于是想重复一下，这篇文献的数据来源是GOBO，一个乳腺癌的专属数据库，所以我一开始选择了调用TCGA的数据，但是很可惜这个结果的癌症种类特异性是比较强的，试了几种癌症都没有这么显著的结果，要么就是相反的结果...不过在曾老师的指引之下我顺便探索了一下不同数据来源的生存分析结果会有什么不同。...2015.11.1 TCGA 1.数据获取（RTCGA） RTCGA是一个可以调用TCGA数据并为画生存分析曲线做方便的数据准备的包，不同于常见的生存分析曲线的地方在于，这个包可以把两个基因的表达信息整合到一起...除了本文要用到的clinical数据和rnaseq数据外，这个包还支持一系列TCGA数据的调用，但值得注意的是，只能调用2015年11月1日版本的TCGA数据，这是一个比较大的缺点（见下图）。 ?...可以看到结果并不显著，随后我又看了每个亚型分开的图，其中只有一张比较符合文献，但是也没那么显著： ? 所以文章可能是对数据进行了更多方面的筛选。
一、数据容器元素排序 调用 sorted 函数 , 可以对 数据容器 中的元素进行排序 ; sorted(数据容器变量, [reverse=True]) 上述两个参数 , 第一个 数据容器变量 参数 ,...是必须要写的 , 第二个 布尔类型 参数 是可选的 , 默认情况下参数为 reverse=False ; 默认情况下 , sorted 函数对数据容器中的元素 进行正向排序 , 小元素在前 , 大元素在后...; sorted(数据容器变量) 如果设置了 reverse=True 参数 , 就会将 数据容器 中的元素 进行 反向排序 , 大元素在前 , 小元素在后 ; sorted(数据容器变量, reverse...1、字符大小比较 字符 大小的比较 , 是通过 字符 在 ASCII 码表中的 对应 数字 进行比较的 ; 2、长短一样的字符串大小比较 字符串 之间的比较 是按位 进行比较 , 只要有一位大 ,...""" result = "abc" > "abd" print(result) # False 执行结果 : False 3、长短不一样的字符串大小比较 如果长短不一样的字符串大小进行比较 ,
HDR技术 优点 缺点 Dolby VisionTM - 12-bit colors- Luminance up to 10000 nits (4000 nit...
一、前言 前几天在Python钻石交流群【gyx】问了一个pyecharts图像可视化的问题，一起来看看吧。 这个图怎么不能根据不同数据大小显示不同颜色？...这篇文章主要盘点了一个Python图像可视化的问题，文中针对该问题，给出了具体的解析和代码实现，帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【gyx】提出的问题，感谢【莫生气】给出的思路，感谢【莫生气】等人参与学习交流。...------------------- End ------------------- 往期精彩文章推荐： 分享一个批量转换某个目录下的所有ppt->pdf的Python代码 通过pandas读取列的数据怎么把一列中的负数全部转为正数...Pandas实战——灵活使用pandas基础知识轻松处理不规则数据 Python自动化办公的过程中另存为Excel文件无效？
向量嵌入是通过将输入数据馈送到预先训练的神经网络并获取倒数第二层的输出而生成的。 神经网络具有不同的架构，并在不同的数据集上进行训练，这使每个模型的向量嵌入都是独一无二的。...这就是使用非结构化数据和向量嵌入为何具有挑战性的原因。后面我们将看到，在不同数据集上微调的具有相同基础的模型可以产生不同的向量嵌入。...因此，找到适合您的数据类型的模型非常重要。 如何比较向量嵌入？ 接下来，让我们看看如何比较它们。本节比较了基于 Hugging Face 的 MiniLM 的三种不同的多语言模型。...一旦我们有了数据，我们就获取不同的嵌入，并将两组嵌入存储在像 Milvus 这样的向量数据库中。我们使用第三个模型的嵌入来查询它们进行比较。 我们希望看到搜索结果是否不同，以及搜索结果之间有多远。...向量嵌入比较数据 我们使用句子转换器模型，这意味着我们的数据应该是句子的形式。我建议至少有 50 句话进行比较。示例笔记本包含 51 个。我也建议使用具有某些相似性的数据。
在上一篇文章结尾，我们提到了，与使用SGD（随机梯度下降）和冲量训练的模型相比，L-BFGS方法产生不同误差的解决方法。...所以，有一个问题就是什么样的解决方法泛化能力最强，而且如果它们关注的方向不同，那么对于单个方法它们又是如何做到泛化能力不同的。...在训练数据集上，两种方法的精度都能够达到100%，并且只要训练误差为零就终止训练。...由于我们没有任何面向这种相关性的经验数据，所以我们在权值向量中分析特征的重要性。...接下来，我们将研究模型对未知数据的泛化能力。
问题 在Java中，int类型数据的大小比较可以使用双等号，double类型则不能使用双等号比较大小，那若使用double类型时怎么进行比较呢？...方法 转换为字符串 如果要比较的两个double数据的字符串精度相等，可以将数据转换成string然后借助string的equals方法来间接实现比较两个double数据是否相等。...代码运行结果如下： (2)使用doubleToLongBits()方法 该方法可以将double转换成long型数据，从而可以使double按照long的方法（, ==）判断是否大小和是否相等...代码中的0.0000001指范围（1e-6） 代码运行结果如下： 结语 针对如何在double类型时比较大小的问题，此处我们提供了三种解法，分别为先将它们转换类型变为字符串类型再进行比较，第二种是使用...注意第一种转换为字符串类型的方法只适用于比较精度相同的数据，并且只用于两者是否相等的情况下。
通过数据判断颜色.png ---- ---- itemStyle:{ normal:{.../// 通过params.value拿到对应的data里面的数据 color:function(params){...return "#9BCA63"; } } }， 可以实现根据不同的数据量来展示不同的颜色
，查找慢 HashSet：值去重，不排序 TreeSet：值去重，且排序（默认升序排序） HashMap：键去重，不排序 TreeMap：键去重，且排序（需手动排序） 测试方法： 计算不同数据结构的对象添加...N个数据之后占用的内存大小 测试代码： import java.util.*; public class Main{ public static void main(String[] args)...：1.5532990 Mb TreeSet对象占内存：1.5648727 Mb HashMap对象占内存：1.4536972 Mb TreeMap对象占内存：1.4656143 Mb 测试结论： 内存大小
前面我的学徒的一个推文：不同数据来源的生存分析比较 , 代码细节和原理展现做的非常棒，但是因为学徒的TCGA数据库知识不熟悉，所以被捉到了一个bug，先更正一下： 有留言说：“TCGA里病人01-09是肿瘤...如果想更详细地了解，请参考：https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables 下面以从 UCSC Xena 上下载的数据为例重新做一次生存分析...（其他来源的数据也是一样的做法） 回到我的数据 和上次一样，先读取数据并预处理 rm(list = ls()) options(stringsAsFactors = F) # 下面的两个数据文件均是手动下载的...，select_exp.txt是取了想要的两种基因的数据，因为原数据包含所有基因的表达信息，读进R里非常慢 exp=read.table("select_exp.txt",sep = '\t',header...上次的结果如下： ? 比较之下差别还是很大的，以后要多多注意了。
我一般用MACS2做peak calling，但是不知道效果是不是最好的，去搜了一下，发现14年有一篇文章用DNase-seq的数据比较了主流的几个peak caller的效果。...这篇文章比较了如下四个软件： ?...image 用 ENCODE中的K562, GM12878 和 HelaS3的DNase-seq的数据从以下几方面去比较这几种软件的效果： sensitivity 和 specificity 作者先从ENCODE...中下载了K562, GM12878 和 HelaS3的几十套转录因子结合（TFBS）的narrow peaks的数据，用BEDOPS取了这些的并集作为比较这几种软件的"reference set"。...但是ZINBA_B的TPR和FDR都比较低，所以ZINBA_B与reference set和其他的方法差距较大。 2. 找到的peaks数量和peaks的长度以及coverage ? image ?
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...作为标准的扩展，MySQL还支持整数类型 TINYINT、MEDIUMINT 和 BIGINT。下表显示了每个整数类型所需的存储和范围。....MySQL支持的整数类型的存储和范围 Type类型 Storage (Bytes)占用存储空间 Minimum Value Signed带符号最小值 Minimum Value Unsigned无符号最小值...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请发送邮件至 举报，一经查实，本站将立刻删除。
介绍这块内容的已经很多了，因此这里我打算直接讲一下这几个不同的算法，以及它们的长处及短处。...1.串行回收器 串行回收器是最简单的一个，你都不会考虑使用它，因为它主要是面向单线程环境的（比如说32位的或者Windows）以及比较小的堆。...为了确保这种情况不会发生，你要么就是增加老生代的大小（或者增加整个堆的大小），要么就是给回收器分配一些后台线程以便与对象分配的速度进行赛跑。...Java 8及持久代 Java 8中最大的改变就是持久代的移除，它原本是用来给类元数据，驻留字符串，静态变量来分配空间的。...即便如此，它本身并不会减少开发人员将应用解耦到不同的JVM中的可能性。 每个回收器都有许多不同的开关和选项来进行调优，这可能会增加吞吐量，也可能会减少，这取决于你的应用的具体的行为了。
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。
使用CPM去除文库大小影响 之所以需要normalization，就是因为测序的各个细胞样品的总量不一样，所以测序数据量不一样，就是文库大小不同，这个因素是肯定需要去除。...对于这样的数据，需要重新转换成 reads counts 才能做下游分析。...适用于bulk RNA-seq的normalization方法 比较流行的有： DESeq的size factor (SF) relative log expression(RLE) upperquartile...也可以比较它相当于最粗糙的对数转换，效果好在哪里。...Downsampling 最后要介绍的这个去除文库大小差异的方法是从大的文库样本里面随机抽取部分reads使之文库大小缩减到跟其它文库一致。
“哈哈，我们在训练我们的模型并且希望得到更加准确的结果，但基于实际的情况（比如算力、时间），往往会按照一定策略来选择。...本文介绍了几种常见的数据集划分与交叉验证的方法策略以及它们的优缺点，主要包括了Train-test-split、k-fold cross-validation、Leave One Out Cross-validation...等，包括了代码层的实现与效果的比较，比较适合综合阅读一次。
概述 Bean不同配置方式比较 Bean不同配置方式的使用场景 基于XML配置 基于注解配置 基于Java类配置 基于Groovy的配置 总结 概述 对于Spring来讲，为实现Bean的信息定义，提供了基于...Bean不同配置方式比较 类别 基于XML配置 基于注解配置 基于Java类配置 基于Groovy DSL配置 Bean定义 在XML文件中通过元素定义Bean，如： 在Bean实现类处通过标注@Component...true) 通过在Bean方法定义处标注@Lazy指定 通过bean->bean.lazyInit-true指定 ---- Bean不同配置方式的使用场景 基于XML配置 1）Bean实现类来源于第三方类库...所以如果实例化Bean的逻辑比较复杂，则比较适合用基于Java类配置的方式 ---- 基于Groovy的配置 基于Groovy DSL配置优势在于可以通过Groovy脚本灵活控制Bean初始化的过程，...如果bean的逻辑较为复杂，则比较适合使用Groovy DSL配置的方式。
CompareTo() 调用CompareTo(Date anotherDate)方法,API如下： public int compareTo(Date anotherDate) 参数：anotherDate—要比较的...// TODO Auto-generated catch block e.printStackTrace(); } 大于 方法二:getTime() 通过getTime()方法的毫秒值判断...public long getTime() 说明：返回自1970年1月1日以来，由 Date对象表示的00:00:00 GMT的毫秒 数 。
麻烦您用任何熟悉的编程语言实现function versionCompare(v1, v2)（版本号比较）函数及测试用例。...对任意软件的版本号进行大小比较，输入参数为两个版本号（格式情况请自行考虑），目标是做成库给外部开发者用。不得使用现成的版本比较函数。重点考察各类情况处理。写好后截图给我们就行。...简单理解后，是让写一个版本比较的函数。...于是乎迅速码code，便写成了这样的功能 // 方法调用 - (void)versionCompareFirst:(NSString *)first andVersionSecond: (NSString...else if (result == -1) { NSLog(@"V1 < V2"); } else if (result ==0 ) { NSLog(@"V1 = V2"); } } // 比较版本号
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