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不同数据来源生存分析比较

于是想重复一下,这篇文献数据来源是GOBO,一个乳腺癌专属数据库,所以我一开始选择了调用TCGA数据,但是很可惜这个结果癌症种类特异性是比较,试了几种癌症都没有这么显著结果,要么就是相反结果...不过在曾老师指引之下我顺便探索了一下不同数据来源生存分析结果会有什么不同。...2015.11.1 TCGA 1.数据获取(RTCGA) RTCGA是一个可以调用TCGA数据并为画生存分析曲线做方便数据准备包,不同于常见生存分析曲线地方在于,这个包可以把两个基因表达信息整合到一起...除了本文要用到clinical数据和rnaseq数据外,这个包还支持一系列TCGA数据调用,但值得注意是,只能调用2015年11月1日版本TCGA数据,这是一个比较缺点(见下图)。 ?...参考来自原作者教程:https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues/97 2.包安装 首先需要两个数据包:RTCGA.clinical和RTCGA.rnaseq. 3.数据预处理

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ABAP 取两个内表交集 比较两个内表不同

SAP自带函数: CTVB_COMPARE_TABLES和BKK_COMPARE_TABLES; 似乎可以比较两个内表,得出第二个内表不同于第一个内表部分...因为,我在测试数据时,发现这两个函数效果不那么简单。 如果上述函数确实可以,提取两个内表不同部分,则我可以据此做两次比较,得到两个内表交集。...所以,我先用另外一种方式解决了-自己写了一个提取两个内表交集函数,供大家检阅: *" IMPORTING *" VALUE(ITAB1) TYPE INDEX TABLE...以下转自华亭博客:感谢华亭分享: 函数模块:CTVB_COMPARE_TABLES 这个函数模块比较两个内表,将被删除、增加和修改内表行分别分组输出。...IF_SORTED:排序标记,如果已排序,在比较时可以提高效率。

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.NET 使用 JustAssembly 比较两个不同版本程序集 API 变化

另外,准备为一个产品级项目更新某个依赖库,但不知道更新此库对我们影响有多大,希望知道目前版本和希望更新版本之间 API 差异。...索性发现了 JustAssembly 可以帮助我们分析程序集 API 变化。本文将介绍如何使用 JustAssembly 来分析不同版本程序集 API 变化。...开始比较 启动 JustAssembly,在一开始丑陋(逃)界面中选择旧和新 dll 文件,然后点击 Load。 然后,你就能看到新版本 API 相比于旧版本差异了。...关于比较结果说明 在差异界面中,差异有以下几种显示: 没有差异 以白色底显示 新增 以绿色底辅以 + 符号显示 删除 以醒目的红色底辅以 - 符号显示 有部分差异 以蓝紫色底辅以 ~ 符号显示 这里可能需要说明一下...对于每一个差异,双击可以去看差异代码详情。 上图我 SourceFusion 项目在版本更新时候只有新增 API,没有修改和删除 API,所以还是一个比较健康 API 更新。

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报错:“来自数据String类型给定不能转换为指定目标类型nvarchar。”「建议收藏」

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 解决sql server批量插入时出现“来自数据String类型给定不能转换为指定目标类型nvarchar。”...问题 问题原因:源一个字段长度超过了目标数据库字段最大长度 解决方法:扩大目标数据库对应字段长度 一般原因是源字段会用空字符串填充,导致字符串长度很大,可以使用rtrim去除 解决sql server...批量插入时出现“来自数据String类型给定不能转换为指定目标类型smallint。”...问题 问题原因:源一个字段类型为char(1),其中有些为空字符串,导数据时不能自动转换成smallint类型 解决方法:将char类型强转为smallint类型之后再导入数据

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【优雅避坑】不要轻易使用==比较两个Integer

自动装箱与自动拆箱 自动装箱(auto boxing)和自动拆箱(auto unboxing)是Java 5引入功能,有了这两个功能,Java在编译阶段,会根据上下文对数据类型自动进行转换,可以保证不同写法在运行时等价...比较两个Integer 看代码: @Test public void test() { Integer i1 = 66; Integer i2 = 66; System.out.println...避坑 那么怎么正确比较两个Integer呢?用equals()! ? equals: /** * 将此对象与指定对象进行比较。...Integer) { return value == ((Integer)obj).intValue(); } return false; } 哈哈,equals方法比较两个对象整型...这也就是阿里Java开发手册上说强制使用equals方法比较整型包装类对象: ? ? END ? 推荐阅读 【优雅避坑】从验证码生成代码优化到JVM栈和堆 Java最强大技术之一:反射

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对“不同数据来源生存分析比较补充说明

前面我学徒一个推文:不同数据来源生存分析比较 , 代码细节和原理展现做非常棒,但是因为学徒TCGA数据库知识不熟悉,所以被捉到了一个bug,先更正一下: 有留言说:“TCGA里病人01-09是肿瘤...(其他来源数据也是一样做法) 回到我数据 和上次一样,先读取数据并预处理 rm(list = ls()) options(stringsAsFactors = F) # 下面的两个数据文件均是手动下载...,select_exp.txt是取了想要两种基因数据,因为原数据包含所有基因表达信息,读进R里非常慢 exp=read.table("select_exp.txt",sep = '\t',header...TCGA-BRCA.survival.tsv",sep = '\t',header = T) sul=data.frame(patient=sul$sample,OS=sul$OS,OS.time=sul$OS.time) # 融合两个数据...上次结果如下: ? 比较之下差别还是很大,以后要多多注意了。

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Android不同应用之间数据

前言 不同应用之间可以使用以下几种方式: Intent传:使用隐式Intent,但需要确保接收方应用可以响应该Intent。...一个应用可以将数据暴露给其他应用,并提供读写权限,其他应用可以通过ContentResolver访问这些数据。 文件共享:两个应用之间可以通过文件共享方式传递数据。...怎样选择: 假如A是数据提供方,B是数据接收方, 如果B一定是A唤起并且传可以使用Intent传方式 如果B也能自己打开,还要获取A,就使用Content Provider方式。...Intent传 使用Intent在不同应用之间传递数据,可以通过IntentputExtra()方法添加数据,并通过startActivity()或startActivityForResult()...文件共享:两个应用之间可以通过文件共享方式传递数据

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Momentdiff方法两个日期正反比较大小竟然不同?看完算法原理,原来是我天真了

问题 大家好,我是数据里奥斯,今天有一段业务逻辑需要判断选择时间范围不能超过3个月,这种常规比较用moment.jsdiff方法不是手到擒来么?...Return P1M30D 看完这一段,我豁然开朗,拿我们今天遇到实际case,我讲一下他解释这段原理到底是怎么实现: diff算法是先加或者减每个整月一直到不能减,然后再看剩下天数和当月比较百分比...结论 所以,moment.jsdiff方法在比较以天/月份/年份这样特殊粒度单位时,都会优先按照整粒度扣除,剩下小数部分,是根据子一级粒度取当年/月/日为参照按比值算出,这才有了这种A比B和...B比A竟然不一样情况。...虽说一般来讲这个多一点少一点不会有影响,毕竟我们是按找自己规定粒度来比较,但是这种原理能整明白,也不失为一种“学到了”收获,嘿嘿 我是数据里奥斯~

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php 比较获取两个数组相同和不同元素例子(交集和差集)

1、获取数组相同元素 array_intersect()该函数比较两个(或更多个)数组键值,并返回交集数组,该数组包括了所有在被比较数组(array1)中, 同时也在任何其他参数数组(array2...(或更多个)数组键名和键值,并返回交集,与 array_intersect() 函数 不同是,本函数除了比较键值, 还比较键名。...> // Array ( [a] => red [b] => green [c] => blue/ / ) 2、获取数组中不同元素 array_diff() 函数返回两个数组差集数组。...> // Array ( [d] => yellow ) array_diff_assoc() 函数用于比较两个(或更多个)数组键名和键值 ,并返回差集。 <?..."blue"); $result=array_diff_assoc($a1,$a2); print_r($result); // Array ( [d] => yellow )/ / 以上这篇php 比较获取两个数组相同和不同元素例子

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php 比较获取两个数组相同和不同元素例子(交集和差集)

1、获取数组相同元素 array_intersect()该函数比较两个(或更多个)数组键值,并返回交集数组,该数组包括了所有在被比较数组(array1)中, 同时也在任何其他参数数组(array2...(或更多个)数组键名和键值,并返回交集,与 array_intersect() 函数 不同是,本函数除了比较键值, 还比较键名。...// Array ( [a] = red [b] = green [c] = blue ) 2、获取数组中不同元素 array_diff() 函数返回两个数组差集数组。...// Array ( [d] = yellow ) array_diff_assoc() 函数用于比较两个(或更多个)数组键名和键值 ,并返回差集。 <?..."blue"); $result=array_diff_assoc($a1,$a2); print_r($result); // Array ( [d] = yellow ) 以上这篇php 比较获取两个数组相同和不同元素例子

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比较不同对单细胞转录组数据聚类方法

通过对表达矩阵聚类,可以把细胞群体分成不同状态,解释为什么会有不同群体。不过从计算角度来说,聚类还是蛮复杂,各个细胞并没有预先标记好,而且也没办法事先知道可以聚多少类。...尤其是在单细胞转录组数据里面有很高噪音,基因非常多,意味着维度很高。 对这样高维数据,需要首先进行降维,可以选择PCA或者t-SNE方法。...这里主要比较6个常见单细胞转录组数据聚类包: SINCERA pcaReduce SC3 tSNE + k-means SEURAT SNN-Cliq 所以需要安装并且加载一些包,安装代码如下; install.packages...这里选取数据,加载了这个scater包SCESet对象,包含着一个23730 features, 301 samples 表达矩阵。...对象基因信息增加了5比较重要是sc3_gene_filter信息,决定着该基因是否拿去聚类,因为基因太多了,需要挑选 table(fData(pollen)$sc3_gene_filter) #

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【Python】基于某些删除数据框中重复

subset:用来指定特定,根据指定数据框去重。默认为None,即DataFrame中一行元素全部相同时才去除。...导入数据处理库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多组合删除数据框中重复') #把路径改为数据存放路径 name = pd.read_csv('name.csv...从结果知,参数为默认时,是在原数据copy上删除数据,保留重复数据第一条并返回新数据框。 感兴趣可以打印name数据框,删重操作不影响name。...结果和按照某一去重(参数为默认)是一样。 如果想保留原始数据框直接用默认即可,如果想直接在原始数据框删重可设置参数inplace=True。...但是对于两中元素顺序相反数据框去重,drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型数据去重问题,参见本公众号中文章【Python】基于多组合删除数据框中重复。 -end-

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