一些关键功能和常见客户要求: 健壮条件格式以进行异常检测 气泡和散布IBCS标准模板 战略用例差异数据标签定制-显示每个数据类别和 分析部分–自定义线,趋势线,参考线和带 运行时选项

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Nature neuroscience:精神疾病脑异常局部、回路和网络异质性

我们对每个与偏差相关FC图进行阈值化和二化(图3c),并对给定的人所有极端偏差取这些阈值图(图3d),生成一个图,该图表示在该个体中至少有一个极端偏差所有显示显著FC区域。...接下来,将体积时间序列映射到标准CIFTI灰度坐标空间中,并在最大一半处平滑到2毫米全宽(其中皮层平滑在表面上,皮层下平滑在体积空间中)。...皮质下区域合适零模型选择更为复杂。虽然基于模型程序可以生成具有可比空间自相关性代理,但它们需要参数调整,可以显示个体之间变量拟合,并且不能保留原始数据的确切,这使得阈值设定具有挑战性。...Δoverlap地图量化了每个诊断组和对照组之间在每个区域观察到重叠差异。因此,通过减去两个重叠图,我们直接测试了与区域水平相比,电路中重叠病例控制差异是否更大。6. ...注意,网络之间重叠比较由于网络大小差异而变得复杂。因此,我们分析主要集中在网络内病例和对照之间比较,因为对照数据提供了一个关键规范性基准,可以与病例进行比较。

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数据可视化基础》两个或多个连续性变量相关可视化(一)

在这种情况下,对多个变量之间关系量化就很有用了。这种量化关系常见方法是计算相关系数。相关系数(r)是一个在-1和1之间数字,用来衡量两个变量共变程度。...例如:镁(Mg)和钾(K)没有任何相关性,但上图没有立即显示这一点。为了克服这个限制,我们可以同时把相关关系显示为彩色圆,并用相关系数绝对来缩放圆大小。这样,低相关性被抑制,而高相关性被突出。...对于配对数据,我们零假设是每对测量都相同或几乎相同,而各对之间却存在很大差异两个双胞胎身高大致相同,但与其他双胞胎身高不同。因此,我们需要选择可视化来突出显示与该零假设偏差。...例如,在1970年和2010年,166个国家/地区进行测量的人均二氧化碳(CO2)排放量数据可视化当中,我们可以突出观察到配对数据两个共同特征。首先,大多数点都相对靠近对角线。...例如,下图就是显示了2000年至2010年人均二氧化碳排放差异最大十个国家倾斜图。 ? 斜线图相对于散点图具有一个重要优势:可用于一次比较两个以上测量。例如下图就是显示了三个时间变化结果。 ?

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聚簇索引和非聚簇索引区别的应用

因此可以得知:214这个数据是聚簇索引B+树根,其下面有两个子节点:1600,1664。接下来再对1600这个数据也运行数据查看指令。得到下面的信息: ?  ...注意红色箭头两个列,一个是我们建立索引列,一个是这个对应数据页面。也就是it_smalint_test为1对应数据也是1377,1378,1379,1380,这四个数据。...it_small_test是从1到100,每个占用两个数据节点,即两个数据(其实这样看法是错误1035这个索引数据也有存放it_small_test=3rid,这个B+树查找算法有关)...因此在查找it_small_test=3时,是通过查找索引树找到rid,然后再去数据堆上去查找数据行,注意这时是一行一行去查找,而不是一个数据一个数据查找,和聚簇索引查找情况是不一样...这里答案是:非聚簇索引同样不适用,归结为一个原因:在返回大数据结果情况下是不适合使用非聚簇索引

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5,ORM组件XCode(动手)

下面以《速览》中UserMember为例,建立数据表: 数据表名: 用户 (UserMember) 中文名 英文名 数据类型 大小 是否主键 是否唯一 是否必填 默认 编号 ID Int32 10...); //user.Insert(); //ID作为自增字段,保存后自动设为新 Console.WriteLine(user.ID); //查找数据,等效 user = UserMember.Find...这个小功能有个好处,比如生产环境是Oracle数据库,而开发环境比较差,跑不起Oracle,完全可以在开发环境用Access进行设计,部署到生成环境再修改连接字符串,XCode会尽其所能屏蔽数据库操作差异...上面是控制台例子,下面看看Web例子。 在生成实体类代码时候,可以看到还有两个模版“列表”和“表单”,取消“中文文件名”选择,分别生成这两个模版代码。新建一个网站,把它们复制进去 ? ?...刷新UserMember.aspx页面 ? ? ? ? ? 列表显示、分页、排序、编辑、删除等功能都有了。

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CVPR2020 | 显著性目标检测,多尺度信息相互融合

此外,由尺度变化引起类不平衡问题削弱了二元交叉熵损失影响,并导致预测空间不一致。因此,本文利用一致性增强损失来突出显示前后差异,并保留类内一致性。...最后,在五个基准数据实验结果表明,与23种最新方法相比,本文方法无需进行任何后处理过程,就具有良好性能。...虽然目前已经取得了很大进展,但仍有两个问题需要注意,一是如何从尺度变化数据中提取更多有效信息,二是如何提高这种情况下预测空间一致性。...同时,CEL可以更好地处理空间一致性问题,在不需要额外参数情况下均匀地突出突出区域,因为其梯度具有保持类内一致性和扩大类间差异特点。...2、提出增强损失函数,以协助模型统一突出显示整个显著区域,并更好地处理由各种比例物体引起前、后区域之间像素不平衡问题,而无需任何后处理或额外处理。

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单细胞分析:整合

虽然此示例只演示了两个数据(条件)整合,但这个方法可以扩展到多个数据。1. 目的以下教程旨在为您概述使用 Seurat 整合后对复杂细胞类型进行各种比较分析。...在这里,我们有以下三个目标:识别两个数据集中都存在细胞类型获得对照组和处理组中都保守细胞类型标记(markers)通过比较数据来寻找对刺激处理产生特异性反应细胞类型2....此函数对每个数据或组执行差异基因表达 test,并使用 MetaDE R 包中元分析(Meta-analysis)方法组合 p 。...在这里,我们取受刺激和对照 naive T 细胞和 CD14 单核细胞群平均表达,并生成散点图,突出显示对干扰素刺激有显着反应基因。...然后使用 FindMarkers 来查找受刺激 B 细胞和对照 B 细胞之间不同基因。请注意,此处显示许多 Top 基因与我们之前绘制核心干扰素反应基因相同。

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