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  • 关键基因和hub基因(生物网络角度)

    写在前面这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累,主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hub基因就是关键基因,甚至有人认为差异表达基因就是关键基因。并且hub基因的筛选有很大的人为因素,到底是取前5%还是10%没有具体要求,一般建议5%。也就是说这是一个很宽松的设定。 关键基因,有人从hub里挑靠前的,有人从差异表达基因里挑p值大的。到怎么才算关键基因?笼统来说,假如你这个基因被敲减,表型显著消失,那肯定是关键基因。但仅从生物信息分析角度怎么挑?不管是生物还是非生物,只要是无尺度网络,都对随机的node移除有抵抗能力,但是对hubs的移除非常敏感。我们提出,date hubs在整个蛋白组网络中生物模块的总体组织中是必须的,参与的是大范围的整合连接(虽然一些date hub可以简单的共享,并且调节模块内或跨模块的局部功能)。
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  • 声纹识别

    声纹识别(VPR)作为生物识别的一种,是根据说话人的声波特性进行身份辨识的服务。身份辨识与口音无关,与语言无关,可以用于说话人辨认和说话人确认,广泛应用于金融安全、智能家居、智慧建筑等领域。
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  • 消息队列 Pulsar 版

    Pulsar 版(TDMQ Pulsar版)是一款基于 Apache Pulsar 自研的消息中间件,具备极好的云原生和 Serverless 特性,兼容 Pulsar 的各个组件与概念,具备计算存储分离
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  • 消息队列 RabbitMQ 版

    消息队列 RabbitMQ 版(TDMQ RabbitMQ 版)是一款腾讯自主研发的消息队列服务,支持AMQP 0-9-1 协议,完全兼容开源 RabbitMQ 的各个组件与概念,同时具备计算存储分离,
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    (TDMQ RocketMQ 版)是一款腾讯自主研发的消息队列服务,兼容Apache RocketMQ 的各个组件与概念,支持RocketMQ 4.6.1及以上版本的客户端零改造接入,同时具备计算存储分离
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  • 用IT加速 BT,腾讯云发布生物基因解决方案

    近年来,随着生命科学行业的不断发展,生物基因领域数据爆炸式地迅速增长,如何快速传递、安全存储、高效计算这些数据,是基因企业、科研工作者面临的新挑战。10月23日,在第4届全国功能基因组学高峰论坛上,腾讯云与百迈客生物科技宣布达成战略合作,并正式发布生物基因解决方案,开放腾讯云计算、存储、人工智能等各项IT能力,助力生物基因行业发展。腾讯云深度定制云商务总经理付雪冬 腾讯云携手百迈客,共谋基因科技服务2.0时代 会上,腾讯云与百迈客生物科技达成战略合作。双方将在基因科技服务、基因云计算等多个领域开展深度合作,共谋基因科技服务2.0时代。腾讯云开放IT能力,助力BT行业发展 腾讯云将全面开放各项IT能力,在传输、存储、计算、管理和洞察等5个方面,助力生物基因行业全面快速发展。 基因数据量的暴增带来的是传输的难题。
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  • 人体分析

    人像分割可识别视频、图片中的半身人体轮廓,并将其与背景分离;人体检测,可识别行人的穿着、体态、发型等信息;行人重识别(Reid)可实现跨摄像头跨场景下行人的识别与检索。
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  • 云数据库 Redis

    产品概述,应用场景,使用常见问题,地域和可用区,产品优势,产品定价,CKV 版(标准架构),CKV 版(集群架构),产品性能,内存版(集群架构),连接登录问题,购买相关问题,开关读写分离,简介,API配置告警,服务等级协议,词汇表,旧集群版迁移指引,修改实例相关信息,存储引擎,使用 DTS 进行迁移,克隆数据,联系我们,使用 redis-port 进行迁移,恢复 CRS 实例,修改实例网络配置,启用读写分离,禁用读写分离,包年包月实例退还,按量计费实例销毁,获取集群版实例分片信息,回收站实例立即下线,查询备份Rdb下载地址,修改实例参数,查询项目安全组信息,查询实例安全组信息,查询实例参数列表,查询参数修改历史列表,内存版(标准架构),命令兼容性,使用 DTS 进行版本升级,免密码访问,管理账号,禁用命令,交换实例VIP,查询实例慢查询记录,读写分离,访问管理概述,可授权的资源类型,授权策略语法,查询实例CPU耗时Redis 实例备份,修改实例名称,查询备份下载地址,产品定价,产品系列,CKV 版(标准架构),CKV 版(集群架构),产品性能,内存版(集群架构),连接登录问题,购买相关问题,购买指南,开关读写分离
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  • TDSQL MySQL版

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  • 一作解读|Nat. Biotechnol.:水稻NRT1.1B基因调控根系微生物组参与氮利用

    ,具有更加活跃的氮转化环境;水稻通过NRT1.1B调控根系具有氮转化能力的微生物,改变根际微环境,影响籼梗稻田间氮肥利用效率;通过高通量微生物分离培养,获得了水稻根系70%的细菌种类,建立了首个系统性水稻根系细菌资源库比较nrt1.1b基因突变体和野生型的根系宏基因组数据,发现氨化过程相关基因丰度明显下降。我们采用梯度稀释方法培养结合标签高通量测序技术,从水稻籼、粳稻根系分离鉴定了1079株细菌纯培养。培养水稻根系微生物组Cultivation of rice root microbiota为了进一步研究籼、粳稻根系微生物组中特异富集OTUs的功能,我们基于昌平农场种植的籼稻品种IR24和粳稻品种日本晴进行细菌分离培养为了最大可能的分离IR24和日本晴根系招募的细菌,每个品种种植于两个地点。对两地点的样本混合,采用梯度稀释的方法在96孔细胞培养板中对细菌进行分离培养(在线方法)。粳稻品种A50为材料分离培养的根系细菌。c. 对1079个纯菌中515个非冗余16S序列的物种分类层级关系图。外圈用黄色和紫色分别代表分离来源于籼稻或粳稻。
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  • 读写分离

    读写分离概述云数据库 MariaDB 默认支持读写分离能力,架构中的每个从机都能支持只读能力,如果配置有多个从机,将由网关集群(TProxy)自动分配到低负载从机上。基于只读帐号的读写分离只读帐号是一类仅有读权限的帐号,默认从数据库集群中的从机(或只读实例)中读取数据。基于注释的读写分离通过如下视频,您可以了解基于注释的读写分离的使用: 在每条需要从机“读”的 SQL 前,增加*slave*字段,且 mysql 后面要增加 -c 参数来解析注释mysql -c -e只读实例(异地只读实例)如果上述读写分离方案无法满足您的需求,云数据库 MariaDB 提供 只读实例 供您使用。只读实例是独立的数据库实例,不参与原主实例高可用切换,仅用于读性能扩展。
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  • 数据万象

    DescribeMediaJobs,CancelMediaJob,CreateMediaJobs,DescribeMediaJob,DescribeMediaJobs,支持的功能和效果,HLS 自适应打包,极速高清,精彩集锦,人声分离设置审核策略,限制图片大小,内容审核,图片审核,视频审核,音频审核,计费项,图片处理费用,内容识别费用,内容审核费用,媒体处理费用,文档处理费用,流量费用,极速高清转码模板接口,精彩集锦模板接口,人声分离模板接口CreateMediaTemplate,DeleteMediaTemplate,DescribeMediaTemplates,UpdateMediaTemplate,多任务接口,精彩集锦任务接口,人声分离任务接口DescribeMediaJobs,CancelMediaJob,CreateMediaJobs,DescribeMediaJob,DescribeMediaJobs,支持的功能和效果,HLS 自适应打包,极速高清,精彩集锦,人声分离
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  • GeneMark-ES:真核生物编码基因预测软件

    GeneMark-ES软件用于预测真核生物中的蛋白编码基因,和其他预测基因结构的软件不同,它采用的是非监督算法,可以不依赖训练集进行预测。gmes_petap.pl --ES --cores 10--sequence genome.fagmes_petap.pl本身整合了geneMark-ES和geneMark-ET两个功能,genemark-ES用于基因组数据的预测gmes_petap.pl --fungus --cores 10--sequence genome.fa默认配置下,输出文件名为genemark.gtf, 保存在软件的安装目录,采用GTF格式来记录基因的结构信息
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  • 云数据库 MySQL

    云数据库灾备实例切换为主实例,隔离策略,设置本地 binlog 保留,数据安全,数据库巡检,binlog 使用空间计入磁盘总使用空间说明,数据库代理简介,开通数据库代理,设置数据库代理连接地址,开通数据库代理读写分离,查看数据库代理监控,关闭数据库代理,注意事项,自动读写分离介绍,Hint 语法使用,内存使用率过高,修改账户最大可用连接数,连接 MySQL 实例出现 Unknown MySQL server host设置本地 binlog 保留,数据安全,数据库巡检,故障处理,公告,binlog 使用空间计入磁盘总使用空间说明,数据库代理,数据库代理简介,开通数据库代理,设置数据库代理连接地址,开通数据库代理读写分离,查看数据库代理监控,关闭数据库代理,注意事项,自动读写分离介绍,Hint 语法使用,内存使用率过高,修改账户最大可用连接数,连接 MySQL 实例出现 Unknown MySQL server host
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  • Elasticsearch Service

    管理索引,MySQL 数据实时同步到 ES,数据迁移,重启集群,监控告警配置建议,ES 版本升级检查,升级 ES 集群,升级ES商业特性,升级ES集群版本,腾讯云 ES+SCF 快速构建搜索服务,冷热分离与索引生命周期管理管理索引,MySQL 数据实时同步到 ES,数据迁移,重启集群,监控告警配置建议,升级,ES 版本升级检查,升级 ES 集群,升级ES商业特性,升级ES集群版本,腾讯云 ES+SCF 快速构建搜索服务,冷热分离与索引生命周期管理
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  • 微生物组—宏基因组分析专题研讨会(2020.2)

    宏基因组微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强本领域的技术交流与传播,推动中国微生物组计划发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。背景:国际微生物组、中国微生物组计划研究对象:人、动物、植物、环境研究方法:培养组学、扩增子、宏基因组、宏转录组、宏蛋白组、宏代谢组、宏基因组关联分析、宏表观组……宏基因组学的研究热点:培养组、肠菌与疾病深彻理解生物测序数据的基本思想宏基因组分析三种模式全面的解决方案,以及结果的统计分析16S扩增子数据PICRUST预测宏基因组宏基因组数据Humann2定量物种和功能Denovo宏基因组拼接和binning2008年毕业于东北农大微生物学专业。2014年中科院遗传发育所获生物信息学博士学位,2016年博士后出站留所工作,任宏基因组学实验室工程师,目前主要研究方向为宏基因组数据分析和植物微生物组。周欣,中科院微生物硕博连续在读博士生(5年级),曾在加拿大农业与农业食品部-渥太华研究发展中心微生物生物信息研究组联合培养一年。熟悉高通量扩增子和宏基因组数据的处理及下游差异统计分析工作。
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  • 云数据库 MariaDB

    功能限制,产品概述,应用场景,系统架构,重命名数据库实例,计费概述,读写分离,解压备份和日志文件,升级计费,服务等级协议,续费说明,欠费说明,分布式版本,通过备份文件恢复实例,数据库审计,数据库审计已支持语法修改云数据库实例账号的权限信息,销毁按量计费实例,取消DCN同步,修改RS的访问策略,创建独享集群Mariadb实例,产品简介,开发指南,功能限制,产品概述,应用场景,系统架构,重命名数据库实例,购买指南,计费概述,读写分离
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  • 深度丨斯坦福 AI Lab 重磅生物学成果:用 GAN 合成基因

    首先需要介绍一下合成生物学。 合成生物学是生物科学在 21 世纪才刚刚出现的一个分支学科,其研究方法就是从最基本的要素系统地去设计和合成生物物质(例如合成蛋白质、DNA 片段等)。据雷锋网了解,近年来合成生物学成长很快,科学家们已经不局限于非常辛苦地进行基因剪接,而是开始构建遗传密码,以期利用合成的遗传因子构建新的生物体。有人甚至认为合成生物学将催生下一次生物技术革命。但是,像几乎所有需要借助人工智能的学科一样,目前的合成生物技术大多还是手动,这需要大量的时间、劳力以及丰富的领域经验;另一方面,他们现在有大量的基因组和蛋白质组数据集。生成对抗网络(GANs)则代表了将 AI 技术应用于合成生物学中,来生成真实数据(例如基因、蛋白质、药物等)的一种新颖的方法。我们将反馈循环机制应用于两个例子:1)产生编码抗菌肽的合成基因;2)优化合成基因用于其所产生肽的二级结构。我们采用几项指标表明 GAN 产生的蛋白质具有理想的生物物理特性。
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  • Augustus:真核生物基因结构预测软件-安装篇

    欢迎关注生信修炼手册组装得到基因组序列之后,进一步的工作就是探究基因结构。Augusust是一款预测真核生物基因结构的软件,官网如下:http:bioinf.uni-greifswald.deaugustus本篇主要介绍该软件的安装过程,这个软件依赖很多其他软件,安装过程比较繁琐
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