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生物信息数据分析教程视频——13-3种R包(DESeq2、edgeR和limma)进行RNAseq的差异表达分析与比较

参考文章: 超详细的DESeq2和edgeR包的基本原理和实战案例 一文就会TCGA数据库基因表达差异分析【过后付费当赞赏】 基于count数据的基因差异表达分析万能代码【和本文代码差不多】 代码:...fun/filterGeneTypeExpr.R") source("H:/MedBioInfoCloud/analysis/TCGA/new/00-fun/del_dup_sample.R") ###差异分析的函数...vn_pcDEG,vn_lncRNA_DEG,file = paste0(opt_deg,"all-DEG-DESeq2-edgeR-limma.Rdata")) ###===========3种方法的差异分析结果比较...:该函数在前面文章【基于count数据的基因差异表达分析万能代码】中有提到,获取方式在最早的差异分析教程文章中获取【一文就会TCGA数据库基因表达差异分析】,现在分享一下这个函数。...size = 4, segment.color = "black", #连接线的颜色,就是名字和点之间的线 show.legend

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浅尝辄止,React是如何工作的

,而是属性的修改,保留其下面元素和节点 相同类型的组件元素 与上面类似,相同类型的组件元素,子元素的实力会保持,不会摧毁。...当子元素有key时,React使用key将原始树中的子元素与后续树中的子元素相匹配。...如果不发生任何变化,reducer将返回旧的state。 Redux只通过比较新旧两个对象的存储位置来比较新旧两个对象是否相同。...如果你在reducer内部直接修改旧的state对象的属性值,那么新的state和旧的state将都指向同一个对象。因此Redux认为没有任何改变,返回的state将为旧的state。...//接上面的例子 a === b //false 我不要进行深度比较,只是浅比较,引用值不一样(不是同一个对象),那就是不一样的。

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    2022react高频面试题有哪些

    在 HTML 中,表单元素如 、和通常维护自己的状态,并根据用户输入进行更新。当用户提交表单时,来自上述元素的值将随表单一起发送。...对新旧两棵树进行一个深度优先遍历,这样每一个节点都会一个标记,在到深度遍历的时候,每遍历到一和个节点,就把该节点和新的节点树进行对比,如果有差异就放到一个对象里面遍历差异对象,根据差异的类型,根据对应对规则更新...React 将 render 函数返回的虚拟 DOM 树与老的进行比较,从而确定 DOM 要不要更新、怎么更新。...JS的代码块在执行期间,会创建一个相应的作用域链,这个作用域链记录着运行时JS代码块执行期间所能访问的活动对象,包括变量和函数,JS程序通过作用域链访问到代码块内部或者外部的变量和函数。...(2)经过调和过程,React 会以相对高效的方式根据新的状态构建 React 元素树并且着手重新渲染整个 UI 界面;(3)在 React 得到元素树之后,React 会自动计算出新的树与老树的节点差异

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    听GPT 讲Istio源代码--pilot

    yamlDiff(base, new string) (string, error): 比较两个YAML格式的字符串之间的差异,返回一个表示差异的YAML格式字符串。...YAMLDiff(data string, base string) ([]string, error): 比较两个YAML格式的字符串之间的差异,返回一个字符串列表,包含了详细的差异信息。...它会根据请求的类型,将请求分派给适当的处理函数来处理。这些处理函数根据需要进行服务发现、负载平衡、健康检查等操作,并返回相应的响应。...applyDefaults函数用于将代理参数的默认值应用到给定的代理参数对象上。如果某些选项没有被指定,这些选项将被设置为默认的值。该函数还会根据给定的选项设置验证和处理逻辑。...它接收一个目标地址作为参数,并返回一个TLS配置对象,可用于与该地址建立TLS连接。 这些方法用于实现在Pilot Agent中对指定地址进行连接和探测的功能。

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    听GPT 讲Istio源代码--operator

    Diff函数:比较两个配置文件的不同之处,并将结果以Diff对象的形式返回。Diff对象可以用于进一步处理和显示配置文件之间的差异,比如输出差异的行号和详细差异信息。...该文件包含以下几个重要元素: kubeClients变量:这是包含了与Kubernetes API进行交互的客户端集合。...函数profileDiff是实际进行配置文件比较的函数,它接收两个配置文件路径作为输入,并根据输出格式参数调用不同的差异显示函数。...函数profileDiffInternal是内部函数,它根据配置文件的类型(如YAML、JSON等)读取配置文件内容,并调用第三方库进行比较,最后将差异结果格式化输出。...它根据操作系统类型和环境变量中的配置进行推断,以返回正确的ConfigMap名称。

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    阿里前端二面必会react面试题指南_2023-02-24

    这种方式很少被使用,咱们可以将一个函数传递给setState,该函数接收上一个 state 的值和当前的props,并返回一个新的状态,如果咱们需要根据以前的状态重新设置状态,推荐使用这种方式。...对新旧两棵树进行一个深度优先遍历,这样每一个节点都会一个标记,在到深度遍历的时候,每遍历到一和个节点,就把该节点和新的节点树进行对比,如果有差异就放到一个对象里面遍历差异对象,根据差异的类型,根据对应对规则更新...React 将 render 函数返回的虚拟 DOM 树与老的进行比较,从而确定 DOM 要不要更新、怎么更新。...此方法就是拿当前props中值和下一次props中的值进行对比,数据相等时,返回false,反之返回true。...(2)经过调和过程,React 会以相对高效的方式根据新的状态构建 React 元素树并且着手重新渲染整个 UI 界面;(3)在 React 得到元素树之后,React 会自动计算出新的树与老树的节点差异

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    前端入门6-JavaScript客户端api&jQuery

    相等比较 Js 中比较分两种,严格和非严格,对应的操作符:===&!== 和 ==&!...= 两个等号的比较时,比较的两个变量只要数值上相等,那么就返回 true,三个等号的比较时,需要同时满足类型和数值相等两个条件才会返回 true。.../hidden/id 获取或设置disable/hidden/id… attributes 获取元素设置的属性值列表,返回Attr[]对象 innerHTML 获取元素标签包装的内容,包括文本内容及子元素...所以,即使找到了元素后,还需要将元素与一些事件进行绑定,比如点击事件等等。...当 js 动态修改的样式比较多时,选择 class 操作较方便,事件将需要的样式写在 css 中,在 js 里直接添加或移除指定 class 实现。

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    js数组中一些实用的方法(forEach,map,filter,find)

    ,返回值为undefined }) 特点 callback函数,为数组中每个元素执行的函数,该函数接收三个参数 变量参数名1表示的是数组中的项值(数组当前项的值) 变量参数名2表示的是索引(数组当前项的索引...,只是将原来的数组拷贝了一份,把拷贝的数组项进行更改,支持链式调用 使用场景 场景1: 拷贝原数组,改变一些东西,假定有一个数组(A),将A数组中的值以双倍的数值放到B数组中 Es5写法 var numbersA...迭代器进行遍历,先取到数组中的每一项的地止放入到队列中,然后按顺序取出队里的地址来访问元素 大体上讲,如果数据量不是很大的情况下,抛开业务场景和使用便利性,单纯谈性能和效率是没有意义的,一些Es5,ES6...)以及console.timeEnd()进行测试的,个人觉得还是要多用Es5和Es6新增的迭代器方法,相比于for循环,得定义初始值,得跟踪循环计数的变量,是很容易出问题的 代码是写给人看的,顺便在机器上运行...方法会返回一个新的数组 find方法返回的根据迭代器函数结果boolean值,若结果为真则返回指定的元素,若无则返回undefined 而改变原有数组的有:增加(push,unshift),删除(pop

    2.9K20

    彻底搞懂Vue虚拟Dom和diff算法

    虚拟DOM(Virtual Dom),也就是我们常说的虚拟节点,是用JS对象来模拟真实DOM中的节点,该对象包含了真实DOM的结构及其属性,用于对比虚拟DOM和真实DOM的差异,从而进行局部渲染来达到优化性能的目的...;虚拟DOM有效降低大面积的重绘与排版,因为是和真实DOM对比,更新差异部分,所以只渲染局部;总损耗 = 真实DOM增删改 + (多节点)回流/重绘; //计算使用真实DOM的损耗总损耗 = 虚拟...updateChildren方法的核心:提取出新老节点的子节点:新节点子节点ch和老节点子节点oldCh;ch和oldCh分别设置StartIdx(指向头)和EndIdx(指向尾)变量,它们两两比较(按照...图片彩蛋因为React只是简单学了基础,这里作为对比来概述一下:1.React渲染机制:React采用虚拟DOM,在每次属性和状态发生变化时,render函数会返回不同的元素树,然后对比返回的元素树和上次渲染树的差异并对差异部分进行更新...通常元素上绑定的key值就是用来比较节点的,所以一定要保证其唯一性,一般不采用数组下标来作为key值,因为当数组元素发生变化时index会有所改动。

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    【React】393 深入了解React 渲染原理及性能优化

    经过 Diff 算法会计算出 Virtual DOM 的差异,然后将这些差异进行实际的DOM操作更新页面。 React 总体架构 ?...而 React 是通过创建与更新虚拟元素 Virtual Element 来管理整个Virtual Dom 的。...虚拟元素可以理解为真实元素的对应,它的构建与更新都是在内存中完成的,并不会真正渲染到 dom 中去。 回到我们的计数器 counter 组件: ?...很明显,因为对象的比较是引用地址,显然是不相等的。 因此 shoudComponentUpdate 方法都返回了 false, 组件就进行了更新。 那么我们怎么能避免这种情况的发生呢?...其中一个方法是做深比较,但是如果对象或数组层级比较深和复制,那么这个代价就太昂贵了。 我们就可以用到 Immutable.js 来解决这个问题,进一步提高组件的渲染性能。

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    一文掌握React 渲染原理及性能优化

    经过 Diff 算法会计算出 Virtual DOM 的差异,然后将这些差异进行实际的DOM操作更新页面。 React 总体架构 ?...而 React 是通过创建与更新虚拟元素 Virtual Element 来管理整个Virtual Dom 的。...虚拟元素可以理解为真实元素的对应,它的构建与更新都是在内存中完成的,并不会真正渲染到 dom 中去。 回到我们的计数器 counter 组件: ?...很明显,因为对象的比较是引用地址,显然是不相等的。 因此 shoudComponentUpdate 方法都返回了 false, 组件就进行了更新。 那么我们怎么能避免这种情况的发生呢?...其中一个方法是做深比较,但是如果对象或数组层级比较深和复制,那么这个代价就太昂贵了。 我们就可以用到 Immutable.js 来解决这个问题,进一步提高组件的渲染性能。

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    接口自动化测试,一键快速校验接口返回值全部字段

    DeepSearch:在对象中搜索其他对象 DeepHash:根据对象的内容进行哈希处理 DeepDiff 的初衷是用来找出不同数据的差别,可以比较JSON、XML文本类的,也可以比较图片,在使用了一下之后...:字段key删除 2.2 案例二:比较接口响应 有了案例一的基础,进一步,我们将本地定义写死的变量值改成采取调用接口的方式(更符合实际接口测试),通过发起请求,获取响应、并结合Deepdiff来断言使用...核心思路:先定义预期的响应结构体(意味着,你得事先知道你期望的结果是什么),再根据实际返回的结构体两者通过Deepdiff进行自动比较。...2.3 案例三:正则搜索匹配 要解决上述的问题,可以利用DeepSearch中的正则搜索匹配功能,如果你的接口返回,是一个很深的嵌套结构对象,然后你想校验查找指定的元素(key和value都行)是否存在...在接口自动化测试中,小结一下,使用 DeepDiff 的好处有: 接口测试的时候,可以直接利用预期结构体(或者称之为接口契约)与实际返回的结构体(字段、值)进行自动比较,来确定是不是一样,可以少写很多代码

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    接口自动化测试,一键快速校验接口返回值全部字段

    DeepSearch:在对象中搜索其他对象 DeepHash:根据对象的内容进行哈希处理 DeepDiff 的初衷是用来找出不同数据的差别,可以比较JSON、XML文本类的,也可以比较图片,在使用了一下之后...:字段key删除 2.2 案例二:比较接口响应 有了案例一的基础,进一步,我们将本地定义写死的变量值改成采取调用接口的方式(更符合实际接口测试),通过发起请求,获取响应、并结合Deepdiff来断言使用...核心思路:先定义预期的响应结构体(意味着,你得事先知道你期望的结果是什么),再根据实际返回的结构体两者通过Deepdiff进行自动比较。...2.3 案例三:正则搜索匹配 要解决上述的问题,可以利用DeepSearch中的正则搜索匹配功能,如果你的接口返回,是一个很深的嵌套结构对象,然后你想校验查找指定的元素(key和value都行)是否存在...在接口自动化测试中,小结一下,使用 DeepDiff 的好处有: 接口测试的时候,可以直接利用预期结构体(或者称之为接口契约)与实际返回的结构体(字段、值)进行自动比较,来确定是不是一样,可以少写很多代码

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    Spark 基础(一)

    (func):与map类似,但每个输入项都可以映射到多个输出项,返回一个扁平化的新RDDunion(otherDataset):将一个RDD与另一个RDD进行合并,返回一个包含两个RDD元素的新RDDdistinct...count():返回RDD中元素的数量first():返回RDD中第一个元素take(n):返回RDD中前n个元素foreach(func):将RDD中的每个元素传递给func函数进行处理saveAsTextFile...根据共享模式的不同,Spark支持两种类型的共享变量:只读变量:只读变量包括Broadcast变量和逻辑区域变量。...可以使用Spark中的RegressionEvaluator来计算预测结果和真实值之间的差异(如均方根误差、平均绝对误差等)。...:波士顿房价数据集相对比较干净,但在实际应用中可能会出现缺失值、异常值等问题,需要进行数据清洗或处理。

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    Java 中的 ==, equals 与 hashCode 的区别与联系

    因此,在使用关系操作符 == 来进行比较时,比较的就是“值”本身。...而通过 new 来产生一个对象,并将这个对象和str1进行绑定: str1= new String("hello");   那么 str1 就指向了这个对象,此时引用变量str1中存储的是它指向的对象在内存中的存储地址...我们根据元素的自身特征把元素分配到不同的链表中去,也是根据这些特征,找到正确的链表,再从链表中找出这个元素。其中,将根据元素特征计算元素数组下标的方法就是散列法。...如果这个位置上没有元素,那么直接将它存储在这个位置上; 如果这个位置上已经有元素了,那么调用它的equals方法与新元素进行比较:相同的话就不存了,否则,将其存在这个位置对应的链表中(Java 中 HashSet..., HashMap 和 Hashtable的实现总将元素放到链表的表头)。

    1.5K22

    JavaScript(基础)

    变量与变量之间是互相独立的,修改一个变量不会影响其他的变量。 引用数据类型的数据,变量是保存的对象的引用(内存地址)。 如果多个变量指向的是同一个对象,此时修改一个变量的属性,会影响其他的变量。...来将其他的数据类型转换为布尔值 && &&可以对符号两侧的值进行与运算 只有两端的值都为true时,才会返回true。只要有一个false就会返回false。...与是一个短路的与,如果第一个值是false,则不再检查第二个值 对于非布尔值,它会将其转换为布尔值然后做运算,并返回原值 规则: 1.如果第一个值为false,则返回第一个值 2.如果第一个值为true...# 相等运算符 == 相等,判断左右两个值是否相等,如果相等返回true,如果不等返回false 相等会自动对两个值进行类型转换,如果对不同的类型进行比较,会将其转换为相同的类型然后再比较, 转换后相等它也会返回...break; } 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 复制 执行流程: switch...case...语句在执行时,会依次将case后的表达式的值和switch后的表达式的值进行全等比较

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    【JavaScript】 基础

    = 将右边的值赋给左边变量 算数运算符 + - * / % 加 减 乘 除 取余 复合运算符 += -= *= /= %= 自增或自减运算符 ++ -- 变量的自增和自减指的是在自身基础上进行...==(不全等) 关系运算符用来判断表达式之间的关系,结果永远是布尔值 true/false 使用 字符串与字符串之间的比较 依次比较每位字符的Unicode码,只要某位字符比较出结果,就返回最终结果...其他情况 一律将操作数转换为number进行数值比较,如果某一操作数无法转换number,则变成NaN参与比较运算,结果永远是false null和其他数据类型做等值比较运算 不转换成数字 null...和undefined相等 但是 null和undefined不全等 相等与全等 相等 : 不考虑数据类型,只做值的比较(包含自动类型转换) 全等 : 不会进行数据类型转换,要求数据类型一致并且值相等才判断全等...sort () 中,会自动传入两个元素进行比较,如果 a-b>0, 交换元素的值,自定义升序排列 String 对象 创建 var str = "100"; 特点 字符串采用数组结构存储每位字符

    2.1K20

    Java基础-甲骨文系列

    如果变量是基础数据类型,==用于比较其对应值是否相等。如果变量指向的是对象,==用于比较两个对象是否指向同一块存储空间。Eg: 两个String比较用==比较的是地址。...简述重载与重写的区别 重写即子类重写父类的方法,方法对应的形参和返回值类型都不能变。 重载即在一个类中,方法名相同,参数类型或数量不同,这个和返回的类型无关。...简述==与equals方法的区别 对于==,在基本数据类型比较时,比较的是对应的值,对引用数据类型比较时,比较的是其内存的存放地址。...对于equals方法,在该方法未被重写时,其效果和==一致,但用户可以根据对应需求对判断逻辑进行改写,比如直接比较对象某个属性值是否相同,相同则返回true,不同则返回false。...简述Java序列化与反序列化的实现 序列化:将java对象转化为字节序列,由此可以通过网络对象进行传输。 反序列化:将字节序列转化为java对象。

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    疯狂Java笔记之常见java集合的实现细节

    也就是说,Java集合实际上是多个引用变量所组成的集合,这些引用变量指向实际的Java对象。对于java集合他只是多个引用变量的集合。...当程序试图将一个key-value对放入HashMap中时,首先根据该key的hashCade()返回值决定该Entry的存储位置—如果两个Entry的key的hashCade返回值相同,那么它们的存储位置相同...:如果这两个Entry的key通过equals比较返回true,则新添加Entry的value将覆盖集合中原有Entry的value,但key不会覆盖;如果这两个Entry的key通过equal比较返回...1.Map接口提供了get(K key)方法,允许Map对象根据key来取得value. 2.List接口提供了get(int index)方法,允许list对象根据元素索引来取得value Map和...同理在删除元素是也要对元素进行“整体搬家”,这就导致增加和删除的性能非常差,当时在取出数据元素时,性能基本和数组是一样的。

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    深入了解React 渲染原理及性能优化

    经过 Diff 算法会计算出 Virtual DOM 的差异,然后将这些差异进行实际的DOM操作更新页面。 React 总体架构 ?...而 React 是通过创建与更新虚拟元素 Virtual Element 来管理整个Virtual Dom 的。...虚拟元素可以理解为真实元素的对应,它的构建与更新都是在内存中完成的,并不会真正渲染到 dom 中去。 回到我们的计数器 counter 组件: ?...很明显,因为对象的比较是引用地址,显然是不相等的。 因此 shoudComponentUpdate 方法都返回了 false, 组件就进行了更新。 那么我们怎么能避免这种情况的发生呢?...首先,我们定义了一个 Immutable 的 List 对象,List 对应于原生 JS 的 Array,对 Immutable 对象进行修改、添加或删除操作,都会返回一个新的 Immutable 对象

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