这些序列包含0或1个精氨酸残基,与未偶联的PMO相比,预测活性增加4-11倍。...如图3A进行的 EGFP 测定中测量的外显子跳跃活性的分析表明,PMO-P6 是表现出最高活性的缀合物,相对于未缀合的 PMO 增加了 23 倍。...PMO 与这 7 种预测肽的偶联物中表现第二和第三好的是 PMO-P4 和 PMO-P5,其活性相对于未偶联的 PMO 分别增加了 8 倍和 9 倍。其余的偶联物显示出 6 倍或更低的增加。...该图显示了内吞抑制剂使用PMO−P6和PMO−P12传递PMO的效果。 2.6 递送阴离子 除了递送反义寡核苷酸外,P6还可以递送一种阴离子的活性酶。...白喉毒素a (DTA)是白喉毒素的一段21 kDa的阴离子蛋白,含有毒素的催化结构域,但缺少进入细胞的部分一旦进入细胞质,这种毒素会抑制蛋白质的合成并杀死细胞。
他们近期的论文(以及贝尔实验室的一项独立研究)显示了关键的任意子以电流的模式进行移动的「征兆」。...Majorana 对称性能够保持量子化免受无序、相互作用和隧道耦合变化的影响。 先前的大多数实验中,显示零偏压峰值远小于 2e2/h,最近的一个实验观察显示其峰值高度接近 2e2/h。...而在这里,我们在覆盖有铝超导层的铟锑化合物半导体纳米线上测量的零偏压电导,显示有一个 2e2/h 的量子化的电导平台。...依靠「百度量子、量子百度」的研究规划,百度计划在五年内组建世界一流的量子计算研究所,并逐步将量子计算融入到百度业务中。...虽然目前还没有看到具体的实验结果,但这块芯片的未来有很大潜力,很有可能达成量子计算领域内的重要里程碑。
当片段离子覆盖率从100%下降到50%时,正确测序的肽段的比例从80%下降到只有20%,这表明从头测序的精度对片段离子覆盖率非常敏感,其根本原因是片段离子的缺乏使得连续氨基酸的顺序发生变化。...如果由数据库搜索结果注释的正确肽谱的前10个候选序列中不包含正确的肽,那么这个谱就不能使用,反之,则认为具有正确肽序列的PSM被视为一个阳性样本,而其他9个具有错误肽序列的PSM被视为9个阴性样本。...4.通过频谱合并来提高结果正确率,在通过SVM-rank的输出分数对每个光谱的前10个候选序列进行重新排序后,在预先设定的容许范围内(如620ppm),对具有相似的前体离子质量的不同光谱进行进一步检查检查它们是否是由同一肽产生的...模型与领域内其他算法的比较 ? 图6 与其他算法的召回率比较 ? 图7 与其他算法的性能 四、总结 本文使用深度学习方法来提取特征,并建立了一个排序学习模型并重新进行排序学习得到结果。...这意味着,现阶段的从头测序算法即使使用有效的深度学习方法在当前阶段可能无法区分具有长间隙子序列的类似结果。
与其他当前可用的工具进行比较显示,Metal3D是迄今为止最准确的锌离子位置预测器,其预测结果与实验位置相差在0.70 ± 0.64 Å范围内。...首先,作者调查了所有工具在二元分类(存在或不存在锌结合位点)中检测锌离子结合位点的潜力。将正确识别的结合位点(真阳性,TP)定义为与实验锌位点在5Å范围内的预测结果。...如果工具在5Å范围内未预测到金属,则将该位点视为假阴性(FN)。假阳性(FP)预测,即在错误的位置上放置金属,按照5Å范围进行聚类,并按每个聚类计数一次。...MIB2在低t分数下具有更高的召回率,但精度降低(图3B)。作者从测试集中的锌位点列表(总共189个)中移除了具有小于2个离实验锌位置2.8Å范围内的唯一蛋白配体和占位度≤0.5的70个位点。...对于所有工具,在这个精简集中的正确预测数量几乎没有变化(图3),这表明如果结合位点具有2个或更多的蛋白配体,大多数工具都能正确预测。
1905 年,著名物理学家阿尔伯特・爱因斯坦创建了关于时空观的革命性的理论――狭义相对论,这是一个能够正确描述高速世界运动规律的理论。...他们使用了相对论重离子对撞机 (RHIC),这是一种强大的粒子加速器,可以以接近光速的速度粉碎重离子。通过这样做,他们创造了包含虚光子的强电磁场,虚光子是场中的短暂干扰,表现得像真实的光子。...STAR 探测器专门跟踪相对论重离子对撞机 (RHIC) 每次离子碰撞产生的数千个粒子,STAR 重达 1200 吨,主要由 12 个子系统组成。...STAR 的主要科学目标是研究夸克 - 胶子等离子体 (QGP) 的形成和特征,夸克 - 胶子等离子体是一种被认为存在于足够高能量密度下的物质状态。...检测和理解 QGP 可以让物理学家更好地理解大爆炸后的几秒钟内的宇宙,此时宇宙的目前观察到的对称性(和不对称性)已经建立。
为了解决PSM中密切相关负样本对的标注挑战,并减轻标注中搜索引擎的偏差,作者采用了批内对比学习框架。...作者首先在拟南芥数据集上研究了DeepSearch对不同长度肽段的评分函数。 传统的使用离子对离子匹配的数据库搜索引擎可能对不同长度的肽段存在偏差,因为较长的肽段通常产生更多的碎片离子。...尽管在训练中未包含诱饵序列,但低置信度目标匹配和诱饵匹配的分布高度相似,这是设计良好的评分函数的关键前提。 使用搜索引擎报告的分数或期望值控制FDR时,作者评估了谱图鉴定率,如图4b、c所示。...图4d、e显示了1%PSM级FDR下基准搜索引擎的肽段鉴定结果。...图6a显示了DeepSearch根据肽段修饰数量报告的分数分布。作者观察到,随着修饰数量的增加,高置信度鉴定的分数倾向于降低,而诱饵和低置信度鉴定的分数分布保持不变。
他们还进一步将离子阴的五比特量子芯片和IBM的五比特超导芯片在性能方面进行了比较,发现离子阴量子计算的保真度和比特的相干时间更长,而超导芯片的速度更快土比特扩展方面两者都有一定的难度不过在20-100个比比特这个数目内...清华大学计划在五年内实现单个离子附中15-20个离子的相干操控演示量子算法,说明中国也已经加入到了离子阱量子计算的竞赛中。二、原子量子计算除了利用离子,较早的方法还包括直接利用原子来进行量子计算。...为了实现量子计算,首先要在某种系统中创造出一系列任意子-反任意子,然后将这些任意子的两种熔接(fusion)结果作为量子比特的两个能级,再利用编织(braiding)进行量子比特的操控,最后通过测量任意子的熔接结果得到比特的末态...这一系列操作对噪声和退相干都有极大地免疫,因为唯一改变量子态的机制就是随机产生的任意子-反任意子对干扰了比特的编织过程,但这种情况在低温下是非常罕见的,噪声和其他量子比特系统常见的电荷等相比,影响是非常小的...研究组在实验中获得任意子的方法就是得到马约拉纳费米子,当s波超导体和一条具有强烈自旋-轨道耦合效应的半导体纳米线耦合在一起时,在纳米线的两端就可以产生马约拉纳费米子,实验中可以观察到马约拉纳费米子引起的电导尖峰
我们一般通过核磁共振确定结构式 (产品是否正确) 和大概纯度 (是否含杂质及杂质大概比例),通过 LCMS 或 HPLC 测定确定产品具体纯度 (产品需要有紫外吸收)。...■ LCMS 检测 质谱 (MS) 是用电场和磁场将运动的离子 (带电荷的原子、分子或分子碎片,有分子离子、同位素离子、碎片离子、重排离子、多电荷离子、亚稳离子、负离子和离子-分子相互作用产生的离子)...MS 联用): 1、LCMS 第一/二个曲线图,为检测器 DAD 紫外吸收高效液相 HPLC 图,检测波长一般是 214 nm/254 nm,可作为纯度参考; 2、第三个曲线图,为 MS 信号流,显示...MS 信号强弱,可能因信号噪音出现基线不平现象,不作为纯度参考; 3、第四个曲线图,为提取的含目标产品 MS 信号图,有出峰表示有目标产品,无出峰表示无目标产品; 4、MS 质谱图,MS 信号显示目标分子量...高效液相色谱是色谱法的一个重要分支,以液体为流动相,采用高压输液系统,将具有不同极性的单一溶剂或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入装有固定相的色谱柱,在柱内各成分被分离后,进入检测器进行检测,从而实现对试样的分析
目前各国科学家及研发机构也在寻找克服锂离子电池缺陷的解决方法,改善使用痛点。 短路的元凶究竟是谁? 锂离子电池最早由索尼在1991年推出,其原理是依靠离子在电极间运动产生能量。...电池内短路的起因有三种:机械因素,由于外力导致电池变形而发生内短路;热因素,高温损坏电芯隔膜导致电池正负极接触发生内短路;电因素,由于锂枝晶刺穿隔膜导致的内短路。...他们得到的结果显示,锂枝晶确实刺穿了隔膜,但是与普遍的猜测不同,它并不是靠自己刺穿的隔膜。 研究人员发现每次电池充电时,都会产生名为固体电解质中间相的副产品。...二者在性能上也存在较大差别,与锂离子电池相比,锂金属电池拥有几乎两倍的能量密度,重量也更轻,这使得锂金属电池在电动汽车领域的应用潜力更大。 不过目前,锂金属电池距离商业化应用还有很长一段距离。...与锂离子电池不同,锂金属电池中的锂离子获得电子后,直接以金属锂颗粒的形式,附着在负极上,从而形成枝晶状图案。
组学表示一组物质整体的表现。蛋白质组学表示特定系统内蛋白质集合的研究。 ? 蛋白质组学有基于二维凝胶分离 (2D-Gel)和质谱鉴定技术。 ?...2D-Gel根据蛋白的等电点和分子质量的差异,通过等点聚焦和SDS-PAGE分离,通过染色和成像把不同电性和大小的蛋白质显示在凝胶上。 ?...最早洗脱出的是越亲水的。 ? 质谱是测量离子质荷比的分析方法,基本原理是使待测样品中的组分在离子源中离子化,经过电场加速形成离子束,进入质量分析器,获得质谱图。...磷酸化肽段富集 (类比于ChIP中的富集和Input) ? ? ? 定量蛋白质组学 ? ? Label free相对定量,蛋白的量与Peak强度正相关。 ?...酶解标记法, 酶解时加入H218O,可以在肽段C端加2个重氧原子。 ?
本文使用1029个自述健康的印度人全基因组数据及53个独立的全外显子验证数据集研究了印度心脏离子通道病的人群特征及特异性变异。...这不仅有助于评估疾病相关变异的患病率,还对其临床可操作性进行了深入研究,并揭示了群体特异性的遗传谱。在印度,由于其丰富的文化多样性和内婚群体的存在,遗传多样性尤为突出。...这为发现心脏离子通道病变的独特遗传特征提供了宝贵的机遇。...本研究利用IndiGenomes数据集(使用Sentieon进行联合基因分型)和独立的全外显子验证数据集对已知的36个心脏离子通道病基因上的变异进行过滤并根据ACMG指南进行分类及独立验证。...最终,鉴定到124个在印度人群中特有的变异,并确定了13个致病/可能致病的突变位点。其中,3个突变位点在53个人构成的独立外显子队列中得到了验证。
例如,在未修饰肽的大型数据集上训练的模型可以部分转移到携带翻译后修饰 (PTM) 的肽模型,该模型随后在较小的数据集上进行训练。...对于相同的肽段和相同的元数据参数值,串联质谱 (MS/MS) 光谱的相似技术复制的预测准确性存在实际限制。...对于基于窗口的方法,例如 wiNNer,由于其神经网络包含多个隐藏层,因此被归类为深度学习,不同长度的肽段有助于同一模型。该模型预测了由一次断裂一个肽键形成的离子相对于光谱中最高峰的峰高。...迁移学习用于修改 pDeep2以预测包含修改的光谱。该模型首先在来自未修饰肽的大型光谱数据集上进行了预训练。...具有较大肽搜索空间的应用包括免疫肽组学、蛋白质组学和元蛋白质组学。 免疫肽组学专注于与人类白细胞抗原 (HLA) 结合的肽,这些肽由细胞内蛋白质的蛋白酶体降解产生,然后重新定位到细胞表面。
扩张过程中选择的顶点,是距离子图最近的顶点,即与子图中顶点形成的边是权值最小的边。...算法过程 按照距离子图的远近,对顶点集合进行排序 选择最近的顶点加入到子图中,并更新相邻顶点对子图的距离 重复执行步骤 2,直到顶点集合为空 演示示例 ?...graph 这里不妨以顶点 5 作为子图中的第一个顶点 step 1: 距离子图的最近顶点为 4 ? step 2: 距离子图的最近顶点为 3 ?...使用 heapSort 堆排序对每个顶点到子图的距离进行排序,即对 vertices 列表进行排序,使用堆排序内的 transformToHeap 函数调整 vertices 列表为小顶堆。...;同时循环结构内执行 updateVertices 函数,更新每个取出顶点的相邻顶点距离值,所以总体的更新顶点数为 ? ,因为每个顶点更新距离后,需要调整堆结构为小顶堆,所以总体的复杂度为 ? 。
Figure5)图解: 正面主视图是液相色谱图(以Retention Time作为X轴,intensity可认为是relative abundance作为Y轴),每个峰表示RT时间相近也即是疏水作用强度相同的肽段离子...鉴定需要依赖于预先lable的DDA库。 由于DIA是一次性放了一堆母离子进来,同时碎裂,所以对于DIA来说,不是一张谱图对应一个母离子,而是一堆谱图对应一堆来自多个母离子的碎片离子混合物。...然后,用每一张导入搜索引擎的实验谱图与落入母离子质量误差窗口内的理论谱图进行匹配打分,并选择打分最好的理论谱图对应的肽段作为该实验谱图的鉴定结果。...搜库质控:实验图谱和理论图谱匹配不一定正确,一般需要设置p value等评估匹配结果的指标阈值 错误匹配原因: 蛋白质序列库不完整或者存在测序错误; 未知修饰,导致谱图难以被正确鉴定; 酶切实验的偏差,...比如错切、漏切等; 母离子或子离子质量偏差; 搜索引擎的打分无法区分谱图对应的正确肽段和错误肽段,因此需要评价肽段鉴定的可靠性,搜索引擎才能根据鉴定到的可信肽段序列进行蛋白质推断。
还有一个特殊的性质就是这些离子之间带有连带关系,默认的连带关系是第i个离子与第i+1个离子连带。当i离子跃迁的时候,即使i+1的离子没有吸收能量也会发生跃迁。其中第N个离子无法建立连带关系。...然后我们可以选择若干个起始位置来遍历链表,使得题意规定的收益最大。 另外我们发现不论这K条边连接如何,除了这K条边之外的内容都还是顺序连接的。我们可以使用前缀和算法来快速求某一段区间的和。...通过这么一个简单的递推式,我们就可以非常方便地求出所有的presum,计算所有的前缀和了。 前缀和非常方便,在很多题目当中都有使用,但是有一个小小的条件就是维护区间和的数组内的元素不能发生变化。...情况1成立是有前提的,前提就是我们选择的激活的离子不能是最后一个,因为最后一个离子没有连接。很有可能前面N-1个离子的代价都大于收益,只有第N离子的收益是正的。...题目虽然简单,但是我们在做题的时候想要一下子把这7中情况都想明白理清楚实在是不容易,不过这样的题目才更加值得我们去做,因为真的很锻炼思维,对于提升我们思维的缜密程度非常有帮助。 最后,我们附上代码。
来源:机器之心本文约2400字,建议阅读5分钟用强化学习控制核聚变反应堆内过热的等离子体。...过去三年,DeepMind 和瑞士洛桑联邦理工学院 EPFL 一直在进行一个神秘的项目:用强化学习控制核聚变反应堆内过热的等离子体,如今它已宣告成功。...技术概览 DeepMind 提出的模型架构如下图所示,该方法具有三个阶段: 第一阶段:设计者为实验指定目标,可能伴随着随时间变化的控制目标; 第二阶段:深度 RL 算法与托卡马克模拟器交互,以找到接近最优的控制策略来满足指定目标...; 第三阶段:以神经网络表示的控制策略直接在托卡马克硬件上实时运行(零样本)。...在第三阶段,控制策略与相关的实验控制目标绑定到一个可执行文件中,使用量身定制的编译器(10 kHz 实时控制),最大限度地减少依赖性并消除不必要的计算。
每当研究人员想要改变等离子体的结构,尝试不同的形状以产生更高的能量时,就需要大量的工程和设计工作。...DeepMind 开发了一种可以自主控制等离子体的 AI,来控制瑞士等离子体中心的可变配置托卡马克内的 19 个电磁线圈。...首先观察改变 19 个线圈的设置如何影响容器内等离子体的形状。其中包括接近 ITER 内部使用的 D形横截面、法国正在建设的大型实验托卡马克装置,以及有助于消散反应强烈热量的雪花结构。...无论是在模拟中,还是当科学家在 TCV 托卡马克装置内进行相同的真实实验以验证模拟时,AI 能够通过以正确的方式操纵磁线圈来自主计算出如何创建这些形状。...结语 总而言之,研究人员认为,使用 AI 算法控制等离子体,将使在反应堆内进行不同条件的实验变得更加容易,帮助他们了解这个过程,并有可能加快商业核聚变的发展。
即使在与锂离子电池竞争之后,铅酸电池的需求也在与日俱增,因为与锂离子电池相比,它们更便宜且易于处理。根据一些市场研究,印度铅酸电池市场预计在 2018-24 年期间的复合年增长率将超过 9%。...铅酸电池的工作铅酸电池的工作与化学有关,了解它非常有趣。铅酸电池的充放电条件涉及到巨大的化学过程。当酸溶解时,稀硫酸H 2 SO 4分子分裂成两部分。它将产生正离子 2H+ 和负离子 SO 4 -。...每种方法都可用于特定应用的特定铅酸电池。一些应用使用恒压充电方法,一些应用使用恒定电流方法,而在某些情况下,挠性充电也很有用。通常电池制造商会提供给特定铅酸电池充电的正确方法。...硫酸为稀释形式,通常与水和硫酸的比例为 3:1。当负载跨板连接时,硫酸再次分解为正离子 2H+ 和负离子 SO 4。氢离子与 PbO 2反应生成PbO 和水 H 2 O。...在 8 小时内消耗的电流超过最大放电电流会损害电池的效率,并且还会改变电池的内阻,从而进一步提高电池温度。另一方面,在充电阶段,我们要注意充电器的极性,要与电池的极性正确连接。
从最接近的同源物开始,选择距离每个将被考虑”移植”的化合物的原子6 Å范围内的所有骨干原子,并用于与AlphaFold模型进行局部结构比对;同时计算该比对的均方根偏差 (r.m.s.d.)。...将局部环境验证(LEV)得分定义为AlphaFill和实验复合物之间的任何配体原子和距离配体6.0 Å内的所有蛋白质原子的全原子密度。...在每个条目页面上(图2),所选择的AlphaFill模型会用可视化软件Mol*来显示,允许用户完全灵活地进行检查。...图2:细胞视黄酸结合蛋白2(AF-P29373)的AlphaFill条目页面的截图 案例 对于在PDB中具有相同结构的模型,AlphaFill数据库部分复制了PDBe-Knowledge Base中已有的信息...图5:AlphaFill有助于理解Abl激酶AlphaFold模型的激活状态。 a,ABL1激酶的AlphaFill模型,显示了ADP和镁离子。
滴定中酸和碱的量通常以当量表示,其中一当量是在酸碱反应中与一摩尔氢离子反应或提供一摩尔氢离子的物质的量。...pH值与NaOH添加量的关系图(滴定曲线)显示了弱酸的pKa。考虑在25°C下用0.1 M NaOH滴定0.1 M乙酸溶液(图2-16)。...随着滴定的继续,加入更多的NaOH,剩余的未解离的乙酸逐渐转化为乙酸盐。滴定的终点发生在pH 7.0左右:所有的乙酸都失去了质子到OH−,形成H2O和乙酸盐。...铵离子是三者中最弱的酸,直到 pH 9.25 才会半离解。这些弱酸的滴定曲线以图形方式显示弱酸及其阴离子(共轭酸碱对)可以充当缓冲液,我们将在下一节中进行描述。...例如,磷酸二氢盐的 pKa 有时为 7.2,有时为 6.86。较高值(表观 pKa)未针对缓冲液浓度的影响进行校正,并且在 25 °C 的温度下定义。
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