近日，《Genome Medicine》发表了一篇综述文章为空间转录组学提供了一个入门指南：涵盖了生物医学研究所需的可用技术、实验设计考虑和生物信息学分析。空间转录组技术已经存在了近十年。...其他组学技术，如 "空间蛋白质组学"（目前用于描述通过基于抗体的方法对几十种蛋白质进行定向评估的术语）、染色质可及性的空间检测和空间基因组学也有新发现。...此外，现在还有了进行空间基因组和蛋白质组实验的技术，比如DNA seqFISH+、DBiT-seq、t-CycIF和CODEX等。空间转录组实验设计指南我可以使用空间转录组学吗?...任何含有活性mRNA的完整组织都适用于空间转录组学。空间转录组学技术在各种生物医学分支学科中都很有用，如神经科学、癌症、免疫学和发育生物学。...空间转录组数据分析指南 预处理基于ISH和ISS的典型方法将通过多轮杂交读取序列或基因特异性条形码，因此图像本身没有信息。将这些图像转换为基因点矩阵需要几个步骤。首先，对图像进行滤波以去除背景和噪声。
dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/group-replication-getting-started.html 译者：kun 最近在翻译MySQL8.0官方文档 本文是第18.2入门指南部分...MySQL组复制是MySQL server的插件，组中的每个server都需要配置和安装该插件。本节提供了一个详细的教程，其中包含创建至少三台server的复制组所需的步骤。...一个组可以包含使用IPv6的成员和使用IPv4的成员的混合。有关IPv6网络以及混合IPv4和IPv6组的组复制支持的更多信息，请参见 第18.4.5节“支持IPv6以及混合IPv6和IPv4组”。...启动组的server不使用此选项，因为它是初始server，因此它负责引导组。第二个加入的server向组中的唯一成员申请加入，然后组得以扩容。...请指示server s1引导组，然后启动组复制程序。
大话脑影像之二十三：浅谈影像组学 放射学中基于影像组学和人工智能预测癌症预后 脑肿瘤的影像组学：图像评估、定量特征描述和机器学习方法 基于MRI医学图像的脑肿瘤分级 Radiology：图像生物标志物标准化...影像组学是放射学领域的一个新词，源于“放射”（意为医学图像）和“组学”（意为基因组学和蛋白质组学）的结合，有助于我们理解各种医学状况的各种领域，如基因组学和蛋白质组学。...可以认为，影像组学是实现这些目标的一种客观方法。无论使用常规或先进的成像技术，影像组学的主要目的是提取尽可能多和有意义的隐藏目标数据，以用于临床决策支持。 为什么我们要将人工智能引入到影像组学中？...表1，传统的影像组学特征示例 可以根据不同的图像类型提取影像组学特征，这有助于影像组学特征的高维性。常见的图像类型如图3所示。...虽然不可能在综述文章中涵盖影像组学和人工智能的所有方面，但我们相信本文中包含的关键论点将有助于研究人员、评论家和影像组学的未来。 表2，人工智能影像组学研究中需要考虑的关键特征清单
我（Lewis Gavin）目前的工作角色是用 Amazon Redshift 来设计数据仓库。...Staging Staging 是任何数据仓库项目都不可避免的一步。 大型的数据仓库都将采集多个不同的业务系统数据，而这些数据都有各自的命名风格或者数据格式。...Staging 只负责简单的存储所有数据仓库范围内的初始化数据，进一步做数据处理和建模，并不在这里实现。...如果你把数据仓库建立在类似 Amazon Redshift 的列式存储结构上，结果就变了。...顺着这条路子，你能很容易的建立起一个使用的数据仓库项目。 但要深知，我们的目的不仅仅是可用，可扩展，还要易于用户的理解。
目标读者 本指南特别适合有Python基础的同学学习Java入门，对于没有任何编程经验的同学可能会存在困难。 为什么测试人员要学Java 选择Java，应该不错。...测试人员怎么学Java 我推荐刷完一遍基础语法后，在LeetCode上面刷算法题来加强练习。
什么是数据仓库（Data Warehouse，DW）？...1991 年，数据仓库之父 Bill Inmon 在《Building the Data Warehouse》一书中，给出的定义： “数据仓库一个面向主题的、集成的、稳定的、随时间变化的数据的集合，以用于支持管理决策过程...建立数据仓库的目的是帮助企业高层系统地组织、理解和使用数据，以便进行战略决策。 数据仓库系统的体系结构 源数据层 源数据是数据仓库系统的基础，是整个系统的数据源泉。...数据存储与管理层 元数据 元数据是关于数据的数据，位于数据仓库的上层，用以描述数据仓库内数据的结构、位置和 建立方法。通过元数据进行数据仓库的管理和使用。...数据仓库 数据仓库中存放了企业的整体信息，而数据集市只存放了某个主题需要的的信息，其目的是 减少数据处理量。
目前，基因组学、蛋白质组学、转录组学、微生物组学、代谢组学、病理组学、放射组学等多组学是研究的热点之一。其中多组学数据、药物和疾病之间的关系受到了研究者们的广泛关注。...本文提出了一种综合的研究策略，即构建多组学数据的异构网络，覆盖多模态数据，并利用当前流行的计算方法进行预测。...多组学关联预测的全面描述 未来面临的挑战 本文以当前热点的生物学关联关系预测研究作为讨论。作者提出了一种可能的策略，融合大规模的多组学数据，以全面探索各种生物实体之间的关系。...放射组学的合理组合也是当前研究的热点，特别是放射组学与组织病理学和生物分子特征的对应关联问题。 3. 设计预测方法的挑战 现阶段的预测方法有很多，每一种方法都有其优缺点。...这导致了生物学意义不明显，无法说服生物学和医学工作者，以及在分析和预测疾病时，很少有对其他关系的全面分析。
■ 什么是代谢组学 在基于基因组-转录组-蛋白质组-代谢组的系统生物学框架内，代谢组学 (metabolomics/metabonomics) 处于最下游，最接近生物表型，主要通过考察生物体系在某一特定时期内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物...■ 代谢组学的优点 1、代谢组处于系统生物学的最下游，基因组和蛋白质组的细微功能变化可以在代谢层面上放大，检测更容易； 2、植物、动物、微生物的代谢物数量远远少于基因和蛋白质，且常见的代谢物在不同生物体系中很相似...■ 代谢组学的常见类型 ■ 非靶向代谢组学检测的案例 肝细胞癌 (HCC) 是全球第三大致死性癌症，目前常采用影像学方法 (如 CT、B 超等) 和血清生物标志物 (甲胎蛋白) 来筛查和诊断 HCC...MCE 代谢组学服务 MCE 代谢组学技术服务主要包括非靶向代谢组学和靶向代谢组学两大类，且有专业的代谢组学技术团队为您提供从样品处理到生信分析的一站式服务！...■ 代谢组学常用的检测方法 ■ 非靶向代谢组学分析流程 ■ 靶向代谢组学分析流程 欢迎大家前来咨询呀！
近两年越来越多的人开始意识到了环境中病毒的重要性，基于不断发展的分子技术，环境宏病毒组学的研究可能越来越热。宏病毒组学的研究如何展开？...今天给大家介绍一部病毒宏基因组学方法与指南，该书详细介绍了不同类型样品的处理流程，以及基本的分析方法，堪称宏病毒组研究宝典。...病毒宏基因组学：方法和指南 Viral Metagenomics Methods and Protocols 内容介绍： 1 细菌-宿主系统中噬菌体的分离及病毒宏基因组学样品制备 2 藤本植物与木本植物组织中小...RNA的分离 3 双链RNA富集与样品制备用于二代测序鉴别类病毒 4 植物中的病毒双链RNA：高通量测序核酸样品制备的备选方案 5 HIV基因组深度测序中人体血液样品的制备 6 Monolith色谱用于水体病毒组研究中样品的制备...7 多足节肢动物和植物病毒群落的高精度病毒宏基因组学方法 8 多种方法发现海洋生物有关的真菌病毒 9 利用病毒感染产生的siRNA对苗圃中木本植物进行病毒诊断 10 利用高通量测序来研究和诊断花粉中的植物病毒与类病毒
最近有几个群友问我大数据怎么入门，作为一个零基础大数据入门学习者该看哪些书呢？我结合自己看过的书和了解到的比较好的数据，给大家分享一下。...现在的很多公司的大数据团队一般有三个小组：大数据平台组、数据仓库组以及数据分析组。 虽然大家都属于一个部门，但是三个小组的岗位要求却不一样。下面介绍一下三个小组的技术要求以及工作重点。...二、数据仓库组 负责数据仓库的设计、建模、ETL任务开发等工作。数仓在小组内一般都是一拨人搞，业务分析、数仓设计、任务开发等都要做。...大数据平台： 《Hadoop权威指南》《Hive编程指南》《Hbase权威指南》《大数据日知录》《Flink技术内幕》，还有各个大数据技术栈的官网。...数据分析： 《业务建模与数据挖掘》《概率论与数理统计》《统计学》《机器学习（西瓜书）》《机器学习实战》，把Python写溜儿了。
☀️建议/推荐你 无论你是计算机专业的学生，还是对编程有兴趣的小伙伴，都建议直接毫无顾忌的学习此专栏「滚雪球学Java」，bug菌郑重承诺，凡是学习此专栏的同学，均能获取到所需的知识和技能，全网最快速入门
Redis的IO模型是构建在单线程架构之上的，这使得它避免了多线程环境下常见的并发问题，如锁竞争和线程上下文切换。然而，单线程设计也带来了一个问题：如何有效处理...
背景介绍 单细胞转录组学可以在一次实验中分析数千个细胞，并在各种组织和生物体中识别新的细胞类型、状态和动态，从而创建多细胞系统中细胞异质性的全面图谱。...现在有很多创建单细胞转录组图谱的分析流程已经被开发出来，然而如何识别细胞类型和状态并最终创建带注释的细胞图谱还是一个重难点。...单细胞转录组学数据通常以二维“map”的形式（如tSNE，UMAP）呈现，根据细胞基因表达谱的相似性来排列细胞，通过这种方式可视化的数据自然地识别具有高度相似细胞的簇，也就是我们通常所说的Cluster...而我们需要对这些通过聚类算法得到的细胞簇加以解释和注释来定义不同细胞类型或状态，以便更好地理解其生物学意义。...Step3: 验证 使用独立的方法（例如新的验证实验）或者与补充数据（例如空间转录组数据）的比较来确认注释细胞类型的身份和功能。
概述 在我们学习ETL测试之前，先了解下business intelligence(即BI)和数据仓库。 什么是BI？...这些数据可以用于汇报、分析、挖掘、数据质量、交互、预测分析等等 什么是数据仓库 数据仓库是为查询和分析而不是事务处理而设计的数据库。 数据仓库是通过整合不同的异构数据源而构建起来的。...我们从联机事务数据库中提取数据，进行转换处理，匹配数据仓库模式，然后载入至数据仓库数据库中。 在通常情况下，大多数的数据仓库要整合非联机事务数据库系统的数据，例如来源文本文件、日志、电子表格等等。...Load 将转换后的数据载入数据仓库 构建聚集：创建聚集对数据进行汇总并存储数据至表中，以改进终端用户的查询体验。...要检查比较目标数据仓库和源数据的关键字段的唯一性 6 正确性问题 1. 数据要没有拼写错误或不准确的记录2.
作者，Evil Genius参考文章Spatial epigenome–transcriptome co-profiling of mammalian tissues | Nature单细胞多组学，特别是染色质可及性表观遗传和转录组同时测序分析...随着近年来空间组学的兴起， 空间多组学技术 (spatial multi-omics)是否也可以同时分析基因表达和基因调控机制？这成为了大家一致期待的新一代革命性组学工具。...空间多组学在2022年更是被Nature杂志展望为为最值得期待的七个技术之一。2020年底，耶鲁大学的樊荣教授团队首次报道了利用组织样本原位编码方法同时分析空间转录组和蛋白组（DBiT-seq）。...为了进一步研究调控基因表达的表观遗传机制，需要对空间表观组和转录组进行同时分析。...因此如果空间分辨的表观遗传组和转录组联合测序分析技术（spatial epigenome–transcriptome co-sequencing）能够实现，将会成为复杂组织生物学研究的一个终极利器，
01、空间转录组技术的发展 近年来单细胞转录组测序技术的应用大大拓宽了人们的视野，使人们能够深入了解组织中细胞的构成的多样性和基因表达状态。...单细胞转录组测序技术和空间转录组技术【2】 单细胞转录组测序技术可以说是融合了高通量组学技术和传统的单细胞研究手段，即解决了通量和分辨率的问题。...空间转录组技术（spatial transcriptomics）则需要利用常规的原位技术和组学技术两方面的优势。 ? 图3....图10. 10X Genomics Visium空间转录组技术的流程 3、应用方向 空间转录组的应用方向包含了肿瘤学，免疫学，发育生物学，神经科学及病理学等各个方向。 ? 图11....基因表达的空间热图【8】 5、空间转录组和单细胞转录组数据的整合 10X Genomics Visium空间转录组技术目前还达不到单细胞分辨率，而单细胞转录组数据则能够起到一定的补充作用，将两者的数据进行锚定和整合
计算机基础书籍 计算机组成原理 《编码：隐匿在计算机软硬件背后的语言》 ：零基础入门 《穿越计算机的迷雾》：零基础，但是读起来没有《编码》流畅 《程序是怎么跑起来的》 ：除了第6章是讲压缩之外，别的都应该读一下...综合类 数据结构与算法 《算法》：用Java讲解，图很多 《算法导论》：有点难，我也没看完 数据结构与算法经典问题解析-Java语言描述 数据结构与算法分析+java语言描述 算法图解 趣学算法...Boot+Docker 跟老男孩学Linux运维：Shell编程实战 《鸟哥的Linux私房菜-基础篇》第四版 JAVA篇 Java核心技术卷1-基础知识第10版 Java核心技术卷2-高级特性...JVM故障诊断与性能优化 SQL Mysql必知必会 高性能MySQL python Python编程：从入门到实践（2016） Python For Data Analysis中文版（2014...》 Hadoop技术内幕 深入理解MapReduce架构设计与实现原理（董西成） hive Hive编程指南 数据仓库： STAR+SCHEMA完全参考手册：数据仓库维度设计权威指南南 纵观大数据：
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