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不同GSE数据不同临床信息,不同分组技巧

最近,我发现学徒在学习GEO数据挖掘过程中,遇到了第一个也是至关重要一个难题就是对下载后数据进行合适分组,因为只有对样本进行合适分组,才有可能得到我们想要信息。...但是不同GSE数据不同临床信息,那么我们应该挑选合适临床信息来进行分组呢?...这里面涉及到两个问题,首先是能否看懂数据配套文章,从而达到正确生物学意义分组,其次能否通过R代码实现这个分组。同样我也是安排学徒完成了部分任务并且总结出来了!..., GSE31056 and GSE78060三个数据 这里主要说一下GSE31056这一个数据,需要一定背景知识与细心才能正常分组,原文里 ?...,在不同情况下选取最合适当下方法,方便自己去做后续数据分析。

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pandas 入门 1 :数据创建和绘制

创建数据- 首先创建自己数据进行分析。这可以防止阅读本教程用户下载任何文件以复制下面的结果。...我们将此数据导出到文本文件,以便您可以获得一些从csv文件中提取数据经验 获取数据- 学习如何读取csv文件。数据包括婴儿姓名和1880年出生婴儿姓名数量。...我们基本上完成了数据创建。现在将使用pandas库将此数据导出到csv文件中。 df将是一个 DataFrame对象。...此时名称列无关紧要,因为它很可能只是由字母数字字符串(婴儿名称)组成。本专栏中可能存在不良数据,但在此分析我们不会担心这一点。在出生栏应该只包含代表出生在一个特定年份具有特定名称婴儿数目的整数。...与该表一起,最终用户清楚地了解Mel是数据集中最受欢迎婴儿名称。plot()是一个方便属性,pandas可以让您轻松地在数据框中绘制数据。我们学习了如何在上一节中找到Births列最大值。

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20个小技巧,让数据可视化图表更专业!

2、根据正负值选择合适绘图方向 绘制水平条形图,在Y轴左侧绘制负值,在Y轴右侧绘制正值,不要把正负值绘制到轴同一侧。 垂直柱状图同理。 3、从0基线开始绘制柱状图 截断Y轴会导致表达失真。...直接在图表上标记对所有查看者都非常有帮助,因为一目了然,更节省时间。 查看图例需要花费很多时间,一般观众不会仔细去对比图例和图表颜色。...分配颜色应该是不同,以确保可读性。 顺序调色板最适合需要按特定顺序放置数字变量。使用色调或亮度或两者组合,可以创建一个连续颜色。...16、选择无障碍颜色设计 研究数据表明,大约每 12 个人中就有 1 人是色盲。图表只有在广泛受众可以访问,才能最大化它价值。...所以在配色注意以下几个方面: 在调色板中使用不同饱和度和亮度 以黑白打印数据可视化图表以检查对比度和可读性 17、时刻注意易读性 确保排版准确传达信息,并帮助用户专注于数据,而不是分散注意力。

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可视化图表样式使用大全

适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。 点数图 ?...堆叠式条形图 ? 跟多组条形图不同,堆叠式条形图 (Stacked Bar Graph) 将多个数据条形彼此重迭显示,适合用来显示大型类别如何细分为较小类别,以及每部分与总量有什么关系。...我们在地图上每个区域以不同深浅度颜色表示数据变量,例如从一种颜色渐变成另一种颜色、单色调渐进、从透明到不透明、从光到暗,甚至动用整个色谱。 但缺点是无法准确读取或比较地图中数值。...在绘制记数符号图表,将类别、数值或间隔放置在同一个轴或列(通常为 Y 轴或左侧第一列)上。每当出现数值,在相应列或行中添加记数符号。...每个都是一组具有共同之处物件或数据,当多个圆圈()相互重迭,称为交集 (intersection),里面的数据同时具有重迭集中所有属性。

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常用60类图表使用场景、制作工具推荐!

适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...堆叠式条形图 跟多组条形图不同,堆叠式条形图 (Stacked Bar Graph) 将多个数据条形彼此重迭显示,适合用来显示大型类别如何细分为较小类别,以及每部分与总量有什么关系。...每个线对应于一个维度/数据,其数值/类别由该线不同线段所表示。每条线宽度和流程路径,均由类别总数比例份数所决定。每条流程路径都可以用不同颜色代表,以显示和比较不同类别之间分布。...我们在地图上每个区域以不同深浅度颜色表示数据变量,例如从一种颜色渐变成另一种颜色、单色调渐进、从透明到不透明、从光到暗,甚至动用整个色谱。 但缺点是无法准确读取或比较地图中数值。...每个都是一组具有共同之处物件或数据,当多个圆圈()相互重迭,称为交集 (intersection),里面的数据同时具有重迭集中所有属性。

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R语言入门之点图和条形图

除此以外,groups参数可以对x进行分组,gcolor指定各个组颜色,而cex则可以控制标签尺寸。在这里我们仍将使用R内置mtcars数据来演示。...从这个这个简单条形图中我们可以看到不同挡数汽车数目,也即车型在挡数上分布,3挡汽车类型最多。...1.3 绘制堆积条形图 # 绘制带有颜色和标签堆积条形图 counts <- table(mtcars$vs, mtcars$gear) # 这里返回counts是一个矩阵,行代表是vs,它代表汽车发动机类型...因此上述条形图生动展示出不同挡数汽车数目,并揭示各个挡数内发动机类型占比情况。...这里设置beside=T,则将前一张图中每一条带拆成两部分水平放置,效果其实是相似的。 注意事项 1. 条形图绘制不必非得是计数或者频数类数据

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52个数据可视化图表鉴赏

4.条形图 条形图是一种用矩形表示分组数据图表,矩形条长度与其表示值成比例。可以垂直或水平绘制条形图。垂直条形图有时也称为折线图。图表一个轴显示要比较特定类别,另一个轴表示离散值。...37.圆型条形图 圆型条形图只是在极坐标系上绘制条形图,而不是在笛卡尔坐标系上绘制条形图。虽然看起来很酷,但圆型条形图问题是条形长度可能会被误解。...散点图通常用于比较跨类别的聚合数据。 42.分段条形图 当两个或多个数据并排绘制并分组在同一轴上类别下,可以使用如图条形图这种变化。...与条形图一样,每个条形图长度用于显示类别之间离散数值比较。每个数据系列都指定了一种单独颜色或同一颜色不同阴影,以便区分它们。然后将每组钢筋彼此隔开。...它使用多个视图来显示数据不同分区。Edward Tufte推广了这个概念。 45.跨度图 用于显示最小值和最大值之间数据范围跨度图。它非常适合比较范围,通常是分类范围。

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60 种常用可视化图表,该怎么用?

适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...堆叠式条形图 跟多组条形图不同,堆叠式条形图 (Stacked Bar Graph) 将多个数据条形彼此重迭显示,适合用来显示大型类别如何细分为较小类别,以及每部分与总量有什么关系。...每个线对应于一个维度/数据,其数值/类别由该线不同线段所表示。每条线宽度和流程路径,均由类别总数比例份数所决定。每条流程路径都可以用不同颜色代表,以显示和比较不同类别之间分布。...我们在地图上每个区域以不同深浅度颜色表示数据变量,例如从一种颜色渐变成另一种颜色、单色调渐进、从透明到不透明、从光到暗,甚至动用整个色谱。 但缺点是无法准确读取或比较地图中数值。...每个都是一组具有共同之处物件或数据,当多个圆圈()相互重迭,称为交集 (intersection),里面的数据同时具有重迭集中所有属性。

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图表(Chart & Graph)你真的用对了吗?

y轴起始为0,可以显示各柱状数值。 2)条形图 条形图基本上是水平柱形图,可以用于避免在超过10个项目进行比较产生杂乱。这种图表类型也可用于显示负数。...3)线形图 线形图展示了数据随时间变换趋势,可用于显示许多不同类别的数据。需要绘制连续数据,很适合使用这种图表类型。 设计线形图最佳做法: 使用实线绘制。...为两个数据使用对比色。 5)面积图 面积图基本上是一条线图,但X轴和线之间空间用颜色或图案填充,用于显示局部和整体关系,可以帮助分析总体趋势和单个数据趋势。...6)堆叠条形图 这种图表用于比较多个不同数据,并显示每个被比较数据组成。 设计堆叠条形图最佳做法: 最适用于说明部分和整体关系。 使用对比色,会使对比更加清晰。...8)散点图 散点图用于显示两个不同变量之间关系,或者用于揭示数据分布趋势。当数据点较多并且需要显示数据相似性,可以使用散点图。这种图形在寻找异常值或了解数据分布,会非常有用。

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羡慕 Excel 高级选择与文本框颜色呈现?Pandas 也可以拥有!! ⛵

图片 案例&背景 我们从一个电商销售案例背景讲起,下图数据透视表(pandas pivot table)显示了 2016 年至 2022 年不同产品总销售额。...数据可以在ShowMeAI百度网盘获取,数据读取与处理代码如下: 实战数据下载(百度网盘):点击 这里 获取本文 [6] Pandas 使用 Styler API 设置多条件数据选择&丰富呈现样式...内容覆盖 图片 本篇后续内容覆盖以下高级功能: 突出缺失值 突出显示每行/列中最大值(或最小值) 突出显示范围内绘制柱内条形图 使用颜色渐变突出显示值 组合显示设置功能 注意:强烈建议大家使用最新版本...# 绘制柱内内条形图 df_pivoted.style.bar() 图片 当然也可以自定义条形图颜色和大小!如下图所示,设定了颜色和宽高等参数。...# 绘制柱内内条形图 df_pivoted.style.bar(color='lightblue',height=70,width=70) 图片 ⑤ 使用颜色渐变突出显示值 我们还可以用颜色渐变来突出显示整个列

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60种常用可视化图表使用场景——(上)

适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...13、堆叠式条形图 跟多组条形图不同,堆叠式条形图 (Stacked Bar Graph) 将多个数据条形彼此重迭显示,适合用来显示大型类别如何细分为较小类别,以及每部分与总量有什么关系。...每个线对应于一个维度/数据,其数值/类别由该线不同线段所表示。每条线宽度和流程路径,均由类别总数比例份数所决定。每条流程路径都可以用不同颜色代表,以显示和比较不同类别之间分布。...当不同数量被分配到各个类别,这些矩形面积大小会与此数量成正比显示。...每个圆形面积也可用来表示额外任意数值,如数量或文件大小。我们也可用颜色数据进行分类,或通过不同色调表示另一个变量。

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python - 绘制数据相关标记和颜色3D散点图

=m) ax.set_xlabel('X Label') ax.set_ylabel('Y Label') ax.set_zlabel('Z Label') plt.show() 以上是官网上代码示例及演示结果...mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D 然后绘图: ax = plt.figure().add_subplot(111, projection = '3d') #基于ax变量绘制三维图...#xs表示x方向变量 #ys表示y方向变量 #zs表示z方向变量,这三个方向上变量都可以用list形式表示 #m表示点形式,o是圆形点,^是三角形(marker) #c表示颜色(color...ax.set_zlabel('Z Label') #显示图像 plt.show() 注: 上面的 ax = plt.figure().add_subplot(111, projection = '3d') 是下面代码略写...fig = plt.figure() ax = fig.add_subplot(111, projection = '3d') 如果我有一个df包含5列f1,f2,f3,f4,y 数据框 可以这样引用

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数据分析入门系列教程-常用图表

条形图 条形图可以查看数据不同类别之间分布请求 盒式图 是由五个数值组成:最大值(max)、最小值(min)、中位数(median)和上下四分位数(Q3,Q1),可以帮助我们分析数据差异性、离散程度和异常值等信息...饼图 饼图可以很好呈现每类数据所占总数据比例情况 热力图 热力图是把数据用矩阵表示形式,不同数据颜色不同,可以通过颜色直观判断某个位置上数值情况 雷达图 可以很好显示一对多关系,比如王者荣耀中对局信息..., style=None, size=None, data=None) x,y:传入数据间 data 名字 hue:按照列名分组,不同组展示不同颜色 style:按照列名分组,不同分组使用不同...marker size:按照列名分组,不同分组符号大小不同 data:传入数据 plt.scatter(tips['total_bill'], tips['tip'], c='#bcbd22',...练习题 其实 Seaborn 自带了很多好玩数据,比如我们用到 tips 和 flights 数据,还有 car_crashes 数据,是一个关于车祸数据,那么你能够使用该数据,做一些探索吗

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教程 | 5种快速易用Python Matplotlib数据可视化方法

在项目的早期阶段,我们通常需要进行探索性数据分析来获得对数据洞察。通过数据可视化可以让该过程变得更加清晰易懂,尤其是在处理大规模、高维度数据。...散点图 由于可以直接看到原始数据分布,散点图对于展示两个变量之间关系非常有用。你还可以通过用颜色数据分组来观察不同数据之间关系,如下图所示。...当类别数太多时,条形图将变得很杂乱,难以理解。你可以基于条形数量观察不同类别之间区别,不同类别可以轻易地分离以及用颜色分组。我们将介绍三种类型条形图:常规、分组和堆叠条形图。...然后我们循环地遍历每一个组,并在 X 轴上绘制柱体和对应值,每一个分组不同类别将使用不同颜色表示。 ? 分组条形图 堆叠条形图非常适合于可视化不同变量分类构成。...在下面的堆叠条形图中,我们比较了工作日服务器负载。通过使用不同颜色方块堆叠在同一条形图上,我们可以轻松查看并了解哪台服务器每天工作效率最高,和同一服务器在不同天数负载大小。

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matlab中绘制三维柱状图bar3函数使用方法

bar3 - 绘制三维条形图 此 MATLAB 函数 绘制三维条形图,Z 中每个元素对应一个条形图。如果 Z 是向量,y 轴刻 度范围是从 1 至 length(Z)。...详细解释 bar3 绘制三维条形图。 bar3(Z) 绘制三维条形图,Z 中每个元素对应一个条形图。如果 Z 是向量,y 轴刻度范围是从 1 至 length(Z)。...如果 Z 是矩阵,则 y 轴刻度范围是从 1 到 Z 行数。 bar3(Y,Z) 在 Y 指定位置绘制 Z 中各元素条形图,其中 Y 是为垂直条形定义 y 值向量。...条形高度是行中元素总和。每个条形标记有多种颜色不同颜色分别对应不同元素,显示每行元素占总和相对量。 bar3(...,color) 使用 color 指定颜色显示所有条形。...如果 Z 是矩阵,则 bar3 将为 Z 中每一列创建一个 Surface 对象。 案例 创建三维条形图 加载数据 count.dat,它会返回一个三列矩阵 count。

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5 种快速易用 Python Matplotlib 数据可视化方法

通过数据可视化可以让该过程变得更加清晰易懂,尤其是在处理大规模、高维度数据。...散点图 由于可以直接看到原始数据分布,散点图对于展示两个变量之间关系非常有用。你还可以通过用颜色数据分组来观察不同数据之间关系,如下图所示。...当类别数太多时,条形图将变得很杂乱,难以理解。你可以基于条形数量观察不同类别之间区别,不同类别可以轻易地分离以及用颜色分组。我们将介绍三种类型条形图:常规、分组和堆叠条形图。...然后我们循环地遍历每一个组,并在 X 轴上绘制柱体和对应值,每一个分组不同类别将使用不同颜色表示。 分组条形图 堆叠条形图非常适合于可视化不同变量分类构成。...在下面的堆叠条形图中,我们比较了工作日服务器负载。通过使用不同颜色方块堆叠在同一条形图上,我们可以轻松查看并了解哪台服务器每天工作效率最高,和同一服务器在不同天数负载大小。

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了解绘制条形图和折线图细节

接下来我们就连载其中一个佼佼者系统性学习五本书笔记: 下面是YT分享 上一个笔记是:R基础知识及快速检阅你数据 第三章 条形图 条形图通常用来展示不同分类下(x轴)某个数值型变量取值(y轴...对于条形图而言 ,有的时候我们展示数据种变量数值,有的时候展示却是频数,但是他们术语又相同,这一点及其容易造成混乱。...本章将以ggplot2为主进行学习啦~~ ---- 3.1 绘制基本条形图 Q:当你有一个包含两列数据框,一列为x轴上位置,一列为y轴上对应高度,基于此如何绘制条形图?...,即c52d21 #又缺失项(没有值或者NA),结果会略去不绘,同时相近条形会自动填充到相应位置 3.3 绘制频数条形图 Q:如果每行数据对应一个样本那么如何针对样本频数绘制条形图?...x ggplot(diamonds,aes(x=carat))+geom_histogram() 3.4条形图着色 Q:如何将条形图条形设定为不同颜色

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