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婴儿EEG数据的多元模式分析(MVPA):一个实用教程

时间分辨多变量模式分析(MVPA)是一种分析磁和脑电图神经成像数据的流行技术,它量化了神经表征支持相关刺激维度识别的程度和时间过程。随着脑电图在婴儿神经成像中的广泛应用,婴儿脑电图数据的时间分辨MVPA是婴儿认知神经科学中一个特别有前途的工具。最近,MVPA已被应用于常见的婴儿成像方法,如脑电图和fNIRS。在本教程中,我们提供并描述了代码,以实现婴儿脑电图数据的MVPA分析。来自测试数据集的结果表明,在婴儿和成人,这种方法具有较高的准确性。同时,我们对分类方法进行了扩展,包括基于几何和基于精度的表示相似度分析。由于在婴儿研究中,每个参与者贡献的无伪影脑电图数据量低于儿童和成人研究,我们还探索和讨论了不同参与者水平的纳入阈值对这些数据集中产生的MVPA结果的影响。

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R软件基于k-mer 的DNA分子序列比较研究及其应用

科学技术的发展为各个领域都带来了深刻的变革,在生物学领域,随着计算机的应用,生物学与信息学的结合诞生了一门新的融合学科——生物信息学。作为生物信息学的重要研究内容之一,生物序列比较成为当下热点问题。基于k-mer的DNA分子序列比较研究是序列比较的一种,该方法以进化论作为依据,从序列的相似性出发探究同源的可能性。关于相似度的计算,首先将生物序列转化为k-mer的词频向量,然后利用距离公式求得生物序列的距离矩阵作为相似度的量化。基于k-mer的DNA分子序列比较研究在这篇论文中采用以熵权作为权重的加权欧氏距离与欧氏距离两种方法计算相似度。最后,通过相似性分析与系统发育树分析测试两种方法的分类效率,评价方法的应用效果。

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