欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制哑铃图并通过线段的连接来进行趋势变化展示,数据无实际意义仅作图形展示用,希望各位观众老爷能够喜欢。
哑铃图(Dumbbell Chart),也叫DNA图。当我们想要比较不同指标不同组的情况可用多个“哑铃”表示。另外,如果想表示某一组在不同条件下的变化情况也可以用这种方法。哑铃图如下图所示: ?...在R中实现可以考虑用ggalt这个包(基于ggplot2)。...yend=Area), color="#b2b2b2", size=1.5)+ # 设置哑铃的两端点的颜色和大小...最后加上 coord_flip() 可以将图片翻转为竖着的哑铃图。
❝本节来分享一个绘制哑铃图的小教程,里面细节满满;各位观众老爷细细品味,下面来看具体案例 ❞ 导入数据 read_tsv("data.xls") %>% distinct(country_name
1绘制 ggplot(mydata) + + geom_bar(aes(x=a, y=b),width = 1,stat="identity", + colour = "black...(size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图
本文利用R语言的ggplot2包,从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。...一 载入数据集和R包 library(ggplot2) pathway = read.csv("KEGG.csv",header=TRUE,check.names = FALSE) head(pathway...二 绘制KEGG气泡图 2.1初始化数据并绘制散点图 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY)) + geom_point() ?...四 参考资料 ggplot2:数据分析与图形艺术 好了,更换成自己的数据集即可以自己动手绘制KEGG通路气泡图了。
>% arrange(-age) %>% mutate(g_rank = row_number(), name = fct_reorder(name, age)) %>% ungroup() 绘制一个基础图
计算Bonferroni校正后的显著性阈值。这是通过将0.05除以GWAS数据中的行数(即测试的总数)来实现的,用于调整多重比较的影响。
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制嵌套圆形图,图形绘制倒也简单主要是细节的调整结果仅供参考❞ 加载R包 library(tidyverse) 导入数据 bytes_total <- read_csv
在找资料的时候偶然发现的这个图,这个图来源于论文 Russian periphery is dying in movement: a cohort assessment of internal youth...gist.github.com/ikashnitsky/2f3e2b2af6f50911bb775bbce6eb0fb8 https://ikashnitsky.github.io/2019/dotplot/ 感觉这个图很漂亮...,数据代码还是公开的,所以我们来重复一下 这个图横坐标是 变化率,纵坐标是地区,每一个纵坐标对应的是两个 1980-84 1988-92 变量,其中每一个对应的是实心点和空心点,census和stat...record 这个图目前还想不到如何应用于我自己的数据,可以用来表示比较摸某一个数值,比如处理和对照 前面整理数据的代码这里就不介绍了,大家感兴趣可以自己运行试试,研究一下每行代码的作用 library...row.names = F) 最终用到的画图数据 df_plot_1<-read.csv("20210822.csv") head(df_plot_1) image.png 画图代码 library(ggplot2
❝本节来复现nature cell biology上的一张热图,通过一系列数据清洗来介绍图形细节的调整,整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。...margin = margin(b=3)), plot.margin=unit(c(0.2,0.2,0.2,0.2),units=,"cm")) 复现图
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制渐变图形,下面小编使用palmerpenguins包内置的企鹅数据集来进行展示仅作图形展示用,希望各位观众老爷能够喜欢。...= 'NA', slab_fill=NA, slab_colour='#3e2c12', slab_size=0.4) + # 添加箱型图,...设置宽度和异常值形状 geom_boxplot(width = .15,outlier.shape = NA,fill='#fafafa') + # 添加半点图,设置透明度和大小 geom_half_point
本节分享一个小案例,如何使用ggplot2中的「stat_smooth」函数来快速绘制残差图。 ❝残差图是一种用于回归分析的图形工具,它显示了模型的预测值与实际观测值之间的差异,即残差。...❞ 「残差图的主要目的是:」 「检查线性回归模型的假设」:线性回归模型有几个关键的假设,如误差项的独立性、常数方差(同方差性)和误差项的正态性。残差图可以帮助我们检查这些假设是否得到满足。...「检查模型的拟合情况」:如果残差图显示出某种模式或趋势,而不是随机分布的点,这可能意味着模型没有充分捕捉到数据中的某些信息或关系。...常见的残差图有: 「基本残差图」:y轴表示残差,x轴表示预测值或观测值。 「标准化残差图」:y轴表示标准化残差,x轴表示预测值。 「QQ图」:用于检查残差的正态分布假设。...「Scale-Location图」:用于检查同方差性的假设。
.), outlier.shape = NA, width=0.5) + # 绘制箱线图的主体部分 stat_boxplot(geom = "errorbar", aes(ymin = ..ymax.....), width=0.2, size=0.35) + # 绘制箱线图的上边缘 stat_boxplot(geom = "errorbar", aes(ymax = ..ymin..), width...=0.2, size=0.35) + # 绘制箱线图的下边缘 geom_boxplot_pattern(aes(pattern_type=year, fill=year), # 应用图案填充
❝本节来绘制一个简单的绘图案例;暂且称之为轨道图;下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图;关于此图的实践应用以后在做介绍 加载R包 library(tidyverse) library(systemfonts
❝本节来介绍如何对常见的柱状图稍加改造绘制成一张美观的面积图,下面通过一个小例子来进行展示; 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <-...year, y = mean_probability, fill = legend_text)) + geom_area(alpha = 0.95)+ # 也可使用 geom_col()来绘制条形图
欢迎关注R语言数据分析指南 案例图 仿图 绘图思路 ❝此图用R绘制难点有两处 (1)在于绘制连接处并进行渐变色填充 (2)绘制独立的甜甜圈图进行拼图 目前ggplot2 3.5已经能指定为图形进行渐变色填充...,那么连接处我们可以当做是旭日图的第三圈并独立对其进行渐变颜色填充,至于拼图个人建议还是AI编辑器实现更为简便。...❞ 有需要学习数据可视化的朋友,欢迎到小编的「淘宝店铺」 「R语言数据分析指南」下单购买,内容主要包括各种「高分论文的图表分析复现以及一些个性化图表的绘制」均包含数据+代码。...markdown注释文档+文档清单」 library(tidyverse) library(geomtextpath) library(ggnewscale) load("da.Rdata") # 加载数据 绘制旭日图...element_blank(), panel.background =element_blank(), plot.background=element_blank()) 绘制甜甜圈图
❝本节来介绍如何使用分面来绘制热图并填充特殊字符,下面通过一个小例子来进行展示; 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) library(ggforce) 数据清洗
这篇是生信技能树的一个学徒作业:小队列的肿瘤外显子临床预后意义 主要学习的图是这几个: 突变全景图 fig2a fig2c 读取数据 附件下载地址:https://ehoonline.biomedcentral.com...Function" "Transcript" "ExIn_ID" "Cosmic ID" "Vary Type" ## [11] "caseAF" Fig2a Fig2a其实就是突变全景图的右边条形图部分...element_line(color = "black",size = 1.1) ) fig2a Fig1 最开始想用complexheatmap画,但是发现是长数据,可以直接用ggplot2...=NULL)+ theme(axis.text.x = element_blank(), axis.ticks = element_blank() ) p1 热图部分...fig2c 可以用trackviewer画,但是我还不会。。只能偷个懒用maftools画。 这个附件也不像常见的几个软件的结果,应该是作者修改过的,所以也没办法直接用技能树的方法转换为maf。
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