首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

AMOS2022——腹部多器官分割挑战赛(二)

今天将分享腹部多器官分割实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...一、AMOS2022介绍 AMOS2022挑战赛是一种大规模、临床和多样化的腹部多器官分割基准。...CT 数据的拆分在两个任务中将保持不变。 评价指标 两个经典的医学分割指标:骰子相似系数 (DSC) 和归一化表面骰子 (NSD),将用于评估分割方法性能。...三、技术路线 任务1的详细流程参考此文AMOS2022——腹部多器官分割挑战赛。在任务1的测试集上进行预测,结果如下所示。...4、搭建VNet3d网络,使用Adam优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是40,损失函数采用多类focal loss。

2.1K10

AMOS2022——腹部多器官分割挑战赛

今天将分享腹部多器官分割实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...一、AMOS2022介绍 AMOS2022挑战赛是一种大规模、临床和多样化的腹部多器官分割基准。...它提供了从多中心、多供应商、多模式、多阶段、多疾病患者收集的 500例 CT 和 100 例MRI ,每一例都有15个腹部器官的体素级注释。...CT 数据的拆分在两个任务中将保持不变。 评价指标 两个经典的医学分割指标:骰子相似系数 (DSC) 和归一化表面骰子 (NSD),将用于评估分割方法性能。...4、搭建VNet3d网络,使用Adam优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是40,损失函数采用多类focal loss。

1.6K31
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    基于自增强注意力机制的室内单图像分段平面三维重建

    最终,采用平衡交叉熵损失和骰子损失构建了一种新的损失函数来训练模型,进一步提升了平面分割的精度。...同时,为了解决室内场景部分平面尺度相差过大的问题,提出了一种新的损失函数以实现准确、可靠、稳定的分段平面重建工作。...,该损失函数通过将平衡交叉熵损失和骰子损失结合以此来提高平面分割的准确性以及算法的稳定性。...本文将交叉熵损失与骰子损失相结合,同时利用2种损失的特性来训练网络,即 其中,ε为权重,用于平衡2种损失;LD在0~1之间;log(LD)将取值范围从0扩展到负无穷区间内,当预测值与真实值相差较大时,LD...本文方法在利用了骰子损失的特性的同时,还提高了损耗的灵敏度。该方法比单纯交叉熵损失更好地解决了类不平衡的问题,且稳定性也优于单骰子损失。

    15410

    适用于稀疏的嵌入、独热编码数据的损失函数回顾和PyTorch实现

    这两个“模型”都被封装在一个叫做Network的类中,它将包含我们的培训和评估的整个系统。最后,我们定义了一个Forward函数,PyTorch将它用作进入网络的入口,用于包装数据的编码和解码。...下面我将介绍三种损失,它们提供了一个解决方案,或上述问题,并在PyTorch实现它们的代码: 余弦嵌入损失 余弦距离是一种经典的向量距离度量,常用于NLP问题中比较字包表示。...简单地说,它是两个集合之间重叠的度量,并且与两个向量之间的Jaccard距离有关。骰子系数对向量中列值的差异高度敏感,利用这种敏感性有效地区分图像中像素的边缘,因此在图像分割中非常流行。...例如,如果您有一个编码列,前7列是7个类别:您可以将其视为一个多类分类问题,并将损失作为子问题的交叉熵损失。然后,您可以将子问题的损失合并在一起,并将其作为整个批的损失向后传递。 ?...这里我们使用了一个负对数似然损失(nll_loss),它是一个很好的损失函数用于多类分类方案,并与交叉熵损失有关。

    1.3K61

    KiPA2022——肾肿瘤多组织分割

    今天将分享肾肿瘤多组织结构分割实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...四、KiPA2022指标 从两个方面评估分割性能:(1)基于区域的度量:使用骰子相似系数(DSC)来评估基于区域的重叠指数。...(2) 基于距离的度量:平均豪斯多夫距离 (AVD) 用于评估表面的重合度是否稳定且对异常值不太敏感。对异常值敏感的豪斯多夫距离(HD)也用于进一步比较异常值的分割质量。...对于一幅图像中的每个目标,将金标准分割点集声明为A,预测分割点集为B,则:DSC(骰子相似系数,越大越好) HD(豪斯多夫距离,越小越好) ||a-b|| 是欧几里得距离。...3、搭建VNet3d网络,使用Adam优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是50,损失函数采用多类dice,多类别权重是1,5,1,5,3。

    1.2K20

    图像分割的「奇技淫巧」

    一个经历了 39 场 Kaggle 比赛的团队在 reddit 上发帖表示,他们整理了一份结构化的图像分割技巧列表,涵盖数据增强、建模、损失函数、训练技巧等多个方面,不失为一份可以参考的图像分割技巧资料...以便提取人们感兴趣的区域。图像分割是图像分析和图像特征提取及识别的基础。 ? 图像分割也是 Kaggle 中的一类常见赛题,比如卫星图像分割与识别、气胸疾病图像分割等。...; 使用 OpenCV 对所有常规图像进行预处理; 采用自主学习并手动添加注释; 将所有图像调整成相同的分辨率,以便将相同的模型用于不同厚度的扫描等。...这部分介绍了一系列损失函数和使用场景,例如: dice 系数:能够很好地处理不平衡数据; 加权边界损失:减少预测分割与真值之间的距离; MultiLabelSoftMarginLoss:基于最大熵优化多标签一对多损失的标准...将几何平均数应用于预测; 在推理过程中将图块重叠,使每个边缘像素至少覆盖 3 次,因为 UNET 在边缘区域范围的预测往往较差; 非极大抑制和边界框收缩; 分水岭后处理:在实例分割问题中分离对象。

    58920

    在参加了39场Kaggle比赛之后,有人总结了一份图像分割炼丹的「奇技淫巧」

    机器之心报道 机器之心编辑部 一个经历了 39 场 Kaggle 比赛的团队在 reddit 上发帖表示,他们整理了一份结构化的图像分割技巧列表,涵盖数据增强、建模、损失函数、训练技巧等多个方面,不失为一份可以参考的图像分割技巧资料...以便提取人们感兴趣的区域。图像分割是图像分析和图像特征提取及识别的基础。 ‍ ? 图像分割也是 Kaggle 中的一类常见赛题,比如卫星图像分割与识别、气胸疾病图像分割等。...; 使用 OpenCV 对所有常规图像进行预处理; 采用自主学习并手动添加注释; 将所有图像调整成相同的分辨率,以便将相同的模型用于不同厚度的扫描等。...这部分介绍了一系列损失函数和使用场景,例如: dice 系数:能够很好地处理不平衡数据; 加权边界损失:减少预测分割与真值之间的距离; MultiLabelSoftMarginLoss:基于最大熵优化多标签一对多损失的标准...将几何平均数应用于预测; 在推理过程中将图块重叠,使每个边缘像素至少覆盖 3 次,因为 UNET 在边缘区域范围的预测往往较差; 非极大抑制和边界框收缩; 分水岭后处理:在实例分割问题中分离对象。

    73810

    AMOS2022——多模态腹部多器官分割挑战赛

    今天将分享多模态腹部多器官分割完整实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...一、AMOS2022介绍 AMOS2022挑战赛是一种大规模、临床和多样化的腹部多器官分割基准。...它提供了从多中心、多供应商、多模式、多阶段、多疾病患者收集的 500例 CT 和 100 例MRI ,每一例都有15个腹部器官的体素级注释。...CT 数据的拆分在两个任务中将保持不变。 评估指标:骰子相似系数 (DSC) 和归一化表面骰子 (NSD),将用于评估分割方法性能的不同方面。...4、搭建VNet3d网络,使用AdamW优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是300,损失函数采用二分类的dice和交叉熵。

    57010

    图像分割 2020 最新进展

    在语义分割中,所有物体都是同一类型的,所有相同类型的物体都使用一个类标签进行标记,而在实例分割中,相似的物体可以有自己独立的标签。 ?...比例因子在训练时自动降低权衡简单示例的贡献,并将重点放在难的示例上。 ? 来源source:neptune.ai 骰子损失 这种损失是通过计算平滑骰子系数函数得到的。...来源source:neptune.al 加权交叉熵 在交叉熵的一个变量中,所有的正例子都被某个一定系数加权。它用于涉及类不平衡的场景或方案。 ?...敏感性\灵敏性-特异性(SS)损失,用于计算特异性和敏感性的均方差的加权和。 Hausdorff 距离(HD)损失,可从卷积神经网络估计Hausdorff距离。 这些只是图像分割中使用的几个损失函数。...MultiPath——这是“用于对象检测的MultiPath网络 ”中对象检测网络的Torch实现。 OpenCV——这是一个开源的计算机视觉库,有超过2500个优化算法。

    1.1K93

    CAS2023——脑动脉分割挑战赛

    今天将分享脑动脉分割挑战赛完整实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...磁共振血管造影(MRA)广泛用于可视化脑动脉树以进行疾病诊断。MRA准确的脑动脉分割对于脑血管疾病的定量分析,如估计管腔狭窄程度具有重要意义。...2) 平均豪斯多夫距离 (AHD)。3)狭窄区域的骰子相似系数。4)狭窄区域的平均豪斯多夫距离(AHD)。...2、在头部ROI区域中进行多尺度海森矩阵增强,增强管状类结构组织特征。...3、搭建VNet3d网络,使用AdamW优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是300,损失函数采用二值化的dice和交叉熵。

    33110

    120参数,运算速度提升四倍:北大、字节跳动等利用增量学习提出超像素分割模型LNSNet

    其中,特征提取模块 FCM 用于生成聚类所需的聚类特征,无迭代聚类模块 NCM 进而利用聚类特征进行聚类得到超像素分割结果。...三、模型结构及损失函数设计 本文提出的模型结构如图 3 所示,其中考虑到超像素分割作为广义分割问题更为关注图像的细节信息与空间信息的融合。...随后我们使用三个不同空洞率 (d=1,3,5) 的空洞卷积进行多尺度的特征提取,并采用两个 3x3 卷积模块进行多尺度特征融合,进而得到用以进行聚类的输出特征图 Z: 接着,进一步增加过程的运算效率,...第二部分为聚类损失 Lc,该部分在 DEC 聚类损失的基础上增加了空间距离约束。...建新·见智 —— 2021亚马逊云科技 AI 在线大会 4月22日 14:00 - 18:00 为什么有那么多的机器学习负载选择亚马逊云科技?大规模机器学习、企业数字化转型如何实现?

    37910

    Tensorflow入门教程(五十一)——H2NF-Net

    所有的下采样操作均采用步长为2的卷积操作完成的,所有上采样操作均通过联合1x 1x 1卷积和三线性插值实现。 PMF模块。PMF模块被设计为两部分,即并行多尺度卷积块和全连接融合块。...事实证明,非局部的自我注意机制可以帮助聚集来自所有空间位置的上下文信息并捕获长距离的依赖关系。但是,潜在的高计算复杂性使其很难应用于3D医学图像分割任务。...因此,将EMA模块引入我们的肿瘤分割模型,旨在将轻量级的非局部注意机制整合到的模型中。EMA模块的主要概念是在一组特征重建基础上进行非局部注意,而不是直接在高分辨率特征图上实现。...训练注释数据是公开可用的,而验证和测试数据的注释则分别保留用于在线评估和最终分类比赛。 3.2、实现细节 预处理。...采用广义骰子损失和二进制交叉熵损失的组合作为损失函数。所有实验均基于PyTorch 1.2.0进行。

    60420

    SPIDER2023——脊柱分割:椎间盘、椎骨和椎管分割

    然而,为了有效地评估复杂的多因素疾病,如LBP,自动分析必须理解脊柱的多个解剖元素,包括椎骨、椎间盘(IVD)和椎管。因此,用于分割这些结构的鲁棒自动算法至关重要。...为了解决这一差距,引入了一个大型多中心腰椎MR数据集,其中包含椎骨,椎间盘(IVD)和椎管的参考分割,将其公开用于AI算法的训练数据。...3、搭建VNet3d网络,使用AdamW优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是300,损失函数采用多类的dice和交叉熵。...3、搭建VNet3d网络,使用AdamW优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是300,损失函数采用多类的dice和交叉熵。...6、搭建VNet3d网络,使用AdamW优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是300,损失函数采用多类的dice和交叉熵。

    1.1K30

    TensorFlow2 keras深度学习:MLP,CNN,RNN

    (235, 34) (116, 34) (235,) (116,)Test Accuracy: 0.940Predicted: 0.991 用于多类分类的MLP 我们将使用鸢尾花多类分类数据集来演示用于多类分类的...鸢尾花数据集(csv) 鸢尾花数据集描述(csv) 鉴于它是一个多类分类,因此该模型在输出层中的每个类必须具有一个节点,并使用softmax激活函数。...损失函数是' sparse_categorical_crossentropy ',它适用于整数编码的类标签(例如,一个类为0,下一类为1,等等) 下面列出了在鸢尾花数据集上拟合和评估MLP的代码片段。...3.python用遗传算法-神经网络-模糊逻辑控制算法对乐透分析 4.用于nlp的python:使用keras的多标签文本lstm神经网络分类 5.用r语言实现神经网络预测股票实例 6.R语言基于Keras...的小数据集深度学习图像分类 7.用于NLP的seq2seq模型实例用Keras实现神经机器翻译 8.python中基于网格搜索算法优化的深度学习模型分析糖 9.matlab使用贝叶斯优化的深度学习

    2.2K30

    神经网络中的损失函数

    Generalized End-to-End Loss 损失函数 Generalized End-to-End 损失函数(简称GE2E)用于说话人验证的广义端到端损失函数。...利用深层卷积神经网络(DCNN)进行大规模人脸识别的特征学习面临的主要挑战之一是如何设计合适的损失函数来提高识别能力。中心损失惩罚了深部特征与其在欧氏空间中相应的类中心之间的距离,以实现类内紧凑性。...Dice系数的值越大意味着这两个样本越相似。 Dice Loss常用于语义分割问题中,对于二分类分割问题,真实分割标签只有0,1两个值。...对于多分类分割问题,Dice Loss是直接优化F1 score而来的,是对F1 score的高度抽象。 2016年,Milletari 等人将其引入计算机视觉社区,用于三维医疗图像分割。...因此,我们可以使用1-DSC 作为骰子损失,以最大限度地提高两个集之间的重叠。

    1.4K30

    《Unet》论文阅读与

    扩张路径由2 * 2的反卷积,反卷机的输出通道为原来通道数的一半,再与原来的feature map(裁剪之后)串联,得到和原来一样多的通道数的feature map,再经过2个尺寸为3 * 3的卷积和ReLU...但是这个网络需要谨慎的选择输入图片的尺寸,以保证所有的Max Pooling操作作用于长宽为偶数的feature map。...而这个策略允许通过重叠区块无缝分割任意大的图像,为了预测图像边界区域中的像素,通过镜像的输入图像来外推丢失的上下文。这种平铺策略对于将网络应用于大图像很重要,否则分辨率将受到GPU内存的限制。...Trick 3 相同物体间的间隔不容易分割出来:加权损失 很多细胞分割任务中的一大挑战是分离同一类接触体,本文采用加权损失,其中接触单元之间的分离背景标签在损失函数中获得大的权重。...代码实现 caffe版本Unet: https://github.com/warden3344/unet keras版本Unet: https://github.com/zhixuhao/unet 我的实现

    1.3K10

    自动驾驶中实时车道检测和警报

    在本文中,我们将探究一个实时模型,用于检测车道、其他车辆等以及生成警报。 训练实时车道检测 车道检测问题通常被构造为语义或实例分割问题,目的是识别属于车道类别的像素。...TUSimple数据集的样本图像和车道注释 在此数据集中,我们可以训练语义分割模型用于分割出属于车道类别的像素。U-Net模型是一个理想的模型,因为它是具有实时推理速度的轻量级模型。...U-Net论文中的U-Net模型架构 但是,损失函数应修改为骰子损失系数。车道线分割问题是一个极不平衡的数据问题,图像中的大多数像素都属于背景类。...Dice Loss尝试匹配地面真实情况和预测模型中的车道像素,并能够获得清晰的边界预测。个人非常喜欢这个关于使用骰子进行边界预测的博客。...LaneNet模型的解释(论文图片-https://arxiv.org/pdf/1807.01726.pdf) 我使用了这个repo中的LaneNet模型实现。代码维护良好,运行无错误。

    50440

    自动驾驶中实时车道检测和警报

    车道检测模型 在本文中,我们将探究一个实时模型,用于检测车道、其他车辆等以及生成警报。 训练实时车道检测 车道检测问题通常被构造为语义或实例分割问题,目的是识别属于车道类别的像素。...TUSimple 数据集的样本图像和车道注释 在此数据集中,我们可以训练语义分割模型用于分割出属于车道类别的像素。U-Net 模型是一个理想的模型,因为它是具有实时推理速度的轻量级模型。...模型架构如下所示: U-Net 论文中的 U-Net 模型架构  但是,损失函数应修改为骰子损失系数。 车道线分割问题是一个极不平衡的数据问题,图像中的大多数像素都属于背景类。...Dice Loss 尝试匹配地面真实情况和预测模型中的车道像素,并能够获得清晰的边界预测。个人非常喜欢这个关于使用骰子进行边界预测的博客。...LaneNet 模型的解释(论文图片-https://arxiv.org/pdf/1807.01726.pdf) 我使用了这个 repo 中的 LaneNet 模型实现。代码维护良好,运行无错误。

    24910

    近端策略优化算法(PPO):RL最经典的博弈对抗算法之一「AI核心算法」

    策略更新不稳定:在许多策略梯度方法中,由于步长较大,策略更新不稳定,导致错误的策略更新,当这个新的错误策略被用于学习时,会导致更糟糕的策略。如果步骤很小,那么就会导致学习的缓慢。...算法的步骤 游戏n步,存储状态,动作概率,奖励,完成变量。 基于上述经验,应用广义优势估计方法。我们将在编码部分看到这一点。 通过计算各自的损失,训练神经网络在某些时期的运行。...下一个循环是代理与环境交互的次数,我们将体验存储在不同的列表中。 在上述循环结束后,我们计算状态的值并加到最后一个状态的值,在广义优势估计方法中进行计算。...我们计算当前的概率和损失。批评家的损失是MSE。 这个函数使用渐变点击来执行渐变更新。...然后,我们计算损失。注意这里的损失是负的因为我们想要进行梯度上升而不是梯度下降。

    7.4K20

    2022ATM——气道树分割挑战赛(二)

    今天将分享气道树深度学习网络分割完整实现版本,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。...三、ATM22数据集 ATM22从多中心收集了500例CT扫描(300 例用于训练,50 例用于验证,150 例用于测试)。...因此,我们最终在测试阶段选择以下指标:[1] 树长检测率(TD)和树枝检测率(BD),[2] 骰子相似系数 (DSC) 和精度。...因此本文针对肺组织内气管采用Vnet3d来分割。 2、肺组织区域提取参考前一篇实现,这里不多赘述。...4、搭建VNet3d网络,使用Adam优化器,学习率是0.001,batchsize是1,epoch是20,损失函数采用二分类的dice。

    1.9K32
    领券