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数据挖掘知识脉络与资源整理(九)–柱形图

柱形图 简介 英文:histogram或者column diagram 排列在工作表的列或行中的数据可以绘制到柱形图中。在柱形图中,通常沿水平轴组织类别,而沿垂直轴组织数值。...当您有代表下列内容的类别时,可以使用簇状柱形图类型: 数值范围(例如,直方图中的项目计数)。 特定的等级排列(例如,具有"非常同意"、"同意"、"中立"、"不同意"和"非常不同意"等喜欢程度)。...= "dodge") 我们发现fill后面跟着的是一个变量,且是一个分类变量,得到的结果是颜色会根据分类不同使用不同颜色. position = "dodge"将同类条形图并排放着,(dodge英文意思是闪躲回避的意思...(palette = "Pastel1") 3、 计数数据条形图 前面我们都是stat="identity"即每一个bar的高度根据另一个数值变量来决定,那如果,面对像下面的数据,caret变量是分类因子型...,这列变量中同一水平的因子有好几个,那么我们画条形图时,一般采用频数型,这时用水平出现的频数当做bar的高度.stat="bin"当然也可以不写,因为geom_bar默认是bin ggplot(diamonds

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day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot()

默认值为FALSE,即表示warning;更改为TRUE,即静默warning加一个变量将物种 species作为图例,用不同颜色和形状标识(兼顾色盲群体的需求)geom_point(aes(color...)) + geom_bar()#根据条形的频率依据处理因子函数对条形重新排序 ggplot(penguins, aes(x = fct_infreq(species))) + geom_bar...需要摸索找到最适宜的geom_bar(color = "red")——边框变红geom_bar(fill = "red")——填色变红Visualizing relationships可视化两个或多个变量之间关系数值变量...= "fill" 创建的相对频率图,对于比较岛屿之间的物种分布更有用,因为它不受岛屿上企鹅数量不相等的影响。...)平滑曲线geom_smooth()三个或更多变量用不同的颜色和形状代表不同观测值将绘图拆分为不同的子图 按单个变量对绘图进行分面facet_wrap() 参数1:公式?

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    R语言作图基础20230206

    ps:高级绘图函数是指可以绘制出一张图,而低价绘图函数是指在图中添加的“零部件”,低级绘图函数必须在高级绘图函数的基础上才能绘制,二者都是base包的内容eg:plot绘图> plot(iris[,1]...,iris[,3],col=iris[,5]) #以iris表格第一列作为x轴,第三列作为y轴,根据品种来绘制不同颜色> text(6.5,4,label="hello") #添加文字,并加上坐标图片三..., y = Petal.Length, color = Species))+ scale_color_manual(values = c("blue","grey","red"))图片总结:映射可以根据某一列的内容分配颜色...,geom_function的映射只能在局部使用7)柱状图/直方图 (y轴无需映射)ggplot(data = diamonds) + geom_bar(mapping = aes(x = cut)...)eoffice包(输出ppt的神器)topptx(p,"example.pptx") #输出ppt格式的图片,图中的每一个元素都是独立可移动、可编辑

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    生信技能树七天学习小组 Day4笔记——R语言基础

    和观测(行)的矩形集合,数据框每一列都有一个唯一的列名,长度相等,同一列的数据类型需要一致,不同列的数据类型可以不一致。...图形属性映射1.3.1 基本定义将数据集中的变量(列)映射为图形的属性(图中对象的可视化属性:数据点的大小、形状和颜色)将图中点的颜色映射为变量class,来显示每辆汽车的类型:ggplot(data...优势:根据想要观测的变量将数据分为每一分面,显示出每一分面中的趋势及不同分面之间的差别劣势:由于数据被分割为一个个的分面,数据整体的趋势就看不出来了如果有一个更大的数据集,就需要根据目标判断,如果看整体趋势的话就不用分面...1.6 几何对象1.6.1 几何对象的定义几何对象:图中用来表示数据的几何图形对象条形图:使用了条形几何对象折线图:使用了直线几何对象箱线图:使用了矩形和直线几何对象可以使用不同的几何对象来表示同样的数据...stat_summary()函数的默认几何对象:pointrangegeom_pointrange用于绘制数据点的范围(2)geom_col()函数的功能是什么?它和geom_bar()函数有何不同?

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    R语言绘图|patchwork拼图

    +p4+plot_layout(ncol = 1)#对p1使用theme_bw() 主题,p3和p2合并成一张图,并且拼成一列图片b)()& theme_参数 设置所有图片的主题(p1+(p2+p3)+...p4+plot_layout(ncol = 1))&theme_bw()图片总结:theme_ 的参数有很多,可以设置不同主题,根据需要选择图片三、进阶拼图(1)坐标法areas两个area函数说明绘制了两个区域,第一区域的开始位置坐标是(1,1),结束位置是(2,1) 第二个区域开始坐标是(2..."auto" , "collect" , "keep"五、插入元素p1+inset_element(p2,0.6,0.6,1,1)#图中的坐标同样表示插入图片的位置,(0.6,0.6)是图片的左下角点...,(1,1)是图片右上角的点图片p1+inset_element(p2,0,0.6,0.4,1)图片六、插入空白 plot_spacer()p1+plot_spacer()+p2#在p1和p2之间插入一个空白图片七

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    跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图

    第二列:每个组里的不同物种。第三列:每个分组里的每个物种的相对丰度。 这样分清层次后,我就自己生成了以下数据,并存为CSV格式。 ?...image.png 说明:ggplot(作图用的dataframe,aes(x=组名的列,y=丰度数值,fill=按照物种类型着色)) + geom_bar(stat = 'identity...箱图box plot的绘制: 简单箱图的绘制 箱图的表示的意义与理解请参考我之前的一个笔记:https://www.jianshu.com/p/54d4996d73cd 箱图数据的格式与要求: ?...发现目标图中,下标都单独拿出来形成了legend,这是想到其实ggplot直接作box plot就可以直接搞定,但是数据格式略有不同,准备的数据为: ?...image.png 箱图2: 带p value的箱图的绘制 先要安装另外两个包:ggsignif这个显著性检验的包 install.packages('ggsignif') 和ggthemr包:

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    “疫”外收获-nCov2019全球疫情之南丁格尔玫瑰图

    来源:人民日报新媒体 最近看到人民日报新媒体公布的疫情相关的图特别漂亮,想着利用疫情的数据学着画一画,R语言爬虫弱爆的我,只能想着站在“巨人的肩膀”学习,正巧Y叔更新公众号信息,Y叔竟然写了一个nCov2019...today_gb1其实就相当于我们在excel中将today这个一维数据列表根据cum_confirm列的数据信息转变为二维数据列表,这个二维数据是将cum_confirm中数值一样的country进行汇总...angle,一个圆360度,将每个角度分成42份 03 画图 >ggplot(today_top,aes(x = country, y =cum_confirm,fill=country))+geom_bar...为解决图片清晰度低的问题,采用Cairo包能够创建高质量矢量图,同时支持高质量图形渲染的特点,将ggplot绘制的图片储存成为pdf格式,同时借助showtext包中的showtext_begin函数和...此次代码运行的南丁格尔玫瑰图是通过学习张杰编著的《R语言数据可视化之美专业图表绘制指南》代码绘制,尽管图的外观和人民日报的图差别有点大,特别是图中数据显示(采用四舍五入法)、扇形角度、geom_bar(

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    课后笔记:ggplot2优雅的显示WB结果

    关于映射的详细介绍-> 一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。...✦ 几何对象(Geometric objects, geoms)代表在图中实际看到的点、线、多边形等。...✦ 统计转换(Statistical trassformations, stats)是对数据进行某种汇总,例如将数据分组创建直方图,或将一个二维的关系用线性模型进行解释。...✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...「position:」 位置调整,有效值是stack、dodge和fill,默认值是stack(堆叠),是指两个条形图堆叠摆放,dodge是指两个条形图并行摆放,fill是指按照比例来堆叠条形图,每个条形图的高度都相等

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    R语言可视化—饼图

    首先我们从基础的极坐标绘图开始,极坐标绘图一般是先画柱形图,再转化为极坐标,如下图: library(ggplot2) # 创建示例数据 data1 <- data.frame( category...geom_bar(stat = "identity", fill = "skyblue"):绘制柱状图,并设置颜色。...接下来再对这张图进行修饰即可,观察Fig.1A,知道应该做如隐藏x,y轴、移除多余的图形元素、将value值标注在对应的色块中并且居中排列、将图例放在图的下方按照两列排列并隐藏图例名称、图例外有黑边包边...具体来说: position_stack:这是一个位置调整函数,用于在堆叠的条形图或饼图中调整元素的位置。对于堆叠的条形图,它将标签按照条形的高度依次堆叠。...在饼图中,position_stack(vjust = 0.5)用于将标签(如百分比)放置在每个饼图扇形区域的中间位置,从而使得标签更清晰地显示在每个部分的中心。

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    从零开始的异世界生信学习 R语言部分 05 作图-1

    5mm alpha = 0.5, # 透明度 50% shape = 8) # 点的形状 图片 3.2.2 映射:按照数据框的某一列来定义图的某个属性...+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length)) + facet_wrap(~ Species) ##分面是根据数据的某一列把一张图分成若干的子图...,根据列的取值分成若干的图 ##用来分面的列:1.应该是分类变量,离散型数据;2.取值数量有限; 图片 #双分面 dat = iris dat$Group = sample(letters[1:5],150...letters(26个小写字母)中1-5(A-E)中可重复的取150个值 图片 3.2.4 几何对象 指一个以geom开头的函数画出来的所有东西称为一个几何对象,也称为了一个图层 几何对象可以叠加 #4...作图只需要一列 ## geom开头的几何对象函数,stat开头的几何变换函数,两种函数存在对应 图片 #统计变换使用场景 #5.1.不统计,数据直接做图 fre = as.data.frame(table

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    Day06 生信马拉松-R语言作图

    ,线型等) 2.1 映射:按照数据框的某一列来定义图的某个属性ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,...y = Petal.Length, color = Species)) #以Species列的分类来自动分配颜色自行指定映射的颜色ggplot(data...WARNING①不要修改内置数据,你会忘记修改过②保留原始数据,防止可正常运行但错误的代码,不对原始数据进行修改3.分面3.1 根据映射分面ggplot(data = iris) + geom_point...中不同的体系,不用细究ggplot(data = diamonds) + stat_count(mapping = aes(x = cut))5.1 使用表中数据直接做图,不统计(统计变化使用场景1...Species)) + geom_boxplot()+ geom_jitter()#注意这里要用 geom_jitter()而不是geom_point()6.1 position参数差异所产生的不同条形图

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    (数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

    图中可能还有分组,就是生成关于数据的不同子集的图形。...)   同样的,我们也可以对图中的散点设置颜色、大小、形状等参数,与plot不同的是,qplot中可以使用更加丰富的内容和更自由的赋参方法,我们可以传入类别型数据,qplot会自动将其识别并分配对应到不同的颜色和不同的尺寸...,下面我们就对ggplot2的语法规则进行探索: 3.1 ggplot2的绘图过程   我们先来看一下ggplot2的绘图过程: 仅根据上面的图,你心中一定很是疑惑,没关系,请你先短暂浏览上面这个过程...qplot()进行绘图,其局限性是只能使用在qplot()中定义的一个数据集和对应的一组图形属性映射,若希望将不同的数据通过不同的图层构建方式来展现在一张图上,就需要使用ggplot()函数,该函数有两个主要的参数...,又接连添加了两个图层,第一个图层绘制出以因子转化后的cyl为shape的散点图,第二个图层绘制出以因子转化后的cyl为colour的光滑拟合曲线,这时summary我们的p也可以观察到分图层的各图层信息

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    阿榜的生信笔记6-R作图

    : 大家记住哦,画图是让自己的数据可视化 我给大家介绍下常见的可视化R包: 一、基础绘图函数 ①、复习plot()函数 提个小问题:图中6.5和4是什么?...3、映射(重点哦) 关键词:数据框、某一列、图的某个属性 按照上述模板一一对应观察,你能找出他们的规律✌ ①、映射设置 提个小问题:一个color的实际参数有引号,另一个color的实际参数没有引号,这是为什么呢...答案:一个是映射,aes()的参数;另一个是手动设置,geom_point()的参数。...,两种方法各有优势哦 两种设置的作用: ⑥、统计变换 ⑦、位置关系 geom_point()与geom_jitter()的区别如上图所示 ⑧、坐标系 注意:不同的函数顺序画出图的效果是不一样的哦?...5mm alpha = 0.5, # 透明度 50% shape = 8) # 点的形状 #2.2 映射:按照数据框的某一列来定义图的某个属性

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    「R」数据可视化4 : 直方图条形图

    直方图例子 而条形图如下列例子统计了不同国家的样本数量。可以看到下图的柱子之间有间隔,体现出国家并非一个连续变量而是一个分类变量。 ? 条形图例子 直方图/条形图怎么画?...ggplot(diamonds, aes(carat)) + geom_bar() ? 可以看到如果使用上述命令,每一个重量对应的都有一个柱子,显示了不同重量而非某个范围的重量所对应的钻石数量。...#加载包 library(ggplot2) #作图 ggplot(diamonds, aes(clarity)) + geom_bar() ? 从图中我们可以看到不同等级净度的钻石情况。...4)如何做好看的直方/条形图 利用下述代码我们可以得到不同重量的钻石切割水平的情况。...关于直方/条形图的介绍就到这里啦。大家还可以更进一步的看一看这两个绘图函数的功能,让图像变得更好看。

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    R语言画图——生信技能书

    base ggplot2(以这个为主) ggpubr拼图:par里的mfrowgrid.arragecowplot:被最后一个取代customlayoutpatchwork:推荐使用导出:经典三段论ggsave...;iris是数据来源,x和y为行和列名;列名不带引号;行末写加号代表是一个整体的代码2.属性的设置:手动设置颜色 color大小:size形状:shape透明度填充颜色映射:按照数据框的某一列来定义图的某个属性...否则无效真正的颜色:颜色编码来代替;十六进制颜色编码:搜索引擎进行搜索Q2:color和fill两个属性空心和实心得形状都用color设置颜色fill:既有边框又有内心的,才需要color和fill两个参数...3.分面:根据species放在同一种图里面;竖着切横着切和竖着切:先新增一列: dollar后面跟着新的列名: 取值数量有限且有重复值,可以按照列分开dat = irisdat$Group = sample...(mapping = aes(x = cut))ggplot(data = diamonds) + stat_count(mapping = aes(x = cut))geom_bar函数:绘制柱状图

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    Jelys Note之生信入门class6

    (1)Plot()多种图形plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) 做一个横坐标用iris第一列的数据,纵坐标用第三列的数据,颜色用第五列数据的图> text(6.5,4...,是列名【color = Species图的颜色按species中的数字来分配,同种类的同个颜色】【映射—与数据有关是aes,根据数据的某一列的内容分配颜色【自动分配颜色,修改颜色】】图片比较:映射与手动设置...区分color和fill两个属性都是颜色,但用法不同需要看设置颜色的形状1)空心形状和实心形状都用color设置颜色#实心的例子--一种颜色ggplot(data = iris)+  geom_point..., y = Petal.Length)) + facet_wrap(~ Species) ----根据其中一列来分面图片species有三种品种,分三张图7....10统计变化:Diamond是内置数据,---用柱状图统计一列有多少取值,出现多少次可用table统计1)如果要画出柱状图:有两个函数可以使用View(diamonds)table(diamonds$cut

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