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R语言贝叶斯分层、层次(Hierarchical Bayesian)模型房价数据空间分析

无结构分量 (v\_i) 被建模为独立同分布的正态变量,均值为零,方差为 (\sigma^2\_v),即 (v\_i \sim N(0, \sigma^2_v))。...(一)贝叶斯推断与INLA 贝叶斯分层模型可通过多种方法进行拟合,如集成嵌套拉普拉斯近似(INLA)(Rue, Martino, and Chopin 2009)和马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法(Gelman...(v\_i) 是建模为 (v\_i \sim N(0, \sigma^2\_v)) 的无结构效应。 (三)邻域矩阵 在模型中,空间随机效应 (u_i) 需要使用邻域结构来指定。...模型拟合结果概述 通过调用 inla() 函数并传入相应的公式、分布族、数据以及使用 R-INLA 中的默认先验信息完成模型拟合后,得到的结果对象 res 包含了模型的拟合情况。...在创建地图过程中,我们为这三张地图指定了一个通用的图例,并使用一个弹出式表格,其中包含区域名称、房价对数、协变量以及后验均值和 可信区间等信息。

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泊松分布 二项分布 正态分布之间的联系,与绘制高斯分布图

反之,如果 np 趋于无限大(如 p 是一个定值),则根据德莫佛-拉普拉斯(De'Moivre-Laplace)中心极限定理,这列二项分布将趋近于正态分布。  ...2.实际运用中当 n 很大时一般都用正态分布来近似计算二项分布,但是如果同时 np 又比较小(比起 n来说很小),那么用泊松分布近似计算更简单些,毕竟泊松分布跟二项分布一样都是离散型分布。...每小时出生3个婴儿,这是最可能的结果,出生得越多或越少,就越不可能。 二、二项分布       二项分布即重复n次的伯努利试验。...P.S.拉普拉斯和高斯研究了它的性质。是一个在数学、物理及工程等领域都非常重要的概率分布,在统计学的许多方面有着重大的影响力。        ..., patches = plt.hist(x, num_bins, normed=True, facecolor = 'blue', alpha = 0.5) # 拟合曲线 y = mlab.normpdf

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    传统图像处理算法总结

    opencv 函数:bilateralFilter (image, out, 100, 0, 0 ); 参数3:每个像素领域的直径d,参数4、5:颜色空间和坐标空间的sigma。...1.3 形态学滤波 1.3.1 腐蚀 操作过程:构建一个核,并指定核的锚点,用该核与图像卷积,计算核覆盖区域的像素点最小值,将其作为图像在锚点位置的像素值 效果:使暗的更暗 1.3.2 膨胀 操作过程...:构建一个核,并指定核的锚点,用该核与图像卷积,计算核覆盖区域的像素点最大值,将其作为图像在锚点位置的像素值 效果:使亮的更亮 1.3.3 开运算 操作过程: 先腐蚀,再膨胀 效果:消除小物体...阈值化 2.1 阈值化的目的 对图像像素进行取舍,直接剔除一些低于或高于一定值的像素。...3.2 拉普拉斯金字塔 3.2.1 求解方式 第 i 层 拉普拉斯金字塔 = 第 i 层高斯金字塔 – 其先下采样再上采样。

    2.1K30

    Sklearn参数详解—贝叶斯

    对象 class_prior_:每个样本的概率 class_count:每个类别的样本数量 theta_:每个类别中每个特征的均值 sigma_:每个类别中每个特征的方差 多项式分布贝叶斯 适用于服从多项分布的特征数据...sklearn.naive_bayes.MultinomialNB(alpha=1.0, fit_prior=True, class_prior=None) alpha:先验平滑因子,默认等于1,当等于1时表示拉普拉斯平滑...特征的条件概率=(指定类下指定特征出现的次数+alpha)/(指定类下所有特征出现次数之和+类的可能取值个数*alpha) coef_: 是朴素贝叶斯对应的线性模型,其值和feature_log_prob...class_count_:拟合过程中每个样本的数量。 feature_count_:拟合过程中每个特征的数量。 方法 贝叶斯的方法和其他模型的方法一致。...fit(X,Y):在数据集(X,Y)上拟合模型。 get_params():获取模型参数。 predict(X):对数据集X进行预测。

    6.8K60

    scikit-learn 朴素贝叶斯类库使用小结

    GaussianNB类使用总结     GaussianNB假设特征的先验概率为正态分布,即如下式: $$P(X_j=x_j|Y=C_k) = \frac{1}{\sqrt{2\pi\sigma_k^2...$\mu_k和\sigma_k^2$为需要从训练集估计的值。     GaussianNB会根据训练集求出$\mu_k和\sigma_k^2$。...$\mu_k$为在样本类别$C_k$中,所有$X_j$的平均值。$\sigma_k^2$为在样本类别$C_k$中,所有$X_j$的方差。     ...$\lambda$ 为一个大于0的常数,常常取为1,即拉普拉斯平滑。也可以取其他值。     MultinomialNB参数比GaussianNB多,但是一共也只有仅仅3个。...其中,参数alpha即为上面的常数$\lambda$,如果你没有特别的需要,用默认的1即可。如果发现拟合的不好,需要调优时,可以选择稍大于1或者稍小于1的数。

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    概率论基础 - 9 - 中心极限定理

    ——百度百科 中心极限定理(CLT)指出,如果样本量足够大,则变量均值的采样分布将近似于正态分布,而与该变量在总体中的分布无关。...}{\sqrt n\sigma} 定义 中心极限定理的内容为:Y_n的概率分布函数F_n(x)对于任意x满足: image.png 证明 通过观察某个分布的采样均值可以发现近似服从正态分布,我们的目标就是证明这个变量与正态分布的特征函数相同...引入一些特征函数的结论 正态分布的特征函数: image.png 标准正态分布的特征函数 随机变量X_i的特征函数用{\varphi_x (t)}表示 \overline S_n的特征函数为:...时,Y_n服从正态分布的结论 应用思路 均值方差为\mu和\sigma^2,的独立同分布的随机变量X_i前n项之和\overline S_n的标准变化量Y_n,当n充分大时,其分布近似于标准正态分布 即在...棣莫佛-拉普拉斯定理 Demoiver-Laplace 定理:设随机变量序列 \eta_{n}, n=1,2, \ldots 服从参数为 (n, p) 的二项分布,其中 0<p<1x, 有: image.png

    5.6K20

    R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据和可视化诊断|附代码数据

    StanStan是一种用于指定统计模型的编程语言。它最常被用作贝叶斯分析的MCMC采样器。马尔科夫链蒙特卡洛(MCMC)是一种抽样方法,允许你在不知道分布的所有数学属性的情况下估计一个概率分布。...如果你需要拟合不同的模型类型,那么你需要自己用rstan编码。模型拟合函数以前缀stan_开始,以模型类型结束。建模函数有两个必要的参数。公式。一个指定因变量和自变量的公式(y ~ x1 + x2)。...例子作为一个简单的例子来演示如何在这些包中指定一个模型,我们将使用汽车数据来拟合一个线性回归模型。我们的因变量是mpg,所有其他变量是自变量。mtcars %>%  head()首先,我们将拟合模型。...当把矩阵或向量声明为一个变量时,你需要同时指定对象的维度。因此,我们还将读出观测值的数量(N)和预测器的数量(K)。在参数块中声明的变量是将被Stan采样的变量。...此外,还有误差项,sigma。模型区块是定义变量概率声明的地方。在这里,我们指定目标变量具有正态分布,其平均值为α+X*β,标准差为sigma。在这个块中,你还可以指定参数的先验分布。

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    Matlab之正态拟合直方图绘制函数histfit

    2.给定bin数的直方图 3.具有指定分布拟合的直方图 4.具有核平滑函数拟合的直方图 ---- 一、功能 绘制正态拟合直方图 二、语法 1.histfit(data) 绘制 data 中的值的直方图并拟合正态密度函数...3.histfit(data,nbins,dist) 使用 nbins 个 bin 绘制直方图,并根据 dist 指定的分布拟合密度函数。...三、示例 1.具有正态拟合分布的直方图 用均值 10 和方差 1 从正态分布生成大小为 100 的样本。...1.1624 [1.02059, 1.35033] 2.给定bin数的直方图 用均值 10 和方差 1 从正态分布生成大小为 100 的样本。...rng default; % For reproducibility r = normrnd(10,1,100,1); histfit(r,6) 3.具有指定分布拟合的直方图 使用参数 (3,10)

    2.1K80

    在R语言和Stan中估计截断泊松分布

    我模拟了1,000个计数观察值,平均值为1.3。然后,如果只观察到两个或更高的观察,我将原始分布与我得到的分布进行比较。 ?...a > 1] # 图形: data_frame(value = c(a, b), ggplot(aes(x = value)) + (binwidth = 1, colour = "w # 模型拟合原始模型效果很好...1.5; 因为所有数据都是整数,这实际上意味着我们只观察2或更多的观察结果。...我们还需要为估计值指定一个合理的起始值lambda,不让误差太大。 贝叶斯 对于替代贝叶斯方法,Stan可以很容易地将数据和概率分布描述为截断的。...以下程序的关键部分是: 在data中,指定数据的x下界为lower_limit 在model中,指定x通过截断的分布T[lower_limit, ] data { int n; int lower_limit

    1.1K20

    深度学习基础入门篇:模型调优:注意力机制,正则化【L1、L2,Dropout,Drop Connect】等

    图片正则化可以避免算法过拟合,过拟合通常发生在算法学习的输入数据无法反应真实的分布且存在一些噪声的情况。...损失函数对应后验估计中的似然函数,两者的乘积即对应贝叶斯最大后验估计的形式2.3.1贝叶斯推断分析法针对L1范数和L2范数还有结论:L1范数相当于给模型参数θ设置一个参数为$\frac{1}{\alpha}$的零均值拉普拉斯先验分布...L2范数相当于给模型参数θ设置一个协方差$\frac{1}{\alpha}$的零均值高斯先验分布1.L2范数相当于给模型参数θ设置一个零均值高斯先验分布以线性模型为例,结论可以推广到任意模型,线性模型方程可以表示为...2.L1范数相当于给模型参数θ设置一个拉普拉斯先验分布以线性模型为例,结论可以推广到任意模型,同样假设 $\epsilon\sim N(0,\sigma^2)\text{,}\theta_i\sim Laplace...已飞桨框架为例:Dropout API中,通过mode参数来指定用哪种方式对神经元进行操作,paddle.nn.Dropout(p=0.5, axis=None, mode=”upscale_in_train

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    深度学习基础入门篇:模型调优:注意力机制,正则化【L1、L2,Dropout,Drop Connect】等

    正则化可以避免算法过拟合,过拟合通常发生在算法学习的输入数据无法反应真实的分布且存在一些噪声的情况。...损失函数对应后验估计中的似然函数,两者的乘积即对应贝叶斯最大后验估计的形式 2.3.1贝叶斯推断分析法 针对L1范数和L2范数还有结论: L1范数相当于给模型参数θ设置一个参数为 \frac{1}{\alpha} 的零均值拉普拉斯先验分布...L2范数相当于给模型参数θ设置一个协方差 \frac{1}{\alpha} 的零均值高斯先验分布 1.L2范数相当于给模型参数θ设置一个零均值高斯先验分布 以线性模型为例,结论可以推广到任意模型...2.L1范数相当于给模型参数θ设置一个拉普拉斯先验分布 以线性模型为例,结论可以推广到任意模型,同样假设 \epsilon\sim N(0,\sigma^2)\text{,}\theta_i\sim...已飞桨框架为例:Dropout API中,通过mode参数来指定用哪种方式对神经元进行操作, paddle.nn.Dropout(p=0.5, axis=None, mode=”upscale_in_train

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    Python用PyMC贝叶斯GLM广义线性模型、NUTS采样器拟合、后验分布可视化

    一般来说,频率论者对线性回归的看法如下: 然后,我们可以使用普通最小二乘法(OLS)或最大似然法来找到最佳拟合。 概率重构 贝叶斯主义者对世界采取概率观,并用概率分布来表达这个模型。...我们上面的线性回归可以重新表述为: 换句话说,我们将Y其视为一个随机变量(或随机向量),其中每个元素(数据点)都根据正态分布分布。此正态分布的均值由具有方差sigma的线性预测变量提供。...分析模型 贝叶斯推理不仅给了我们一条最佳拟合线(就像最大似然那样),而是给出了合理参数的整个后验分布。让我们绘制参数的后验分布和我们绘制的单个样本。...其次,每个变量的最大后验估计值(左侧分布中的峰值)非常接近用于生成数据的真实参数(x是回归系数,sigma是我们正态的标准差)。 因此,在 GLM 中,我们不仅有一条最佳拟合回归线,而且有许多。...但是由于我们只有有限的数据,我们的估计存在不确定性,这里用线的可变性来表示。 总结 可用性目前是更广泛采用贝叶斯统计的巨大障碍。 Bambi允许使用从 R 借用的便捷语法进行 GLM 规范。

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    Python用PyMC贝叶斯GLM广义线性模型、NUTS采样器拟合、后验分布可视化

    一般来说,频率论者对线性回归的看法如下: 然后,我们可以使用普通最小二乘法(OLS)或最大似然法来找到最佳拟合。 概率重构 贝叶斯主义者对世界采取概率观,并用概率分布来表达这个模型。...我们上面的线性回归可以重新表述为: 换句话说,我们将Y其视为一个随机变量(或随机向量),其中每个元素(数据点)都根据正态分布分布。此正态分布的均值由具有方差sigma的线性预测变量提供。...分析模型 贝叶斯推理不仅给了我们一条最佳拟合线(就像最大似然那样),而是给出了合理参数的整个后验分布。让我们绘制参数的后验分布和我们绘制的单个样本。...其次,每个变量的最大后验估计值(左侧分布中的峰值)非常接近用于生成数据的真实参数(x是回归系数,sigma是我们正态的标准差)。 因此,在 GLM 中,我们不仅有一条最佳拟合回归线,而且有许多。...但是由于我们只有有限的数据,我们的估计存在不确定性,这里用线的可变性来表示。 总结 可用性目前是更广泛采用贝叶斯统计的巨大障碍。 Bambi允许使用从 R 借用的便捷语法进行 GLM 规范。

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    带答案面经分享-L1正则&L2正则

    3.3 贝叶斯先验 从贝叶斯角度来看,L1正则化相当于对模型参数w引入了拉普拉斯先验,L2正则化相当于引入了高斯先验(为什么我们在后面详细解释)。我们来看一下高斯分布和拉普拉斯分布的形状: ? ?...可以看到,当均值为0时,高斯分布在极值点处是平滑的,也就是高斯先验分布认为w在极值点附近取不同值的可能性是接近的。...但对拉普拉斯分布来说,其极值点处是一个尖峰,所以拉普拉斯先验分布中参数w取值为0的可能性要更高。...第二项,咱们就得分类讨论了,如果θ服从的是0均值的高斯分布,为了和上面的方差所区分,这里咱们用alpha来表示,那么有: ? 所以,最终可以得到: ? 我们把与θ无关的情况去掉,便得到: ?...你可能觉得,alpha不是θ的方差么,请注意,这里是先验分布,我们可以任意指定alpha的值,所以去掉也是可以的。 同理,我们可以得到当先验是拉普拉斯分布时的情况。 ? ? ?

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第六章 参数估计与R实现(上)

    :interval是一个数值向量,指定要求解的根的区间范围:或者用lower和upper分别指定区间的两个端点;tol表示所需的精度(收敛容忍度):maxiter为最人迭代次数。...2.函数optim()和nlm() 当分布包含多个参数时,用函数optim()或nlm()计算似然函数的极大值点。...3.函数nlminb() 在实际应用中,上面这三个基本函数在遇到数据量较大或分布较复杂的计算时,就需要使用优化函数nlminb() nlminb(start, objective, gradient =...例: 采用两参数的负二项分布做极大似然估计,具体说明离散分布的拟合: 编写R程序时首先要写出对数似然函数loglik,用到R中的负二项函数dnbinom(),它的参数是r、p。...,为greater求置信卜限;mu表示均值,它仅在假设检验中起作用,默认为0; sigma.x和sigma.y分别指定两个样本总体的标准差:conf.level指定区间估计时的置信水平。

    2.9K31

    【1024特辑 | 机器学习-无监督学习】EM算法

    二、动手求解GMM拟合数据分布   虽然GMM是由高斯分布组成的,然而理论上它可以用来拟合任意的数据分布。...如果我们试图用两个高斯分布来拟合数据,如右上角所示,每个椭圆形区域表示拟合出的一个高斯分布,可以看出该结果与实际数据偏差仍然较大。但是,当我们继续增加GMM中高斯分布的数目时,拟合结果也会越来越精确。...下图的左下方和右下方分别展示了用5个和10个高斯分布拟合出的结果,已经可以基本覆盖所有的数据点,且几乎没有多出的区域。事实上我们可以证明,任何数据分布都可以用GMM来无限逼近。...图2 用高斯混合分布拟合正弦函数   从上图的拟合结果中我们还可以发现,如果我们有一组分布未知的数据,并且还希望能按照同样的分布生成一些新的数据,那么也可以先用GMM对数据进行拟合,再由它来继续做数据生成...除了k-means之外,我们还可以用随机性更小、效果更好的k-means++算法进行初始化。 小故事:   GMM通常用来拟合数据分布后,再生成相同分布的数据。

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    概率分析方法与推断统计(来自我写的python书)

    2 用直方图来拟合正态分布效果 正态分布是一种连续随机变量概率分布,它是很多分析统计方法的基础,比如包括回归分析等在内的多种方法均要求被分析的样本服从正态分布。...= 1 8 num = 1000000 9 points = np.random.normal(u, sigma, num) 10 #以直方图来拟合正态分布 11 ax.hist(points, bins...从图上能看到这些随机数的分布情况,而0位置的分布最为密集,其中0是生成该正态分布随机数时指定的数学期望值。...3 验证序列是否满足正态分布 之前提到,很多数学统计规律和方法是基于正态分布的,也就是说,如果某组样本变量符合正态分布,那么就可以用到这些规律和方法来进行分析或预测工作。...在如下的TTestDemo.py范例中,就将演示用t检验验证收盘价的均值。

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    R语言Rstan概率编程规划MCMC采样的贝叶斯模型简介

    我们可以通过以下方式指定层次贝叶斯模型 根据该模型,教学的效果遵循正态分布,其均值是真实效果, θĴ ,其标准差是 σĴ ,从数据中已知。真正的效果,θĴ ,遵循正态分布 μ 和 τ 。...(必需):用于指定模型 生成数量:用于后处理结果 对于模型程序块,可以以两种等效方式指定分布。...这里,行名称表示估计的参数:mu是后验分布的均值,tau是其标准偏差。eta和theta的条目表示向量的估计η 和 θ 。 列指示计算的值。百分比表示可信区间。...; // 老鼠体重的标准差 real sigma_alpha; // 截距分布的标准差 sigma_y <- sqrt(sigmasq_y); sigma_alpha <- sqrt...数据准备 要为模型准备数据,我们首先将测量点提取为数值,然后在列表结构中对所有内容进行编码: 拟合回归模型 我们现在可以拟合大鼠体重数据集的贝叶斯分层回归模型: 用层次回归模型预测 确定了 α 和 β

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