是因为Rmarkdown在生成HTML报告时会使用自己的样式表来渲染内容，覆盖掉了自定义的CSS样式。要解决这个问题，可以通过以下方法：

1. 使用内联样式：在Rmarkdown中直接使用内联样式来设置标题的字体大小，例如：

# 设置一级标题的字体大小为20px
# 设置二级标题的字体大小为16px
# 设置三级标题的字体大小为14px
# 设置四级标题的字体大小为12px
# 设置五级标题的字体大小为10px
# 设置六级标题的字体大小为8px

1. 使用HTML标签：在Rmarkdown中使用HTML标签来设置标题的字体大小，例如：

# 设置一级标题的字体大小为20px
# 设置二级标题的字体大小为16px
# 设置三级标题的字体大小为14px
# 设置四级标题的字体大小为12px
# 设置五级标题的字体大小为10px
# 设置六级标题的字体大小为8px

1. 使用自定义CSS文件：在Rmarkdown中引入自定义的CSS文件，并在其中设置标题的字体大小，例如：

# 在Rmarkdown中引入自定义的CSS文件
# 设置一级标题的字体大小为20px
# 设置二级标题的字体大小为16px
# 设置三级标题的字体大小为14px
# 设置四级标题的字体大小为12px
# 设置五级标题的字体大小为10px
# 设置六级标题的字体大小为8px

以上方法可以根据具体需求选择使用，通过设置合适的字体大小可以使标题选择器在Rmarkdown生成的HTML报告中响应CSS中的字体大小规则。

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