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13 个非常有用的 Python 代码片段,建议收藏!

今天我们主要来介绍应用程序当中的通用 Python 代码片段,一起进步吧 Lists Snippets 我们先从最常用的数据结构列表开始 №1:将两个列表合并成一个字典 假设我们在 Python 中有两个列表...这是在用 Python 编写代码时经常遇到的一个非常常见的问题 但是为了解决这个问题,我们需要考虑几个限制,比如两个列表的大小,两个列表中元素的类型,以及其中是否有重复的元素,尤其是我们将使用的元素作为...= None): #missing_val will be used when one of the smaller lists is shorter tham the others....中有多种方法可以格式化字符串,使用 f 字符串是比较好的选择 #Formatting strings with f string. str_val = 'books' num_val = 15 print...str2 = "" def str_size(s): return len(s.encode('utf-8')) str_size(str1) str_size(str2) Input/ Output

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独家 | Python 3.10发布——你应该知道的五大新特性

print(my_list) 在以前的版本——Python3.9和更早的版本中,你会看到如下的报错—— File "my_precious.py", line 3 print(my_list)...这里还有我尝试的另一个例子,看看错误信息是否足够清晰—— # missing_comma.py dc_characters = { 1: "Superman" # Comma missing...现在让我们看看这里到底发生了什么变化—— # Before Python 3.10 Release from typing import Union def f(list: List[Union[int...Output: [(Tom, 21024), (Harry, 75978), (Jessica, 92176), (Robert, 75192), (Kevin, 34323)] 让我们再次使用上面显示的这两个序列的名称和编号...如果你的数据集比较大,这类错误就很难发现。而且,即使你意识到有问题,也不一定容易解决。 假设被压缩的序列具有相同的长度,就可以帮助你避免这种差异的发生。

2.9K20

群体遗传系列之:一文了解和使用Treemix来研究群体之间的基因流

其基本原理可以分为三个要点: 根据基因频率,算出每对群体之间的协方差 根据基因型频率数据,构建最大似然树,利用两个种群在进化树上的关系,计算出协方差的估计值 根据实际值与估计值之间的差的大小,判断两个种群之间是否发生基因流...,如果实际值小于估计值,则说明我们构建出来的树夸大了种群之间的差异,则说明种群之间有基因交流,因为基因流会减少种群之间的差异 Treemix安装比较简单,直接下载编辑就能安装: wget https:/...50 10 0.2 --out tmp.ld --allow-extra-chr --set-missing-var-ids @:# --keep-allele-order ~/biosoft/plink...out input --allow-extra-chr --set-missing-var-ids @:# --keep-allele-order 压缩频率文件,使用treemix里面的脚本,将freq...频率文件转成treemix的输入文件: gzip input.frq.strat python2.7 plink2treemix.py input.frq.strat.gz input_treemix.frq.gz

7.3K40

跟着Nature Genetics学GWAS分析:emmax软件gwas分析qqman包展示结果

1001genomes_snp-short-indel_only_ACGTN.vcf.gz --remove-indels --recode --recode-INFO-all --min-alleles 2 --max-alleles 2 --max-missing...--recode 12 --output-missing-genotype 0 --transpose --out at_snp ~/biotools/emmax/emmax-kin-intel64...at_snp.map | paste - at_snp.ps | awk '{print $2,$1,$4,$8}' | sed '1i\SNP CHR BP P' | sed 's/ /\t/g' > gwas.output...Rscript manhattan_qq.R gwas.output gwas.png 5 manhattan_qq.R 这个脚本是论文中提供的 最后5是显著性的阈值,是自己随便写的, 整个代码能够跑通...image.png 推文记录的是自己的学习笔记,内容可能会存在错误,请大家批判着看,欢迎大家指出其中的错误 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python

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