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rmarkdown+flexdashboard制作dashboard原型

其中yaml头文件vertical_layout参数用于控制整个图标布局行列布局规则,vertical_layout: fill效果为自动按布局。...参数为fill时,所有图表高度会根据当前页面浏览器高度自适应调整)。...Page Navigation——导航页支持二级菜单选择 Multiple Columns 当然flexdashboard可以支持多布局,只需要在代码声明参数即可,而且可以自定义各宽。...Tabsets——页面切换按钮 使用flexdashoardtab功能可以组织页面切换效果: --- title: "Tabset Column" output: flexdashboard::flex_dashboard...### Cars ```{r} knitr::kable(mtcars) ``` ? Data Table DT包输出表格支持动态筛选和分页功能,交互体验很有特色。

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小站工具2.0|单基因生存期曲线图+ROC,重点是根据批量生成单因素COX与AUC结果筛选~回复:SUV,可获得测试文件!

重磅更新:可根据AUC与单因素COX结果筛选生存曲线+ROC图 这里大大感谢:Daying!...3)右上角表格可以进行,各筛选,比如5年生存期AUC>0.7 & 单因素COX p<0.05 & prognosis is bad。...基因筛选一下在跑,最好是200个基因x200以内个样本。 如果跑过程,出现 画面不动情况,千万别盯着,去刷刷朋友圈,看看站长教程。...至少要有三:分别是 基因名(Gene Symbol),倍数(log2FlodChange),p值(padj),在右上那几个列名中分别填写自己表格名字。...之前站长精选配色依然可以选择,如果想自己DIY,请选择YouLike,然后在调色板选颜色,火山图会实时更新。 2.升级指示基因功能。可以实现单选多选,并与表格交互。你想选哪个基因,在右边表格点一下。

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个人永久性免费-Excel催化剂功能第58波-批量生成单选复选框

插件最大威力莫过于可以把简单重复事情批量完全,对日常数据采集或打印报表排版过程,弄个单选、复选框和用户交互,美观同时,也能保证到数据采集准确性,一般来说用原生方式插入单选、复选框,操作繁琐,...今天Excel催化剂给大家送上批量一键生成多个单选复选框功能,可直接根据选择内容即可生成,同时提供数据单元格链接功能,方便数据采集。...单选、复选功能按钮位置 操作步骤 选择要添加单选或复选框内容 控制生成单选或复选框链接单元格位置 链接单元格位置是指当用户交互过程选择了某个组件,该组件状态信息会反应到相应链接单元格内容上...复选框批量全选、反选、清除筛选 同样地此几项选择,仅对选择单元格范围内复选框生效,因使用了单元格链接方式,生成复选框默认都会变成灰色全选,可使用清除筛选让其所有选择为空。...链接了单元格时,生成效果如图所示灰色选择状态 使用清除筛选,把灰色选择去除,同时链接单元格内容生效 生成单选复选后需要调整大小 当初始生成控件大小不合适时,可使用第54波介绍图形调整功能,把行高

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Excel技巧:使用上方单元格值填充空单元格

有时候,工作表列中有许多空单元格,而不是在每行都重复相同内容,这样可以使报表更容易阅读,然而也会导致一些问题,例如不方便排序或筛选数据。...如下图1所示,在A中有一些空单元格,如果对A进行筛选,则只会出现有内容单元格数据,因此空白单元格需要使用其上方单元格内容填充。...图1 首先,选择包含空单元格,单击功能区“开始”选项卡“编辑”组“查找和选择——定位条件”,在弹出“定位条件”对话框勾选“空值”前单选按钮。...然后,输入=号,按向上箭头键选择上方单元格,再按Ctrl+回车键,在所有被选择单元格输入公式。 最后,选择A,复制数据,然后在所选单击右键,选择“粘贴值”命令。...EntireColumn .Value = .Value End With End With End Sub 在运行这个宏之前,使当前单元格位于要填充空白单元格

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十个超级好用R语言编程技巧,一般人绝不知道!

这个技巧在编程需要根据之前抉择加载一个不同数据集时非常有用。比如说,现在有一个变量“animal”,编程需要根据animal是dog,cat还是rabbit来加载一个不同数据集。..."dog" ="dogdata.csv", "cat" ="catdata.csv", "rabbit" ="rabbitdata.csv")) 当需要根据一个或多个输入菜单选择在...R Shinyreq函数和validate函数 R Shiny常常让人崩溃,特别是在弹出一般性错误提醒而程序员又一头雾水时候。...但是,如果在转换文件选择参数时,选择了RStudioKnit下拉列表选项(或使用了kint_with_parameters()函数),一个菜单就会出现,来在转换文件前选择参数。非常棒! ?...R ShinyHTML标签(以在Shiny应用程序播放音频为例) R Shiny中有110种HTML标签,可以为各种各样HTML命令,如格式化,提供快捷方式。

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RShiny 教程笔记

p4:分享 Shiny 将所有脚本和材料保存到一个目录,目录下代码通常以以下 2 种方式之一存储: app.R ui.R & server.R ? ? ?...p7:响应式编程 响应式编程:当输入改变时,输出根据逻辑会自动进行所需要运算,对结果值更新。...p9:reactive 工具集 render* 函数构建 shiny app 要显示对象。 它会将结果保存到 output 对应元素。...p10:使用 reactive 表达式模块化 Shiny 回顾上一部分学习,当多处使用同一随机数据时,不同地方数据将变得不一致。...column() 创建。每个新增都会对齐到左侧。页面总宽度为12,offset 可以设置偏移量。 如果要在网格布局添加元素,只需要将元素当作参数传入即可。 ? ? ? ? ? ?

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Shiny 练习 | 堆积柱状图

因为胆汁酸根据来源可以分为初级胆汁酸、次级胆汁酸以及胆汁酸代谢产物,所以就想着,柱状图也可以根据每个类别进行不同着色(分类内条目为对应色系渐变色),进一步观察来源分类上差异: ?...,样本名需和第一个数据矩阵相同,第二为分组 SampleID GroupSample1 group1Sample2 group1Sample3 group1Sample4...,实际程序只会统计第二有几个分类,我这里用 1,2,3,4 来代表数据条目的四个分组,第一需与第一个数据矩阵列名相同 Taxa ColorA 1B 1C 1D 1E...把这个小勾勾打上程序就会根据类别数据出现相应数量取色器(示例数据是 4 类): ? 然后再点击绘图按钮,就会出现自定义分类颜色第三张图啦: ? 这就是这个网站主要功能。...),只有 Custom colors for each taxon group 选项打上勾时才会显示取色器 UI,这部分会在 server.R 中介绍) 根据不同选项类型,选择使用不同输入方案,比如

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R」Rmarkdown与Shiny

,JavaScript库(例如DataTables)可以很方便将大数据集嵌入网页,它可以自动执行分页,也支持搜索与筛选。...一般图非常简单,和平常写R代码一样,不过不在.R写,而是在.Rmd写,将你代码写入如下代码框,使用Control+Alt+i可以直接插入一个代码框。...服务器背后逻辑是根据输入input样本容量n生成随机数,计算随机样本均值,并将结果放在output。...我们可以根据想展示给用户参数来定义shiny应用程序用户界面,shiny提供了丰富输入控件: shiny_vars = ls(getNamespace("shiny")) shiny_vars[...GMB生成一条路径,sapply()将所有生成路径组合成一个矩阵,矩阵每一代表一条路径,然后使用matplot()画图。

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Excel 实例:单因素方差分析ANOVA统计分析

这是通过选择  Office按钮> Excel选项>  Excel 加载项或  从Excel 开始Excel版本文件>帮助|选项>加载项 ,然后单击   窗口底部“ 转到”按钮来完成。...图3 –样本输入范围 在这种情况下,将范围B2:E9插入 (图2对话框)“  输入范围”字段,然后选择“  ”  单选按钮。...如果按行而不是按列出处理数据,则可以选择“  行”  单选按钮,还可以选择“ 第一  标签”  复选框。...现在,您可以 从“ 输出”  选项中选择“  新建工作表层”单选按钮  (并将数据字段保留为空白)。...或者,您可以选择“  输出范围”  或“  新工作簿”  单选按钮,以将报告置于您选择某个特定输出范围或新工作簿

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基于R语言shiny网页工具开发基础系列-01

上面是shiny团队稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) R包 一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素...runApp和其他R许多函数(read.csv, read.table)一样,第一个参数是从工作目录到app目录文件路径,以上代码假设my_app文件夹包含在你工作路径,因此,只需要输入文件夹名字...当shiny app启动后,R会话框会变成忙碌状态,不能运行任何其他代码,R会监控app并处理app反应。...Shift+Enter) 点击灰色向下展开小箭头还有更多惊喜哦 一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名路径(文件夹) 保存app.R到myapp文件夹 使用runApp...函数或者Rstudio按钮启动app 通过点击叉叉或者stop退出app 下一节将开始了解app每一个部分 Reference: Shiny - Welcome to Shiny

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R」第一个Shiny应用(一) hello world

Shiny 是一个开源 R 包,它为使用 R 构建 Web 应用提供了一个优雅有力 Web 框架。Shiny 帮助你在不需要前端知识条件下将数据分析转变为可交互 Web 应用。...Shiny 构成与安装 每个 Shiny App 都有 2 个关键组成: UI(用户界面):定义应用外形 Server(后端):定义应用如何工作 Shiny 应用了响应式编程技术,可以根据输入变换自动更新输出...使用下面命令进行安装: install.packages("shiny") 然后将包载入当前 R 会话: library(shiny) Hello world 示例 在几种创建 Shiny 应用方式...使用 shinyApp(ui, server) 构建和启动一个 Shiny 应用。 如何运行 如果使用 RStudio: 点击文档工具栏 Run App 按钮。...停止 运行后 R 会话会处于忙碌状态,需要用以下方式停止: RStudio 中点击工具栏停止图标。 R 控制台中键入 Ctrl + C。 关闭 Shiny 应用窗口。

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三种方式制作数据地图

话不多说,还是先上效果图: 首先是全国省份色温图,点击单选按钮可切换不同指标。...另有下拉列表可选择单击各省份时,是显示该省份标签,还是下钻到该省份各城市色温图;下钻到各城市后,依然可以通过点击单选按钮切换该省份各城市不同指标色温图。...通过B:D,查询引用当前指标对应数据(C),并计算色温图透明度(D)。 2.2在全国地图中,插入六个单选按钮 单击右键"编辑文字",分别为各单选按钮命名。...2.3为六个单选按钮赋宏 按下ALT+F11键,插入如下代码,其可实现勾选单选按钮时,会根据单选按钮对应指标,为各省份矢量图填色和设置透明度。 右键点击单选按钮,指定宏。...并通过以下代码,将选中省份数据从数据库汇总筛选出来,粘贴到province_data工作表J:N相应位置,用于生成省市色温图和条形图。 B.通过以下代码,生成省市色温图。

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haploview进行连锁不平衡分析

IGR1143a_1 286593 第一为SNP位点ID, 第二为SNP位点在基因组上位置。...导入输入文件 点击Linkage Format菜单,然后选择对应输入文件。...设置好相应阈值之后,点击Rescore Markers按钮,就可以根据阈值过滤了,最后一Rating如果勾选上了,表示该SNP位点符合要求。 ? 3....右键点击格子,可以看到LD分析详细结果。方框数值为D'值,为了美观,这里乘以了100。通过最上方Display按钮,可以调整热图外观。...Tagger Tagger按钮用于挑选tagSNPs, Configuration有两个用途,第一个是筛选SNP位点,通过勾选对应单选框,可以指定想要进行分析SNP位点;第二个用途是指定tagSNPs

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2022-03-11

Shiny reactive用法与案例展示 在Shiny,reactive()是一个函数,用于创建一个响应式变量(reactive variable)。...什么时候会用到 reactive 以下是一个简单 Shiny 应用程序,演示了如何使用 reactive() 函数。该应用程序根据用户输入两个数字,计算它们和并显示结果。...但是,reactiveVal() 作用对象是值而不是表达式Shiny bookdown。 当需要在 Shiny 应用程序创建一个简单响应式变量时,可以使用 reactiveVal() 函数。...当用户点击添加按钮时,observeEvent() 函数会检测到该事件,并将新项目添加到项目列表。最后,renderUI() 函数会根据项目列表,生成一个项目列表 UI 输出。...例如reactiveValues(),在以下 Shiny 应用程序,我们创建了一个 reactiveValues() 对象 data,其中根据数据cut,更改comment里面的数据。

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Python交互式数据分析报告框架:Dash

只因去年下半年时候,用R语言博哥和龙少有Shiny这样框架可以开发交互式整合Web数据分析报告,让我这个成天鼓吹用Python做数据分析的人眼馋不已。...用户点击下拉菜单选择不同值,程序代码就能动态地从谷歌金融导入数据到PandasDataFrame。这个应用仅用了43行代码,简单吧! ?...如果你使用R语言开发,那你还是蛮幸运Shiny仅使用R语言即可开发Web应用,它也是一种响应式程序框架,非常棒!你还可以使用Shiny和PlotlyR语言库创建交互式图形。...Dash和Shiny很像,但是Dash不会成为Shiny复制品,毕竟Python和R之间习语与理念非常不同,所使用语法也不同。 ?...使用R语言Shiny构建交互式Web应用 如果你使用MATLAB,那你一定熟悉MATLAB用户界面“GUIDE”。

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使用GenomeStudio 鉴定差异甲基化位点

Normalization 选择controls 算法, 勾选Subtract background前面的单选框 Content Descriptor 是芯片对应bpm 格式注释文件 Ref Group...Diff methylation 差异甲基化位点结果 ? 差异分析结果,p值时我们最常用过滤手段,这里默认结果并没有给出P值,而是给出了1个DiffScore值。...DiffScore值筛选差异分析结果,如果你以P=0.05作为阈值, 那么DiffScore > 13 或者 DIffScore 0 时是上调...对于下游分析而言,我们肯定想要知道差异探针关联基因是哪些,可以通过 按钮,在默认结果添加更多。...面板右边是一些隐藏,这里分为了Columns 和 SubColumns 两,鼠标选中希望展示,然后单击中间<=Show按钮,然后点击OK就可以了 ?

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如何在矩阵行上显示“其他”【4】看得见与看不见,看上去看不见但还是能看得见,看上去看不见也真的看不见

正文开始 上一篇文章我们已经实现了这个效果: 当年度切片器变换筛选时,子类别显示种类和顺序是不相同,但不变是: ①others永远显示在最后一行 ②显示10个子类别按照sales或sales...2016-2019年,我们可以在不同年份对应子类别上分别加上不同数量空格,这样,在[子类别3]这一,就不会有重复值了,也就是说在对[子类别3]进行“按排序”选择[sales.oneyear.rankx2...比如,年度切片器如果不选或者多选时候,就露馅了,完全不觉明历: 为避免露馅,只能设置为单选: 但这样一来,就没法查看所有年度总数据排名了,略有瑕疵。...所以,作者巧妙地将原列名“隐藏”掉,改用带着文本按钮来显示标题: 这思想着实很厉害了,值得学习。 这就是我说“看得见”与“看不见”——看上去看不见但还是能看得见。...最后放一张图: 根据上面的思路,可以实现动态显示TopN,其他为others。可以选择任意进行排序: 报告链接:https://app.powerbi.cn/view?

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