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处理医学时间序列缺失数据3种方法

在这些医学图表趋势、模式、高峰和低谷嵌入了大量有价值信息。医疗行业要求对医疗时间序列数据进行有效分析,这被认为是提高医疗质量、优化资源利用率、降低整体医疗成本关键。...在这篇文章,我们将回顾 3 种简单方法来处理与 RNN 一起使用时间序列研究缺失医学数据。后一种方法都是建立在前一种方法基础上,具有更高复杂性。因此强烈建议按照它们出现顺序阅读。...阴影部分是缺失数据,我们应用前向插补来填充它们最近观测值。...下图是衰减因子得计算公式 在任意给定时间步t,如果x被观测到,我们使用x。否则,我们使用t′最后一次观测值,衰减为x均值。RNN最终输入见公式4。...总结 在这篇文章,我们介绍了医学时间序列数据研究背景,并提出了3种专为rnn设计得缺失数据填补得简单方法,这三种方法都可以产生更好结果,如果你有兴趣可以在实际应用实验以下。

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处理医学时间序列缺失数据3种方法

在这些医学图表趋势、模式、高峰和低谷嵌入了大量有价值信息。医疗行业要求对医疗时间序列数据进行有效分析,这被认为是提高医疗质量、优化资源利用率、降低整体医疗成本关键。...在这篇文章,我们将回顾 3 种简单方法来处理与 RNN 一起使用时间序列研究缺失医学数据。后一种方法都是建立在前一种方法基础上,具有更高复杂性。因此强烈建议按照它们出现顺序阅读。...阴影部分是缺失数据,我们应用前向插补来填充它们最近观测值。...下图是衰减因子计算公式: 在任意给定时间步长t,如果x被观测到,我们使用x。否则,我们使用t′最后一次观测值,衰减为x均值。RNN最终输入见公式4。...总结 在这篇文章,我们介绍了医学时间序列数据研究背景,并提出了3种专为rnn设计缺失数据填补简单方法,这三种方法都可以产生更好结果,如果你有兴趣可以在实际应用实验一下。

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超全 100 个 Pandas 函数汇总,建议收藏

来源丨吊车尾学院 今天给大家整理了100个Pandas常用函数,可以放在手头当字典那种。 分别分为6类:统计汇总函数、数据清洗函数、数据筛选、绘图与元素级运算函数、时间序列函数和其他函数。...() 判断序列元素是否为缺失(返回与序列长度一样bool值) notnull() 判断序列元素是否不为缺失(返回与序列长度一样bool值) dropna() 删除缺失值 fillna() 缺失填充...ffill() 前向后填充缺失值(使用缺失前一个元素填充) bfill() 后向填充缺失值(使用缺失后一个元素填充) dtypes() 检查数据类型 astype() 类型强制转换 pd.to_datetime...转日期时间型 factorize() 因子化转换 sample() 抽样 where() 基于条件判断值替换 replace() 按值替换(不可使用正则) str.replace() 按值替换(可使用正则...() 判断日期是否为当年第一天 dt.is_year_end() 判断日期是否为当年最后一天 dt.is_leap_year() 判断日期是否为闰年 其它函数 函数 含义 append() 序列元素追加

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超全整理100个 Pandas 函数,建议收藏!

今天给大家整理了100个Pandas常用函数。 分别分为6类:统计汇总函数、数据清洗函数、数据筛选、绘图与元素级运算函数、时间序列函数和其他函数。...() 判断序列元素是否为缺失(返回与序列长度一样bool值) notnull() 判断序列元素是否不为缺失(返回与序列长度一样bool值) dropna() 删除缺失值 fillna() 缺失填充...ffill() 前向后填充缺失值(使用缺失前一个元素填充) bfill() 后向填充缺失值(使用缺失后一个元素填充) dtypes() 检查数据类型 astype() 类型强制转换 pd.to_datetime...转日期时间型 factorize() 因子化转换 sample() 抽样 where() 基于条件判断值替换 replace() 按值替换(不可使用正则) str.replace() 按值替换(可使用正则...() 判断日期是否为当年第一天 dt.is_year_end() 判断日期是否为当年最后一天 dt.is_leap_year() 判断日期是否为闰年 其它函数 函数 含义 append() 序列元素追加

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7步搞定数据清洗-Python数据清洗指南

也可以用这两条来看: #1.1查看一列数据类型 DataDF.dtypes #1.2有多少行,多少列 DataDF.shape # 2.检查缺失数据 # 如果你要检查缺失数据数量,使用下列代码是最快方法...python缺失值有3种: 1)Python内置None值 2)在pandas,将缺失值表示为NA,表示不可用not available。...1、去除缺失值 # 再一次提醒检查缺失数据 DataDF.isnull().sum().sort_values(ascending=False) 去除缺失知识点: DataFrame.dropna...)填充缺失值 2) 以同一指标的计算结果(均值、中位数、众数等)填充缺失值 3) 用相邻值填充缺失值 4) 以不同指标的计算结果填充缺失值 去除缺失知识点: DataFrame.fillna https...DataDF.UnitPrice = DataDF.UnitPrice.fillna(DataDF.UnitPrice.mean()) 3)除此,还有一种常见方法,就是用相邻值进行填充, 这在时间序列分析相当常见

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Pandas中级教程——时间序列数据处理

在实际项目中,对时间序列数据处理涉及到各种操作,包括日期解析、重采样、滑动窗口等。本篇博客将深入介绍 Pandas 时间序列数据处理技术,通过实例演示如何灵活应用这些功能。 1....日期解析 在处理时间序列数据时,首先需要将日期解析为 Pandas datetime 类型: # 读取包含日期数据集 df = pd.read_csv('your_data.csv', parse_dates...设置日期索引 将日期列设置为 DataFrame 索引,以便更方便地进行时间序列分析: # 将日期列设置为索引 df.set_index('date_column', inplace=True) 5....处理缺失日期时间序列数据,有时会存在缺失日期。可以使用 asfreq 方法填充缺失日期: # 填充缺失日期 df = df.asfreq('D', fill_value=0) 12....总结 通过学习以上 Pandas 时间序列数据处理技术,你可以更好地处理时间相关数据,从而进行更精确分析和预测。这些功能对于金融分析、气象分析、销售预测等领域都非常有用。

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疑车无据:大熊猫何时交配才能怀上宝宝?四川学者用音频AI给出预测

研究表明,大熊猫成为濒危物种主要是因为繁殖艰难,而繁殖难问题主要源于「性冷淡」。 熊猫繁殖季节时间非常短,一年 365 天,最佳交配时间仅有 1 天。...给定一段原始音频序列,作者首先对其进行了预处理:裁剪出大熊猫叫声,然后根据一个预先设定最大值对其进行了归一化处理,并将一段序列长度设定为 2 秒,并且每秒提取出 43 个声学特征。...然后,基于一个预先设定最大值,对音频幅度进行归一化,并将一段音频长度规范为 2 秒——裁切长音频序列或通过复制部分短音频来填充短音频序列。...最后,在经过归一化音频段(2 秒) 86 帧一帧上提取其梅尔频率倒谱系数(MFCC),并将其用作深度网络输入。...门控循环单元(GRU)是循环神经网络一种门控机制,其在 2014 年由 Cho 等人引入。多层式双向 GRU 在帮助 CGANet 学习更深度时间信息方面发挥着关键性作用。

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Pandas入门2

apply方法是对DataFram一行或者一列进行映射。 ?...applymap方法是对DataFram一格进行映射,如下图所示: ?...image.png notnull方法为isnull方法结果取反 fillna方法可以填充缺失值。 dropna方法可以根据行列是否有空值进行删除。...Pandas时间序列 不管在哪个领域中(如金融学、经济学、生态学、神经科学、物理学等),时间序列数据都是一种重要结构化数据形式。在多个时间点观察或者测量到任何事物都是可以形成一段时间序列。...image.png 7.3 Pandas时间序列 pandas通常是用于处理成组日期,不管这个日期是DataFrame轴索引还是列。to_datetime方法可以解析多种不同日期表示形式。

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Pandas 2.2 中文官方教程和指南(七)

涵盖了 NumPy 和 pandas 基本操作,4 种主要数据操作方法(包括索引、分组、重塑和连接)以及 4 种主要数据类型(包括缺失数据、字符串数据、分类数据和时间序列数据)。...Numba 加速例程 其他有用功能 示例 窗口操作 概览 滚动窗口 加权窗口 扩展窗口 指数加权窗口 时间序列/日期功能 概览 时间戳...分组 时间序列 合并 绘图 数据输入/输出 计算 时间增量 创建示例数据 常量序列 如何阅读这些指南 在这些指南中,您将看到代码块输入代码...加速例程 其他有用功能 示例 窗口操作 概述 滚动窗口 加权窗口 扩展窗口 指数加权窗口 时间序列/日期功能 概述 时间戳 vs....时间跨度 转换为时间戳 生成时间戳范围 时间戳限制 索引 时间/日期组件 DateOffset 对象 与时间序列相关实例方法 重新取样 时间跨度表示

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一行代码对日期插值

问 题引入 对日期进行插值是一项非常常见任务。很多时候我们手头时间序列都是不完整,当中总会因为这样那样原因漏了几天观测,例如股票停牌了,观测仪器坏了,值班工人生病了等等。...在分析时,我们为了获得完整时间序列就需要“插入”那些丢失日期。 举一个例子: ? 这个数据集中有5行观测,2组分类(id等于1和2)。...我们看到每个id对应date都是有缺失,例如从2001-01-09直接跳到了2001-01-12,当中少了10号和11号。 如何只用一行代码就高效优美地把这些缺失日期补上呢?...我们看到CJ数据集中,每个id所对应时间都被填充完整了。 (在建立CJ数据集过程,我们使用了seq函数来建立完整时间序列) 接下来,我们把CJ数据集merge回原来数据集dt。...例如,在我们样例数据集sample,id=1观测对应日期最小值为01-08,最大值为01-14,而我们希望填充这两个日期“之间”所有值。

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OpenTSDB翻译-降采样

这将为我们提供每个序列三个数据点: 正如你所看到,对于每一个时间序列,我们会生成标准化间隔边界(30秒),这样我们就必须在时间戳t0,t0+30s和t0+60s合并序列值。...只要降采样桶为空,填充策略就会简单地发出预定义值。   可用策略包括: None(none) –默认行为,在序列化过程不会发出缺失值,并在聚合序列时执行线性插值(或其他指定插值)。...NaN(nan) –当序列中所有值都缺失时,在序列化输出中发出NaN 。当值缺失时跳过聚合序列,而不是将整个组计算转换为NaN组。...在这个例子,我们10秒钟报告一次数据,并且我们希望通过10秒降采样并通过NaN填充缺失值来执行10秒报告查询 - 时间策略10s-sum-nan: 如果我们在没有填充策略情况下要求输出,则在...另外,B序列在t0+30s和t0+50s值将被线性插值,以填充要与序列A相加

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精选100个Pandas函数

assign() 字段衍生 b bfill() # 后向填充;使用缺失值后一个填充缺失值 between() 区间判断 c count() # 计数(不包含缺失值) cov() 计算协方差...diff() 一阶差分 dt.date() 提取日期 dt.time() 提取时间 dt.year() 提取年份 dt.month() 提取年份 dt.day() 提取天/日 dt.hour...dt.is_year_end() 是否为当年最后一天 dt.is_leap_year() # 判断是否为闰年 e explode() # 爆炸函数 f fillna() 填充缺失值 ffill...() 判断元素是否存在缺失值;返回是True或者False i isnull() # 判断序列元素是否为缺失值,返回bool值 isin() 成员判断 iloc() # 定位数据;只能使用数值...n个值 nlargest() 最大前n个值 p pct_change 运算比率;后一个和前一个比例 pd.to_datetime() 转日期时间类型 pd.Series() # 创建Series

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数据科学和人工智能技术笔记 六、日期时间预处理

六、日期时间预处理 作者:Chris Albon 译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 把日期时间拆成多个特征 # 加载库 import pandas as pd # 创建数据帧...day hour minute 0 2001-01-07 2001 1 7 0 0 1 2001-01-14 2001 1 14 0 0 2 2001-01-21 2001 1 21 0 0 计算日期时间之间差...代码 描述 示例 %Y 整年 2001 %m 零填充月份 04 %d 零填充日期 09 %I 零填充小时(12 小时) 02 %p AM 或 PM AM %M 零填充分钟 05 %S 零填充秒钟...' # 查看星期 dates.dt.weekday_name ''' 0 Thursday 1 Sunday 2 Tuesday dtype: object ''' 处理时间序列缺失值...# 设置索引 df = df.set_index(df['date']) # 选择两个日期时间之间观测 df.loc['2002-1-1 01:00:00':'2002-1-1 04:00:00']

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饭店流量指标预测

因为客流数据受店铺本身、店铺特性、位置、天气、节假日多种因素影响,如果结合时间序列加法或乘法模型来做预测,那么特征工程变得得更加巨大。...同时也手动删除了9个大区以外天气文件,剩下323个可用文件。部分天气特征缺失值用前一天数值来填充。...在这323个可以天气数据,结合提取出来大区和城市特征,发现有34个城市,称一类地方,可以直接用对应城市天气数据合并到训练数据后面;有7个城市,称为二类地方,缺失列比较多,要用大区天气数据填充二类地方缺失数据...部分天气特征缺失值用前一天数值来填充。这两类地方保存成19个以大区名_城市名.csv为名文件。 有62个城市是没对就城市天气数据,所以用大区天气数据填充。...用前值,用0,还是用均值填充,应当以经特征反遇实际情况来处理。 从特征重要性图和不要重要特征图可以看出,除了时间序列客流特征外,天气特征很多在前面,加上天气类特征还是有作用

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电商用户复购实战:图解 pandas 移动函数 shift

axis=0表示index,横轴;axis=1表示columns,纵轴 fill_value:表示当我们数据发生了移动之后,产生缺失值用什么数据填充。...如果是数值型缺失值,用np.nan;如果是时间类型缺失值,用NaT(not a time) 模拟数据 模拟了两份数据,其中一份和时间相关。...: 参数fill_value 移动之后缺失填充数据 参数freq 表示移动频率,专门用于时间序列移动 频率 时间序列变化频率有间隔相同,也有不同。...许多字符串别名被赋予有用普通时间序列频率。我们将这些别名称为偏移别名。...每个用户一次购买时间是不存在上次购买时间,所以显示为NaT 8、将NaT数据删除 使用dropna函数来删除缺失数据 df6 = df5.dropna().reset_index(drop=True

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独家 | 手把手教你处理数据缺失

分配新值 上一个或下一个值:(仅用于完全随机缺失(MCAR)时间序列)只要你在处理时间序列问题,你就可以使用最后或下一个值填充缺失值。...众数值:(仅用于完全随机缺失(MCAR))通过选择最常见值,可以确定大部分时间你正确填充空值。但是要小心多众数分布,因为对于此,使用众数就不再是一个可行方案。...线性插值法:(仅用于完全随机缺失(MCAR)下时间序列)在具有趋势和几乎没有季节性问题时间序列,我们可以用缺失值前后值进行线性插值来估算出缺失值。 ?...样条插值法:(仅用于完全随机缺失(MCAR)下时间序列)这个方法和线性插值法相似,但是因为样条插值法使用高阶多项式特征从而得到了更平滑插值。重申,这个方法不适用于季节性数据。...具有季节性调整线性/样条插值法:(只适用于完全随机缺失(MCAR)情况下时间序列)这个方法和线性、样条插值法原理一致,但是对于季节性进行了调整。

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利用VAE和LSTM生成时间序列

更准确地说,我们尝试使用一种变分自动编码器结构来填充一些时间序列序列,这些序列特征是在真实场景存在缺失数据。...给定有意义数据选定时间间隔,我们强制在数据流引入一些缺失时间间隔(具有固定长度和比例)。缺失序列形成了我们变分自动编码器主要输入,该编码器被训练来接近真实序列而不缺失片段。...在处理原始交通信号缺失值时,我们小心地用一个特殊整数(假设0)替换相应类别,以正确编码“缺失信息”状态(这不适用于月、工作日、小时,它们总是已知每个日期)。 编码器由一个LSTM单元组成。...我们还可以仅对要重建缺失部分计算特定统计信息。通过在数据集最后一部分上进行简单时间拆分即可获得测试集。这部分大致由与整个数据集中相同比例缺失序列组成。 ?...还需要注意是,样本生成优劣与整个VAE重构能力严格相关。 ? 潜在空间作为某些分类变量函数 ? 时间序列增广 总结 在本文中,我们介绍了变分自动编码器在时间序列分析应用。

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Pandas三百题

().sum() 9-计算缺失值|分列 具体列有多少缺失值 df.isnull().sum() 10-查看缺失值 查看全部缺失值所在行 df[df.isnull().T.any()==True] 11...df.dropna(how='any') 13-缺失值补全|整体填充 将全部缺失值替换为* df.fillna('*') 14-缺失值补全|向上填充 将评分列缺失值,替换为上一个电影评分 df['评分...()) 17-缺失值补全|匹配填充 现在填充 “语言” 列缺失值,要求根据 “国家/地区” 列值进行填充 例如 《海上钢琴师》国家/地区为 意大利,根据其他意大利国家对应语言来看,应填充为 意大利语...8-1pandas时间操作 1-时间生成|当前时间 使用pandas获取当前时间 pd.Timestamp('now') Timestamp('2021-12-15 11:32:16.625393...D').last() 28 - 日期重采样|低频 -> 高频 将 df2 5分钟 数据改为 3分钟,缺失数据向前填充 df_3min = df2.set_index('时间').resample('

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