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用Flex模拟智能手机表单输入的自动放大功能

用iphone或itouch登录过微薄的同学们想必都会发现:登录一些手机版网站(比如微薄时),表单中的输入框会自动放大,以方便用户输入,等输入完成后,页面会再次缩小到正常状态。...在flex开发过程中,有时也会遇到一些输入项很多的表单,可以借鉴iphone上的这种体验,基本思路就是:将整个容器放大,以适应屏幕,然后将获得焦点的文本框定位到屏幕中央。...下面是演示: 当UserName与PassWord文本框获得焦点时,表单(其实就是panel)会自动放大,并重新定位,最终将获得焦点的文本框定位在屏幕中央,以方便输入。...private var SH:Number;//舞台的高度 private var WH:Number;//panel的高度 private var WW:Number;//panel...:Number = current.y * radio + loginWin.y + loginWin.titleDisplay.height*radio; //当前焦点对应的文本框中心点的实际位置

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动态变化:用 Mathematica 模拟全球变暖的经济效应

,能够做到如此简洁和强大的功能,这使得开发过程非常快速,因此专家小组告诉我,一个人在六个月内完成了需要很多人及很多年才能完成的大部分工作。”...| Alpha 中与 TB 级的精选数据相结合 面临挑战 Stuart Nettleton 是悉尼科技大学的高级讲师,他知道他所研究的问题的重要性—他称之为“未来世界上我们面临的最大问题”。...解决方案 Mathematica 的高效编程语言、处理数据的能力和可伸缩性为 Nettleton 节省了多年的开发时间。...他说“Mathematica 提供的快速开发环境,功能编程和模式匹配所带来的简洁和强大的功能,以及所有这些都是Mathematica的巨大优势—这使得开发过程非常快速,因此专家小组告诉我,一个人在六个月内完成了需要很多人及很多年才能完成的大部分工作...2021年友万学院将陆续推出更多Mathematica软件功能免费视频,支持用户在线观看,供大家学习参考。

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    SnapGene软件安装包下载,分子生物学研究SnapGene软件下载安装

    然后,我们可以在“序列”部分查看DNA序列,并进行相关的编辑和注释操作。分子克隆 SnapGene软件支持PCR引物设计和限制酶消化模拟等多种分子克隆设计工具。...用户可以在SnapGene中快速比较不同物种的DNA序列差异和变化,并进行进化分析。举例说明:假设我们需要在SnapGene软件中比较两种不同物种的DNA序列。...然后,我们可以使用SnapGene的PCR引物设计工具进行引物设计。SnapGene的引物设计工具可以根据输入的DNA序列,自动计算出最佳的引物设计方案。...限制酶消化模拟 在进行限制酶消化模拟之前,我们需要选择合适的限制酶以及相应的消化体系和反应条件。然后,我们可以使用SnapGene的限制酶消化模拟工具,对克隆方案进行验证。...SnapGene的限制酶消化模拟工具可以在软件中自动计算出消化后的DNA序列,并提供图像化的结果展示。分子克隆操作记录 在完成分子克隆实验后,我们需要将实验操作过程和结果记录下来。

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    IBM | 基于断开提示的逆向合成语言模型

    通过识别化合物中变化的原子和键,从SMILES中自动提取提示,自动提取的提示仅用于模型训练。该提示对应断开位置,通过识别反应物和生成物之间键序不同的原子,在生成物SMILES中进行标记。...该模型通过监督学习进行训练,其输入是将提示标注重新排列组合的化合物,以模拟用户的不完整输入,如图2B所示,输出为对应的具有全部提示标注的分子,如图2(B→C)所示。...作者进行了两种实验分析,一种是对于断开感知任务,样本中包含全部的成分,另一种样本中排除了那些未映射的成分,结果显示,预测结果与ground truth相符的比例从14%提升至41%。...图4 断开模型的具体预测结果示例 3.3 自动标注补全模型 为了模拟用户的输入为一组不完整的标注提示,作者将标注进行排列组合,如图2B所示。并以此进行了三种实验。...实验表明模型具有79%的平均断开精度,在所有标记原子数量上平均往返精度为52%,证明了模型在酶促反应中的有效性。图8展示了断开感知模型在几个酶促反应上的预测示例。

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    分子克隆软件SnapGene下载安装,生物学分析软件SnapGene下载安装

    该软件拥有直观的图形用户界面、强大的序列编辑和分析功能、多样化的文件格式支持等特点,可以帮助生物科学研究人员高效地开展相关工作。...2.序列分析:用户可以选择需要进行的序列分析类型,如限制性酶切图谱、ORF预测等,然后在弹出的窗口中输入序列信息和参数,点击“运行”按钮即可完成分析。...4.质粒设计:用户可以根据需要选择不同的质粒设计工具,例如质粒拼接、克隆位点标签等,在工具界面中输入相应信息并选择相应的设置参数,然后点击“运行”按钮即可完成质粒设计。...5.根据PCR模拟结果调整反应参数,再次进行模拟,直到获得满意的PCR模拟结果。SnapGene总结本文综合介绍了SnapGene软件的特色功能和使用方法,并结合实例详细说明了具体的操作流程。...SnapGene软件是一款集序列编辑、分析、PCR模拟、质粒设计等功能于一体的生物信息学工具,能够帮助用户高效完成复杂的DNA序列分析工作。希望本文能为生物科学研究人员提供更好的参考和指导。

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    JCIM | 使用片段链接预测网络设计PROTAC药物

    作者提出了一种名为AIMLinker的深度神经网络,以快速设计和生成具有意义的药物样蛋白酶靶向嵌合体(PROTACs)类似物。该模型从输入片段中提取结构信息并生成连接器以将它们结合起来。...PROTACs是一种异功能的小分子,连接一个用于招募感兴趣的目标蛋白(POI)的配体和一个泛素蛋白连接酶(E3)的配体,并有一个适当的连接物来降解目标蛋白。...图2 结果 图3 表1 作者提供了生成分子的详细化学属性和结构统计信息。...最后,他们选取了具有最好化学属性的生成分子,通过分子动力学(MD)模拟和自由能摄动(FEP)模拟进行验证。...结论 作者提出了一种深度神经网络模型AIMLinker,用于生成和设计新的PROTACs分子并展示了生成分子的稳健性。这些生成的结构具有与现有晶体结构相当或更优的化学性质。

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    Science | 一种在哺乳动物细胞中实现的合成蛋白质级神经网络

    实验上,构建合成分类系统的努力已经取得了一些成果,例如在试管中实现了基于DNA或酶的分类器,以及在细胞中实现了基于microRNA(miRNA)或基因的分类器。...激活后,N节点与包含C端蛋白酶半体的C节点结合,形成功能性或非功能性蛋白酶,后者通过相互抑制机制发挥作用。所有节点蛋白共享相同的重组域,以确保类似的蛋白酶重组动力学。 该设计实现了输入的加权求和。...此外,每种功能性蛋白酶还能通过切割C节点的重组域,抑制其他类型的功能性蛋白酶。 这些设计特性共同实现了加权求和、相互抑制和自激活,从而支持胜者为王的分类行为。...同时,电路对输入时机的变化具有鲁棒性,晚24小时加入输入仍能产生相同的分类结果。 可扩展的分类能力 神经网络的关键特征在于其可扩展性。研究人员通过增加一个互相抑制的节点,将分类任务扩展为三种输出状态。...实验中,引入了HRV3C蛋白酶作为第三节点,并在稳定细胞系中实现了三类输入分类,结果与模拟预测一致。这证明了随着正交蛋白酶的增加,Perceptein网络可以扩展其分类能力。

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    Science背靠背|看完诺奖的氧感应通路,再来细看癌症中细胞感应氧气的新机制,缺氧对基因的功能有直接影响,并抑制细胞分化

    干细胞是未分化细胞的一个例子,其通常位于人体最贫氧的微环境(niches)中。现在,研究人员也证明了氧含量、组蛋白去甲基酶活性、基因功能和细胞分化之间的直接联系。...在环境正常氧条件下,HIF-1α(HIF异二聚体转录因子复合物的DNA结合成分)被泛素化并失活。...该过程是由吲哚羟化酶(PHD)的EglN家族对HIF-1α中的脯氨酸残基进行羟基化而发生,而脯氨酰羟化酶是2-氧代戊二酸和氧依懒性的双加氧酶,其能感知氧张力的生理变化并且在正常氧条件下被激活。...此外,在恶性肿瘤中发现了表观遗传调节因子的多个突变,并且观察到许多组蛋白甲基转移酶和KDM中存在功能丧失性突变,很有可能模拟了低氧环境。...目前正在癌症治疗和非恶性疾病如肾病的治疗中探索用小分子抑制剂靶向HIF途径。这些研究表明,如果可以确定这种传感的机械基础,那么KDM的氧传感也可能是治疗手段。

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    Insilico Medicine | 助力抗2019新型冠状病毒药物开发

    InsilicoMedicine将携手国际大型公开研究平台的各团队来完成分子的合成及筛查工作。...我们的团队将合成和测试其中的一些化合物” ---- 1 输入数据和数据集 2019-nCoV 3C样蛋白酶的晶体结构 _ 2019-nCoV 3C样蛋白酶的晶体结构是从Rao博士的实验室获得的。...然后,利用专有的口袋模块对结合位点进行注释,以创建适合作为基于靶标结构生成的输入数据的氨基酸残基图谱。...在生成阶段,总共28个机器学习(ML)模型用于生成分子结构,并通过采用如下所述的奖励函数的强化学习(RL)对其进行了优化。...药物相似性评分驱动着具有代表蛋白酶肽模拟物数据集的分子特性的分子的发展logP:1.49–6.00;分子量(MW):400–800;氢键供体(HBD)的数量:1-10;氢键受体数量(HBA):2-10;

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    德睿论文|Molecule Dance揭秘药物-蛋白质动态结合方式

    技术平台 该研究使用「德睿智药」Molecule Dance技术平台,其主要功能为蛋白质结构预测,以及微观尺度下的蛋白动态模拟。...据此,研究团队以SARS-CoV-2主蛋白酶(SCM)及其抑制剂为案例,开展了此项研究。既往该类型药物研究只提供了静态的结合模式,并未能捕捉到SCM与抑制剂之间相互作用的动态模拟。...五个显著的峰值展示了五种不同抑制剂结合后引起的主要残基构象变化,这些残基主要位于SCM底物结合位点的环状区域。蛋白酶结合位点的柔性环状区域对于识别不同的底物非常关键。...使用MM-GBSA和MM-PBSA计算所选SCM/抑制剂复合物的结合自由能的能量成分(kcal/mol) 在模拟的前20ns内,N3、NMV等抑制剂与蛋白质复合物的结合非常稳定。...研究人员还关注了能量成分之间微妙的相互作用,特别是离子相互作用在ESV结合中的重要性。尽管非共价动力学模拟不能完全解释共价抑制剂的行为,但对于进一步理解抑制剂的动态行为具有一定帮助。

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    mLife|华东师范大学张鲁嘉团队:高效的酶智能设计平台NAC4ED

    ,从而快速筛选出符合特定功能要求的酶突变体。...结合分子动力学模拟获得关键构象参数后,分析一定时间内的构象变化,确定该时间范围内活性构象的比例(图1C),通过分析活性构象群体,采用公式(1)评估致突变作用。...基于此生成新的酶突变体,针对突变体的构象优化模块利用分子动力学进行快速的侧链优化反应,准确描述酶构象变化对底物结合状态的影响(图3B)。...(B) 突变前后蛋白质的结构变化。(C) 进行分子对接模拟,以模拟蛋白质突变体与底物的相互作用。如果对接结果符合NAC的标准,则该过程进入MD模拟。(D) MD模拟模块。...通过模拟,分析突变体随时间变化的活性构象比,并计算其催化效率。

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    蛋白激酶磷酸酶 调控信号通路、细胞机制 | MedChemExpress

    蛋白激酶/磷酸酶与药物开发 前期,研发人员的思路是针对具有特定生理功能的蛋白激酶/磷酸酶开发出一系列的小分子药物。...TNO155 与 SHP2 的非活性结构域结合引起 SHP2 的构象变化、从而抑制 SHP2 的酶活性。 蛋白激酶/磷酸酶的种类繁多,调节细胞众多的生理过程。...TNO155 SHP2 的变构抑制剂,与 SHP2 非活性结构域结合引起 SHP2 的构象变化、从而抑制 SHP2 的酶活性。...aeruginosa 成分,可以有效的抑制碱性磷酸酶和丝氨酸/苏氨酸磷酸酶,用于维持蛋白的磷酸化状态。...Molybdate 和 Imidazole 成分,可以广谱的抑制酸性磷酸酶、碱性磷酸酶和蛋白酪氨酸磷酸酶。

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    . | 用DiffNets探究蛋白质生化性质的结构决定因素

    计算机模拟蛋白质的生化特性的关键一步是,用降维算法简化变种的复杂结构集;而常见的降维算法依赖于“哪个结构特征重要”的误导性假设,例如强调大的几何变化比小的几何变化更重要。...但目前的算法的实用性都受到假设不够普遍的限制。例如,主成分分析(PCA)假设大的结构变化比细微的结构变化更重要,而这种假设在很多蛋白质结构的降维中都无效。...比如在酶中,一个大环的任意运动带来的影响可能远远不及活性位点中功能相关的侧链的微小运动。本文探索了监督学习和降维算法相结合的思想。...本文示例中,输入是来自模拟帧的蛋白质XYZ坐标(C、CA、N、CB),这些坐标经过白化以进行规格化。...而他们之间的差别仅在于有无更强的氢键,所以两个状态的变化相对附近的大环变化来说是微小的,本文的DiffNet将学习分类这些状态。

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    ICML 2024 | SurfPro:基于连续表面的功能性蛋白质设计

    最终目标是设计具有特定功能的蛋白质,例如与特定底物结合的酶或抑制特定靶标的蛋白质。逆折叠方法的局限在于它仅通过给定的骨架结构来规定几何约束。...具体来说,作者通过主成分分析(PCA)从压缩后的点云X’计算出三个主成分v1, v2, v3。利用这三个主成分,定义了一个框架(式4),其中t是点云X’的质心。...式 4 frame函数形成八个变换的代数群。作者利用式5计算全局消息传递。其中,是局部视角建模输出的顶点特征。代表用t平移X’并用旋转矩阵[α1v1, α2v2, α3v3]旋转X′。...因此,即使没有专门针对特定目标进行结合体蛋白的训练,SurfPro也能在这些类别中生成pAE相互作用低于正结合体的结合体。在整个PDB上预训练后,贪婪解码生成的结合体功能变化不大。...这些发现表明,作者的SurfPro能够设计出与实际酶相比具有更强酶-底物相互作用功能的酶,再次验证了表面特性对于功能性蛋白质设计的帮助。

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    JCIM|用晶体学药物片段筛选结合COLAV方法,高效捕捉蛋白质的构象多样性

    蛋白质是动态的巨分子,其构象多样性直接影响其功能。传统的蛋白质研究多集中于其单一静态结构,但蛋白质的实际功能依赖于构象间的转换及其动态特性。...研究通过分析两种具有重要医学价值的蛋白:蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)和SARS-CoV-2主蛋白酶(MPro),展示了如何利用药物片段筛选构建蛋白的构象景观,从而揭示靶点新的药物设计机会。...引言:蛋白动态与药物设计的融合 图1:示意图 2. 研究背景与挑战 2.1 蛋白构象景观的重要性 蛋白质功能的实现依赖于其动态的构象变化,例如配体结合、活性调控等。...研究方法与技术实现 3.1 COLAV工具的核心功能 COLAV工具通过三种结构表示法表征蛋白的构象变化: 主链二面角,捕捉局部主链的动态变化。 Cα原子间的成对距离,反映蛋白整体的全局动态。...这些表示法通过主成分分析(PCA)或其他降维技术(如t-SNE和UMAP),将蛋白的高维构象数据映射到低维空间,从而清晰地展现其构象分布及动态转变路径。

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    【Cancer Cell】生物分子凝聚体与肿瘤(完整版)

    凝结体是无膜的团体,通常由液液相分离形成,将具有相关功能的蛋白质和RNA分子隔离开来。来自凝结体研究的新见解预示着我们对癌症细胞失调机制的理解将发生深刻的变化。...肿瘤组蛋白H3K36M在软骨母细胞瘤中反复出现,并驱动肉瘤的发展,它抑制组蛋白甲基转移酶的活性,并导致全基因表达的全局性变化。...不同的致癌易位将IDR与DNA结合结构域融合,无序区域促进转录凝集体形成的能力可能有助于这些融合致癌转录因子的致癌功能。 调控变化 任何包含在凝结物中的分子浓度的变化可能会改变该凝结物的行为。...对癌症中失控的代谢过程的进一步见解几乎肯定会来自信号、转录和酶凝缩的研究。 癌细胞与细胞间相互作用的变化是肿瘤微环境的一个特征,也是肿瘤细胞转移性状态的特征。...此外,一些药物似乎能够选择性地破坏凝结体,为模拟对疾病病理学有贡献的小室提供了机会。此外,抑制后翻译修饰酶的药物可以影响凝结体的行为,并可能被利用来改变聚集在凝结体中的致癌活性。

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    生化小课 | 酶促进了化学反应通路

    酶通过提供更舒适的过渡状态来催化反应:一个在立体化学、极性和电荷方面与过渡态互补的表面。酶与过渡态的结合是放能的,这种结合释放的能量降低了反应的活化能,大大提高了反应速率。...同样,除了少数例外,每种酶都催化一个特定的反应,而细胞中的每一个反应都是由不同的酶催化的。因此,每个细胞需要数千种不同的酶。...细胞中数以千计的酶催化化学反应在功能上被组织成许多连续反应序列,称为通路(pathways),其中一个反应的产物成为下一个反应的反应物。...其他途径从小的前体分子开始,并逐渐将其转化为更大、更复杂的分子,包括蛋白质和核酸。这种合成途径总是需要能量的输入,统称为合成代谢(anabolism)。...ATP(以及其他能量等效的核苷三磷酸盐)是该网络分解代谢和合成代谢成分之间的连接纽带(如图1-28所示)。作用于细胞主要成分(蛋白质、脂肪、糖和核酸)的酶催化反应途径在所有生物体中几乎是相同的。

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    Nat Rev Drug Discov|调控生物分子凝聚物:一种新的药物治疗方法

    这些材料特性与凝聚物的组成和生物功能相关,可以通过环境的变化或活跃的生物过程进行动态调控。例如,液态的特性使应力颗粒能够随着条件的变化而迅速组装和拆卸。 凝聚物提供了一个独特环境。...凝聚物内的环境通过分隔参与相关生物过程的成分来调节酶的反应。这种独特的环境可以调节以下一个或多个参数:成分的扩散、底物的富集和/或抑制剂的耗尽。...b | 用c-mod调节凝聚物新特性的策略,在文中有详细描述。这些策略可以单独使用,也可以组合使用,任何一种策略都可以影响凝聚物的多种特性。...调控凝聚物的组成 凝聚物成分的变化可以影响许多特征,从材料特性(例如,粘度和表面张力),到动力学和对环境刺激的反应能力(例如,持久性和老化),到单个成分的酶活性。...调节凝聚物的调节过程 诸如伴侣蛋白和螺旋酶等酶在调节凝聚物环境方面可以发挥关键作用。

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    基于生成式深度学习方法设计潜在2019-nCoV蛋白酶抑制剂

    1 输入数据和数据集 2019-nCoV 3C样蛋白酶的晶体结构 _ 2019-nCoV 3C样蛋白酶的晶体结构是从Rao博士的实验室获得的。...然后,利用专有的口袋模块对结合位点进行注释,以创建适合作为基于靶标结构生成的输入数据的氨基酸残基图谱。...蛋白酶数据集 _ 从Integrity数据库、实验药理模块和ChEMBL数据库中提取酶法测定的蛋白酶数据集与对各种蛋白酶具有活性的分子合并在一起。...在生成阶段,总共28个机器学习(ML)模型用于生成分子结构,并通过采用如下所述的奖励函数的强化学习(RL)对其进行了优化。...药物相似性评分驱动着具有代表蛋白酶肽模拟物数据集的分子特性的分子的发展logP:1.49–6.00;分子量(MW):400–800;氢键供体(HBD)的数量:1-10;氢键受体数量(HBA):2-10;

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    领券