一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 带图例的堆叠柱状图2.4 带图例的分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图...") #可自行更换颜色图片2.2 水平柱状图barplot(values,horiz = TRUE) #翻转图片2.3 带图例的堆叠柱状图#构建数据data frame...作图#下载和加载包install.packages("ggplot2") library("ggplot2") #构建数据框group frame...")图片2.6 plotly作图#下载和加载包install.packages("plotly") library("plotly") #绘图plot_ly...table(c(as.vector(rt[,1]),as.vector(rt[,2]))) #统计rt1=sort(rt1,decreasing =T) #排序#计算节点交叉个数out=as.data.frame
Highcharts是一个制作图表的纯Javascript类库，支持大部分的图表类型：直线图，曲线图、区域图、区域曲线图、柱状图、饼状图、散布图等。在rCharts包中提供了hPlot函数来实现。...plotly包 接下来要给大家介绍的是另一个功能强大的plotly包。它是一个基于浏览器的交互式图表库，它建立在开源的JavaScript图表库plotly.js之上。...如果想绘制交互箱线图，需要将type参数设置为box。...如果你已熟悉ggplot2的绘图系统，也可以针对ggplot2绘制的对象p，利用ggplotly函数实现交互效果。...例如我们想对ggplot绘制的密度图实现交互效果，执行以下代码即可： library(plotly) p ggplot(data=lattice::singer,aes(x=height,fill
虽然用 matplotlib 可以很方便的得到数据的大致信息，但是如果要更快捷简单地制作可供发表的图表就不那么容易了。...由于Seaborn是构建在matplotlib的基础上的，你需要了解matplotlib从而来调整Seaborn的默认参数。...基于R的一个作图包 ggplot2, 同时利用了源于 《图像语法》（The Grammar of Graphics）中的概念。...虽然《图像语法》得到了“接近思维过程”的作图方法的好评，但是习惯了matplotlib的用户可能需要一些时间来适应这个新思维方式。...由于所有的图表都被封装成了方法，而且默认的风格也很漂亮，用几行代码就可以很容易地制作出漂亮的图表。
虽然用matplotlib可以很方便的得到数据的大致信息，但是如果要更快捷简单地制作可供发表的图表就不那么容易了。...由于Seaborn是构建在matplotlib的基础上的，你需要了解matplotlib从而来调整Seaborn的默认参数。...基于R的一个作图包 ggplot2, 同时利用了源于 《图像语法》（The Grammar of Graphics）中的概念。...虽然《图像语法》得到了“接近思维过程”的作图方法的好评，但是习惯了matplotlib的用户可能需要一些时间来适应这个新思维方式。...由于所有的图表都被封装成了方法，而且默认的风格也很漂亮，用几行代码就可以很容易地制作出漂亮的图表。
而这里提到的plotly包就是该机构专门针对R语言环境发布的可视化包（具有不仅R语言，给MATLAB和Python都留有接口），不但可以协助ggplot2包将静态图表动态化，而且拥有自己独特的作图函数语法...今天只涉及ggplot结合plotly而动态化图表的功能，暂不涉及plotly的独有作图函数。（主要是自己也正摸索中，找个合适的时间再跟大家分享）。...包下载及加载： devtools::install_github("ropensci/plotly") library("plotly") library(ggplot2) 这里我将使用ggplot2的内置数据集...更加不可思议的是，当你用鼠标单击右侧图例对应分类项，则图表中会对应只显示选中的分类项目数据点； 右上角的菜单中你可以自由选择将图表聚焦呈现、放大缩小、保存为图片等多种功能。 ?...下面是我录制的一个动态小视频，可以感受下plotly带给ggplot的动态交互体验： ?
本篇将主要介绍 ggplot2 包及函数的用法以及它的拓展（ gganimate 和 plotly 包）。 1....包的颜色(Garnier 2018)； 可用 scale_*_manual() 手动定义我们自己的颜色集，此函数有一个逻辑参数叫 drop ，用来决定是否在尺度中保留不常用的因子水平； 连续变量的颜色刻度可以用...下图是用 viridis 包中的 scale_*_distiller() 函数和 ggplot() 函数绘制的 1974 年北卡罗来纳州婴儿猝死的地图： 例子 ： library(viridis) map...图像保存 要保存用 ggplot2 绘制的图，我们可以使用 ggsave() 函数。...}") 用 gapminder 数据集创建的动画 将数据点作为背景： 加入参数shadow_mark(alpha = 0.3, size = 0.5)，使得数据点作为动画演示的背景。
Seaborn是在matplotlib的基础上进行了更高级的API封装，从而使得作图更加容易，在大多数情况下使用seaborn能做出很具有吸引力的图，而使用matplotlib就能制作具有更多特色的图。...它的构建是为了用最少的代码快速绘制专业又美观的图表。 ggplot与python中的pandas有着共生关系。如果打算使用ggplot，最好将数据保存在DataFrames中。...唯一不足的是它是一个底层构建工具，所有的多边形映射都需要手动构造循环（目前还没有发现比较好用的基于basemap的扩展工具），作图效率与速度上自然无法媲美R语言的ggplot2(缺少一套健全的顶层语法支撑...DataFrame是一种整洁的格式，其中的行与样本相对应，而列与观察到的变量相对应。数据通过数据转换映射到使用组的视觉属性(位置、颜色、大小、形状、面板等)。...plotly Plotly Express 是一个新的高级 Python 可视化库。 它是 Plotly.py 的高级封装，它为复杂的图表提供了一个简单的语法。
Plotly是个交互式可视化的第三方库，可以实现R语言的交互可视化，用法与ggplot差不多，默认的颜色比ggplot好看很多，本文简单介绍一下Plotly的应用。...首先安装并运行包 install.packages("plotly") # 载入ggplot2包 library(plotly) 主要参数： plot_ly(data = data.frame(),...主要通过type来控制是画boxplot,barplot，scatter plot还是其他； name:Values mapped to the trace's name attribute.即选中处追加的名字...Boxplot library(plotly) fig <- plot_ly(iris, x = ~Petal.Length, color = ~Species, type = "box") fig...image.png lineplot x <- c(1:100) random_y <- rnorm(100, mean = 0) data frame(x, random_y) fig
ggplot2是R语言最为强大的作图软件包，有着自成一派的可视化理念，数据可视化是数据分析的重要一步，让我们通过由浅入深的掌握数据可视化的精髓。...x或y的截距就可以了，可以作为一个简单的参数传给geom_hline或geom_vline，但是画点涉及到的是一些x、y的数据值，ggplot是把数据和作图撇清的，也就是数据是数据，成像是成像 我们先来构造点...： > ggplot(data, aes(x = x, y = y)) + geom_point() 前面是声明数据部分，后面是声明怎么成像 下面我们开始调整geom_point的参数，比如展示不同的颜色...= 1/5) 如果我们想按照不同的y值来分开画密度图，并且用不同颜色来表示不同的y值，那么我们可以用描边的方式(左)，也可以用填充的方式(中)，当然也可以两者结合 > ggplot(data, aes...作图原理以及基本的几种作图方式，基于这些知识相信你很容易能做出精美的图像了 来源：SharEDITor
所以我觉得这一篇推送很有必要，确实在最新版的ggplot2（ggplot 2.2.0以上版本）中，已经加入了次坐标轴参数，通过这个次坐标轴的转换，我们可以模拟出不同数量级的次坐标轴效果。...) 生成作图数据 作图数据1——单序列柱形图 data1 frame( Month = seq(from = as.Date('2017-01-01'),to=as.Date...，这里不做过多解释，仅提示其中两处重点，注意第二行geom_line内的y参数赋值以及第四行的scale_y_continuous语句： ggplot() + geom_col( data = data1...不过这次映射的过程刚好是相反的操作，即将之前已经被标准化到0~50区间内的原始度量标签通过rescale函数再次标准化到0~0.5区间内，这样保障显示在次坐标轴上的度量是符合原始数据极差范围呢。...说的有些拗口了，实际上以上过程思路很简单，就是先将数据映射到正确的位置，然后将词作败欧洲刻度线再按照真实极差进行分布，一虚一实，正好达到了模拟效果。
全文并非是对数据整理的实操整理,主要整理在数据整理/清洗中常用的R包介绍 library(tidyr) library(dplyr) library(stringr) library(tibble) 1...中的第一列 ggplot2对行名并不友好，通常要使样本名转化为data.frame中的第一列，防止在后续代码运行过程中行名丢失 图片 图片 step2 把原来的行名转变为第一列 图片 step3 宽变长...：test、gene、count数均在一行上（将上图的宽数据变为长数据） 图片 6.2实操代码 6.2.1 如何生成一个matrix set.seed(10086) #设置种子数使随机生成的数固定 exp...names_to = "gene", values_to = "count") 6.2.3 作图 library(ggplot2) p =...（facet）详解 7.一些实操中的便捷函数 7.1 match() 函数 load("matchtest.Rdata") x y ## 把y的列名正确替换为x里面的ID的方法 ## (1)分步解法
安装与使用 安装非常简单，使用pip命令即可 使用的时候，导入import之后一般是用px别名 pip install plotly_express # 安装 import plotly_express...散点图 散点图是最简单的图形，有两个属性即可作图。...参数详解 以散点图为例，对绘制的参数进行解释 定义 def scatter(data_frame, x=None, y=None, color=None, symbol=None, size=None,...列中的值用于在负方向调整 Y 轴误差线的大小，如果参数error_y==None，则直接忽略该参数； animation_frame：指定列名。...（以像素为单位）； 其他作图方法的作图参数类似 参考资料 px真的是见过最好的可视化神器，特别是结合dash的在线功能，学习?
具体可参见如下(点击查看) 4W字，最强 Matplotlib 实操指南！...人们已经在 Python 中实现了 ggplot2，复制了这个包从美化到语法的一切内容。...ggplot2（我觉得也包括 Python 的 ggplot）举足轻重的原因是它们用「图形语法」来构建图片。...但下面的图展示了 Plotly 的潜力，以及我为什么要在它身上花好几个小时： Plotly 页面上的一些示例图 Pygal Pygal 的名气就不那么大了，和其它常用的绘图包一样，它也是用图形框架语法来构建图像的...有很多数据可视化的包，但没法说哪个是最好的。希望阅读本文后，你可以了解到在不同的情境下，该如何使用不同的美化工具和代码。
Photo by Andreea Chidu on Unsplash 当我们的爬虫程序已经完成使命，帮我们抓取大量的数据。你内心也许会空落落的。或许你会疑惑，自己抓取这些数据有啥用？...Seaborn Seaborn 是一个基于 Matplotlib 的高级可视化效果库， 偏向于统计作图。因此，针对的点主要是数据挖掘和机器学习中的变量特征选取。...ggplot ggplot 是 yhat 大神基于 R 语言的 ggplot2 制作的 python 版本库。 如果你使用 R 语言的话，ggplot2 可以算是必不可少的工具。...不过可惜的是，yhat 大神已经停止维护该库了。 Plotly Plotly 也是一个做可视化交互的库。它不仅支持 Python 还支持 R 语言。...Plotly 的优点是能提供 WEB 在线交互，配色也真心好看。如果你是一名数据分析师，Plotly 强大的交互功能能助你一臂之力完成展示。
安装与使用 安装非常简单，使用pip命令即可 使用的时候，导入import之后一般是用px别名 pip install plotly_express # 安装 import plotly_express...，有两个属性即可作图。...") [007S8ZIlgy1gfmi6pp02nj30jg0go0tr.jpg] 参数详解 以散点图为例，对绘制的参数进行解释 定义 def scatter(data_frame, x=None, y...列中的值用于在负方向调整 Y 轴误差线的大小，如果参数error_y==None，则直接忽略该参数； animation_frame：指定列名。...（以像素为单位）； 其他作图方法的作图参数类似 参考资料 可视化神器plotly_express详解 API详解 Plotly_express in python
作图是用groups做x轴，type填充颜色，每个group分为A，B两组 作图的时候和普通的箱线图小提琴图是一样的 代码 ggplot(data = df, aes(x = groups, y =...image.png 箱线图的宽度有点大，盖住了背后的小提琴图，把宽度设置的小一点，需要加width参数 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value, fill...image.png 这样的话两个箱子靠到了一起，没有和小提琴图的位置完全对上，这个时候需要设置position参数 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value...image.png 这样就好了，上图每组的小提琴图之间的距离好像有点大，这个也可以用position这个参数调节 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value,...欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 另外还遇到一个问题是 R语言ggplot2作图如果文字标签包含罗马数字，如何输出pdf呢？
这意味着现有的包几乎足以解决所有你能想象到的数据可视化任务，从癌症基因组可视化到图书的可视化分析。...1.名称：ggplot2包 简介：将绘图与数据分离，按图层作图，一个语句代表了一张图；将常见的统计融入了绘图中。...7.名称：Plotly 简介：Plotly更多是因为其在线绘图工具的属性为人所知，比如GEPIA网站中一个热图的可视化就用到了plotly的外接，但其实他也是一个可视化R包。...10.名称：pheatmap 简介：pheatmap是目前用的到做多的绘制热图的一个R包，他可以通过一个矩阵和一个legend配置文件轻松完成热图绘制.对于入门级的朋友非常友好。...23.推荐：ggfortify 简介：最开始在初学R的时候，一开始就知道如果要表达时间序列可以用最基本的ggplot2来实现。但是接触了ggfortify你就能打开人生的新天地，找到人生的新世界。
用的R包和数据 ggplot2，是这本书的作者之一Hadley Wickham开发的，包括tidyverse，他也是rstudio的首席科学家；ggplot2是个作图功能很强大的R包，底层是Wilkinson...mpg data frame，这个数据框是ggplot2包自带的，数据框是R中的一种数据结构，其每一列是一个变量，每一行是一个观测。...在上面这张图的代码中，首先使用了ggplot()这个函数，它的功能是创建一个空白坐标系，其xy轴可以通过后续图层添加，它的第一个参数是作图用的数据，用ggplot(data = mpg)就会生成如下图片...参数，需要使用函数aes()来传递参数给mapping，aes()中需指定x和y参数代表了数据中的哪个变量，如mapping = aes(x = displ, y = hwy)，geom函数会继承在ggplot...用其他变量作图，直接套模板即可 ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = cyl, y = hwy)) image.png 4.
本文中介绍了几种常见的利用plotly_express作图方法的参数 scatter scatter_geo line line_polar area bar bar_polar violin histogram...列中的值用于在负方向调整 Y 轴误差线的大小，如果参数error_y==None，则直接忽略该参数； animation_frame：指定列名。...其优先级高，会覆盖color_discrete_sequence参数中的设置； color_continuous_scale：有效的CSS颜色字符串列表，取自plotly_express的color子模块...有三个内置的 Plotly 主题： plotly， plotly_white 和 plotly_dark； width：整数，默认无，设置图表的宽度（以像素为单位）； height：整数，默认600，设置图表的高度...（以像素为单位）； 其他作图方法的作图参数类似
，用的是X1-X12, 因为变量全名过长，仅用作标签。...第1-10行，创建绘图函数参数是列名； 第2行，获取该列的离群值； 第3行，为后续作图时的x轴名称赋值； 第4-5行，绘制密度曲线图，请注意string_aes是专门用于批量出图的功能； 第6-8行，用判断语句对没有离群值的列进行处理...来了 一般而言，ggplot2属于学院派，安静而严密，而plotly对比而言，表现出明显的动态特征，使可视化感染力倍增。...7.1 与ggplot2的衔接 ggplotly函数可将ggplot2的图转化为plotly ggplotly(infection_ggplot, message=FALSE) 7.2 直方图与离群值...在这里我们把上边第五题的内容，用shiny展示一下：用选择框来动态选择出图。最后你会发现，一点都不难。
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