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「R」绘制分组排序点图

我在看过的一些 Nature 文章和 COSMIC 数据库中看到用点图来展示不同癌症类型下 TMB 的分布差异。...在 R 包中，我有看到过 maftools 中可以绘制这样的图，用来表示新的数据队列与 TCGA 数据的比较，这也是应用于 TMB 分析。因为研究问题，我最近也想尝试使用改种图形来展示数据。...而且，该图可以拓展到任意可以适应的场景下，所以我想基于 ggplot2 来创建一个通用的绘图函数。 ?...下面是一个使用示例，通过构建一个示例数据进行绘图，展示如何传入分组变量和值变量、分组标签位置、排序以及点的透明度等： set.seed(1234) data <- data.frame( yval...怎么保证数据量只有 1-2 个这种情况也能画出图形？

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ggplot2绘制多层分组热图

❝本节来复现nature cell biology上的一张热图，通过一系列数据清洗来介绍图形细节的调整，整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。...「数据代码已经整合上传到2023VIP交流群」，加群的观众老爷可自行下载，有需要的朋友可关注文末介绍加入VIP交流群。...❞ 论文加载R包 library(tidyverse) library(ggh4x) library(MetBrewer) 数据清洗 df % pivot_longer...", name) ~ "Bio rep 3", TRUE ~ "Other" )) 数据可视化 df %>% ggplot(....margin = margin(b=3)), plot.margin=unit(c(0.2,0.2,0.2,0.2),units=,"cm")) 复现图

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趋势（六）利用python绘制螺旋图

趋势（六）利用python绘制螺旋图螺旋图（Spiral Diagram）简介 1、螺旋图适合用来显示大型时间内的数据趋势，也能有效地显示其周期性。...绘制螺旋图基本的螺旋框架 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import pandas as pd # 设置随机种子 np.random.seed...* 2 * np.pi # 初始化布局 fig = plt.figure(figsize=(8, 8)) ax = fig.add_subplot(111, polar=True) # 添加条形图数据...indices = (pd.Series(dates).dt.year == year) # 添加条形图数据，为每年选择不同的颜色 ax.bar(theta[indices...False) # 删除极坐标的外环（边框） ax.spines['polar'].set_visible(False) plt.show() 4、总结以上基于matplotlib极坐标叠加条形图绘制出了螺旋图

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趋势（四）利用python绘制流图

趋势（四）利用python绘制流图流图（Streamgraph）简介流图是一种围绕中心轴偏移的堆叠面积图，从而形成流动的有机形状。...数据在不同的阶段产生了结构性的变化时，通过可视化手段看数据成分的变动大小及变动方向。...绘制流图 import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np from scipy import stats # 自定义数据 x = np.arange...(1990, 2020) y = [np.random.randint(0, 5, size=30) for _ in range(5)] 绘制基本的堆叠面积图 fig, ax = plt.subplots...，调整baseline和平滑曲线完成了流图的绘制。

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趋势（五）利用python绘制烛台图

趋势（五）利用python绘制烛台图烛台图（Candlestick）简介烛台图也叫K线图，通常用作交易工具，用来显示和分析证券、衍生工具、外汇货币、股票、债券等商品随着时间的价格变动。...绘制基本烛台图由于不是专业的金融从业者，这里只是简单的进行分享，更多用法可参考baostock 数据平台[1]、mplfinance文档[2]以及Candlestick charts in Python...- Plotly[3] 获取股票数据 # 获取股票数据 import baostock as bs import pandas as pd lg = bs.login() rs = bs.query_history_k_data_plus....astype(float) bs.logout() 基于mplfinance import mplfinance as mpf moving_averages = [5,10,15] # 需要绘制的均线...，并利用mplfinance和plotly快速绘制烛台图。

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ggplot2 分组箱线图图绘制方法

生成模拟数据生成示例数据 library(data.table)library(ggplot2)dat <- data.table(Spring = c(runif(9,0,1),2),..., Autumn = runif(10,0,1), Winter = runif(10,0,1))dat1 = melt(dat) 数据如下...生成分组箱线图要点 data=dat1 # 定义数据 aes(x = variable, y = value) # 定义x轴和y轴 geom_boxplot() #定义箱线图 ?

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趋势（七）利用python绘制日历热图

趋势（七）利用python绘制日历热图日历热图（Calendar Heatmap）简介日历热图通过将事件聚合到日历网格中进行可视化分析，针对时序类数据特征较为直观，其中以github代码热图而知名。...快速绘制基于plotly_calplot import pandas as pd import numpy as np from plotly_calplot import calplot # 自定义数据...-15') values = np.random.randint(0, 100, len(dt)) df = pd.DataFrame({"dt": dt, "value": values}) # 绘制图形...plt.show() 总结以上通过plotly_calplot、pyecharts、calplot和july快速绘制日历热图。...并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的日历热图来适应相关使用场景。共勉～

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趋势（三）利用python绘制堆叠面积图

趋势（三）利用python绘制堆叠面积图堆叠面积图（Stacked area Chart）简介堆叠式面积图的原理与简单面积图相同，但它能同时显示多个数据系列，适合用来比较同一间隔内多个变量的变化。...快速绘制基于matplotlib import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 自定义数据 x=range(1,6) y1=[1,4,6,8,9...] y2=[2,2,7,10,12] y3=[2,8,5,10,6] # 利用stackplot绘制堆叠面积图 plt.stackplot(x,y1, y2, y3, labels=['A','B'...1,4,6,8,9], [2,2,7,10,12], [2,8,5,10,6]] df = pd.DataFrame(y).T df.columns = ['A', 'B', 'C'] # 利用area函数绘制堆叠面积图...) plt.show() 总结以上通过matplotlib和pandas快速绘制堆叠面积图。

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趋势（二）利用python绘制面积图

趋势（二）利用python绘制面积图面积图（ Area Chart）简介面积图是折线图的一种，通过颜色或纹理填充线下面的区域，可以更好的突出趋势信息。...快速绘制基于matplotlib import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # 自定义数据 x=range(1,6) y=[1,4,6,8,4...] # 绘制面积图 plt.fill_between(x, y) plt.show() 定制多样化的面积图自定义面积图一般是结合使用场景对相关参数进行修改，并辅以其他的绘图知识。...matplotlib主要利用plot绘制面积图，可以通过matplotlib.pyplot.plot[1]了解更多用法修改参数 import numpy as np import matplotlib.pyplot...color="skyblue", alpha=0.2) # 绘制一条高亮的线 plt.plot(x, y, color="Slateblue", alpha=0.6) plt.show() 分组面积图

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绘制分组散点图（克里夫兰点图）

1读取数据 mydata<-read.csv("/home/shijm/Rlearning/Beautiful-Visualization-with-R-master/第3章_类别比较型图表/DotPlots_Data.csv...Hidalgo Female 7361.04 8 Los Angeles Female 6014.64 9 Merida Female 4770.14 2绘制分组散点图

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在Python中用matplotlib函数绘制股票趋势图

我们经常在电视上看到股票趋势图，今天跟大家分享怎么用Python绘制这种图。...本文目录安装包读取数据文件将日期列设置为数据框索引绘制股票趋势图 1 安装包首先要在cmd中安装绘图需要的matplotlib包，输入如下语句即可安装。...4 绘制股票趋势图可以把时间作为横轴，每天的收盘价或处理后的收盘价作为纵轴绘制折线图，以此当成股票趋势图。...从这个图可以发现，相比上一个图更能体现股价的趋势，即从2011年到2020年整体股价是下降的。有些同学还可能说，时间越近越能体现当前股价的趋势，以前多少天的平均值作为当前值可能掩盖一些股价趋势。...至此，在Python中绘制股票趋势图已介绍完毕，大家可以动手练习一下

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ggplot2绘制哑铃图进行趋势展示

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制哑铃图并通过线段的连接来进行趋势变化展示，数据无实际意义仅作图形展示用，希望各位观众老爷能够喜欢。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggh4x) 数据清洗 df % # 读取名为 data.xls 的 TSV...文件，并将数据存储在 df 变量中 filter(!...Accepted 和 Raised 列 inner_join(winners %>% count(Year, Nationality), by = "Year") %>% # 与 winners 数据集进行内连接

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ggplot2绘制多组趋势变化图

加载R包 library(tidyverse) library(patchwork) library(janitor) library(glue) library(ggtext) 导入数据 prices...<- read_csv('prices.txt') companies <- read_csv('companies.txt') 数据整合 df_base <- map_dfr(unique(prices...$stock_symbol), ~{ # 对 prices 数据进行变换，添加 group 和 stock_symbol 列 prices |> mutate( group...) }) |> # 使用 stock_symbol 列将 df_base 和 companies 进行左连接操作 left_join(companies,by="stock_symbol") 数据可视化...列用于区分不同的股票 geom_line(aes(date, close, group = group),alpha = 0.5,size = 0.1,colour = "grey") + # 添加面积图，

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ggplot2绘制趋势变化堆砌条形图

❝本节来介绍一个小案例，如何根据某数值来对堆砌条形图数据的趋势变化进行排序，下面小编就通过一个具体案例来介绍如何处理；加载R包 library(tidyverse) 构建数据 df = data.frame...df$fruit <- sample(c("banana", "apple", "orange", "kiwi", "plum"), size = nrow(df), replace = TRUE) 数据可视化...legend.key.width=unit(0.4,"cm"), legend.key.height=unit(0.4,"cm")) ❝结果可以看到苹果的数量随着Y轴不断下降，此图在展示某一特殊组成物质的变化趋势时也许会有用处

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tidyHeatmap使用长数据绘制热图

tidyHeatmap基于ComplexHeatmap，遵循图形语法，最大的好处是直接使用长数据画热图，这是目前其他画热图的R包所不具备的。...目前大部分图形都是基于ggplot2绘制的，需要长数据，现在画热图也可以直接用长数据了，不需要再进行各种转换，这是我认为最大的优点。...tidyverse_conflicts() ── ## ✖ dplyr::filter() masks stats::filter() ## ✖ dplyr::lag() masks stats::lag() 首先一定是把数据变为长数据...value, scale = "row", palette_value = c("red", "white", "blue") ) 分割热图...热图分割的思路也是非常tidy，直接使用group_by()即可。

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利用python绘制EC数据全国降水图

Python的绘图功能非常强大，在大气和海洋常常用来绘制一些有关地理方面的图。本片主要介绍python绘制EC数据（grib格式）的的全国降水分布图。...总体流程：首先利用pygrib读取grib数据中的累计降水量数据，然后利用matplotlib进行绘图，其中利用cartopy进行地图shp文件的处理，并绘制南海小地图。.../国家基础地理数据400万/国界线.shp').geometries() # 绘制中国国界省界九段线等等 ax.add_geometries(china, proj,facecolor='none',edgecolor...所以在绘制地图时，特别是有国家分界线的一定多加要小心。获取国家基础地理数据，加载全国shp文件，可以后台回复chinashp获取链接。关注气海同途，获取更多大气海洋数值模拟相关内容。...WRF中使用SRTM高分辨率的地形资料构建适合大气与海洋应用的Anaconda环境 WRF后处理：降雨量的说明以及降雨的绘制 python爬取中央气象台台风网当前台风实况和预报数据

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Power BI条形图技巧：模拟麦肯锡数据分组

industries/retail/our-insights/automation-in-retail-an-executive-overview-for-getting-ready Power BI内置条形图使用重叠和误差线也可以制作类似的效果...：首先，新建三个度量值： M.1 = 1 M.2 = 2 M.3 = 3 簇状条形图如下拖拽字段：效果如下：重叠功能打开，系列间距100%，适当调整颜色：为M3添加误差线，误差线的起点为

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基因型数据绘制PCA图和聚类分析图

下面看一下利用基因型SNP数据进行PCA计算，以及可视化的分析。很多软件可以分析PCA，这里介绍一下使用plink软件和R语言，进行PCA分析，并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。...绘制后的图如下： 2-D PCA图：图片解释，将每个品种用不同的颜色表示，同时绘制置信区间圆圈，X坐标是PC1，解释24.9%的变异，Y坐标是PC2，解释10.61%的变异。...可以看到，三个品种在PCA图里面分的比较开，C品种的有两个A和B的点，应该是异常数据。基因型数据：共有3个品种A，B，C，共有412个个体。...，将其转化为0,1,2的形式 2，计算G矩阵 3，计算PCA的特征向量和特征值 4，根据特征值计算解释百分比 5，根据特征向量和品种标签，进行PCA的绘制绘制代码如下：首先，使用plink命令...然后使用R语言，计算PCA，并绘制PCA图。

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Python绘制树图展示数据分布情况

任务描述：绘制树图展示数据分布，所有数值按比例划分区域，数值越大，对应的色块面积越大。准备工作：安装扩展库NumPy、squarify、Matplotlib。运行效果：参考代码：

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数据可视化-Matplotlib使用子图绘制数据

背景介绍今天我们将学习如何在Matplotlib中使用子图。使用子图，以便我们可以以更面向对象的方式使用Matplotlib。...我们将学习如何使用子图来绘制我们在之前的文章中关于开发语言工资的数据图表，然后我们将学习如何使用子图在一个图上创建多个图。让我们开始吧... ?...入门实例首先我们从data.csv文件中读取数据，进行绘制： ?...] dev_salaries = data['All_Devs'] py_salaries = data['Python'] js_salaries = data['JavaScript'] #创建子图...font_manager.\ FontProperties(fname='C:\\Windows\\Fonts\\msyh.ttf') ax1.legend() ax1.set_title('年龄的平均薪水图'

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