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应用空间统计学分析空间表达数据

空间信息在空间转录组中的运用 Giotto|| 空间表达数据分析工具箱 SPOTlight || 用NMF解卷积空间表达数据 stLearn :空间轨迹推断 Seurat 新版教程:分析空间转录组数据(...上) Seurat 新版教程:分析空间转录组数据(下) scanpy教程:空间转录组数据分析 10X Visium:空间转录组样本制备到数据分析 定量免疫浸润在单细胞研究中的应用 在之前的文章中,我们提出地理学三大定律是完全适用于空间表达数据的...这里我们用的方法是广义空间线性模型(generalized spatial linear models,GSLM),这一方法在单细胞转录组中的应用被封装在R包SPARK中,文章见: Shiquan Sun...地理加权回归 地理加权回归(Geographically weighted regression, GWR)是一种空间分析技术,广泛应用于地理学及涉及空间模式分析的相关学科。...应用模型的标准不是代码跑不跑得通,而是该模型能给我们带来怎样的神奇体验。我相信每一门学科都是人类的一双眼睛,让我们得以看见这平凡世界的离奇的美。

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应用空间统计学分析空间表达数据

分析空间表达数据,如果离开空间信息,只用其表达矩阵那么单细胞的所有分析点当然是完全能跑得通的,但是有两点我们需要追问: 这样做的生物学意义是什么 既然你忽视了空间数据,为什么要做空间表达,而不是只做表达...这里我们用的方法是广义空间线性模型(generalized spatial linear models,GSLM),这一方法在单细胞转录组中的应用被封装在R包SPARK中,文章见: Shiquan Sun...,广泛应用于地理学及涉及空间模式分析的相关学科。...空间统计已经形成一个独立的学科门类,空间表达数据如能利用空间统计的基本概念与模型,一定会带来新的角度。本文只是做了一些简单探索,甚至空间统计的许多基础概念都只是一笔带过,算是抛砖引玉吧。...应用模型的标准不是代码跑不跑得通,而是该模型能给我们带来怎样的神奇体验。我相信每一门学科都是人类的一双眼睛,让我们得以看见这平凡世界的离奇的美。

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    如何更有效地利用数据中心空间

    什么是数据中心空间?...然而,当今许多企业都面临数据中心空间有限的挑战。原因之一是技术的进步增加了他们对更大数据中心空间的需求,但建造一个新的数据中心将花费大量成本。...以下是充分利用数据中心空间的十种方法。 如何利用数据中心空间? 结合空白和灰色空间:数据中心空白是指IT设备和基础设施所在的空间,而数据中心灰色空间是指后端设备所在的空间。...通过整合这两类数据中心空间,企业可以使用云计算等技术,可以节省大量数据中心空间。 更新技术:为了提高数据中心空间效率,必须升级技术以最小化功耗。...优化垂直空间:与水平数据中心空间相比,利用垂直空间可以在不占用地面空间的情况下增加数据中心的容量和密度。传统的机架和机柜支持 42U 到 45U 的机架空间,而更高的机架提供高达 58U 的机架空间

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    图像色彩空间应用转换

    上面的黑色三角形区域就称为sRGB色彩空间,被广泛应用在个人电脑显示器、打印机、数码相机中,占据了大量市场份额、到了90年代的时候Adobe公司提出了一个新RGB色彩空间模型Adobe RGB色彩空间,...从图中可以看成Adobe RGB色彩空间是比sRGB色彩空间大的,但是这个也有缺陷,就是不同色彩空间生成的彩色图像,在不同的设备上显示或者浏览会出现色差,为了解决这个问题,需要对不同色彩空间之间建立转换模型...后来RGB色彩空间就被大家玩坏了,现在常用的RGB色彩空间如下: ?...HSV色彩空间 RGB立方图色彩空间无法很好区分颜色与亮度的关系,要单独调整颜色或者亮度不是很方便,这个时候HSV色彩空间是一个很好的选择,它对颜色与亮度有着很好的区分度,HSV色彩空间图示如下: ?...LAB色彩空间 LAB色彩空间又名CIE Lab / LAB,它的图示如下: ?

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    应用中心:开放应用模型(OAM)初探

    如今,已有无数的应用以容器的形式运行在各种版本 Kubernetes 中了。 应用管理之惑 然而我们慢慢发现,随着应用和服务数量、使用场景以及承载业务的增加,Kubernetes 资源越来越难以管理。...而开放应用模型(OAM)可能是助我脱离苦海的一味良药。 开放应用模型(OAM) OAM 是阿里云与 Azure 在 2019 年末联合推出的标准化云原生应用管理模型。...相比于传统 PaaS 封闭、不能同“以 Operator 为基础的云原生生态”衔接的现状,基于 OAM 和 Kubernetes 构建的现代云原生应用管理平台,本质上是一个 “以应用中心” 的 Kubernetes...所谓 “应用模型”,其实是一个专门用来对云原生应用本身和它所需运维能力进行定义与描述的标准开源规范。...(Trait)来支持这个组件,逐层的查看每个模块的描述和配置,最终全面了解这个应用,而不用像现在这样使用 label 和 name,漫无目的的靠运气来理清整个架构,真正的做到以应用中心

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    如何构建智能空间的方法与应用

    导读 7月13日,来自腾讯用户研究与体验设计部(简称:CDC)的陈晓畅及蔡羿围绕“如何构建智能空间的方法与应用“这一主题,在2017国际体验设计大会中开展了半天的专题工作坊。...演讲主题:如何构建智能空间的方法与应用 演讲嘉宾:腾讯TEG用户研究与体验设计部 陈晓畅 蔡羿 随着智能时代的来临与城市化建设的发展,建筑中的智能设备与智能化应用越来越普遍。...本次工作坊旨在于在短时间内,将腾讯CDC近年来在智慧旅游、智慧建筑及公共服务等多个领域上的设计探索和实际项目中沉淀的设计成果与解决方案分享与参会者,并通过项目实战,快速让与会者掌握所接触的设计工具与设计方法,以应用于今后的工作之中...工作坊第一部分以上海龙美术馆为例,介绍了空间设计的五要素 以“人”为中心:即我们常说的用户 (使用者、提供服务方),“人”是“事”的主体,赋予了“场”意义。...2.2 建筑体设计实践:以“场”为维度的信息组织与架构设计 如前文所述,智能空间的设计仍然以“人”为中心,智能建筑除了办公大楼的管理,也体现在员工的智能化办公生活场景。

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    中心母钟在金融系统的应用

    本文主要讲了金融系统在运转中对时间基准要求的重要性,以及中心母钟在金融系统运行的功能和中心母钟在对时间同步统一过程中发挥的作用,方便金融系统的用户在对时间同步问题上的顾虑参考。...金融系统使用的中心母钟进行时间同步服务的功能,主要是指建立以中心母钟为标准时基源的网络时钟授时系统,为系统内的各类应用设备提供高精度的时钟校正参考基准,是链接资金盈余机构,金融中介和金融市场相互关系的网络链路间实时信息系统的时间保持同步...目前金融系统中心母钟的主要应用型号有SYN2151型NTP时间同步服务器,SYN4505A型时钟同步设备和SYN012型时统设备,是目前应用于金融系统时间同步中最常用的三种作为中心母钟功能的设备。...在所有应用于金融系统链路体系中的中心母钟,均需满足时间源和NTP网络授时一体化的功能,即中心母钟作为时间同步统一功能的载体,承担了接收时间源的功能,标准为接收北斗GPS卫星时间信号,同时承担了将从卫星上接收到的标准时间信号...中心母钟作为时间同步功能的载体,是金融系统正常运行过程中必须配备的标准时间提供设备。对于金融系统中中心母钟对时间同步服务具体的应用,可咨询我公司业务人员。

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    开源应用中心 | Wordpress、Discuz! Q等应用免代码,极速开通

    腾讯云开源应用中心上线至今已有4个月,在程序员小哥疯狂打码下,应用中心已适配40款热门开源应用和50多款插件。例如世界第一的CMS系统WordPress,轻量私域流量经营系统Discuz!...Q 为例,看看如何在短短几分钟内快速上线这款应用~ 1 进入腾讯云开源应用中心,选择Discuz! Q >点击正式开通 2 一键开通授权>配置环境信息 3 让子弹飞5分钟,正式运行成功。...了解更多 开源应用极速开通: https://app.cloud.tencent.com 开源应用插件项目进展: https://openapp.qq.com/docs 往期回顾 腾讯云开源应用中心发布...---- SMB 腾讯云中小企业产品中心     腾讯云中小企业产品中心(简称SMB),作为腾讯云体系中唯一专业服务于8000万中小企业的业务线,致力于为中小微企业提供全面完善贴心的数字化解决方案。...腾讯云中小企业产品中心,助力中小企业数字化升级的好伙伴。 点击阅读原文了解更多

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    开源应用中心 | 如何快速开发一款文字识别应用

    腾讯云开源应用中心,基于腾讯云产品能力,适配热门开源应用。完全开源,全栈云生,一键使用。 在日常生活中,我们经常会需要将图片里的文字信息提取出来使用,通过人工方式采集的录入方式十分机械且效率低下。...市面上也存在较多OCR识别应用,但不一定能够适用于我们。 接下来,我们将基于开源应用uni-app和腾讯云开源应用插件中心适配的腾讯云文字识别(OCR)插件,快速的开发一款文字识别应用。...2.4 将云函数上传到我们自己的云空间中,如果之前没有过云空间需要先创建再关联云空间,最后执行上传操作 ? 3....我们在腾讯云开源应用中心,也同时上架了一款uni-app的体验应用,免费开放所有的腾讯云uni-app插件的体验试用。 ? ? ? 创作团队 腾讯云开源应用/插件项目由腾讯云中小企业产品中心维护。...更多开源应用免费体验: https://app.cloud.tencent.com 更多开源应用插件项目进展: https://openapp.qq.com/docs SMB 腾讯云中小企业产品中心

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    开源应用中心 | Wordpress、Discuz! Q等应用免代码,极速开通

    腾讯云开源应用中心上线至今已有4个月,在程序员小哥疯狂打码下,应用中心已适配40款热门开源应用和50多款插件。例如世界第一的CMS系统WordPress,轻量私域流量经营系统Discuz!...还有凝聚了腾讯云产品能力的语音识别、验证码、对象存储、内容安全、云点播等插件也仅需在应用管理后台简单开启即可体验。 我们留意到许多用户在试用体验了我们的热门应用后,对这些应用有着长期使用的诉求。...Q和bitwaeren_rs这三款应用的开通适配,你只需简单几步便可以正式开通,部署上线使用。未来,我们将陆续对近百款热门应用进行开通适配,以满足大家的业务需求。...Q 为例,看看如何在短短几分钟内快速上线这款应用。 1)进入腾讯云开源应用中心,选择Discuz! Q >点击正式开通 2)一键开通授权>配置环境信息 3)让子弹飞5分钟,正式运行成功。...另外,正式开通版本的热门开源应用在持续上新中。你还希望我们适配哪些应用或插件?快来留言告诉我们吧!

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    开源应用中心 | 如何快速开发一款文字识别应用

    市面上也存在较多OCR识别应用,但不一定能够适用于我们。 接下来,我们将基于开源应用uni-app和腾讯云开源应用插件中心适配的腾讯云文字识别(OCR)插件,快速的开发一款文字识别应用。...tencentcloud-plugin/config.js 文件,将腾讯云的密钥信息配置进去,可以在腾讯云 API密钥管理 中获取 SecretId、SecretKey 和 APPID 2.4 将云函数上传到我们自己的云空间中...,如果之前没有过云空间需要先创建再关联云空间,最后执行上传操作 3....我们在腾讯云开源应用中心,也同时上架了一款uni-app的体验应用,免费开放所有的腾讯云uni-app插件的体验试用。 创作团队 腾讯云开源应用/插件项目由腾讯云中小企业产品中心维护。...更多开源应用免费体验: https://app.cloud.tencent.com 更多开源应用插件项目进展: https://openapp.qq.com/docs

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    spotBinning 在空间数据中的应用

    今天我们就来看看spotBinning 在空间数据中的应用,主角是:同属于Seurat生态的schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)中细胞重叠的问题。...当然,如果我们把pca空间换成空间位置信息,自然也是可以做类似的操作的。而空间位置的点,往往是均匀分布的,所以每个bin(箱子)可以看作是重采样的过程。...在单细胞转录组中重采样的话,随机抽取就可以了,但是在空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到的空间信息采的稀烂。...WhichCells(Brain,downsample = 50)) p1<- SpatialDimPlot(Brain2) p2<- SpatialDimPlot(Brain) p1+ p2 其实空间数据的获得本身就是空间位置分箱采样的过程...,不信请看: Binning 在空间数据中的应用: ---- References [1] High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue

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    spotBinning 在空间数据中的应用

    今天我们就来看看spotBinning 在空间数据中的应用,主角是:同属于Seurat生态的schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)中细胞重叠的问题。...可以看到schex在pca空间中将细胞点划分为不同的区域,并计算了该区域的细胞数。当然,如果我们把pca空间换成空间位置信息,自然也是可以做类似的操作的。...还记得Seurat空间变异基因如何计算的吗?...本文提出的问题其实是在空间数据中如何重采样? 在单细胞转录组中重采样的话,随机抽取就可以了,但是在空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到的空间信息采的稀烂。...其实空间数据的获得本身就是空间位置分箱采样的过程,不信请看: ? Binning 在空间数据中的应用: ?

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    Docker高级应用之动态扩展容器空间大小

    docker容器默认的空间是10G,如果想指定默认容器的大小(在启动容器的时候指定),可以在docker配置文件里通过dm.basesize参数指定,比如 docker -d --storage-opt...master/daemon/graphdriver/devmapper 上面方法只是真的生成容器的时候进行的,并且修改后需要重启docker,无法做到动态给运行容器指定大小,下面我介绍一下如何动态的扩展容器空间大小...sdb1            ext4    1.8T  30G  1.7T  2% /.dockerenv 可以看到我运行test容器的根分区是ext4分区,容器是10G 2、使用我的脚本动态扩展容器空间...fi 目前给test容器进行动态增加20G空间 15:24:40 # sh dynamic_modify_docker_disk.sh test 20 dynamic container test disk...2014/01/29/docker-device-mapper-resize/ FAQ: centos 7里使用docker的时候默认存储引擎是devicemapper 在进行动态调整docker容器磁盘空间的时候

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